MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloferax volcanii DS2 plasmid pHV4

Total Repeats: 13672

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_013966	GGC	2	6	520124	520129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654059
10502	NC_013966	CAG	2	6	520134	520139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654059
10503	NC_013966	ACG	2	6	520153	520158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654059
10504	NC_013966	GAG	2	6	520161	520166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292654059
10505	NC_013966	AGT	2	6	520169	520174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292654059
10506	NC_013966	GAC	2	6	520179	520184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654059
10507	NC_013966	GCC	2	6	520185	520190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654059
10508	NC_013966	GCC	2	6	520290	520295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654059
10509	NC_013966	GAA	2	6	520359	520364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292654059
10510	NC_013966	GACGGC	3	18	520419	520436	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	292654059
10511	NC_013966	CGA	2	6	520442	520447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654059
10512	NC_013966	CGAG	2	8	520520	520527	25 %	0 %	50 %	25 %	292654059
10513	NC_013966	GAG	2	6	520596	520601	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292654059
10514	NC_013966	GAC	2	6	520644	520649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654059
10515	NC_013966	GAG	2	6	520650	520655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292654059
10516	NC_013966	CG	3	6	520683	520688	0 %	0 %	50 %	50 %	292654059
10517	NC_013966	CGC	3	9	520706	520714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654059
10518	NC_013966	GGA	2	6	520724	520729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292654059
10519	NC_013966	GC	3	6	520730	520735	0 %	0 %	50 %	50 %	292654059
10520	NC_013966	CGT	2	6	520736	520741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654059
10521	NC_013966	GGT	2	6	520742	520747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292654059
10522	NC_013966	GAC	2	6	520788	520793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654059
10523	NC_013966	CGA	2	6	520874	520879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654059
10524	NC_013966	CCG	2	6	520885	520890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654059
10525	NC_013966	GCC	2	6	520917	520922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654059
10526	NC_013966	ACG	2	6	520927	520932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654059
10527	NC_013966	GAT	2	6	520947	520952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292654059
10528	NC_013966	TCG	2	6	520967	520972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654059
10529	NC_013966	GCGCC	2	10	521021	521030	0 %	0 %	40 %	60 %	292654059
10530	NC_013966	GTA	2	6	521049	521054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292654059
10531	NC_013966	GTCGAT	2	12	521058	521069	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	292654059
10532	NC_013966	ATC	2	6	521116	521121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292654059
10533	NC_013966	AGCGCC	2	12	521158	521169	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	292654059
10534	NC_013966	GAT	2	6	521181	521186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292654059
10535	NC_013966	AGT	2	6	521204	521209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292654059
10536	NC_013966	TGA	2	6	521288	521293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292654059
10537	NC_013966	AGG	2	6	521326	521331	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292654059
10538	NC_013966	CGA	2	6	521393	521398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654059
10539	NC_013966	CGA	2	6	521402	521407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654059
10540	NC_013966	CGA	3	9	521417	521425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654059
10541	NC_013966	CGC	2	6	521444	521449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654059
10542	NC_013966	TGA	2	6	521516	521521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292654059
10543	NC_013966	TCG	2	6	521648	521653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654060
10544	NC_013966	CGG	2	6	521660	521665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654060
10545	NC_013966	CGGT	2	8	521681	521688	0 %	25 %	50 %	25 %	292654060
10546	NC_013966	GTA	2	6	521701	521706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292654060
10547	NC_013966	GTC	2	6	521728	521733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654060
10548	NC_013966	CGT	2	6	521772	521777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654060
10549	NC_013966	TCG	2	6	521822	521827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654060
10550	NC_013966	TCG	2	6	521843	521848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654060
10551	NC_013966	GAGGTA	2	12	521878	521889	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	292654060
10552	NC_013966	TC	3	6	521894	521899	0 %	50 %	0 %	50 %	292654060
10553	NC_013966	CGA	2	6	521931	521936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654060
10554	NC_013966	GGA	2	6	521946	521951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292654060
10555	NC_013966	CGA	2	6	522040	522045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654060
10556	NC_013966	GC	3	6	522048	522053	0 %	0 %	50 %	50 %	292654060
10557	NC_013966	CCG	2	6	522063	522068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654060
10558	NC_013966	GCC	2	6	522074	522079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654060
10559	NC_013966	GCCGC	2	10	522098	522107	0 %	0 %	40 %	60 %	292654060
10560	NC_013966	CGT	2	6	522123	522128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654060
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10564	NC_013966	CGC	2	6	522349	522354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654060
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10567	NC_013966	CGAC	2	8	522414	522421	25 %	0 %	25 %	50 %	292654060
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10570	NC_013966	CGT	2	6	522522	522527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654060
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10572	NC_013966	TCG	2	6	522554	522559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654060
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10581	NC_013966	GC	3	6	522775	522780	0 %	0 %	50 %	50 %	292654061
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10599	NC_013966	GAC	2	6	523620	523625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654063
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10602	NC_013966	CGC	2	6	523734	523739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654063
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10612	NC_013966	CGA	2	6	524001	524006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654064
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10615	NC_013966	CGG	2	6	524141	524146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654064
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10617	NC_013966	TCG	2	6	524174	524179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654064
10618	NC_013966	GAC	2	6	524188	524193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654064
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10620	NC_013966	CGC	2	6	524223	524228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654064
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10973	NC_013966	CGT	2	6	536368	536373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654077
10974	NC_013966	GTC	2	6	536387	536392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654077
10975	NC_013966	GGA	2	6	536443	536448	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292654077
10976	NC_013966	GAC	2	6	536462	536467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654077
10977	NC_013966	TCG	2	6	536523	536528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654077
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10980	NC_013966	CTC	2	6	536823	536828	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292654078
10981	NC_013966	CGA	2	6	536831	536836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654078
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10983	NC_013966	ACT	2	6	536893	536898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292654078
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10986	NC_013966	CCG	2	6	536938	536943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654078
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10988	NC_013966	CGT	2	6	537080	537085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654078
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10992	NC_013966	CGGC	2	8	537186	537193	0 %	0 %	50 %	50 %	292654078
10993	NC_013966	GCG	2	6	537201	537206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654078
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11000	NC_013966	CCGA	2	8	537546	537553	25 %	0 %	25 %	50 %	292654078

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