MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloferax volcanii DS2 plasmid pHV3

Total Repeats: 10778

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_013964	TCG	2	6	59021	59026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292493989
1502	NC_013964	ACC	2	6	59033	59038	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292493989
1503	NC_013964	CGT	2	6	59049	59054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292493989
1504	NC_013964	GAC	2	6	59056	59061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292493989
1505	NC_013964	GTC	2	6	59108	59113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292493989
1506	NC_013964	GTC	2	6	59137	59142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292493989
1507	NC_013964	CGT	2	6	59160	59165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292493989
1508	NC_013964	CGC	2	6	59232	59237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292493989
1509	NC_013964	CGA	2	6	59265	59270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292493989
1510	NC_013964	CTC	2	6	59278	59283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292493989
1511	NC_013964	GTC	2	6	59299	59304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292493989
1512	NC_013964	GCA	2	6	59409	59414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292493989
1513	NC_013964	CGC	2	6	59424	59429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292493989
1514	NC_013964	GC	3	6	59436	59441	0 %	0 %	50 %	50 %	292493989
1515	NC_013964	GCC	2	6	59446	59451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292493989
1516	NC_013964	CGG	2	6	59481	59486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292493989
1517	NC_013964	TCG	2	6	59531	59536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292493989
1518	NC_013964	GTC	2	6	59563	59568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292493989
1519	NC_013964	GC	3	6	59571	59576	0 %	0 %	50 %	50 %	292493989
1520	NC_013964	CG	3	6	59588	59593	0 %	0 %	50 %	50 %	292493989
1521	NC_013964	TCG	3	9	59639	59647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292493989
1522	NC_013964	GA	3	6	59747	59752	50 %	0 %	50 %	0 %	292493989
1523	NC_013964	GTC	3	9	59764	59772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292493989
1524	NC_013964	CGA	2	6	59877	59882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292493989
1525	NC_013964	GTCG	2	8	59895	59902	0 %	25 %	50 %	25 %	292493989
1526	NC_013964	GCGG	2	8	59906	59913	0 %	0 %	75 %	25 %	292493989
1527	NC_013964	CGT	2	6	59947	59952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292493989
1528	NC_013964	CGA	2	6	59985	59990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292493989
1529	NC_013964	TCG	2	6	59993	59998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292493989
1530	NC_013964	TCG	2	6	60014	60019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292493989
1531	NC_013964	CCGCG	2	10	60036	60045	0 %	0 %	40 %	60 %	292493989
1532	NC_013964	CGT	2	6	60057	60062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292493989
1533	NC_013964	CGAGGT	2	12	60081	60092	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	292493989
1534	NC_013964	CGA	2	6	60105	60110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292493989
1535	NC_013964	CGC	2	6	60129	60134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292493989
1536	NC_013964	GGGC	2	8	60140	60147	0 %	0 %	75 %	25 %	292493989
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1541	NC_013964	GCG	2	6	60477	60482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292493989
1542	NC_013964	CG	3	6	60531	60536	0 %	0 %	50 %	50 %	292493989
1543	NC_013964	CGG	2	6	60598	60603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292493989
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1549	NC_013964	GAGGT	2	10	60749	60758	20 %	20 %	60 %	0 %	292493989
1550	NC_013964	CGT	2	6	60879	60884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292493989
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1552	NC_013964	GGA	2	6	60903	60908	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292493989
1553	NC_013964	TTC	2	6	60920	60925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292493989
1554	NC_013964	TCG	2	6	60926	60931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292493989
1555	NC_013964	GGCG	2	8	60969	60976	0 %	0 %	75 %	25 %	292493989
1556	NC_013964	GC	3	6	61017	61022	0 %	0 %	50 %	50 %	292493989
1557	NC_013964	CGCC	2	8	61029	61036	0 %	0 %	25 %	75 %	292493989
1558	NC_013964	GGGT	2	8	61067	61074	0 %	25 %	75 %	0 %	292493989
1559	NC_013964	CGAC	2	8	61104	61111	25 %	0 %	25 %	50 %	292493989
1560	NC_013964	CGG	2	6	61227	61232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292493989
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1563	NC_013964	GAC	2	6	61297	61302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292493989
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1569	NC_013964	TCG	2	6	61538	61543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292493989
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1571	NC_013964	GTC	2	6	61600	61605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292493989
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1583	NC_013964	GAC	2	6	61927	61932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292493989
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1612	NC_013964	GCCG	2	8	63019	63026	0 %	0 %	50 %	50 %	292493990
1613	NC_013964	CGA	3	9	63029	63037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292493990
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1624	NC_013964	CGACGC	2	12	63218	63229	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	292493990
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1992	NC_013964	AACGA	2	10	75475	75484	60 %	0 %	20 %	20 %	292494006
1993	NC_013964	CGA	3	9	75482	75490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494006
1994	NC_013964	CCG	2	6	75517	75522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494006
1995	NC_013964	GAC	2	6	75528	75533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494006
1996	NC_013964	GCC	2	6	75579	75584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494006
1997	NC_013964	GTC	2	6	75618	75623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494006
1998	NC_013964	TCG	2	6	75629	75634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494006
1999	NC_013964	GGCT	2	8	75683	75690	0 %	25 %	50 %	25 %	292494006
2000	NC_013964	GGCC	2	8	75731	75738	0 %	0 %	50 %	50 %	292494006

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