MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloterrigena turkmenica DSM 5511 plasmid pHTUR02

Total Repeats: 7281

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_013745	TGA	2	6	167999	168004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284172663
3002	NC_013745	GGT	3	9	168006	168014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284172663
3003	NC_013745	CGG	2	6	168068	168073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284172663
3004	NC_013745	CTG	2	6	168091	168096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172663
3005	NC_013745	GTC	2	6	168113	168118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172663
3006	NC_013745	GTAC	2	8	168294	168301	25 %	25 %	25 %	25 %	284172663
3007	NC_013745	TGC	2	6	168357	168362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172664
3008	NC_013745	CTG	2	6	168455	168460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172664
3009	NC_013745	GGA	2	6	168478	168483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284172664
3010	NC_013745	GTG	2	6	168492	168497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284172664
3011	NC_013745	CCA	2	6	168518	168523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284172664
3012	NC_013745	TGA	2	6	168704	168709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284172665
3013	NC_013745	TCC	2	6	169317	169322	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284172666
3014	NC_013745	TTC	2	6	169410	169415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284172666
3015	NC_013745	GGT	2	6	169417	169422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284172666
3016	NC_013745	ATC	2	6	169478	169483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284172666
3017	NC_013745	AC	4	8	169517	169524	50 %	0 %	0 %	50 %	284172666
3018	NC_013745	CGA	2	6	170460	170465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172667
3019	NC_013745	GATG	2	8	170565	170572	25 %	25 %	50 %	0 %	284172667
3020	NC_013745	AGG	3	9	170606	170614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284172667
3021	NC_013745	CGC	2	6	170759	170764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284172667
3022	NC_013745	CGG	2	6	170844	170849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284172667
3023	NC_013745	CGA	2	6	170862	170867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172667
3024	NC_013745	GAC	2	6	170908	170913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172667
3025	NC_013745	CG	3	6	170981	170986	0 %	0 %	50 %	50 %	284172667
3026	NC_013745	CGG	2	6	171074	171079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284172667
3027	NC_013745	GCG	2	6	171107	171112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284172667
3028	NC_013745	GCCG	2	8	171189	171196	0 %	0 %	50 %	50 %	284172667
3029	NC_013745	ACGA	2	8	171244	171251	50 %	0 %	25 %	25 %	284172667
3030	NC_013745	GGACG	2	10	171276	171285	20 %	0 %	60 %	20 %	284172667
3031	NC_013745	CAA	2	6	171806	171811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284172668
3032	NC_013745	CTC	2	6	171828	171833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284172668
3033	NC_013745	AATT	2	8	171874	171881	50 %	50 %	0 %	0 %	284172668
3034	NC_013745	TGG	2	6	171890	171895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284172668
3035	NC_013745	GAG	2	6	171975	171980	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284172668
3036	NC_013745	ATCG	2	8	171986	171993	25 %	25 %	25 %	25 %	284172668
3037	NC_013745	CGAG	2	8	171998	172005	25 %	0 %	50 %	25 %	284172668
3038	NC_013745	ATG	2	6	172006	172011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284172668
3039	NC_013745	CGG	2	6	172236	172241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284172669
3040	NC_013745	TGG	2	6	172258	172263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284172669
3041	NC_013745	CGG	2	6	172346	172351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284172669
3042	NC_013745	TCGG	2	8	172412	172419	0 %	25 %	50 %	25 %	284172669
3043	NC_013745	CAC	2	6	172427	172432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284172669
3044	NC_013745	GATC	2	8	173684	173691	25 %	25 %	25 %	25 %	284172670
3045	NC_013745	CTT	2	6	173724	173729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284172670
3046	NC_013745	GCC	2	6	173733	173738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284172670
3047	NC_013745	TTCG	2	8	173799	173806	0 %	50 %	25 %	25 %	284172670
3048	NC_013745	TCGT	2	8	173830	173837	0 %	50 %	25 %	25 %	284172670
3049	NC_013745	CCG	2	6	173877	173882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284172670
3050	NC_013745	GACCG	2	10	173922	173931	20 %	0 %	40 %	40 %	284172670
3051	NC_013745	CCT	2	6	173936	173941	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284172670
3052	NC_013745	CGT	3	9	173957	173965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172670
3053	NC_013745	CGT	2	6	174056	174061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172670
3054	NC_013745	CGT	2	6	174089	174094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172670
3055	NC_013745	AGC	2	6	174188	174193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172670
3056	NC_013745	TGA	2	6	174196	174201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284172670
3057	NC_013745	CGT	2	6	174213	174218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172670
3058	NC_013745	TCA	2	6	174239	174244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284172670
3059	NC_013745	CGA	2	6	174368	174373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172670
3060	NC_013745	TCG	2	6	174409	174414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172670
3061	NC_013745	GTC	2	6	174445	174450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172670
3062	NC_013745	TCGCCG	2	12	174451	174462	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	284172670
3063	NC_013745	GAC	3	9	174555	174563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172670
3064	NC_013745	TCG	2	6	174716	174721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172670
3065	NC_013745	GTA	2	6	174732	174737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284172670
3066	NC_013745	TCG	2	6	174823	174828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172670
3067	NC_013745	CGC	2	6	174891	174896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284172670
3068	NC_013745	CCT	2	6	174943	174948	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284172670
3069	NC_013745	ACT	2	6	175338	175343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284172671
3070	NC_013745	GTCC	2	8	175357	175364	0 %	25 %	25 %	50 %	284172671
3071	NC_013745	GCG	2	6	175365	175370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284172671
3072	NC_013745	GACC	2	8	175386	175393	25 %	0 %	25 %	50 %	284172671
3073	NC_013745	GAG	2	6	175465	175470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284172671
3074	NC_013745	TCCGT	2	10	175475	175484	0 %	40 %	20 %	40 %	284172671
3075	NC_013745	CGA	2	6	175485	175490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172671
3076	NC_013745	TGG	2	6	175541	175546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284172671
3077	NC_013745	GCTC	2	8	175592	175599	0 %	25 %	25 %	50 %	284172671
3078	NC_013745	GACA	2	8	175818	175825	50 %	0 %	25 %	25 %	284172672
3079	NC_013745	CCG	2	6	176037	176042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284172672
3080	NC_013745	TCG	2	6	176069	176074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172672
3081	NC_013745	CGG	2	6	176176	176181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284172672
3082	NC_013745	GAG	2	6	176215	176220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284172672
3083	NC_013745	TCGAAC	2	12	176240	176251	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	284172672
3084	NC_013745	GCT	2	6	176313	176318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172672
3085	NC_013745	GC	3	6	176330	176335	0 %	0 %	50 %	50 %	284172672
3086	NC_013745	TTCGAA	2	12	176365	176376	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	284172672
3087	NC_013745	CGGCG	2	10	176412	176421	0 %	0 %	60 %	40 %	284172672
3088	NC_013745	GAG	2	6	176458	176463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284172672
3089	NC_013745	GAG	2	6	176470	176475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284172672
3090	NC_013745	CAG	2	6	176491	176496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172672
3091	NC_013745	CGA	2	6	176667	176672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172672
3092	NC_013745	TCG	2	6	176693	176698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172672
3093	NC_013745	CAG	2	6	176732	176737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172673
3094	NC_013745	GC	3	6	176785	176790	0 %	0 %	50 %	50 %	284172673
3095	NC_013745	ATCGAC	2	12	176957	176968	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	284172673
3096	NC_013745	CGG	2	6	176976	176981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284172673
3097	NC_013745	GC	3	6	177000	177005	0 %	0 %	50 %	50 %	284172673
3098	NC_013745	TCG	2	6	177009	177014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172673
3099	NC_013745	CGG	2	6	177040	177045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284172673
3100	NC_013745	TCG	2	6	177048	177053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172673
3101	NC_013745	CGT	2	6	177063	177068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172673
3102	NC_013745	GACC	2	8	177082	177089	25 %	0 %	25 %	50 %	284172673
3103	NC_013745	CGT	2	6	177109	177114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172673
3104	NC_013745	GCC	2	6	177149	177154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284172673
3105	NC_013745	TGC	2	6	177234	177239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172673
3106	NC_013745	GCGACG	2	12	177240	177251	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	284172673
3107	NC_013745	CTGCA	2	10	177258	177267	20 %	20 %	20 %	40 %	284172673
3108	NC_013745	TCG	2	6	177291	177296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172673
3109	NC_013745	CGAG	2	8	177390	177397	25 %	0 %	50 %	25 %	284172673
3110	NC_013745	AGCG	2	8	177438	177445	25 %	0 %	50 %	25 %	284172673
3111	NC_013745	CGA	3	9	177475	177483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172673
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3114	NC_013745	GA	3	6	177552	177557	50 %	0 %	50 %	0 %	284172673
3115	NC_013745	GTC	2	6	177560	177565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172673
3116	NC_013745	GAC	2	6	177583	177588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172673
3117	NC_013745	CTTG	2	8	177616	177623	0 %	50 %	25 %	25 %	284172673
3118	NC_013745	CTT	2	6	177762	177767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284172674
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3120	NC_013745	AGG	2	6	177794	177799	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284172674
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3241	NC_013745	AGA	2	6	183449	183454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284172680
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3243	NC_013745	CAGC	2	8	183708	183715	25 %	0 %	25 %	50 %	284172680
3244	NC_013745	CGT	2	6	183812	183817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172680
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3272	NC_013745	TG	3	6	186875	186880	0 %	50 %	50 %	0 %	284172685
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3351	NC_013745	TC	3	6	192255	192260	0 %	50 %	0 %	50 %	284172691
3352	NC_013745	ACT	2	6	192290	192295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284172692
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3358	NC_013745	TCCCGG	2	12	192505	192516	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	284172692
3359	NC_013745	ACG	2	6	192609	192614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172692
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3362	NC_013745	GAG	2	6	192857	192862	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284172693
3363	NC_013745	AGG	2	6	192875	192880	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284172693
3364	NC_013745	TCG	2	6	192932	192937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172693
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3367	NC_013745	TCG	3	9	193013	193021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172693
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3480	NC_013745	TCCG	2	8	203677	203684	0 %	25 %	25 %	50 %	284172702
3481	NC_013745	CGG	2	6	203692	203697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284172702
3482	NC_013745	CGT	2	6	203767	203772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172702
3483	NC_013745	TAC	2	6	203786	203791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284172702
3484	NC_013745	ACT	2	6	203839	203844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284172702
3485	NC_013745	GAT	2	6	203884	203889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284172702
3486	NC_013745	CCA	2	6	204074	204079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284172702
3487	NC_013745	TAT	2	6	204100	204105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284172702
3488	NC_013745	TAT	2	6	204127	204132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284172702
3489	NC_013745	CGG	2	6	204151	204156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284172702
3490	NC_013745	ACT	2	6	204157	204162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284172702
3491	NC_013745	TTC	2	6	204207	204212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284172702
3492	NC_013745	GCA	2	6	204304	204309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172702
3493	NC_013745	ACGT	2	8	204311	204318	25 %	25 %	25 %	25 %	284172702
3494	NC_013745	CTTT	2	8	204415	204422	0 %	75 %	0 %	25 %	284172702
3495	NC_013745	GC	3	6	204433	204438	0 %	0 %	50 %	50 %	284172702
3496	NC_013745	ACT	2	6	204503	204508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284172702
3497	NC_013745	CGACC	2	10	205786	205795	20 %	0 %	20 %	60 %	284172703
3498	NC_013745	CTT	2	6	205803	205808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284172703
3499	NC_013745	ACG	2	6	206376	206381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172704
3500	NC_013745	GGC	2	6	208032	208037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284172705

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