MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloferax volcanii DS2 plasmid pHV4

Total Repeats: 13672

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_013966	CGA	2	6	223168	223173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653777
4502	NC_013966	CGAG	2	8	223186	223193	25 %	0 %	50 %	25 %	292653777
4503	NC_013966	GGC	2	6	223194	223199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653777
4504	NC_013966	GC	3	6	223232	223237	0 %	0 %	50 %	50 %	292653777
4505	NC_013966	CGC	2	6	223316	223321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292653777
4506	NC_013966	CG	3	6	223365	223370	0 %	0 %	50 %	50 %	292653777
4507	NC_013966	CGC	3	9	223382	223390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292653777
4508	NC_013966	ACG	2	6	223422	223427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653777
4509	NC_013966	CGC	2	6	223435	223440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292653777
4510	NC_013966	CCA	2	6	223460	223465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292653777
4511	NC_013966	CTA	2	6	223544	223549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292653777
4512	NC_013966	AGC	2	6	223567	223572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653777
4513	NC_013966	GAA	2	6	223611	223616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292653777
4514	NC_013966	TC	3	6	223631	223636	0 %	50 %	0 %	50 %	292653777
4515	NC_013966	CCG	2	6	223731	223736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292653778
4516	NC_013966	CGG	2	6	223750	223755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653778
4517	NC_013966	CG	3	6	223772	223777	0 %	0 %	50 %	50 %	292653778
4518	NC_013966	CGT	2	6	223780	223785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653778
4519	NC_013966	AACC	2	8	223804	223811	50 %	0 %	0 %	50 %	292653778
4520	NC_013966	CG	3	6	223813	223818	0 %	0 %	50 %	50 %	292653778
4521	NC_013966	GACGCG	2	12	223862	223873	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	292653778
4522	NC_013966	CGC	2	6	223879	223884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292653778
4523	NC_013966	CGC	2	6	223891	223896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292653778
4524	NC_013966	GAG	2	6	223925	223930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292653778
4525	NC_013966	GTCG	2	8	223984	223991	0 %	25 %	50 %	25 %	292653778
4526	NC_013966	TCG	2	6	224025	224030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653778
4527	NC_013966	TCG	2	6	224040	224045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653778
4528	NC_013966	TCGGCG	2	12	224052	224063	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	292653778
4529	NC_013966	GGA	2	6	224083	224088	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292653778
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4533	NC_013966	CGC	2	6	224205	224210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292653778
4534	NC_013966	CGT	2	6	224233	224238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653778
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4540	NC_013966	GTG	2	6	224540	224545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292653778
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4552	NC_013966	GGC	2	6	224986	224991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653779
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4555	NC_013966	ACC	2	6	225079	225084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292653779
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4561	NC_013966	TCG	4	12	225224	225235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653779
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4570	NC_013966	CGA	2	6	225567	225572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653779
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4572	NC_013966	CGG	2	6	225654	225659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653779
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4621	NC_013966	CGT	2	6	226897	226902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653780
4622	NC_013966	GTC	2	6	226914	226919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653780
4623	NC_013966	CGT	2	6	226994	226999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653780
4624	NC_013966	CGG	2	6	227072	227077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653780
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4626	NC_013966	CGA	2	6	227126	227131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653780
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4633	NC_013966	GTCT	2	8	227404	227411	0 %	50 %	25 %	25 %	292653781
4634	NC_013966	ACG	2	6	227417	227422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653781
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4640	NC_013966	TCG	2	6	227569	227574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653781
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4642	NC_013966	G	8	8	227713	227720	0 %	0 %	100 %	0 %	292653781
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4645	NC_013966	CG	3	6	227786	227791	0 %	0 %	50 %	50 %	292653781
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4736	NC_013966	GC	3	6	230998	231003	0 %	0 %	50 %	50 %	292653784
4737	NC_013966	GCC	2	6	231037	231042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292653784
4738	NC_013966	TCC	2	6	231112	231117	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292653784
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4740	NC_013966	CGA	2	6	231246	231251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653785
4741	NC_013966	CGC	2	6	231309	231314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292653785
4742	NC_013966	CGA	2	6	231318	231323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653785
4743	NC_013966	CCG	2	6	231399	231404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292653785
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4745	NC_013966	CGC	3	9	231431	231439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292653785
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4860	NC_013966	CCG	2	6	235799	235804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292653791
4861	NC_013966	AGG	2	6	235831	235836	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292653791
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4863	NC_013966	CCGT	2	8	235858	235865	0 %	25 %	25 %	50 %	292653791
4864	NC_013966	GACC	2	8	235878	235885	25 %	0 %	25 %	50 %	292653791
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4980	NC_013966	TAG	2	6	241632	241637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292653798
4981	NC_013966	TG	3	6	241687	241692	0 %	50 %	50 %	0 %	292653798
4982	NC_013966	GCGA	2	8	241800	241807	25 %	0 %	50 %	25 %	292653798
4983	NC_013966	CGA	2	6	241835	241840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653798
4984	NC_013966	GCG	2	6	241851	241856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653798
4985	NC_013966	TCA	3	9	241915	241923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292653798
4986	NC_013966	ATG	2	6	241938	241943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292653798
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4989	NC_013966	CAG	2	6	242018	242023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653798
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4991	NC_013966	GC	3	6	242065	242070	0 %	0 %	50 %	50 %	292653798
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4993	NC_013966	TTC	2	6	242297	242302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292653798
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