MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloferax volcanii DS2 plasmid pHV4

Total Repeats: 13672

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11002	NC_013966	ACC	2	6	537627	537632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292654078
11003	NC_013966	CGG	2	6	537643	537648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654078
11004	NC_013966	GGCG	2	8	537662	537669	0 %	0 %	75 %	25 %	292654078
11005	NC_013966	GAC	2	6	537693	537698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654078
11006	NC_013966	GAC	2	6	537710	537715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654078
11007	NC_013966	CGGCCT	2	12	537731	537742	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	292654078
11008	NC_013966	CGG	2	6	537841	537846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654078
11009	NC_013966	GAG	2	6	537867	537872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292654078
11010	NC_013966	GTC	3	9	537876	537884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654078
11011	NC_013966	CGA	2	6	537887	537892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654078
11012	NC_013966	CTC	2	6	537903	537908	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292654078
11013	NC_013966	GAG	2	6	537924	537929	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292654078
11014	NC_013966	CGG	2	6	538200	538205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654079
11015	NC_013966	GCGTCG	2	12	538209	538220	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	292654079
11016	NC_013966	GTC	2	6	538223	538228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654079
11017	NC_013966	GCC	4	12	538241	538252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654079
11018	NC_013966	GTC	2	6	538272	538277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654079
11019	NC_013966	GTC	2	6	538296	538301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654079
11020	NC_013966	CGA	2	6	538324	538329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654079
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11022	NC_013966	CCG	2	6	538382	538387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654079
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11024	NC_013966	GCC	2	6	538451	538456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654079
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11027	NC_013966	CGA	2	6	538504	538509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654079
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11031	NC_013966	GCC	3	9	538613	538621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654079
11032	NC_013966	GTA	2	6	538631	538636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292654079
11033	NC_013966	CCG	2	6	538653	538658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654079
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11035	NC_013966	GCTG	2	8	538762	538769	0 %	25 %	50 %	25 %	292654079
11036	NC_013966	GCC	2	6	538781	538786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654079
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11039	NC_013966	GAG	2	6	538814	538819	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292654079
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11043	NC_013966	GCCGT	2	10	538965	538974	0 %	20 %	40 %	40 %	292654079
11044	NC_013966	GTC	3	9	539030	539038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654079
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11051	NC_013966	CGC	2	6	539216	539221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654079
11052	NC_013966	GC	3	6	539227	539232	0 %	0 %	50 %	50 %	292654079
11053	NC_013966	CGGCG	2	10	539239	539248	0 %	0 %	60 %	40 %	292654079
11054	NC_013966	GAG	3	9	539273	539281	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292654079
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11229	NC_013966	CG	3	6	546340	546345	0 %	0 %	50 %	50 %	292654086
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11234	NC_013966	CG	3	6	546494	546499	0 %	0 %	50 %	50 %	292654086
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11237	NC_013966	ACG	2	6	546541	546546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654086
11238	NC_013966	GCG	2	6	546555	546560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654086
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11354	NC_013966	GTC	2	6	551297	551302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654093
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11356	NC_013966	GTC	2	6	551327	551332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654093
11357	NC_013966	TCG	2	6	551350	551355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654093
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11471	NC_013966	CGC	2	6	555258	555263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654094
11472	NC_013966	GCC	2	6	555275	555280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654094
11473	NC_013966	CGA	2	6	555339	555344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654094
11474	NC_013966	GTA	2	6	555361	555366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292654094
11475	NC_013966	TTC	2	6	555407	555412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292654094
11476	NC_013966	GAC	2	6	555610	555615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654095
11477	NC_013966	CTC	2	6	555623	555628	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292654095
11478	NC_013966	CGC	2	6	555667	555672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654095
11479	NC_013966	CGA	2	6	555691	555696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654095
11480	NC_013966	GTCG	2	8	555706	555713	0 %	25 %	50 %	25 %	292654095
11481	NC_013966	CAA	2	6	555739	555744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	292654095
11482	NC_013966	CCG	2	6	555762	555767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654095
11483	NC_013966	CG	3	6	555820	555825	0 %	0 %	50 %	50 %	292654095
11484	NC_013966	CGA	2	6	555834	555839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654095
11485	NC_013966	GTC	2	6	555893	555898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654095
11486	NC_013966	CGGC	2	8	555909	555916	0 %	0 %	50 %	50 %	292654095
11487	NC_013966	ACT	2	6	555933	555938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292654095
11488	NC_013966	GGA	2	6	555952	555957	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292654095
11489	NC_013966	GGC	2	6	555967	555972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654095
11490	NC_013966	GCGA	2	8	555995	556002	25 %	0 %	50 %	25 %	292654095
11491	NC_013966	GTC	2	6	556013	556018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654095
11492	NC_013966	CCGC	2	8	556083	556090	0 %	0 %	25 %	75 %	292654095
11493	NC_013966	CCGACG	2	12	556095	556106	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	292654095
11494	NC_013966	TCC	2	6	556107	556112	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292654095
11495	NC_013966	GCG	3	9	556131	556139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654095
11496	NC_013966	CTG	2	6	556151	556156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654095
11497	NC_013966	CTC	2	6	556169	556174	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292654095
11498	NC_013966	CGT	2	6	556195	556200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654095
11499	NC_013966	TCA	2	6	556209	556214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292654095
11500	NC_013966	CCT	2	6	556237	556242	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292654095

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