MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloferax volcanii DS2 plasmid pHV4

Total Repeats: 13672

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_013966	TAC	2	6	627854	627859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292654168
13502	NC_013966	GC	3	6	627871	627876	0 %	0 %	50 %	50 %	292654168
13503	NC_013966	ATC	2	6	627908	627913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292654168
13504	NC_013966	GCG	2	6	627927	627932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654168
13505	NC_013966	CGA	2	6	628144	628149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654168
13506	NC_013966	TCG	2	6	628176	628181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654168
13507	NC_013966	GGC	2	6	628183	628188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654168
13508	NC_013966	GAC	2	6	628190	628195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654168
13509	NC_013966	CGC	2	6	628254	628259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654168
13510	NC_013966	TCG	2	6	628275	628280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654168
13511	NC_013966	GGC	2	6	628318	628323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654168
13512	NC_013966	CGGA	2	8	628328	628335	25 %	0 %	50 %	25 %	292654168
13513	NC_013966	CG	3	6	628354	628359	0 %	0 %	50 %	50 %	292654168
13514	NC_013966	CGGCG	2	10	628375	628384	0 %	0 %	60 %	40 %	292654168
13515	NC_013966	CGA	2	6	628387	628392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654168
13516	NC_013966	CGG	2	6	628417	628422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654168
13517	NC_013966	CCGAA	2	10	628447	628456	40 %	0 %	20 %	40 %	292654168
13518	NC_013966	CGA	2	6	628459	628464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654168
13519	NC_013966	TCG	2	6	628473	628478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654168
13520	NC_013966	CGA	3	9	628486	628494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654168
13521	NC_013966	CGA	2	6	628510	628515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654168
13522	NC_013966	TCA	2	6	628527	628532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292654168
13523	NC_013966	GCG	2	6	628536	628541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654168
13524	NC_013966	CGC	2	6	628548	628553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654168
13525	NC_013966	GTC	2	6	628595	628600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654168
13526	NC_013966	GCGG	2	8	628607	628614	0 %	0 %	75 %	25 %	292654168
13527	NC_013966	G	6	6	628643	628648	0 %	0 %	100 %	0 %	292654168
13528	NC_013966	CGAC	2	8	628704	628711	25 %	0 %	25 %	50 %	292654168
13529	NC_013966	GAG	2	6	628811	628816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292654169
13530	NC_013966	CGA	2	6	628819	628824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654169
13531	NC_013966	GTC	2	6	628872	628877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654169
13532	NC_013966	TCG	2	6	628986	628991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654169
13533	NC_013966	CGA	2	6	629017	629022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654169
13534	NC_013966	CGC	2	6	629038	629043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654169
13535	NC_013966	GC	3	6	629060	629065	0 %	0 %	50 %	50 %	292654169
13536	NC_013966	CGG	2	6	629086	629091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654169
13537	NC_013966	CTC	2	6	629099	629104	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292654169
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13539	NC_013966	GA	3	6	629122	629127	50 %	0 %	50 %	0 %	292654169
13540	NC_013966	GTG	2	6	629198	629203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292654169
13541	NC_013966	TCG	2	6	629403	629408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654170
13542	NC_013966	TCGT	2	8	629438	629445	0 %	50 %	25 %	25 %	292654170
13543	NC_013966	AGG	2	6	629463	629468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292654170
13544	NC_013966	CAG	2	6	629474	629479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654170
13545	NC_013966	GCCGTC	2	12	629480	629491	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	292654170
13546	NC_013966	ACA	2	6	629499	629504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	292654170
13547	NC_013966	CGT	2	6	629605	629610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654170
13548	NC_013966	ACC	2	6	629625	629630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292654170
13549	NC_013966	CG	4	8	629652	629659	0 %	0 %	50 %	50 %	292654170
13550	NC_013966	ACG	2	6	629676	629681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654170
13551	NC_013966	GC	4	8	629692	629699	0 %	0 %	50 %	50 %	292654170
13552	NC_013966	AGAT	2	8	629712	629719	50 %	25 %	25 %	0 %	292654170
13553	NC_013966	CGC	2	6	629730	629735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654170
13554	NC_013966	CTCGGT	2	12	630292	630303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654171
13555	NC_013966	ACG	2	6	630350	630355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654171
13556	NC_013966	ATCACG	2	12	630367	630378	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	292654171
13557	NC_013966	GTG	2	6	630386	630391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292654171
13558	NC_013966	CGA	2	6	630405	630410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654171
13559	NC_013966	CGT	2	6	630417	630422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654171
13560	NC_013966	GAA	2	6	630456	630461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292654171
13561	NC_013966	CGA	2	6	630471	630476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654171
13562	NC_013966	TCG	2	6	630500	630505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654171
13563	NC_013966	CGA	2	6	630522	630527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654171
13564	NC_013966	TCTCGG	2	12	630961	630972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654172
13565	NC_013966	ACG	2	6	631020	631025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654172
13566	NC_013966	CACG	2	8	631042	631049	25 %	0 %	25 %	50 %	292654172
13567	NC_013966	GCG	2	6	631053	631058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654172
13568	NC_013966	CGT	3	9	631171	631179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654172
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13571	NC_013966	CGT	2	6	631476	631481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654173
13572	NC_013966	CCTC	2	8	631484	631491	0 %	25 %	0 %	75 %	292654173
13573	NC_013966	CGT	2	6	631509	631514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654173
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13578	NC_013966	CTG	2	6	631699	631704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654173
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13580	NC_013966	GCGG	2	8	631764	631771	0 %	0 %	75 %	25 %	292654173
13581	NC_013966	GCGCG	2	10	631788	631797	0 %	0 %	60 %	40 %	292654173
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13588	NC_013966	GAC	2	6	631983	631988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654173
13589	NC_013966	CCG	2	6	632063	632068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654173
13590	NC_013966	CCGA	2	8	632079	632086	25 %	0 %	25 %	50 %	292654173
13591	NC_013966	CG	3	6	632119	632124	0 %	0 %	50 %	50 %	292654173
13592	NC_013966	ATCGA	2	10	632134	632143	40 %	20 %	20 %	20 %	292654173
13593	NC_013966	TCG	2	6	632189	632194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654173
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13597	NC_013966	CGCGG	2	10	632316	632325	0 %	0 %	60 %	40 %	292654173
13598	NC_013966	CGG	2	6	632348	632353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654173
13599	NC_013966	CGG	3	9	632363	632371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654173
13600	NC_013966	GTC	2	6	632392	632397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654173
13601	NC_013966	ACG	2	6	632405	632410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654173
13602	NC_013966	GGTC	2	8	632435	632442	0 %	25 %	50 %	25 %	292654173
13603	NC_013966	GC	3	6	632465	632470	0 %	0 %	50 %	50 %	292654173
13604	NC_013966	CGG	2	6	632508	632513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654173
13605	NC_013966	GT	3	6	632516	632521	0 %	50 %	50 %	0 %	292654173
13606	NC_013966	CCG	2	6	632523	632528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654173
13607	NC_013966	CGG	3	9	632538	632546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654173
13608	NC_013966	CGA	2	6	632622	632627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654173
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13612	NC_013966	CGA	2	6	632682	632687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654173
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13616	NC_013966	CGAC	2	8	632769	632776	25 %	0 %	25 %	50 %	292654173
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13618	NC_013966	CGA	2	6	632820	632825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654174
13619	NC_013966	ACG	2	6	632833	632838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654174
13620	NC_013966	CGA	2	6	632850	632855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654174
13621	NC_013966	GC	3	6	632876	632881	0 %	0 %	50 %	50 %	292654174
13622	NC_013966	ACGAGT	2	12	632936	632947	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	292654174
13623	NC_013966	CGA	2	6	632955	632960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654174
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13646	NC_013966	ACG	2	6	633875	633880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654174
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13668	NC_013966	GTCG	2	8	635397	635404	0 %	25 %	50 %	25 %	292654177
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