MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Hydrogenobacter thermophilus TK-6

Total Repeats: 33642

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013799	T	6	6	114	119	0 %	100 %	0 %	0 %	288817322
2	NC_013799	AGA	2	6	177	182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288817322
3	NC_013799	ACA	2	6	188	193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	288817322
4	NC_013799	AAG	2	6	288	293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288817322
5	NC_013799	TGT	2	6	363	368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	288817322
6	NC_013799	TA	3	6	447	452	50 %	50 %	0 %	0 %	288817322
7	NC_013799	GAT	2	6	561	566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288817322
8	NC_013799	A	6	6	576	581	100 %	0 %	0 %	0 %	288817322
9	NC_013799	GAT	2	6	637	642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288817322
10	NC_013799	AG	3	6	663	668	50 %	0 %	50 %	0 %	288817322
11	NC_013799	GAT	2	6	823	828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288817322
12	NC_013799	ATA	2	6	844	849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	288817322
13	NC_013799	GGT	2	6	963	968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288817322
14	NC_013799	A	6	6	987	992	100 %	0 %	0 %	0 %	288817322
15	NC_013799	TGG	2	6	1019	1024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288817322
16	NC_013799	AGA	2	6	1056	1061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288817322
17	NC_013799	A	6	6	1065	1070	100 %	0 %	0 %	0 %	288817322
18	NC_013799	AG	3	6	1080	1085	50 %	0 %	50 %	0 %	288817322
19	NC_013799	ATA	2	6	1090	1095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	288817322
20	NC_013799	AAGG	2	8	1206	1213	50 %	0 %	50 %	0 %	288817322
21	NC_013799	GGA	2	6	1215	1220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288817322
22	NC_013799	A	6	6	1220	1225	100 %	0 %	0 %	0 %	288817322
23	NC_013799	ATG	2	6	1252	1257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288817322
24	NC_013799	TAA	2	6	1297	1302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	288817322
25	NC_013799	TTA	2	6	1331	1336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	288817323
26	NC_013799	CTTG	2	8	1338	1345	0 %	50 %	25 %	25 %	288817323
27	NC_013799	AGG	2	6	1496	1501	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288817323
28	NC_013799	GGT	2	6	1509	1514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288817323
29	NC_013799	AGG	2	6	1580	1585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288817323
30	NC_013799	CTT	2	6	1609	1614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288817323
31	NC_013799	TGG	2	6	1658	1663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288817323
32	NC_013799	AAC	2	6	1672	1677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	288817323
33	NC_013799	TGG	3	9	1754	1762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288817323
34	NC_013799	AGG	2	6	1778	1783	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288817323
35	NC_013799	AG	4	8	1881	1888	50 %	0 %	50 %	0 %	288817323
36	NC_013799	A	6	6	1917	1922	100 %	0 %	0 %	0 %	288817323
37	NC_013799	GCT	2	6	1963	1968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288817323
38	NC_013799	TGG	2	6	1973	1978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288817323
39	NC_013799	GAT	2	6	1990	1995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288817323
40	NC_013799	GTA	2	6	2005	2010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288817323
41	NC_013799	GAG	2	6	2167	2172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288817323
42	NC_013799	GGT	2	6	2220	2225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288817323
43	NC_013799	AAAT	2	8	2284	2291	75 %	25 %	0 %	0 %	288817323
44	NC_013799	ATC	2	6	2309	2314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288817324
45	NC_013799	T	6	6	2340	2345	0 %	100 %	0 %	0 %	288817324
46	NC_013799	T	6	6	2369	2374	0 %	100 %	0 %	0 %	288817324
47	NC_013799	A	6	6	2392	2397	100 %	0 %	0 %	0 %	288817324
48	NC_013799	AGA	2	6	2407	2412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288817324
49	NC_013799	GA	3	6	2491	2496	50 %	0 %	50 %	0 %	288817324
50	NC_013799	T	6	6	2513	2518	0 %	100 %	0 %	0 %	288817324
51	NC_013799	TC	3	6	2560	2565	0 %	50 %	0 %	50 %	288817324
52	NC_013799	CTT	2	6	2588	2593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288817324
53	NC_013799	CAGG	2	8	2643	2650	25 %	0 %	50 %	25 %	288817324
54	NC_013799	TTTTC	2	10	2694	2703	0 %	80 %	0 %	20 %	288817324
55	NC_013799	GCT	2	6	2867	2872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288817324
56	NC_013799	AGA	2	6	3087	3092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288817325
57	NC_013799	TGA	2	6	3167	3172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288817325
58	NC_013799	TAT	2	6	3179	3184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	288817325
59	NC_013799	C	6	6	3188	3193	0 %	0 %	0 %	100 %	288817325
60	NC_013799	A	6	6	3229	3234	100 %	0 %	0 %	0 %	288817325
61	NC_013799	CA	3	6	3267	3272	50 %	0 %	0 %	50 %	288817325
62	NC_013799	TCC	2	6	3273	3278	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	288817325
63	NC_013799	ATT	2	6	3320	3325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	288817325
64	NC_013799	CTT	2	6	3463	3468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288817325
65	NC_013799	CTT	2	6	3499	3504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288817325
66	NC_013799	TTA	2	6	3514	3519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	288817325
67	NC_013799	TGA	2	6	3553	3558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288817325
68	NC_013799	ATGG	2	8	3567	3574	25 %	25 %	50 %	0 %	288817325
69	NC_013799	GA	4	8	3792	3799	50 %	0 %	50 %	0 %	288817326
70	NC_013799	AT	3	6	3855	3860	50 %	50 %	0 %	0 %	288817326
71	NC_013799	AGG	2	6	3918	3923	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288817326
72	NC_013799	A	6	6	3937	3942	100 %	0 %	0 %	0 %	288817326
73	NC_013799	GAG	2	6	3949	3954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288817326
74	NC_013799	ACA	2	6	4004	4009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	288817326
75	NC_013799	AGG	2	6	4010	4015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288817326
76	NC_013799	A	6	6	4103	4108	100 %	0 %	0 %	0 %	288817326
77	NC_013799	GTG	2	6	4109	4114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288817326
78	NC_013799	TCT	2	6	4149	4154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288817326
79	NC_013799	ATA	2	6	4225	4230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	288817326
80	NC_013799	TGG	2	6	4232	4237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288817326
81	NC_013799	TA	3	6	4278	4283	50 %	50 %	0 %	0 %	288817326
82	NC_013799	TACC	2	8	4328	4335	25 %	25 %	0 %	50 %	288817326
83	NC_013799	AT	3	6	4368	4373	50 %	50 %	0 %	0 %	288817326
84	NC_013799	AAG	2	6	4427	4432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288817326
85	NC_013799	AG	3	6	4437	4442	50 %	0 %	50 %	0 %	288817326
86	NC_013799	AAG	2	6	4484	4489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288817326
87	NC_013799	TGG	2	6	4511	4516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288817326
88	NC_013799	TA	3	6	4567	4572	50 %	50 %	0 %	0 %	288817326
89	NC_013799	GAG	2	6	4579	4584	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288817326
90	NC_013799	AGG	2	6	4606	4611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288817327
91	NC_013799	TA	3	6	4646	4651	50 %	50 %	0 %	0 %	288817327
92	NC_013799	AGG	2	6	4732	4737	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288817327
93	NC_013799	CTTGGA	2	12	4740	4751	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	288817327
94	NC_013799	AG	3	6	4752	4757	50 %	0 %	50 %	0 %	288817327
95	NC_013799	G	6	6	4849	4854	0 %	0 %	100 %	0 %	288817327
96	NC_013799	TAG	2	6	4858	4863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288817327
97	NC_013799	TCC	2	6	4969	4974	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	288817327
98	NC_013799	CAT	2	6	4994	4999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288817327
99	NC_013799	ACC	2	6	5140	5145	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288817327
100	NC_013799	ACC	2	6	5196	5201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288817328
101	NC_013799	CAA	2	6	5207	5212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	288817328
102	NC_013799	CAA	2	6	5239	5244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	288817328
103	NC_013799	GGA	2	6	5330	5335	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288817328
104	NC_013799	TAAAG	2	10	5338	5347	60 %	20 %	20 %	0 %	288817328
105	NC_013799	CCA	2	6	5353	5358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288817328
106	NC_013799	AGC	2	6	5396	5401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288817328
107	NC_013799	AG	3	6	5444	5449	50 %	0 %	50 %	0 %	288817328
108	NC_013799	AAG	2	6	5558	5563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288817328
109	NC_013799	AGAA	2	8	5591	5598	75 %	0 %	25 %	0 %	288817328
110	NC_013799	GAA	2	6	5680	5685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288817328
111	NC_013799	ATA	2	6	5693	5698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	288817328
112	NC_013799	CTG	2	6	5825	5830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288817328
113	NC_013799	TTA	2	6	5892	5897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	288817328
114	NC_013799	GGA	2	6	5977	5982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288817328
115	NC_013799	CAA	2	6	5998	6003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	288817328
116	NC_013799	TCA	2	6	6004	6009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288817328
117	NC_013799	ACC	2	6	6047	6052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288817328
118	NC_013799	A	6	6	6064	6069	100 %	0 %	0 %	0 %	288817328
119	NC_013799	ACA	2	6	6072	6077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	288817328
120	NC_013799	GCG	2	6	6156	6161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288817328
121	NC_013799	AG	4	8	6176	6183	50 %	0 %	50 %	0 %	288817328
122	NC_013799	ATA	2	6	6189	6194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	288817328
123	NC_013799	CAG	2	6	6251	6256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288817328
124	NC_013799	CTA	2	6	6292	6297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288817328
125	NC_013799	A	7	7	6297	6303	100 %	0 %	0 %	0 %	288817328
126	NC_013799	AG	3	6	6307	6312	50 %	0 %	50 %	0 %	288817328
127	NC_013799	AACCA	2	10	6391	6400	60 %	0 %	0 %	40 %	288817328
128	NC_013799	GCA	3	9	6414	6422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288817328
129	NC_013799	AAAG	2	8	6454	6461	75 %	0 %	25 %	0 %	288817328
130	NC_013799	CCCTAT	2	12	6497	6508	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	288817328
131	NC_013799	TGCT	2	8	6567	6574	0 %	50 %	25 %	25 %	288817329
132	NC_013799	CT	3	6	6591	6596	0 %	50 %	0 %	50 %	288817329
133	NC_013799	AG	3	6	6621	6626	50 %	0 %	50 %	0 %	288817329
134	NC_013799	CA	3	6	6663	6668	50 %	0 %	0 %	50 %	288817329
135	NC_013799	CCA	2	6	6698	6703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288817329
136	NC_013799	TCT	3	9	6825	6833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288817329
137	NC_013799	CAT	2	6	7097	7102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288817329
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