MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloferax volcanii DS2 plasmid pHV4

Total Repeats: 13672

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_013966	CGT	2	6	319139	319144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653864
6502	NC_013966	GAA	2	6	319167	319172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292653864
6503	NC_013966	GCC	2	6	319185	319190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292653864
6504	NC_013966	GAA	2	6	319197	319202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292653864
6505	NC_013966	CGGCG	2	10	319209	319218	0 %	0 %	60 %	40 %	292653864
6506	NC_013966	CGGT	2	8	319285	319292	0 %	25 %	50 %	25 %	292653864
6507	NC_013966	GAC	2	6	319329	319334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653864
6508	NC_013966	GTC	2	6	319353	319358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653864
6509	NC_013966	GTC	2	6	319410	319415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653864
6510	NC_013966	CGG	2	6	319460	319465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653864
6511	NC_013966	CGT	2	6	319484	319489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653864
6512	NC_013966	GCC	2	6	319549	319554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292653864
6513	NC_013966	GA	3	6	319588	319593	50 %	0 %	50 %	0 %	292653864
6514	NC_013966	CGC	2	6	319614	319619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292653864
6515	NC_013966	CGA	2	6	319625	319630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653864
6516	NC_013966	TCG	2	6	319645	319650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653864
6517	NC_013966	CGA	2	6	319664	319669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653864
6518	NC_013966	GGC	2	6	319758	319763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653864
6519	NC_013966	GAC	2	6	319764	319769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653864
6520	NC_013966	CGC	2	6	319784	319789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292653864
6521	NC_013966	GCG	2	6	319816	319821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653864
6522	NC_013966	CGA	2	6	319859	319864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653864
6523	NC_013966	CGT	2	6	319883	319888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653864
6524	NC_013966	CGA	2	6	319892	319897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653864
6525	NC_013966	GAC	2	6	319935	319940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653864
6526	NC_013966	TCG	2	6	319960	319965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653864
6527	NC_013966	TCT	2	6	320000	320005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292653864
6528	NC_013966	ATC	2	6	320068	320073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292653864
6529	NC_013966	CCG	2	6	320126	320131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292653864
6530	NC_013966	TCG	2	6	320134	320139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653864
6531	NC_013966	GCG	2	6	320149	320154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653864
6532	NC_013966	CAT	2	6	320175	320180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292653864
6533	NC_013966	TCG	2	6	320242	320247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653864
6534	NC_013966	GTC	2	6	320286	320291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653864
6535	NC_013966	CGC	2	6	320373	320378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292653864
6536	NC_013966	CGT	2	6	320396	320401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653864
6537	NC_013966	CCG	2	6	320408	320413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292653864
6538	NC_013966	CGACG	2	10	320430	320439	20 %	0 %	40 %	40 %	292653864
6539	NC_013966	TC	3	6	320443	320448	0 %	50 %	0 %	50 %	292653864
6540	NC_013966	CCCG	2	8	320468	320475	0 %	0 %	25 %	75 %	292653864
6541	NC_013966	TCG	2	6	320476	320481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653864
6542	NC_013966	TCT	2	6	320542	320547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292653864
6543	NC_013966	GCG	2	6	320743	320748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653865
6544	NC_013966	CAC	2	6	320861	320866	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292653865
6545	NC_013966	GAA	2	6	320955	320960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292653865
6546	NC_013966	GGC	2	6	320972	320977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653865
6547	NC_013966	AAG	2	6	321024	321029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292653865
6548	NC_013966	TC	3	6	321053	321058	0 %	50 %	0 %	50 %	292653865
6549	NC_013966	TTC	2	6	321066	321071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292653865
6550	NC_013966	GGC	2	6	321098	321103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653865
6551	NC_013966	GTC	2	6	321141	321146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653865
6552	NC_013966	TCGT	2	8	321155	321162	0 %	50 %	25 %	25 %	292653865
6553	NC_013966	CCG	2	6	321206	321211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292653865
6554	NC_013966	CCG	2	6	321217	321222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292653865
6555	NC_013966	CGA	2	6	321308	321313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653865
6556	NC_013966	CTCGAA	2	12	321318	321329	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	292653865
6557	NC_013966	TCG	2	6	321364	321369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653865
6558	NC_013966	GCT	2	6	321443	321448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653865
6559	NC_013966	CGA	2	6	321455	321460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653865
6560	NC_013966	CGGA	2	8	321476	321483	25 %	0 %	50 %	25 %	292653865
6561	NC_013966	CAT	2	6	321527	321532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292653865
6562	NC_013966	GAG	2	6	321612	321617	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292653865
6563	NC_013966	GCC	2	6	321657	321662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292653865
6564	NC_013966	CGC	2	6	321665	321670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292653865
6565	NC_013966	GAG	2	6	321756	321761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292653865
6566	NC_013966	CGG	2	6	321766	321771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653865
6567	NC_013966	CG	3	6	321793	321798	0 %	0 %	50 %	50 %	292653865
6568	NC_013966	CGCGC	2	10	321829	321838	0 %	0 %	40 %	60 %	292653865
6569	NC_013966	CGA	2	6	321839	321844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653865
6570	NC_013966	CGT	2	6	321893	321898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653865
6571	NC_013966	CGA	2	6	321899	321904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653865
6572	NC_013966	TCA	2	6	321961	321966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292653865
6573	NC_013966	CGGT	2	8	322125	322132	0 %	25 %	50 %	25 %	292653866
6574	NC_013966	CAA	2	6	322253	322258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	292653866
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6576	NC_013966	GTG	2	6	322270	322275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292653866
6577	NC_013966	CGA	2	6	322373	322378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653866
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6579	NC_013966	TAC	2	6	322422	322427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292653866
6580	NC_013966	TCG	2	6	322447	322452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653866
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6584	NC_013966	CCT	2	6	322531	322536	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292653866
6585	NC_013966	GAG	2	6	322593	322598	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292653866
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6587	NC_013966	TCA	2	6	322612	322617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292653866
6588	NC_013966	ACG	2	6	322627	322632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653866
6589	NC_013966	GAA	2	6	322948	322953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292653867
6590	NC_013966	ACT	2	6	323004	323009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292653867
6591	NC_013966	CCT	2	6	323017	323022	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292653867
6592	NC_013966	CCA	2	6	324130	324135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292653868
6593	NC_013966	GGA	2	6	324268	324273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292653868
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6595	NC_013966	CGG	2	6	324290	324295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653868
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6597	NC_013966	CAAGCG	2	12	324355	324366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653868
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6600	NC_013966	GTCG	2	8	324440	324447	0 %	25 %	50 %	25 %	292653868
6601	NC_013966	GCGA	2	8	324471	324478	25 %	0 %	50 %	25 %	292653868
6602	NC_013966	GCG	2	6	324493	324498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653868
6603	NC_013966	GA	3	6	324579	324584	50 %	0 %	50 %	0 %	292653868
6604	NC_013966	CTC	2	6	324602	324607	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292653868
6605	NC_013966	GCT	2	6	324625	324630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653868
6606	NC_013966	GAG	2	6	324644	324649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292653868
6607	NC_013966	GAC	2	6	324773	324778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653868
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6609	NC_013966	GA	3	6	324792	324797	50 %	0 %	50 %	0 %	292653868
6610	NC_013966	CCG	2	6	324808	324813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292653868
6611	NC_013966	TCGT	2	8	324873	324880	0 %	50 %	25 %	25 %	292653868
6612	NC_013966	CGC	2	6	324965	324970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292653869
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6615	NC_013966	CGC	2	6	325080	325085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292653869
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6617	NC_013966	GAG	2	6	325158	325163	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292653869
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6981	NC_013966	CTC	2	6	343349	343354	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292653890
6982	NC_013966	CTC	2	6	343405	343410	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292653890
6983	NC_013966	GACA	2	8	343490	343497	50 %	0 %	25 %	25 %	292653890
6984	NC_013966	GAC	2	6	343508	343513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653890
6985	NC_013966	CGC	2	6	343525	343530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292653890
6986	NC_013966	CGA	3	9	343540	343548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653890
6987	NC_013966	CTC	2	6	343584	343589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292653890
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6993	NC_013966	CG	4	8	344917	344924	0 %	0 %	50 %	50 %	292653891
6994	NC_013966	CTG	2	6	344963	344968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653891
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