MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloterrigena turkmenica DSM 5511 plasmid pHTUR04

Total Repeats: 3783

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013747	CTC	2	6	197	202	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284176134
2	NC_013747	TCG	2	6	213	218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176134
3	NC_013747	CGAGC	2	10	227	236	20 %	0 %	40 %	40 %	284176134
4	NC_013747	TCG	2	6	249	254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176134
5	NC_013747	TCG	2	6	330	335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176134
6	NC_013747	CCG	2	6	337	342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176134
7	NC_013747	CTG	3	9	344	352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176134
8	NC_013747	TCG	2	6	363	368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176134
9	NC_013747	TG	3	6	1254	1259	0 %	50 %	50 %	0 %	284176135
10	NC_013747	GCT	2	6	1300	1305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176135
11	NC_013747	CGGC	2	8	1344	1351	0 %	0 %	50 %	50 %	284176135
12	NC_013747	CGA	2	6	1405	1410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176135
13	NC_013747	TCGA	2	8	1421	1428	25 %	25 %	25 %	25 %	284176135
14	NC_013747	CGC	2	6	1434	1439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176135
15	NC_013747	TCGG	2	8	1448	1455	0 %	25 %	50 %	25 %	284176135
16	NC_013747	CCGA	2	8	1490	1497	25 %	0 %	25 %	50 %	284176135
17	NC_013747	CGA	2	6	1519	1524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176135
18	NC_013747	CGT	2	6	1540	1545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176135
19	NC_013747	ATC	2	6	1556	1561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284176135
20	NC_013747	CGACAC	2	12	1618	1629	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	284176135
21	NC_013747	CGA	2	6	1663	1668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176135
22	NC_013747	CGA	2	6	1705	1710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176135
23	NC_013747	CGC	2	6	1765	1770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176135
24	NC_013747	CGC	2	6	1782	1787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176135
25	NC_013747	GTC	2	6	1790	1795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176135
26	NC_013747	GGA	2	6	1801	1806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284176135
27	NC_013747	GTT	2	6	1862	1867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284176135
28	NC_013747	CGT	2	6	1885	1890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176135
29	NC_013747	TCG	2	6	1893	1898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176135
30	NC_013747	ACG	3	9	1899	1907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176135
31	NC_013747	TCGA	2	8	1937	1944	25 %	25 %	25 %	25 %	284176135
32	NC_013747	AGC	2	6	2028	2033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176135
33	NC_013747	TCG	2	6	2142	2147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176135
34	NC_013747	CCT	2	6	2157	2162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284176135
35	NC_013747	CGC	2	6	2167	2172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176135
36	NC_013747	GCTC	2	8	2181	2188	0 %	25 %	25 %	50 %	284176135
37	NC_013747	GCC	2	6	2251	2256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176135
38	NC_013747	CGA	3	9	2260	2268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176135
39	NC_013747	GCG	2	6	2295	2300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284176135
40	NC_013747	CGG	2	6	2304	2309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284176135
41	NC_013747	AGGCCG	2	12	2331	2342	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	284176135
42	NC_013747	GTCACG	2	12	2357	2368	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	284176135
43	NC_013747	CGT	2	6	2371	2376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176135
44	NC_013747	CCG	2	6	2385	2390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176135
45	NC_013747	CGA	2	6	2401	2406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176135
46	NC_013747	CGC	2	6	2443	2448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176135
47	NC_013747	TCC	2	6	2462	2467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284176135
48	NC_013747	GCT	2	6	2485	2490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176135
49	NC_013747	CGC	2	6	2503	2508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176135
50	NC_013747	GCT	2	6	2545	2550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176135
51	NC_013747	CGA	2	6	2581	2586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176135
52	NC_013747	CTT	2	6	2647	2652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284176135
53	NC_013747	GC	3	6	2691	2696	0 %	0 %	50 %	50 %	284176135
54	NC_013747	CGCTGG	2	12	2763	2774	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	284176135
55	NC_013747	AC	3	6	2784	2789	50 %	0 %	0 %	50 %	284176135
56	NC_013747	GC	3	6	2862	2867	0 %	0 %	50 %	50 %	284176135
57	NC_013747	CTA	2	6	2992	2997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284176135
58	NC_013747	CCT	2	6	3007	3012	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284176135
59	NC_013747	CGA	2	6	3503	3508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176136
60	NC_013747	CGA	2	6	3596	3601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176136
61	NC_013747	CGA	2	6	3653	3658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176136
62	NC_013747	CGT	2	6	3665	3670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176136
63	NC_013747	GGC	2	6	3671	3676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284176136
64	NC_013747	CGT	2	6	3687	3692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176136
65	NC_013747	GACGTT	2	12	3702	3713	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	284176136
66	NC_013747	GA	3	6	3769	3774	50 %	0 %	50 %	0 %	284176136
67	NC_013747	TCTCGA	2	12	3782	3793	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	284176136
68	NC_013747	CCGA	2	8	3802	3809	25 %	0 %	25 %	50 %	284176136
69	NC_013747	CCG	2	6	3817	3822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176136
70	NC_013747	CGC	2	6	3833	3838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176136
71	NC_013747	CGA	2	6	3929	3934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176136
72	NC_013747	CGT	2	6	3956	3961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176136
73	NC_013747	CCG	2	6	3981	3986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176136
74	NC_013747	GAG	2	6	4020	4025	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284176136
75	NC_013747	CGAC	2	8	4036	4043	25 %	0 %	25 %	50 %	284176136
76	NC_013747	CGC	2	6	4124	4129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176136
77	NC_013747	TCG	2	6	4202	4207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176136
78	NC_013747	TCGG	2	8	4213	4220	0 %	25 %	50 %	25 %	284176136
79	NC_013747	GTC	2	6	4233	4238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176136
80	NC_013747	GAC	2	6	4239	4244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176136
81	NC_013747	GTCG	2	8	4325	4332	0 %	25 %	50 %	25 %	284176136
82	NC_013747	CGC	2	6	4335	4340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176136
83	NC_013747	GGC	3	9	4398	4406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284176136
84	NC_013747	TCG	2	6	4471	4476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176136
85	NC_013747	AGT	2	6	4481	4486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284176136
86	NC_013747	GCA	2	6	4592	4597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176136
87	NC_013747	CGC	2	6	4647	4652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176136
88	NC_013747	AAC	2	6	4656	4661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284176136
89	NC_013747	AACC	2	8	5073	5080	50 %	0 %	0 %	50 %	284176137
90	NC_013747	C	6	6	5124	5129	0 %	0 %	0 %	100 %	284176137
91	NC_013747	CGT	2	6	5194	5199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176137
92	NC_013747	GAAG	2	8	5257	5264	50 %	0 %	50 %	0 %	284176137
93	NC_013747	CGAA	2	8	5840	5847	50 %	0 %	25 %	25 %	284176138
94	NC_013747	AGG	2	6	5918	5923	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284176138
95	NC_013747	CGC	2	6	5928	5933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176138
96	NC_013747	CGAT	2	8	6118	6125	25 %	25 %	25 %	25 %	284176139
97	NC_013747	CAG	2	6	6126	6131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176139
98	NC_013747	CCG	2	6	6149	6154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176139
99	NC_013747	CGA	2	6	6227	6232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176139
100	NC_013747	CGC	2	6	6329	6334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176139
101	NC_013747	CGA	3	9	6365	6373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176139
102	NC_013747	GCC	2	6	6378	6383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176139
103	NC_013747	CGA	2	6	6518	6523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176139
104	NC_013747	CGT	2	6	6533	6538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176139
105	NC_013747	CGA	2	6	6554	6559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176139
106	NC_013747	CG	3	6	6595	6600	0 %	0 %	50 %	50 %	284176139
107	NC_013747	GCT	2	6	6603	6608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176139
108	NC_013747	GTC	2	6	6624	6629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176139
109	NC_013747	CGA	2	6	6647	6652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176139
110	NC_013747	GTC	2	6	6705	6710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176139
111	NC_013747	CGG	2	6	6716	6721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284176139
112	NC_013747	CGAT	2	8	6754	6761	25 %	25 %	25 %	25 %	284176139
113	NC_013747	CCG	2	6	6786	6791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176139
114	NC_013747	CGG	2	6	6796	6801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284176139
115	NC_013747	CGA	2	6	6956	6961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176139
116	NC_013747	GCG	2	6	6968	6973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284176139
117	NC_013747	CGTCC	2	10	7029	7038	0 %	20 %	20 %	60 %	284176139
118	NC_013747	TCG	2	6	7063	7068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176139
119	NC_013747	CGT	2	6	7089	7094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176139
120	NC_013747	GGT	2	6	7135	7140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284176140
121	NC_013747	CGT	2	6	7153	7158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176140
122	NC_013747	CG	3	6	7163	7168	0 %	0 %	50 %	50 %	284176140
123	NC_013747	GATCG	2	10	7169	7178	20 %	20 %	40 %	20 %	284176140
124	NC_013747	CGT	2	6	7196	7201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176140
125	NC_013747	CTC	2	6	7202	7207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284176140
126	NC_013747	CGA	2	6	7216	7221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176140
127	NC_013747	TCG	2	6	7300	7305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176140
128	NC_013747	CGAG	2	8	7312	7319	25 %	0 %	50 %	25 %	284176140
129	NC_013747	TCG	2	6	7326	7331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176140
130	NC_013747	CGG	2	6	7345	7350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284176140
131	NC_013747	CGA	2	6	7351	7356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176140
132	NC_013747	CGA	2	6	7420	7425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176140
133	NC_013747	TCG	2	6	7470	7475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176140
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245	NC_013747	GTA	2	6	11679	11684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284176142
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248	NC_013747	CTC	2	6	11733	11738	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284176142
249	NC_013747	CAG	2	6	11805	11810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176142
250	NC_013747	CGA	2	6	11813	11818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176142
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252	NC_013747	CA	3	6	12913	12918	50 %	0 %	0 %	50 %	284176143
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254	NC_013747	GCG	2	6	12964	12969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284176143
255	NC_013747	GAC	2	6	12977	12982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176143
256	NC_013747	ACG	2	6	13024	13029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176143
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498	NC_013747	GCTC	2	8	22081	22088	0 %	25 %	25 %	50 %	284176150
499	NC_013747	TCGG	2	8	22096	22103	0 %	25 %	50 %	25 %	284176150
500	NC_013747	CCGC	2	8	22104	22111	0 %	0 %	25 %	75 %	284176150

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