MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloferax volcanii DS2 plasmid pHV3

Total Repeats: 10778

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_013964	GAC	2	6	39865	39870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292493975
1002	NC_013964	CAG	2	6	39880	39885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292493975
1003	NC_013964	AAC	2	6	39919	39924	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	292493975
1004	NC_013964	TCG	2	6	39929	39934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292493975
1005	NC_013964	GAT	2	6	39954	39959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292493975
1006	NC_013964	TCG	2	6	39995	40000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292493975
1007	NC_013964	CGA	2	6	40023	40028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292493975
1008	NC_013964	CGA	2	6	40047	40052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292493975
1009	NC_013964	CGA	2	6	40056	40061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292493975
1010	NC_013964	CGA	2	6	40113	40118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292493975
1011	NC_013964	CGC	2	6	40119	40124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292493975
1012	NC_013964	CGA	2	6	40128	40133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292493975
1013	NC_013964	CGT	2	6	40158	40163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292493975
1014	NC_013964	TCC	2	6	40187	40192	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292493975
1015	NC_013964	CCG	2	6	40217	40222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292493975
1016	NC_013964	ACG	2	6	40223	40228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292493975
1017	NC_013964	CCG	2	6	40294	40299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292493975
1018	NC_013964	CA	3	6	40374	40379	50 %	0 %	0 %	50 %	292493975
1019	NC_013964	CGA	2	6	40412	40417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292493976
1020	NC_013964	CGA	2	6	40436	40441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292493976
1021	NC_013964	GCG	3	9	40444	40452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292493976
1022	NC_013964	TCG	2	6	40456	40461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292493976
1023	NC_013964	CGA	2	6	40487	40492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292493976
1024	NC_013964	TCG	2	6	40510	40515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292493976
1025	NC_013964	CGA	2	6	40537	40542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292493976
1026	NC_013964	GAT	2	6	40550	40555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292493976
1027	NC_013964	GAC	2	6	40731	40736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292493976
1028	NC_013964	GAG	2	6	40755	40760	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292493976
1029	NC_013964	CGAC	2	8	40762	40769	25 %	0 %	25 %	50 %	292493976
1030	NC_013964	GGC	2	6	40818	40823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292493976
1031	NC_013964	CAA	2	6	40827	40832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	292493976
1032	NC_013964	CG	3	6	40848	40853	0 %	0 %	50 %	50 %	292493976
1033	NC_013964	GCGG	2	8	40916	40923	0 %	0 %	75 %	25 %	292493976
1034	NC_013964	GAC	2	6	40967	40972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292493976
1035	NC_013964	CGA	2	6	41033	41038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292493976
1036	NC_013964	CAG	2	6	41049	41054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292493976
1037	NC_013964	CGC	2	6	41062	41067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292493976
1038	NC_013964	AAC	2	6	41088	41093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	292493976
1039	NC_013964	TCG	2	6	41098	41103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292493976
1040	NC_013964	CGG	2	6	41216	41221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292493976
1041	NC_013964	GCG	2	6	41273	41278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292493976
1042	NC_013964	GTC	4	12	41307	41318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292493976
1043	NC_013964	TCG	2	6	41356	41361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292493976
1044	NC_013964	ACC	2	6	41394	41399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292493976
1045	NC_013964	GAA	2	6	41492	41497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292493976
1046	NC_013964	CTC	2	6	41811	41816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292493977
1047	NC_013964	TG	3	6	41843	41848	0 %	50 %	50 %	0 %	292493977
1048	NC_013964	GTCGAG	2	12	41859	41870	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	292493977
1049	NC_013964	GTC	2	6	41925	41930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292493977
1050	NC_013964	CGA	2	6	41936	41941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292493977
1051	NC_013964	TCC	2	6	41944	41949	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292493977
1052	NC_013964	CGA	2	6	42039	42044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292493977
1053	NC_013964	GTA	2	6	42069	42074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292493977
1054	NC_013964	GCC	2	6	42114	42119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292493977
1055	NC_013964	GAT	2	6	42141	42146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292493977
1056	NC_013964	AGC	2	6	42166	42171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292493977
1057	NC_013964	ACCG	2	8	42204	42211	25 %	0 %	25 %	50 %	292493977
1058	NC_013964	CGT	3	9	42219	42227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292493977
1059	NC_013964	CGT	2	6	42251	42256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292493977
1060	NC_013964	CGG	2	6	42264	42269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292493977
1061	NC_013964	CCA	2	6	42285	42290	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292493977
1062	NC_013964	CGT	2	6	42293	42298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292493977
1063	NC_013964	CCG	2	6	42334	42339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292493977
1064	NC_013964	CG	3	6	42372	42377	0 %	0 %	50 %	50 %	292493977
1065	NC_013964	CGA	2	6	42404	42409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292493977
1066	NC_013964	CG	3	6	42453	42458	0 %	0 %	50 %	50 %	292493977
1067	NC_013964	CGT	2	6	42503	42508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292493977
1068	NC_013964	CTC	2	6	42537	42542	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292493977
1069	NC_013964	TCG	2	6	42601	42606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292493977
1070	NC_013964	CGA	2	6	42620	42625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292493977
1071	NC_013964	GAG	2	6	42645	42650	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292493977
1072	NC_013964	CGT	2	6	42662	42667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292493977
1073	NC_013964	TCT	2	6	42734	42739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292493977
1074	NC_013964	CGA	2	6	42785	42790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292493977
1075	NC_013964	GAT	2	6	42810	42815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292493977
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1077	NC_013964	CGA	2	6	42854	42859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292493977
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1080	NC_013964	GAACGA	2	12	43322	43333	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	292493978
1081	NC_013964	CGC	2	6	43334	43339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292493978
1082	NC_013964	GGC	2	6	43340	43345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292493978
1083	NC_013964	CGC	2	6	43352	43357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292493978
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1086	NC_013964	CTC	2	6	43431	43436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292493978
1087	NC_013964	CCG	2	6	43471	43476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292493978
1088	NC_013964	GCG	2	6	43500	43505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292493978
1089	NC_013964	GC	3	6	43517	43522	0 %	0 %	50 %	50 %	292493978
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1093	NC_013964	CGG	2	6	43565	43570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292493978
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1095	NC_013964	GGTG	2	8	43625	43632	0 %	25 %	75 %	0 %	292493978
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1101	NC_013964	CGA	2	6	43775	43780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292493978
1102	NC_013964	GGCC	2	8	43781	43788	0 %	0 %	50 %	50 %	292493978
1103	NC_013964	CGT	2	6	43808	43813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292493978
1104	NC_013964	TCGG	2	8	43830	43837	0 %	25 %	50 %	25 %	292493978
1105	NC_013964	GCA	2	6	43885	43890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292493978
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1107	NC_013964	GAA	2	6	43961	43966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292493978
1108	NC_013964	TCG	2	6	43975	43980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292493978
1109	NC_013964	GCC	2	6	44004	44009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292493978
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1111	NC_013964	CGG	2	6	44024	44029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292493978
1112	NC_013964	ACC	2	6	44037	44042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292493978
1113	NC_013964	ACG	2	6	44092	44097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292493978
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1117	NC_013964	CTC	2	6	44192	44197	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292493978
1118	NC_013964	ACATCG	2	12	44209	44220	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	292493978
1119	NC_013964	CCGAGG	2	12	44221	44232	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	292493978
1120	NC_013964	TCG	2	6	44242	44247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292493978
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1122	NC_013964	TCG	2	6	44293	44298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292493978
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1243	NC_013964	CGC	2	6	50187	50192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292493982
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1491	NC_013964	GCG	2	6	58747	58752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292493989
1492	NC_013964	CGT	2	6	58761	58766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292493989
1493	NC_013964	GCC	2	6	58804	58809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292493989
1494	NC_013964	GTC	2	6	58843	58848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292493989
1495	NC_013964	TCG	2	6	58859	58864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292493989
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1499	NC_013964	CGG	2	6	58971	58976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292493989
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