MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloferax volcanii DS2 plasmid pHV4

Total Repeats: 13672

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_013966	GTC	2	6	84210	84215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653647
1502	NC_013966	CCA	2	6	84264	84269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292653647
1503	NC_013966	CCT	2	6	84278	84283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292653647
1504	NC_013966	GAC	2	6	84288	84293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653647
1505	NC_013966	AGG	2	6	84451	84456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292653647
1506	NC_013966	CGA	2	6	84473	84478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653647
1507	NC_013966	CGA	2	6	84548	84553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653647
1508	NC_013966	TCC	2	6	84559	84564	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292653647
1509	NC_013966	TTC	2	6	84582	84587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292653647
1510	NC_013966	TTC	2	6	84691	84696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292653647
1511	NC_013966	TTG	2	6	84724	84729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292653647
1512	NC_013966	TCG	2	6	84751	84756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653647
1513	NC_013966	CG	3	6	84801	84806	0 %	0 %	50 %	50 %	292653647
1514	NC_013966	GGC	2	6	84849	84854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653647
1515	NC_013966	GTC	2	6	84892	84897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653647
1516	NC_013966	GAC	2	6	84909	84914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653647
1517	NC_013966	GTC	2	6	84915	84920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653647
1518	NC_013966	ACA	2	6	84932	84937	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	292653647
1519	NC_013966	TCC	2	6	84943	84948	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292653647
1520	NC_013966	TCG	2	6	84985	84990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653647
1521	NC_013966	TCG	2	6	85462	85467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653648
1522	NC_013966	GAC	2	6	85520	85525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653648
1523	NC_013966	GCC	2	6	85572	85577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292653648
1524	NC_013966	CAT	3	9	85598	85606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292653648
1525	NC_013966	G	6	6	85610	85615	0 %	0 %	100 %	0 %	292653648
1526	NC_013966	GAC	2	6	85622	85627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653648
1527	NC_013966	CAA	2	6	85668	85673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	292653648
1528	NC_013966	TCGA	2	8	85678	85685	25 %	25 %	25 %	25 %	292653648
1529	NC_013966	GTTC	2	8	85718	85725	0 %	50 %	25 %	25 %	292653648
1530	NC_013966	CGG	2	6	85738	85743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653648
1531	NC_013966	TCT	2	6	85744	85749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292653648
1532	NC_013966	TCA	2	6	85831	85836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292653648
1533	NC_013966	GGA	2	6	85893	85898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292653648
1534	NC_013966	GCA	2	6	85977	85982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653648
1535	NC_013966	CTA	2	6	86009	86014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292653648
1536	NC_013966	ACA	2	6	86047	86052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	292653648
1537	NC_013966	CT	3	6	86215	86220	0 %	50 %	0 %	50 %	292653648
1538	NC_013966	CGG	2	6	86323	86328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653648
1539	NC_013966	CG	3	6	86349	86354	0 %	0 %	50 %	50 %	292653648
1540	NC_013966	GTC	2	6	86397	86402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653648
1541	NC_013966	GTT	2	6	86427	86432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292653648
1542	NC_013966	CGTT	2	8	86479	86486	0 %	50 %	25 %	25 %	292653648
1543	NC_013966	GCT	2	6	86489	86494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653648
1544	NC_013966	ATC	2	6	86538	86543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292653648
1545	NC_013966	GCGGA	2	10	86548	86557	20 %	0 %	60 %	20 %	292653648
1546	NC_013966	TTC	2	6	86559	86564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292653648
1547	NC_013966	GCA	2	6	86569	86574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653648
1548	NC_013966	TCG	2	6	86578	86583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653648
1549	NC_013966	TCT	2	6	86641	86646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292653648
1550	NC_013966	GCACCG	2	12	86652	86663	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	292653648
1551	NC_013966	ATG	2	6	86664	86669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292653648
1552	NC_013966	CGA	2	6	86681	86686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653648
1553	NC_013966	CTC	2	6	86739	86744	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292653648
1554	NC_013966	GCG	2	6	86772	86777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653648
1555	NC_013966	CCT	2	6	86915	86920	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292653649
1556	NC_013966	TGA	2	6	86978	86983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292653649
1557	NC_013966	GCC	2	6	87088	87093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292653649
1558	NC_013966	TTC	2	6	87109	87114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292653649
1559	NC_013966	GTC	3	9	87126	87134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653649
1560	NC_013966	CTTC	2	8	87170	87177	0 %	50 %	0 %	50 %	292653649
1561	NC_013966	GCTT	2	8	87205	87212	0 %	50 %	25 %	25 %	292653649
1562	NC_013966	GCC	2	6	87525	87530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292653650
1563	NC_013966	CGT	2	6	87626	87631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653650
1564	NC_013966	CGT	2	6	87660	87665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653650
1565	NC_013966	GTC	2	6	87804	87809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653650
1566	NC_013966	GAC	2	6	87825	87830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653650
1567	NC_013966	CGA	2	6	87839	87844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653650
1568	NC_013966	CGC	2	6	87887	87892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292653650
1569	NC_013966	TCG	2	6	87943	87948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653650
1570	NC_013966	TCGAC	2	10	88003	88012	20 %	20 %	20 %	40 %	292653650
1571	NC_013966	GTC	2	6	88014	88019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653650
1572	NC_013966	CGA	2	6	88049	88054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653650
1573	NC_013966	TCGA	2	8	88090	88097	25 %	25 %	25 %	25 %	292653650
1574	NC_013966	CGA	2	6	88283	88288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653650
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1579	NC_013966	AGT	2	6	88522	88527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292653651
1580	NC_013966	AGT	2	6	88530	88535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292653651
1581	NC_013966	CGG	2	6	88547	88552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653651
1582	NC_013966	GTTCC	2	10	88567	88576	0 %	40 %	20 %	40 %	292653651
1583	NC_013966	GGT	2	6	88592	88597	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292653651
1584	NC_013966	GTC	2	6	88613	88618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653651
1585	NC_013966	CGG	2	6	88657	88662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653651
1586	NC_013966	CGAT	2	8	88702	88709	25 %	25 %	25 %	25 %	292653651
1587	NC_013966	AAT	2	6	88720	88725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	292653651
1588	NC_013966	GC	3	6	88797	88802	0 %	0 %	50 %	50 %	292653651
1589	NC_013966	GTG	2	6	88820	88825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292653651
1590	NC_013966	TCTT	2	8	88827	88834	0 %	75 %	0 %	25 %	292653651
1591	NC_013966	TGG	2	6	88845	88850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292653651
1592	NC_013966	CGAC	2	8	88867	88874	25 %	0 %	25 %	50 %	292653651
1593	NC_013966	GTC	2	6	88878	88883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653651
1594	NC_013966	GAC	2	6	89033	89038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653651
1595	NC_013966	CG	3	6	89095	89100	0 %	0 %	50 %	50 %	292653651
1596	NC_013966	CGA	2	6	89107	89112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653651
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1598	NC_013966	GAA	2	6	89243	89248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292653651
1599	NC_013966	CCG	2	6	89289	89294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292653651
1600	NC_013966	CGTG	2	8	89505	89512	0 %	25 %	50 %	25 %	292653651
1601	NC_013966	CCT	2	6	89599	89604	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292653651
1602	NC_013966	TCG	2	6	89613	89618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653651
1603	NC_013966	GTC	2	6	89627	89632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653651
1604	NC_013966	CG	3	6	89669	89674	0 %	0 %	50 %	50 %	292653651
1605	NC_013966	CGT	3	9	89681	89689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653651
1606	NC_013966	CAC	2	6	89761	89766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292653651
1607	NC_013966	CGT	2	6	89857	89862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653651
1608	NC_013966	CG	4	8	90000	90007	0 %	0 %	50 %	50 %	292653651
1609	NC_013966	CCG	2	6	90036	90041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292653651
1610	NC_013966	CCG	2	6	90097	90102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292653651
1611	NC_013966	GCGG	2	8	90121	90128	0 %	0 %	75 %	25 %	292653651
1612	NC_013966	GA	3	6	90289	90294	50 %	0 %	50 %	0 %	292653651
1613	NC_013966	CT	3	6	90335	90340	0 %	50 %	0 %	50 %	292653651
1614	NC_013966	GGT	2	6	90397	90402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292653651
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1622	NC_013966	TGC	2	6	90633	90638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653651
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1753	NC_013966	TCG	2	6	98513	98518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653657
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1867	NC_013966	GCT	2	6	105633	105638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653662
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1987	NC_013966	CAG	2	6	111100	111105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653673
1988	NC_013966	CAC	2	6	111109	111114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292653673
1989	NC_013966	ACA	2	6	111120	111125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	292653673
1990	NC_013966	GTC	2	6	111152	111157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653673
1991	NC_013966	GTG	2	6	111231	111236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292653673
1992	NC_013966	GCG	2	6	111257	111262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653673
1993	NC_013966	CGCCA	2	10	111274	111283	20 %	0 %	20 %	60 %	292653673
1994	NC_013966	TCG	2	6	111287	111292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653673
1995	NC_013966	CCGT	2	8	111295	111302	0 %	25 %	25 %	50 %	292653673
1996	NC_013966	GGTA	2	8	111306	111313	25 %	25 %	50 %	0 %	292653673
1997	NC_013966	CGTC	2	8	111421	111428	0 %	25 %	25 %	50 %	292653673
1998	NC_013966	AGC	2	6	111473	111478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653673
1999	NC_013966	CTG	2	6	111575	111580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653673
2000	NC_013966	TTC	2	6	111629	111634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292653673

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