MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloferax volcanii DS2 plasmid pHV4

Total Repeats: 13672

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12002	NC_013966	TCG	2	6	573574	573579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654110
12003	NC_013966	TCG	2	6	573592	573597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654110
12004	NC_013966	GCA	2	6	573620	573625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654110
12005	NC_013966	CGA	2	6	573629	573634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654110
12006	NC_013966	GAG	2	6	573660	573665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292654110
12007	NC_013966	TCC	2	6	573678	573683	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292654111
12008	NC_013966	TCG	2	6	573708	573713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654111
12009	NC_013966	GTCG	2	8	573721	573728	0 %	25 %	50 %	25 %	292654111
12010	NC_013966	CGT	2	6	573739	573744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654111
12011	NC_013966	GGT	2	6	573769	573774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292654111
12012	NC_013966	GAC	2	6	573818	573823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654111
12013	NC_013966	GTC	2	6	573842	573847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654111
12014	NC_013966	CG	3	6	573865	573870	0 %	0 %	50 %	50 %	292654111
12015	NC_013966	TCG	2	6	573882	573887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654111
12016	NC_013966	GCGTC	2	10	573922	573931	0 %	20 %	40 %	40 %	292654111
12017	NC_013966	GCC	2	6	573933	573938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654111
12018	NC_013966	CCT	2	6	573955	573960	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292654111
12019	NC_013966	GTC	2	6	573971	573976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654111
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12022	NC_013966	GTC	2	6	574049	574054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654111
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12025	NC_013966	CGA	2	6	574166	574171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654111
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12040	NC_013966	CCGG	2	8	575074	575081	0 %	0 %	50 %	50 %	292654112
12041	NC_013966	CGA	2	6	575110	575115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654112
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12045	NC_013966	CGA	2	6	575254	575259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654112
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12052	NC_013966	CGT	2	6	575653	575658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654112
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12055	NC_013966	CGG	2	6	575689	575694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654112
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12113	NC_013966	GTC	2	6	577379	577384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654114
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12117	NC_013966	GTA	2	6	577444	577449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292654114
12118	NC_013966	GTA	2	6	577468	577473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292654114
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12231	NC_013966	CCT	2	6	581956	581961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292654118
12232	NC_013966	GAT	2	6	582001	582006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292654118
12233	NC_013966	TCA	2	6	582024	582029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292654118
12234	NC_013966	TCG	3	9	582051	582059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654118
12235	NC_013966	TGGT	2	8	582074	582081	0 %	50 %	50 %	0 %	292654118
12236	NC_013966	CGGC	2	8	582090	582097	0 %	0 %	50 %	50 %	292654118
12237	NC_013966	CGC	3	9	582124	582132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654118
12238	NC_013966	GTC	2	6	582155	582160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654118
12239	NC_013966	CAT	2	6	582181	582186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292654118
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12241	NC_013966	TCA	2	6	582234	582239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292654118
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12244	NC_013966	GC	4	8	582447	582454	0 %	0 %	50 %	50 %	292654118
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12350	NC_013966	TCG	2	6	585723	585728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654122
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12354	NC_013966	GCG	2	6	585807	585812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654122
12355	NC_013966	CCG	2	6	585819	585824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654122
12356	NC_013966	GAC	2	6	585859	585864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654122
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12358	NC_013966	GGC	2	6	585916	585921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654122
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12454	NC_013966	AGTC	2	8	589595	589602	25 %	25 %	25 %	25 %	292654125
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12465	NC_013966	TCG	2	6	589967	589972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654125
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12469	NC_013966	GCCCGC	2	12	590131	590142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654125
12470	NC_013966	CCG	3	9	590223	590231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654125
12471	NC_013966	GAC	2	6	590236	590241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654125
12472	NC_013966	CGA	2	6	590250	590255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654125
12473	NC_013966	GAG	2	6	590356	590361	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292654125
12474	NC_013966	CGGTC	2	10	590367	590376	0 %	20 %	40 %	40 %	292654125
12475	NC_013966	CCCG	2	8	590416	590423	0 %	0 %	25 %	75 %	292654125
12476	NC_013966	CGG	2	6	590435	590440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654125
12477	NC_013966	GAC	2	6	590479	590484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654125
12478	NC_013966	GCC	2	6	590491	590496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654125
12479	NC_013966	AG	3	6	590503	590508	50 %	0 %	50 %	0 %	292654125
12480	NC_013966	GCG	2	6	590559	590564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654125
12481	NC_013966	AG	3	6	590662	590667	50 %	0 %	50 %	0 %	292654125
12482	NC_013966	CGA	2	6	590726	590731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654126
12483	NC_013966	CGC	2	6	590745	590750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654126
12484	NC_013966	AC	3	6	590791	590796	50 %	0 %	0 %	50 %	292654126
12485	NC_013966	ACCGC	2	10	590886	590895	20 %	0 %	20 %	60 %	292654126
12486	NC_013966	GAGC	2	8	590900	590907	25 %	0 %	50 %	25 %	292654126
12487	NC_013966	TGCCG	2	10	590971	590980	0 %	20 %	40 %	40 %	292654126
12488	NC_013966	TCGGTA	2	12	590997	591008	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	292654126
12489	NC_013966	CCGA	2	8	591063	591070	25 %	0 %	25 %	50 %	292654126
12490	NC_013966	CGC	2	6	591121	591126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654127
12491	NC_013966	CCG	2	6	591160	591165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654127
12492	NC_013966	CCG	2	6	591213	591218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654127
12493	NC_013966	CGC	2	6	591220	591225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654127
12494	NC_013966	CGGC	2	8	591231	591238	0 %	0 %	50 %	50 %	292654127
12495	NC_013966	TCG	3	9	591255	591263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654127
12496	NC_013966	ACT	2	6	591288	591293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292654127
12497	NC_013966	CCGCG	2	10	591367	591376	0 %	0 %	40 %	60 %	292654127
12498	NC_013966	C	6	6	591378	591383	0 %	0 %	0 %	100 %	292654127
12499	NC_013966	CGA	2	6	591394	591399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654127
12500	NC_013966	TCG	2	6	591405	591410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654127

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