MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloterrigena turkmenica DSM 5511 plasmid pHTUR05

Total Repeats: 1473

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013748	GAG	2	6	23802	23807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284176321
502	NC_013748	ACG	2	6	23811	23816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176321
503	NC_013748	GACC	2	8	23822	23829	25 %	0 %	25 %	50 %	284176321
504	NC_013748	GAC	2	6	23864	23869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176321
505	NC_013748	TAC	2	6	23874	23879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284176321
506	NC_013748	CGAC	2	8	23954	23961	25 %	0 %	25 %	50 %	284176321
507	NC_013748	GCC	2	6	23968	23973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176321
508	NC_013748	GAA	2	6	23991	23996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284176321
509	NC_013748	AGT	2	6	24143	24148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284176321
510	NC_013748	CCG	2	6	24158	24163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176321
511	NC_013748	TGT	2	6	24181	24186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284176321
512	NC_013748	CGGCCG	2	12	24191	24202	0 %	0 %	50 %	50 %	284176321
513	NC_013748	CGG	2	6	24293	24298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284176321
514	NC_013748	GAC	2	6	24330	24335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176321
515	NC_013748	CGT	2	6	24350	24355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176321
516	NC_013748	ACG	2	6	24412	24417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176321
517	NC_013748	ACA	2	6	24532	24537	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284176322
518	NC_013748	TCG	2	6	24658	24663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176322
519	NC_013748	CGA	3	9	24665	24673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176322
520	NC_013748	CCG	2	6	24680	24685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176322
521	NC_013748	GAG	2	6	24702	24707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284176322
522	NC_013748	CGAA	2	8	24734	24741	50 %	0 %	25 %	25 %	284176322
523	NC_013748	GGCC	2	8	24815	24822	0 %	0 %	50 %	50 %	284176322
524	NC_013748	GTCG	2	8	24860	24867	0 %	25 %	50 %	25 %	284176322
525	NC_013748	GCC	2	6	24949	24954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176322
526	NC_013748	CGA	2	6	25004	25009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176322
527	NC_013748	CGC	2	6	25010	25015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176322
528	NC_013748	AC	3	6	25044	25049	50 %	0 %	0 %	50 %	284176322
529	NC_013748	TCG	2	6	25050	25055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176322
530	NC_013748	CGA	2	6	25102	25107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176322
531	NC_013748	ACT	2	6	25144	25149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284176322
532	NC_013748	CGA	2	6	25166	25171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176322
533	NC_013748	ACG	2	6	25207	25212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176322
534	NC_013748	GAC	2	6	25347	25352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176322
535	NC_013748	CGA	2	6	25535	25540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176322
536	NC_013748	GGA	2	6	25580	25585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284176322
537	NC_013748	GCC	2	6	25599	25604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176322
538	NC_013748	GCC	2	6	25701	25706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176322
539	NC_013748	TGT	2	6	25713	25718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284176322
540	NC_013748	GAA	2	6	25844	25849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284176322
541	NC_013748	TCT	2	6	25915	25920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284176322
542	NC_013748	GCC	2	6	25942	25947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176322
543	NC_013748	ACG	2	6	25981	25986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176322
544	NC_013748	CCGGT	2	10	25995	26004	0 %	20 %	40 %	40 %	284176322
545	NC_013748	CGA	2	6	26014	26019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176322
546	NC_013748	GAG	2	6	26040	26045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284176322
547	NC_013748	GAT	2	6	26126	26131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284176322
548	NC_013748	CGG	2	6	26138	26143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284176322
549	NC_013748	ACG	2	6	26260	26265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176322
550	NC_013748	GTC	2	6	26322	26327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176322
551	NC_013748	AGG	2	6	26413	26418	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284176322
552	NC_013748	CGC	2	6	26426	26431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176322
553	NC_013748	GCG	2	6	26438	26443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284176322
554	NC_013748	ACG	2	6	26538	26543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176322
555	NC_013748	GGT	2	6	26552	26557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284176322
556	NC_013748	AAG	2	6	26602	26607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284176322
557	NC_013748	CGA	2	6	26648	26653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176322
558	NC_013748	ACG	2	6	26656	26661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176322
559	NC_013748	GAA	2	6	26747	26752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284176322
560	NC_013748	GCG	2	6	26767	26772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284176322
561	NC_013748	AGCG	2	8	26800	26807	25 %	0 %	50 %	25 %	284176322
562	NC_013748	GGA	2	6	26834	26839	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284176322
563	NC_013748	ACG	2	6	26857	26862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176323
564	NC_013748	GAC	2	6	26925	26930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176323
565	NC_013748	CGA	2	6	26939	26944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176323
566	NC_013748	GCTC	2	8	26947	26954	0 %	25 %	25 %	50 %	284176323
567	NC_013748	GTCG	2	8	26990	26997	0 %	25 %	50 %	25 %	284176323
568	NC_013748	CGA	2	6	26999	27004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176323
569	NC_013748	TCC	2	6	27007	27012	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284176323
570	NC_013748	CGA	2	6	27040	27045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176323
571	NC_013748	TGA	2	6	27062	27067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284176323
572	NC_013748	GTC	2	6	27075	27080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176323
573	NC_013748	TCCG	2	8	27168	27175	0 %	25 %	25 %	50 %	284176323
574	NC_013748	GTC	2	6	27183	27188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176323
575	NC_013748	GAA	2	6	27216	27221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284176323
576	NC_013748	CGAA	2	8	27292	27299	50 %	0 %	25 %	25 %	284176323
577	NC_013748	CCG	2	6	27387	27392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176323
578	NC_013748	GAG	2	6	27405	27410	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284176323
579	NC_013748	CCG	2	6	27411	27416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176323
580	NC_013748	TCA	2	6	27610	27615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284176323
581	NC_013748	GAG	2	6	27630	27635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284176323
582	NC_013748	CGAC	2	8	27643	27650	25 %	0 %	25 %	50 %	284176323
583	NC_013748	GCC	2	6	27657	27662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176323
584	NC_013748	CGT	2	6	27674	27679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176323
585	NC_013748	CGT	2	6	27686	27691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176323
586	NC_013748	GCGT	2	8	27703	27710	0 %	25 %	50 %	25 %	284176323
587	NC_013748	GAC	2	6	27723	27728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176323
588	NC_013748	ACG	2	6	27754	27759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176323
589	NC_013748	CGA	2	6	28092	28097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176324
590	NC_013748	GAG	2	6	28147	28152	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284176324
591	NC_013748	CGA	2	6	28167	28172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176324
592	NC_013748	CGC	3	9	28189	28197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176324
593	NC_013748	CGCC	2	8	28248	28255	0 %	0 %	25 %	75 %	284176324
594	NC_013748	GCA	2	6	28260	28265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176324
595	NC_013748	GA	3	6	28280	28285	50 %	0 %	50 %	0 %	284176324
596	NC_013748	CGA	2	6	28352	28357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176324
597	NC_013748	ACA	2	6	28379	28384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284176324
598	NC_013748	CG	3	6	28425	28430	0 %	0 %	50 %	50 %	284176324
599	NC_013748	GC	3	6	28470	28475	0 %	0 %	50 %	50 %	284176324
600	NC_013748	CGA	2	6	28562	28567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176324
601	NC_013748	ACT	2	6	28619	28624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284176324
602	NC_013748	CGG	2	6	28635	28640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284176324
603	NC_013748	GCC	2	6	28762	28767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176324
604	NC_013748	TCG	2	6	28787	28792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176324
605	NC_013748	GCC	2	6	28849	28854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176324
606	NC_013748	GCG	2	6	28952	28957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284176324
607	NC_013748	GAG	2	6	29041	29046	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284176324
608	NC_013748	ACCGGC	2	12	29056	29067	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	284176324
609	NC_013748	CCG	2	6	29082	29087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176324
610	NC_013748	GAA	2	6	29101	29106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284176324
611	NC_013748	GAG	2	6	29155	29160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284176324
612	NC_013748	CCG	2	6	29163	29168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176324
613	NC_013748	TCGG	2	8	29175	29182	0 %	25 %	50 %	25 %	284176324
614	NC_013748	GAAC	2	8	29220	29227	50 %	0 %	25 %	25 %	284176324
615	NC_013748	CGA	2	6	29235	29240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176324
616	NC_013748	GAC	2	6	29248	29253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176324
617	NC_013748	CGA	2	6	29328	29333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176324
618	NC_013748	ACG	2	6	29339	29344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176324
619	NC_013748	GAT	2	6	29385	29390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284176324
620	NC_013748	GAC	2	6	29392	29397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176324
621	NC_013748	CGA	2	6	29430	29435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176324
622	NC_013748	GAT	2	6	29497	29502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284176324
623	NC_013748	GATC	2	8	29547	29554	25 %	25 %	25 %	25 %	284176324
624	NC_013748	AGT	2	6	29570	29575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284176324
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626	NC_013748	GACC	2	8	29753	29760	25 %	0 %	25 %	50 %	284176325
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754	NC_013748	TCGA	2	8	37139	37146	25 %	25 %	25 %	25 %	284176330
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1000	NC_013748	CGT	2	6	49443	49448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176356

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