MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloferax volcanii DS2 plasmid pHV3

Total Repeats: 10778

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013964	CCG	2	6	21068	21073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292493959
502	NC_013964	CGAG	2	8	21129	21136	25 %	0 %	50 %	25 %	292493959
503	NC_013964	GAC	2	6	21137	21142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292493959
504	NC_013964	ATC	2	6	21272	21277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292493959
505	NC_013964	GCG	2	6	21337	21342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292493959
506	NC_013964	ACT	2	6	21372	21377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292493959
507	NC_013964	ACC	2	6	21378	21383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292493959
508	NC_013964	AGG	2	6	21393	21398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292493959
509	NC_013964	GAC	2	6	21418	21423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292493959
510	NC_013964	CGAC	3	12	21420	21431	25 %	0 %	25 %	50 %	292493959
511	NC_013964	GAG	2	6	21440	21445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292493959
512	NC_013964	TCG	2	6	21447	21452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292493959
513	NC_013964	GCGCA	2	10	21458	21467	20 %	0 %	40 %	40 %	292493959
514	NC_013964	GC	3	6	21486	21491	0 %	0 %	50 %	50 %	292493959
515	NC_013964	ATC	2	6	21512	21517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292493959
516	NC_013964	CGA	2	6	21573	21578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292493959
517	NC_013964	TCGT	2	8	21584	21591	0 %	50 %	25 %	25 %	292493959
518	NC_013964	CGA	2	6	21622	21627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292493959
519	NC_013964	ACC	2	6	21650	21655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292493959
520	NC_013964	GCC	2	6	21683	21688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292493959
521	NC_013964	GGC	2	6	21689	21694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292493959
522	NC_013964	ACG	2	6	21723	21728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292493959
523	NC_013964	ACGCC	2	10	21738	21747	20 %	0 %	20 %	60 %	292493959
524	NC_013964	GTC	2	6	21758	21763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292493959
525	NC_013964	CGG	3	9	21778	21786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292493959
526	NC_013964	TCG	2	6	21789	21794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292493959
527	NC_013964	ACC	2	6	21800	21805	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292493959
528	NC_013964	ACTC	2	8	21811	21818	25 %	25 %	0 %	50 %	292493959
529	NC_013964	ACG	2	6	21840	21845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292493959
530	NC_013964	GGA	2	6	21862	21867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292493959
531	NC_013964	CTC	2	6	21901	21906	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292493959
532	NC_013964	GTCG	2	8	21940	21947	0 %	25 %	50 %	25 %	292493959
533	NC_013964	GGTTC	2	10	21967	21976	0 %	40 %	40 %	20 %	292493959
534	NC_013964	CGT	2	6	22015	22020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292493959
535	NC_013964	TCA	2	6	22029	22034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292493959
536	NC_013964	GGA	2	6	22051	22056	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292493959
537	NC_013964	CGA	3	9	22177	22185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292493959
538	NC_013964	GCG	2	6	22293	22298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292493959
539	NC_013964	ACG	2	6	22316	22321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292493959
540	NC_013964	CCGCG	2	10	22342	22351	0 %	0 %	40 %	60 %	292493959
541	NC_013964	CCG	2	6	22356	22361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292493959
542	NC_013964	CGC	2	6	22392	22397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292493959
543	NC_013964	GATA	2	8	22468	22475	50 %	25 %	25 %	0 %	292493959
544	NC_013964	TGC	2	6	22497	22502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292493959
545	NC_013964	CG	3	6	22508	22513	0 %	0 %	50 %	50 %	292493959
546	NC_013964	ACC	2	6	22571	22576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292493959
547	NC_013964	CTC	2	6	22610	22615	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292493959
548	NC_013964	GAC	3	9	22637	22645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292493959
549	NC_013964	GCC	2	6	22679	22684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292493959
550	NC_013964	TCG	2	6	22686	22691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292493959
551	NC_013964	CGA	2	6	22726	22731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292493959
552	NC_013964	G	6	6	22795	22800	0 %	0 %	100 %	0 %	292493960
553	NC_013964	TCG	2	6	22887	22892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292493960
554	NC_013964	CAG	2	6	22952	22957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292493960
555	NC_013964	GGC	2	6	23004	23009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292493960
556	NC_013964	CTG	2	6	23036	23041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292493960
557	NC_013964	AGCC	2	8	23069	23076	25 %	0 %	25 %	50 %	292493960
558	NC_013964	G	6	6	23082	23087	0 %	0 %	100 %	0 %	292493960
559	NC_013964	GAC	2	6	23140	23145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292493960
560	NC_013964	CAT	2	6	23215	23220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292493960
561	NC_013964	ACG	2	6	23225	23230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292493960
562	NC_013964	TCC	2	6	23232	23237	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292493960
563	NC_013964	TCA	2	6	23253	23258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292493960
564	NC_013964	TCA	2	6	23274	23279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292493960
565	NC_013964	CAC	2	6	23381	23386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292493960
566	NC_013964	TAC	2	6	23417	23422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292493960
567	NC_013964	GCG	2	6	23424	23429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292493960
568	NC_013964	CTG	2	6	23435	23440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292493960
569	NC_013964	GC	3	6	23444	23449	0 %	0 %	50 %	50 %	292493960
570	NC_013964	CGT	2	6	23455	23460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292493960
571	NC_013964	CG	3	6	23495	23500	0 %	0 %	50 %	50 %	292493960
572	NC_013964	GCA	2	6	23518	23523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292493960
573	NC_013964	CG	3	6	23527	23532	0 %	0 %	50 %	50 %	292493960
574	NC_013964	TGC	2	6	23550	23555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292493960
575	NC_013964	GAT	2	6	23587	23592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292493960
576	NC_013964	GTC	2	6	23618	23623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292493960
577	NC_013964	CAG	2	6	23669	23674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292493960
578	NC_013964	GCC	2	6	23693	23698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292493960
579	NC_013964	TCA	2	6	23703	23708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292493960
580	NC_013964	TCG	2	6	23736	23741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292493960
581	NC_013964	CGACC	2	10	23764	23773	20 %	0 %	20 %	60 %	292493960
582	NC_013964	GGT	2	6	23789	23794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292493960
583	NC_013964	TCG	2	6	23921	23926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292493961
584	NC_013964	CCT	2	6	23946	23951	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292493961
585	NC_013964	CGA	2	6	23997	24002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292493961
586	NC_013964	TGC	2	6	24014	24019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292493961
587	NC_013964	ACCG	2	8	24030	24037	25 %	0 %	25 %	50 %	292493961
588	NC_013964	GAC	2	6	24054	24059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292493961
589	NC_013964	GC	3	6	24098	24103	0 %	0 %	50 %	50 %	292493961
590	NC_013964	TCG	2	6	24116	24121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292493961
591	NC_013964	CGG	2	6	24129	24134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292493961
592	NC_013964	TAC	2	6	24181	24186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292493961
593	NC_013964	GGC	2	6	24187	24192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292493961
594	NC_013964	CGA	2	6	24198	24203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292493961
595	NC_013964	ATC	2	6	24307	24312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292493961
596	NC_013964	GCCC	2	8	24333	24340	0 %	0 %	25 %	75 %	292493961
597	NC_013964	CGT	2	6	24342	24347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292493961
598	NC_013964	AG	3	6	24370	24375	50 %	0 %	50 %	0 %	292493961
599	NC_013964	GC	4	8	24394	24401	0 %	0 %	50 %	50 %	292493961
600	NC_013964	GCG	2	6	24404	24409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292493961
601	NC_013964	CGC	2	6	24501	24506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292493961
602	NC_013964	CGACC	2	10	24537	24546	20 %	0 %	20 %	60 %	292493961
603	NC_013964	TGG	3	9	24607	24615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292493961
604	NC_013964	CCCG	2	8	24621	24628	0 %	0 %	25 %	75 %	292493961
605	NC_013964	CAC	2	6	24648	24653	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292493961
606	NC_013964	GAA	2	6	24682	24687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292493961
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608	NC_013964	CCT	2	6	24722	24727	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292493962
609	NC_013964	CGAC	2	8	24757	24764	25 %	0 %	25 %	50 %	292493962
610	NC_013964	ACG	2	6	24787	24792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292493962
611	NC_013964	CGA	2	6	24806	24811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292493962
612	NC_013964	TCC	2	6	24883	24888	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292493962
613	NC_013964	GCA	2	6	24913	24918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292493962
614	NC_013964	AGCG	2	8	24951	24958	25 %	0 %	50 %	25 %	292493962
615	NC_013964	GGA	2	6	24980	24985	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292493962
616	NC_013964	CTCG	2	8	25016	25023	0 %	25 %	25 %	50 %	292493962
617	NC_013964	GC	3	6	25042	25047	0 %	0 %	50 %	50 %	292493962
618	NC_013964	CGA	2	6	25085	25090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292493962
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620	NC_013964	CGA	2	6	25151	25156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292493962
621	NC_013964	G	6	6	25176	25181	0 %	0 %	100 %	0 %	292493962
622	NC_013964	GCGCTC	2	12	25209	25220	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	292493962
623	NC_013964	TCA	2	6	25231	25236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292493962
624	NC_013964	CGA	2	6	25241	25246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292493962
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626	NC_013964	TCA	2	6	25336	25341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292493962
627	NC_013964	CGA	2	6	25373	25378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292493962
628	NC_013964	CGG	2	6	25394	25399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292493962
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752	NC_013964	GTC	3	9	30946	30954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292493966
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