MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloferax volcanii DS2 plasmid pHV4

Total Repeats: 13672

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_013966	ACG	2	6	274894	274899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653827
5502	NC_013966	GAC	2	6	274908	274913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653827
5503	NC_013966	GAC	2	6	274917	274922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653827
5504	NC_013966	ATG	2	6	274950	274955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292653827
5505	NC_013966	GGT	2	6	274982	274987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292653827
5506	NC_013966	ACCCGA	2	12	275038	275049	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	292653827
5507	NC_013966	CGA	2	6	275053	275058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653827
5508	NC_013966	ACT	2	6	275083	275088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292653827
5509	NC_013966	CGT	2	6	275135	275140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653827
5510	NC_013966	CGG	2	6	275141	275146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653827
5511	NC_013966	CAC	2	6	275153	275158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292653827
5512	NC_013966	GA	3	6	275164	275169	50 %	0 %	50 %	0 %	292653827
5513	NC_013966	CGGA	2	8	275226	275233	25 %	0 %	50 %	25 %	292653827
5514	NC_013966	CGA	2	6	275273	275278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653827
5515	NC_013966	CGA	2	6	275366	275371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653827
5516	NC_013966	TGCGAG	2	12	275388	275399	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	292653827
5517	NC_013966	GGC	2	6	275499	275504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653827
5518	NC_013966	CGA	2	6	275573	275578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653827
5519	NC_013966	CGA	3	9	275665	275673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653827
5520	NC_013966	ACG	2	6	275680	275685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653827
5521	NC_013966	CGA	2	6	275702	275707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653827
5522	NC_013966	GGAC	2	8	275736	275743	25 %	0 %	50 %	25 %	292653827
5523	NC_013966	TCG	3	9	275786	275794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653828
5524	NC_013966	GCG	2	6	275795	275800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653828
5525	NC_013966	GCC	2	6	275830	275835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292653828
5526	NC_013966	AAG	2	6	275869	275874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292653828
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5528	NC_013966	CGG	2	6	275936	275941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653828
5529	NC_013966	GC	3	6	275970	275975	0 %	0 %	50 %	50 %	292653828
5530	NC_013966	GCGGT	2	10	275986	275995	0 %	20 %	60 %	20 %	292653828
5531	NC_013966	GACC	2	8	276029	276036	25 %	0 %	25 %	50 %	292653828
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5534	NC_013966	ACC	2	6	276062	276067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292653828
5535	NC_013966	CTCG	2	8	276072	276079	0 %	25 %	25 %	50 %	292653828
5536	NC_013966	GAC	2	6	276118	276123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653828
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5539	NC_013966	CG	3	6	276215	276220	0 %	0 %	50 %	50 %	292653828
5540	NC_013966	GCGA	2	8	276238	276245	25 %	0 %	50 %	25 %	292653828
5541	NC_013966	CGAC	2	8	276246	276253	25 %	0 %	25 %	50 %	292653828
5542	NC_013966	TCG	3	9	276260	276268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653828
5543	NC_013966	GAG	2	6	276370	276375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292653828
5544	NC_013966	ACG	2	6	276422	276427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653828
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5546	NC_013966	CG	3	6	276490	276495	0 %	0 %	50 %	50 %	292653828
5547	NC_013966	CGA	2	6	276525	276530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653828
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5550	NC_013966	GGA	2	6	276627	276632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292653828
5551	NC_013966	ACG	2	6	276641	276646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653828
5552	NC_013966	CGT	2	6	276687	276692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653828
5553	NC_013966	TCGT	2	8	276778	276785	0 %	50 %	25 %	25 %	292653828
5554	NC_013966	GGC	2	6	276796	276801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653828
5555	NC_013966	TCG	2	6	276803	276808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653828
5556	NC_013966	CGG	2	6	276833	276838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653828
5557	NC_013966	AG	3	6	276841	276846	50 %	0 %	50 %	0 %	292653828
5558	NC_013966	GAC	2	6	276901	276906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653828
5559	NC_013966	CGC	2	6	276969	276974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292653828
5560	NC_013966	CGC	2	6	277005	277010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292653828
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5567	NC_013966	CGAAT	2	10	277217	277226	40 %	20 %	20 %	20 %	292653829
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5619	NC_013966	CGA	2	6	279792	279797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653831
5620	NC_013966	GTC	2	6	279805	279810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653831
5621	NC_013966	CGGAGA	2	12	279812	279823	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	292653831
5622	NC_013966	GCG	2	6	279887	279892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653831
5623	NC_013966	CGT	2	6	279987	279992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653831
5624	NC_013966	GGC	2	6	280023	280028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653831
5625	NC_013966	CG	3	6	280063	280068	0 %	0 %	50 %	50 %	292653831
5626	NC_013966	CG	3	6	280237	280242	0 %	0 %	50 %	50 %	292653832
5627	NC_013966	GACC	2	8	280334	280341	25 %	0 %	25 %	50 %	292653832
5628	NC_013966	CGA	2	6	280384	280389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653832
5629	NC_013966	GAC	2	6	280407	280412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653832
5630	NC_013966	CGT	2	6	280415	280420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653832
5631	NC_013966	GAG	2	6	280425	280430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292653832
5632	NC_013966	TCG	2	6	280543	280548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653832
5633	NC_013966	ACGT	2	8	280599	280606	25 %	25 %	25 %	25 %	292653832
5634	NC_013966	CGG	2	6	280613	280618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653832
5635	NC_013966	ACGG	2	8	280633	280640	25 %	0 %	50 %	25 %	292653832
5636	NC_013966	ACG	2	6	280654	280659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653832
5637	NC_013966	TCG	2	6	280681	280686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653832
5638	NC_013966	CCG	2	6	280769	280774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292653832
5639	NC_013966	CGA	2	6	280841	280846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653832
5640	NC_013966	CAC	2	6	280881	280886	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292653832
5641	NC_013966	GAG	2	6	280980	280985	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292653832
5642	NC_013966	GGC	2	6	281003	281008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653832
5643	NC_013966	GCG	2	6	281027	281032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653832
5644	NC_013966	GTCA	2	8	281175	281182	25 %	25 %	25 %	25 %	292653833
5645	NC_013966	GGC	2	6	281187	281192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653833
5646	NC_013966	CGA	2	6	281236	281241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653833
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5648	NC_013966	AGA	2	6	281302	281307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292653833
5649	NC_013966	GC	3	6	281332	281337	0 %	0 %	50 %	50 %	292653833
5650	NC_013966	CGA	2	6	281359	281364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653833
5651	NC_013966	ACC	2	6	281367	281372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292653833
5652	NC_013966	CCG	2	6	281395	281400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292653833
5653	NC_013966	CCG	2	6	281425	281430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292653833
5654	NC_013966	TGG	2	6	281451	281456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292653833
5655	NC_013966	CTG	2	6	281609	281614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653833
5656	NC_013966	CGA	2	6	281629	281634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653833
5657	NC_013966	CGC	2	6	281645	281650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292653833
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5666	NC_013966	GAC	2	6	281798	281803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653833
5667	NC_013966	CGGCG	2	10	281825	281834	0 %	0 %	60 %	40 %	292653833
5668	NC_013966	CGA	2	6	281887	281892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653833
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5674	NC_013966	GC	3	6	282067	282072	0 %	0 %	50 %	50 %	292653833
5675	NC_013966	CCG	2	6	282180	282185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292653833
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5680	NC_013966	ATC	2	6	282255	282260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292653833
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5684	NC_013966	CGT	2	6	282407	282412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653834
5685	NC_013966	CTG	2	6	282426	282431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653834
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5692	NC_013966	CGC	4	12	282629	282640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292653834
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5696	NC_013966	CG	3	6	282772	282777	0 %	0 %	50 %	50 %	292653834
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5732	NC_013966	CGAC	2	8	285289	285296	25 %	0 %	25 %	50 %	292653835
5733	NC_013966	TCG	2	6	285306	285311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653835
5734	NC_013966	GTTCG	2	10	285317	285326	0 %	40 %	40 %	20 %	292653835
5735	NC_013966	GAC	2	6	285416	285421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653835
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5738	NC_013966	TCG	2	6	285609	285614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653835
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5740	NC_013966	TCG	2	6	285639	285644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653835
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5861	NC_013966	CGA	3	9	292628	292636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653841
5862	NC_013966	CGT	2	6	292646	292651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653841
5863	NC_013966	TCG	2	6	292734	292739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653841
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5865	NC_013966	CGA	2	6	292982	292987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653841
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5933	NC_013966	ACT	2	6	295973	295978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292653844
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5973	NC_013966	CGA	2	6	297815	297820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653846
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5981	NC_013966	GGCT	2	8	298140	298147	0 %	25 %	50 %	25 %	292653846
5982	NC_013966	TCA	2	6	298231	298236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292653846
5983	NC_013966	CGT	2	6	298247	298252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653846
5984	NC_013966	CGG	2	6	298259	298264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653846
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5986	NC_013966	CGT	2	6	298285	298290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653846
5987	NC_013966	TCA	2	6	298291	298296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292653846
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5989	NC_013966	ACG	2	6	298328	298333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653846
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