MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloterrigena turkmenica DSM 5511 plasmid pHTUR03

Total Repeats: 2279

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013746	CAG	2	6	406	411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172855
2	NC_013746	CGA	2	6	456	461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172855
3	NC_013746	CGA	2	6	825	830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172856
4	NC_013746	TCC	2	6	837	842	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284172856
5	NC_013746	GACG	2	8	858	865	25 %	0 %	50 %	25 %	284172856
6	NC_013746	GCC	2	6	949	954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284172856
7	NC_013746	GAC	3	9	970	978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172856
8	NC_013746	GAT	2	6	994	999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284172856
9	NC_013746	CTC	2	6	1021	1026	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284172856
10	NC_013746	CTG	2	6	2238	2243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172857
11	NC_013746	CCT	2	6	2272	2277	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284172857
12	NC_013746	ACGG	2	8	2351	2358	25 %	0 %	50 %	25 %	284172857
13	NC_013746	GCC	2	6	2382	2387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284172857
14	NC_013746	GAG	2	6	2411	2416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284172857
15	NC_013746	GAG	2	6	2420	2425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284172857
16	NC_013746	CGC	2	6	2426	2431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284172857
17	NC_013746	GTA	2	6	2452	2457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284172857
18	NC_013746	TGG	2	6	2461	2466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284172857
19	NC_013746	GCC	2	6	2485	2490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284172857
20	NC_013746	TGT	2	6	2562	2567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284172857
21	NC_013746	TGC	2	6	2643	2648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172857
22	NC_013746	GATG	2	8	3310	3317	25 %	25 %	50 %	0 %	284172858
23	NC_013746	AG	3	6	3318	3323	50 %	0 %	50 %	0 %	284172858
24	NC_013746	GTC	2	6	3374	3379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172858
25	NC_013746	GTC	2	6	3402	3407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172858
26	NC_013746	CTC	2	6	3410	3415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284172858
27	NC_013746	AGCG	2	8	3434	3441	25 %	0 %	50 %	25 %	284172858
28	NC_013746	GGA	2	6	3448	3453	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284172858
29	NC_013746	GTT	2	6	3461	3466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284172858
30	NC_013746	CCA	2	6	3486	3491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284172858
31	NC_013746	GT	3	6	3532	3537	0 %	50 %	50 %	0 %	284172858
32	NC_013746	TC	3	6	3544	3549	0 %	50 %	0 %	50 %	284172858
33	NC_013746	TCAG	2	8	3604	3611	25 %	25 %	25 %	25 %	284172858
34	NC_013746	TGA	2	6	3639	3644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284172858
35	NC_013746	AAC	2	6	4216	4221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284172859
36	NC_013746	GAA	2	6	4291	4296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284172859
37	NC_013746	CAA	2	6	4317	4322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284172859
38	NC_013746	AGC	2	6	4350	4355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172859
39	NC_013746	TTCA	2	8	4363	4370	25 %	50 %	0 %	25 %	284172859
40	NC_013746	TTA	2	6	4414	4419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284172859
41	NC_013746	TGGA	2	8	4439	4446	25 %	25 %	50 %	0 %	284172859
42	NC_013746	TTC	2	6	4454	4459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284172859
43	NC_013746	ACC	2	6	4472	4477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284172859
44	NC_013746	ATT	2	6	4501	4506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284172859
45	NC_013746	ATG	2	6	4553	4558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284172859
46	NC_013746	CGA	2	6	4596	4601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172859
47	NC_013746	CGT	2	6	4644	4649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172859
48	NC_013746	GAA	2	6	5844	5849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284172860
49	NC_013746	GGTG	2	8	5858	5865	0 %	25 %	75 %	0 %	284172860
50	NC_013746	TC	3	6	5909	5914	0 %	50 %	0 %	50 %	284172860
51	NC_013746	AGC	2	6	5923	5928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172860
52	NC_013746	CTC	2	6	5964	5969	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284172860
53	NC_013746	ACG	2	6	5989	5994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172860
54	NC_013746	ATCG	2	8	6006	6013	25 %	25 %	25 %	25 %	284172860
55	NC_013746	TTC	2	6	6045	6050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284172860
56	NC_013746	CCG	2	6	6078	6083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284172860
57	NC_013746	CGT	2	6	6134	6139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172860
58	NC_013746	CGG	2	6	6172	6177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284172860
59	NC_013746	CTCG	2	8	6269	6276	0 %	25 %	25 %	50 %	284172860
60	NC_013746	CGG	2	6	6288	6293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284172860
61	NC_013746	TCG	2	6	6328	6333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172860
62	NC_013746	CTC	2	6	6357	6362	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284172860
63	NC_013746	CGTCT	2	10	6378	6387	0 %	40 %	20 %	40 %	284172860
64	NC_013746	GGA	2	6	6393	6398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284172860
65	NC_013746	GGT	2	6	6534	6539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284172860
66	NC_013746	GTA	2	6	6556	6561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284172860
67	NC_013746	TCG	2	6	6649	6654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172860
68	NC_013746	TCG	2	6	6658	6663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172860
69	NC_013746	TCG	2	6	6742	6747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172860
70	NC_013746	TTA	2	6	6833	6838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284172861
71	NC_013746	TGTT	2	8	6843	6850	0 %	75 %	25 %	0 %	284172861
72	NC_013746	TC	3	6	6861	6866	0 %	50 %	0 %	50 %	284172861
73	NC_013746	TTC	2	6	6867	6872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284172861
74	NC_013746	CAG	2	6	6895	6900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172861
75	NC_013746	CGA	2	6	6931	6936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172861
76	NC_013746	AATCCG	2	12	7036	7047	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	284172861
77	NC_013746	AAC	2	6	8655	8660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284172862
78	NC_013746	GGGA	2	8	8688	8695	25 %	0 %	75 %	0 %	284172862
79	NC_013746	GGA	2	6	8770	8775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284172862
80	NC_013746	CGG	2	6	8800	8805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284172862
81	NC_013746	GA	3	6	8960	8965	50 %	0 %	50 %	0 %	284172862
82	NC_013746	GAA	2	6	8968	8973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284172862
83	NC_013746	CCG	2	6	8977	8982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284172862
84	NC_013746	ATC	2	6	8994	8999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284172862
85	NC_013746	GCG	2	6	9014	9019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284172862
86	NC_013746	GA	3	6	9072	9077	50 %	0 %	50 %	0 %	284172862
87	NC_013746	TA	3	6	9080	9085	50 %	50 %	0 %	0 %	284172862
88	NC_013746	AGCA	2	8	9131	9138	50 %	0 %	25 %	25 %	284172862
89	NC_013746	ATG	2	6	9292	9297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284172863
90	NC_013746	CGA	3	9	9315	9323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172863
91	NC_013746	GAG	2	6	9370	9375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284172863
92	NC_013746	GAG	2	6	10878	10883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284172864
93	NC_013746	CAA	2	6	10940	10945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284172864
94	NC_013746	ATG	2	6	10977	10982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284172864
95	NC_013746	TGA	2	6	11054	11059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284172864
96	NC_013746	TCT	2	6	11078	11083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284172864
97	NC_013746	ATC	2	6	11088	11093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284172864
98	NC_013746	GCA	2	6	11105	11110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172864
99	NC_013746	GA	3	6	11158	11163	50 %	0 %	50 %	0 %	284172864
100	NC_013746	CTGG	2	8	11201	11208	0 %	25 %	50 %	25 %	284172864
101	NC_013746	GTT	2	6	11217	11222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284172864
102	NC_013746	GTT	2	6	11398	11403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284172865
103	NC_013746	TCT	2	6	11411	11416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284172865
104	NC_013746	GATC	3	12	11427	11438	25 %	25 %	25 %	25 %	284172865
105	NC_013746	GAG	2	6	11487	11492	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284172865
106	NC_013746	CTGTGT	2	12	11525	11536	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	284172865
107	NC_013746	TGG	2	6	11543	11548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284172865
108	NC_013746	TTA	2	6	11642	11647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284172866
109	NC_013746	GA	3	6	11676	11681	50 %	0 %	50 %	0 %	284172866
110	NC_013746	ACA	2	6	11730	11735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284172866
111	NC_013746	TCGG	2	8	11982	11989	0 %	25 %	50 %	25 %	284172866
112	NC_013746	TC	3	6	12012	12017	0 %	50 %	0 %	50 %	284172866
113	NC_013746	TTCG	2	8	12026	12033	0 %	50 %	25 %	25 %	284172866
114	NC_013746	CGA	2	6	12085	12090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172866
115	NC_013746	CACG	2	8	12106	12113	25 %	0 %	25 %	50 %	284172866
116	NC_013746	CGAG	2	8	12138	12145	25 %	0 %	50 %	25 %	284172866
117	NC_013746	GTG	2	6	12232	12237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284172867
118	NC_013746	CGG	2	6	12260	12265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284172867
119	NC_013746	GCG	2	6	12284	12289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284172867
120	NC_013746	GGT	2	6	13722	13727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284172868
121	NC_013746	TAACA	2	10	13756	13765	60 %	20 %	0 %	20 %	284172868
122	NC_013746	TGCT	2	8	13826	13833	0 %	50 %	25 %	25 %	284172868
123	NC_013746	ATG	2	6	13847	13852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284172868
124	NC_013746	CAG	2	6	13870	13875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172868
125	NC_013746	TTC	2	6	13951	13956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284172868
126	NC_013746	CGAT	2	8	14012	14019	25 %	25 %	25 %	25 %	284172868
127	NC_013746	TCG	2	6	14063	14068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172868
128	NC_013746	TTC	2	6	14086	14091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284172868
129	NC_013746	A	6	6	14181	14186	100 %	0 %	0 %	0 %	284172868
130	NC_013746	TCT	2	6	14231	14236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284172868
131	NC_013746	CGT	2	6	14277	14282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172868
132	NC_013746	CAGCC	2	10	14290	14299	20 %	0 %	20 %	60 %	284172868
133	NC_013746	TCC	2	6	14372	14377	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284172868
134	NC_013746	GCA	2	6	14393	14398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172868
135	NC_013746	AG	3	6	14452	14457	50 %	0 %	50 %	0 %	284172868
136	NC_013746	CGC	3	9	14465	14473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284172868
137	NC_013746	CAT	2	6	14496	14501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284172868
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139	NC_013746	GAT	2	6	14559	14564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284172868
140	NC_013746	CT	3	6	14587	14592	0 %	50 %	0 %	50 %	284172868
141	NC_013746	CTA	2	6	14685	14690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284172868
142	NC_013746	CTT	2	6	14730	14735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284172868
143	NC_013746	GGA	2	6	14808	14813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284172868
144	NC_013746	ATTT	2	8	14818	14825	25 %	75 %	0 %	0 %	284172868
145	NC_013746	TC	3	6	14827	14832	0 %	50 %	0 %	50 %	284172868
146	NC_013746	GTC	2	6	15182	15187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172869
147	NC_013746	CGG	3	9	15193	15201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284172869
148	NC_013746	TCG	2	6	15288	15293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172869
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151	NC_013746	CGA	2	6	15388	15393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172869
152	NC_013746	ACC	3	9	15415	15423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284172869
153	NC_013746	CGA	2	6	15433	15438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172869
154	NC_013746	CGT	2	6	15541	15546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172869
155	NC_013746	CGA	2	6	15613	15618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172869
156	NC_013746	CGT	2	6	15633	15638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172869
157	NC_013746	GTCTT	2	10	15645	15654	0 %	60 %	20 %	20 %	284172869
158	NC_013746	CGA	2	6	15676	15681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172869
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163	NC_013746	GTA	2	6	15929	15934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284172869
164	NC_013746	CCG	2	6	15942	15947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284172869
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169	NC_013746	GAG	2	6	16076	16081	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284172869
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241	NC_013746	AAG	2	6	21863	21868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284172874
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243	NC_013746	AAG	2	6	21908	21913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284172874
244	NC_013746	GAA	2	6	21919	21924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284172874
245	NC_013746	TCGACA	2	12	21957	21968	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	284172874
246	NC_013746	GAG	2	6	22061	22066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284172874
247	NC_013746	GGT	2	6	22283	22288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284172874
248	NC_013746	GCT	2	6	22291	22296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172874
249	NC_013746	TGA	2	6	23680	23685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284172875
250	NC_013746	CCAC	2	8	23721	23728	25 %	0 %	0 %	75 %	284172875
251	NC_013746	CAG	2	6	23738	23743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172875
252	NC_013746	GGACGC	2	12	23798	23809	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	284172875
253	NC_013746	GCTG	2	8	23814	23821	0 %	25 %	50 %	25 %	284172875
254	NC_013746	GAT	2	6	23918	23923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284172875
255	NC_013746	CGCTGG	2	12	23976	23987	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	284172875
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257	NC_013746	CAG	2	6	24083	24088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172875
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388	NC_013746	GAG	2	6	39355	39360	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284172892
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