MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloferax volcanii DS2 plasmid pHV4

Total Repeats: 13672

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_013966	G	6	6	182172	182177	0 %	0 %	100 %	0 %	292653738
3502	NC_013966	CGA	2	6	182186	182191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653738
3503	NC_013966	CGG	2	6	182197	182202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653738
3504	NC_013966	CGC	2	6	182318	182323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292653739
3505	NC_013966	CGA	2	6	182348	182353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653739
3506	NC_013966	CTG	2	6	182358	182363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653739
3507	NC_013966	CGG	2	6	182384	182389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653739
3508	NC_013966	CAA	2	6	182426	182431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	292653739
3509	NC_013966	CG	4	8	182441	182448	0 %	0 %	50 %	50 %	292653739
3510	NC_013966	TCG	2	6	182509	182514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653739
3511	NC_013966	GAC	2	6	182517	182522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653739
3512	NC_013966	CGA	2	6	182561	182566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653739
3513	NC_013966	CGA	2	6	182576	182581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653739
3514	NC_013966	CGT	2	6	182599	182604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653739
3515	NC_013966	ACCG	2	8	182651	182658	25 %	0 %	25 %	50 %	292653739
3516	NC_013966	CG	4	8	182699	182706	0 %	0 %	50 %	50 %	292653739
3517	NC_013966	GAA	2	6	182750	182755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292653739
3518	NC_013966	CAC	2	6	182877	182882	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292653739
3519	NC_013966	CGA	2	6	182891	182896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653739
3520	NC_013966	GAG	2	6	182904	182909	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292653739
3521	NC_013966	CGG	2	6	182939	182944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653739
3522	NC_013966	CGGG	2	8	182953	182960	0 %	0 %	75 %	25 %	292653739
3523	NC_013966	GC	3	6	182986	182991	0 %	0 %	50 %	50 %	292653739
3524	NC_013966	TCG	2	6	183043	183048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653739
3525	NC_013966	GCC	2	6	183051	183056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292653739
3526	NC_013966	CG	3	6	183146	183151	0 %	0 %	50 %	50 %	292653740
3527	NC_013966	CGC	2	6	183181	183186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292653740
3528	NC_013966	CGC	2	6	183213	183218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292653740
3529	NC_013966	CGAC	2	8	183255	183262	25 %	0 %	25 %	50 %	292653740
3530	NC_013966	GGAA	2	8	183296	183303	50 %	0 %	50 %	0 %	292653740
3531	NC_013966	GAC	2	6	183310	183315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653740
3532	NC_013966	CCG	2	6	183333	183338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292653740
3533	NC_013966	CGG	2	6	183395	183400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653740
3534	NC_013966	GAC	2	6	183416	183421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653740
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3536	NC_013966	GC	3	6	183482	183487	0 %	0 %	50 %	50 %	292653740
3537	NC_013966	CGGG	2	8	183559	183566	0 %	0 %	75 %	25 %	292653740
3538	NC_013966	GAG	2	6	183590	183595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292653740
3539	NC_013966	GC	3	6	183607	183612	0 %	0 %	50 %	50 %	292653740
3540	NC_013966	GGC	2	6	183613	183618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653740
3541	NC_013966	CGC	2	6	183622	183627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292653740
3542	NC_013966	CGG	2	6	183628	183633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653740
3543	NC_013966	AGACG	2	10	183634	183643	40 %	0 %	40 %	20 %	292653740
3544	NC_013966	CG	3	6	183642	183647	0 %	0 %	50 %	50 %	292653740
3545	NC_013966	CG	3	6	183665	183670	0 %	0 %	50 %	50 %	292653740
3546	NC_013966	CGAC	2	8	183697	183704	25 %	0 %	25 %	50 %	292653740
3547	NC_013966	CCG	2	6	183714	183719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292653740
3548	NC_013966	AAC	2	6	183732	183737	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	292653740
3549	NC_013966	CG	3	6	183742	183747	0 %	0 %	50 %	50 %	292653740
3550	NC_013966	GAC	2	6	183779	183784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653740
3551	NC_013966	GC	3	6	183794	183799	0 %	0 %	50 %	50 %	292653740
3552	NC_013966	CTT	2	6	183851	183856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292653740
3553	NC_013966	ACG	2	6	183867	183872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653740
3554	NC_013966	CCG	2	6	183877	183882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292653740
3555	NC_013966	CGT	2	6	183883	183888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653740
3556	NC_013966	GACCG	2	10	183896	183905	20 %	0 %	40 %	40 %	292653740
3557	NC_013966	CTG	2	6	183908	183913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653740
3558	NC_013966	CGT	2	6	183931	183936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653740
3559	NC_013966	CGA	3	9	183937	183945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653740
3560	NC_013966	GACG	2	8	183973	183980	25 %	0 %	50 %	25 %	292653740
3561	NC_013966	TCG	2	6	183983	183988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653740
3562	NC_013966	CGA	2	6	184003	184008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653740
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3564	NC_013966	AGCC	2	8	184048	184055	25 %	0 %	25 %	50 %	292653740
3565	NC_013966	CG	3	6	184092	184097	0 %	0 %	50 %	50 %	292653740
3566	NC_013966	CGACGC	2	12	184103	184114	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	292653740
3567	NC_013966	CGC	2	6	184172	184177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292653740
3568	NC_013966	CGA	2	6	184180	184185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653740
3569	NC_013966	CG	4	8	184186	184193	0 %	0 %	50 %	50 %	292653740
3570	NC_013966	CGA	2	6	184222	184227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653740
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3572	NC_013966	CGA	2	6	184306	184311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653740
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3575	NC_013966	CGA	2	6	184453	184458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653740
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3577	NC_013966	CGAG	2	8	184515	184522	25 %	0 %	50 %	25 %	292653740
3578	NC_013966	TCG	3	9	184530	184538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653740
3579	NC_013966	GC	3	6	184566	184571	0 %	0 %	50 %	50 %	292653740
3580	NC_013966	GCGAGG	2	12	184575	184586	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	292653740
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3582	NC_013966	CGG	2	6	184675	184680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653740
3583	NC_013966	CGA	2	6	184687	184692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653740
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3585	NC_013966	TC	3	6	184717	184722	0 %	50 %	0 %	50 %	292653740
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3589	NC_013966	CCT	2	6	184921	184926	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292653741
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3591	NC_013966	TCG	2	6	185010	185015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653741
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3593	NC_013966	CGAG	2	8	185074	185081	25 %	0 %	50 %	25 %	292653741
3594	NC_013966	CTC	2	6	185093	185098	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292653741
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3597	NC_013966	TCCG	2	8	185153	185160	0 %	25 %	25 %	50 %	292653741
3598	NC_013966	GGA	2	6	185164	185169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292653741
3599	NC_013966	TCGT	2	8	185178	185185	0 %	50 %	25 %	25 %	292653741
3600	NC_013966	GAA	2	6	185204	185209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292653741
3601	NC_013966	TCG	2	6	185241	185246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653741
3602	NC_013966	GCG	2	6	185275	185280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653741
3603	NC_013966	TCG	2	6	185286	185291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653741
3604	NC_013966	CGT	2	6	185344	185349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653741
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3606	NC_013966	GACG	2	8	185382	185389	25 %	0 %	50 %	25 %	292653741
3607	NC_013966	GCC	2	6	185393	185398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292653741
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3609	NC_013966	TCCG	2	8	185420	185427	0 %	25 %	25 %	50 %	292653741
3610	NC_013966	GTC	2	6	185432	185437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653741
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3617	NC_013966	GAG	2	6	185561	185566	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292653741
3618	NC_013966	CGT	2	6	185589	185594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653741
3619	NC_013966	GCG	2	6	185671	185676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653742
3620	NC_013966	GGC	2	6	185684	185689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653742
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3622	NC_013966	GTCG	2	8	185733	185740	0 %	25 %	50 %	25 %	292653742
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3743	NC_013966	CGC	2	6	190113	190118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292653750
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3862	NC_013966	CGTCG	2	10	194260	194269	0 %	20 %	40 %	40 %	292653754
3863	NC_013966	GCGA	2	8	194290	194297	25 %	0 %	50 %	25 %	292653754
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3979	NC_013966	CGACG	2	10	198432	198441	20 %	0 %	40 %	40 %	292653756
3980	NC_013966	AG	3	6	198447	198452	50 %	0 %	50 %	0 %	292653756
3981	NC_013966	CGG	2	6	198533	198538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653756
3982	NC_013966	TCG	3	9	198541	198549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653756
3983	NC_013966	CCTC	2	8	199021	199028	0 %	25 %	0 %	75 %	292653757
3984	NC_013966	GAC	2	6	199108	199113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653757
3985	NC_013966	CGA	2	6	199119	199124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653757
3986	NC_013966	CGA	2	6	199134	199139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653757
3987	NC_013966	CGA	2	6	199152	199157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653757
3988	NC_013966	GCG	2	6	199158	199163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653757
3989	NC_013966	CGCCAT	2	12	199192	199203	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	292653757
3990	NC_013966	CGC	2	6	199206	199211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292653757
3991	NC_013966	GGA	2	6	199239	199244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292653757
3992	NC_013966	CCG	2	6	199246	199251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292653757
3993	NC_013966	CG	4	8	199281	199288	0 %	0 %	50 %	50 %	292653757
3994	NC_013966	TCG	2	6	199359	199364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653757
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4000	NC_013966	CGA	2	6	199563	199568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653757

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