MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloferax volcanii DS2 plasmid pHV4

Total Repeats: 13672

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11502	NC_013966	ACG	2	6	556305	556310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654095
11503	NC_013966	GGA	3	9	556324	556332	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292654095
11504	NC_013966	GC	3	6	556360	556365	0 %	0 %	50 %	50 %	292654095
11505	NC_013966	CGA	3	9	556375	556383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654095
11506	NC_013966	CGACG	2	10	556504	556513	20 %	0 %	40 %	40 %	292654095
11507	NC_013966	TCC	2	6	556536	556541	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292654095
11508	NC_013966	CGA	2	6	556561	556566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654095
11509	NC_013966	CGA	3	9	556594	556602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654095
11510	NC_013966	GTC	2	6	556625	556630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654095
11511	NC_013966	GCG	2	6	556638	556643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654095
11512	NC_013966	GAC	2	6	556697	556702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654095
11513	NC_013966	TCG	2	6	556860	556865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654095
11514	NC_013966	CGGCG	2	10	556891	556900	0 %	0 %	60 %	40 %	292654095
11515	NC_013966	ACG	2	6	556944	556949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654095
11516	NC_013966	CGC	2	6	556950	556955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654095
11517	NC_013966	CCGG	2	8	556999	557006	0 %	0 %	50 %	50 %	292654095
11518	NC_013966	CGA	3	9	557007	557015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654095
11519	NC_013966	CGG	2	6	557022	557027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654095
11520	NC_013966	CGA	2	6	557044	557049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654095
11521	NC_013966	CGC	3	9	557077	557085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654095
11522	NC_013966	TCG	2	6	557088	557093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654095
11523	NC_013966	GGC	2	6	557110	557115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654095
11524	NC_013966	CTCG	2	8	557125	557132	0 %	25 %	25 %	50 %	292654095
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11526	NC_013966	GCC	2	6	557185	557190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654096
11527	NC_013966	GAC	2	6	557235	557240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654096
11528	NC_013966	GC	3	6	557261	557266	0 %	0 %	50 %	50 %	292654096
11529	NC_013966	GGAAC	2	10	557273	557282	40 %	0 %	40 %	20 %	292654096
11530	NC_013966	CGC	2	6	557333	557338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654096
11531	NC_013966	CGA	2	6	557339	557344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654096
11532	NC_013966	CGAC	2	8	557372	557379	25 %	0 %	25 %	50 %	292654096
11533	NC_013966	GAG	2	6	557389	557394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292654096
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11535	NC_013966	AGA	2	6	557438	557443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292654096
11536	NC_013966	CCG	2	6	557446	557451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654096
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11539	NC_013966	GCG	2	6	557473	557478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654096
11540	NC_013966	CGC	2	6	557514	557519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654096
11541	NC_013966	CGA	2	6	557525	557530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654096
11542	NC_013966	GC	3	6	557531	557536	0 %	0 %	50 %	50 %	292654096
11543	NC_013966	GAG	2	6	557578	557583	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292654096
11544	NC_013966	CGG	2	6	557588	557593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654096
11545	NC_013966	CGA	3	9	557597	557605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654096
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11547	NC_013966	GCCGAG	2	12	557649	557660	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	292654096
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11549	NC_013966	GAG	2	6	557679	557684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292654096
11550	NC_013966	GAA	2	6	557688	557693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292654096
11551	NC_013966	CGG	2	6	557717	557722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654096
11552	NC_013966	TCG	2	6	557797	557802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654096
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11554	NC_013966	CGA	2	6	557828	557833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654096
11555	NC_013966	CGC	2	6	557888	557893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654096
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11557	NC_013966	GGC	2	6	557928	557933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654096
11558	NC_013966	CGA	2	6	557975	557980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654096
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11566	NC_013966	GAC	2	6	558792	558797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654097
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11568	NC_013966	AGCG	2	8	558869	558876	25 %	0 %	50 %	25 %	292654097
11569	NC_013966	CGT	4	12	558884	558895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654097
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11600	NC_013966	CGT	2	6	560216	560221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654099
11601	NC_013966	AGC	2	6	560248	560253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654099
11602	NC_013966	AGG	2	6	560291	560296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292654099
11603	NC_013966	ACGTC	2	10	560303	560312	20 %	20 %	20 %	40 %	292654099
11604	NC_013966	GCCG	2	8	560313	560320	0 %	0 %	50 %	50 %	292654099
11605	NC_013966	GCGG	2	8	560342	560349	0 %	0 %	75 %	25 %	292654099
11606	NC_013966	TCG	2	6	560384	560389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654099
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11609	NC_013966	CCGA	2	8	560456	560463	25 %	0 %	25 %	50 %	292654099
11610	NC_013966	GAG	2	6	560472	560477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292654099
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11612	NC_013966	CGA	2	6	560543	560548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654099
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11614	NC_013966	GTC	2	6	560574	560579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654099
11615	NC_013966	GGC	2	6	560593	560598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654099
11616	NC_013966	CGA	2	6	560708	560713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654099
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11618	NC_013966	GTA	2	6	560829	560834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292654099
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11854	NC_013966	CCG	2	6	567963	567968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654104
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