MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloterrigena turkmenica DSM 5511 plasmid pHTUR02

Total Repeats: 7281

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_013745	TCCG	2	8	42924	42931	0 %	25 %	25 %	50 %	284172559
1002	NC_013745	CGT	2	6	42966	42971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172559
1003	NC_013745	CGA	2	6	43032	43037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172559
1004	NC_013745	CGT	2	6	43038	43043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172559
1005	NC_013745	GC	3	6	43182	43187	0 %	0 %	50 %	50 %	284172559
1006	NC_013745	TCTG	2	8	43205	43212	0 %	50 %	25 %	25 %	284172559
1007	NC_013745	CGG	2	6	43277	43282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284172559
1008	NC_013745	AAG	2	6	43285	43290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284172559
1009	NC_013745	CGG	2	6	43314	43319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284172559
1010	NC_013745	GAC	2	6	43396	43401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172559
1011	NC_013745	GACT	2	8	43417	43424	25 %	25 %	25 %	25 %	284172559
1012	NC_013745	ACG	2	6	44435	44440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172560
1013	NC_013745	CGA	2	6	44506	44511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172560
1014	NC_013745	ACG	2	6	44523	44528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172560
1015	NC_013745	ACG	2	6	44546	44551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172560
1016	NC_013745	ACG	2	6	44565	44570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172560
1017	NC_013745	CGC	3	9	44614	44622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284172560
1018	NC_013745	TTC	2	6	44669	44674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284172560
1019	NC_013745	GAC	2	6	44690	44695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172560
1020	NC_013745	CTG	2	6	44725	44730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172560
1021	NC_013745	GGA	2	6	44767	44772	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284172560
1022	NC_013745	TCTCG	2	10	44791	44800	0 %	40 %	20 %	40 %	284172560
1023	NC_013745	CGC	2	6	44809	44814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284172560
1024	NC_013745	CGA	2	6	44847	44852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172560
1025	NC_013745	GAC	2	6	44867	44872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172560
1026	NC_013745	GAG	2	6	44873	44878	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284172560
1027	NC_013745	TGG	2	6	44879	44884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284172560
1028	NC_013745	CGC	3	9	44887	44895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284172560
1029	NC_013745	GCG	2	6	44982	44987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284172560
1030	NC_013745	ACCGGA	2	12	45028	45039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172560
1031	NC_013745	CCGA	2	8	45189	45196	25 %	0 %	25 %	50 %	284172561
1032	NC_013745	GGC	2	6	45204	45209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284172561
1033	NC_013745	CCG	2	6	45210	45215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284172561
1034	NC_013745	ACG	2	6	45241	45246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172561
1035	NC_013745	CCT	2	6	45269	45274	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284172561
1036	NC_013745	CGG	2	6	45324	45329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284172561
1037	NC_013745	GAC	2	6	45330	45335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172561
1038	NC_013745	CGG	2	6	45401	45406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284172561
1039	NC_013745	CGC	2	6	45413	45418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284172561
1040	NC_013745	CCCGGC	2	12	45432	45443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284172561
1041	NC_013745	GAA	2	6	45467	45472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284172561
1042	NC_013745	CGA	2	6	45479	45484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172561
1043	NC_013745	CGC	2	6	45506	45511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284172561
1044	NC_013745	ACT	2	6	45592	45597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284172561
1045	NC_013745	CGC	2	6	45658	45663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284172561
1046	NC_013745	CTC	2	6	45699	45704	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284172561
1047	NC_013745	CGC	2	6	45721	45726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284172561
1048	NC_013745	CCG	2	6	45741	45746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284172561
1049	NC_013745	CG	3	6	45782	45787	0 %	0 %	50 %	50 %	284172561
1050	NC_013745	ACT	2	6	45791	45796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284172561
1051	NC_013745	CGCCGA	2	12	45797	45808	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	284172561
1052	NC_013745	GTC	2	6	45816	45821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172561
1053	NC_013745	TCGGCG	2	12	45826	45837	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	284172561
1054	NC_013745	TCG	2	6	45874	45879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172561
1055	NC_013745	CGT	2	6	45896	45901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172561
1056	NC_013745	CCT	2	6	45904	45909	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284172561
1057	NC_013745	CAAGGG	2	12	45911	45922	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	284172561
1058	NC_013745	CG	3	6	45990	45995	0 %	0 %	50 %	50 %	284172561
1059	NC_013745	GCC	2	6	46002	46007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284172561
1060	NC_013745	CGT	2	6	46010	46015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172561
1061	NC_013745	CCG	2	6	46051	46056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284172561
1062	NC_013745	CTCGA	2	10	46098	46107	20 %	20 %	20 %	40 %	284172561
1063	NC_013745	TCG	2	6	46144	46149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172561
1064	NC_013745	ACG	2	6	46150	46155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172561
1065	NC_013745	AG	3	6	46197	46202	50 %	0 %	50 %	0 %	284172561
1066	NC_013745	GCC	2	6	46227	46232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284172561
1067	NC_013745	GTCG	2	8	46233	46240	0 %	25 %	50 %	25 %	284172561
1068	NC_013745	CG	3	6	46248	46253	0 %	0 %	50 %	50 %	284172561
1069	NC_013745	ACG	2	6	46258	46263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172561
1070	NC_013745	GAC	2	6	46293	46298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172561
1071	NC_013745	CGGC	2	8	46312	46319	0 %	0 %	50 %	50 %	284172561
1072	NC_013745	GC	3	6	46318	46323	0 %	0 %	50 %	50 %	284172561
1073	NC_013745	CGT	2	6	46358	46363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172561
1074	NC_013745	GAC	2	6	46364	46369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172561
1075	NC_013745	CGG	2	6	46376	46381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284172561
1076	NC_013745	GGA	2	6	46415	46420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284172561
1077	NC_013745	ACGTC	2	10	46432	46441	20 %	20 %	20 %	40 %	284172561
1078	NC_013745	GTC	2	6	46515	46520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172561
1079	NC_013745	CGG	2	6	46535	46540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284172561
1080	NC_013745	ATG	2	6	46545	46550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284172561
1081	NC_013745	CAA	2	6	46610	46615	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284172561
1082	NC_013745	ATC	2	6	46629	46634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284172561
1083	NC_013745	CGC	2	6	46700	46705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284172561
1084	NC_013745	CG	3	6	46784	46789	0 %	0 %	50 %	50 %	284172561
1085	NC_013745	CGT	2	6	46846	46851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172561
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1087	NC_013745	CGA	2	6	47433	47438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172562
1088	NC_013745	AGGCGC	2	12	47561	47572	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	284172562
1089	NC_013745	CAGC	2	8	47607	47614	25 %	0 %	25 %	50 %	284172562
1090	NC_013745	CGG	2	6	47628	47633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284172562
1091	NC_013745	CGA	2	6	47655	47660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172562
1092	NC_013745	CGA	2	6	47664	47669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172562
1093	NC_013745	GACGG	2	10	47737	47746	20 %	0 %	60 %	20 %	284172562
1094	NC_013745	TGG	2	6	47752	47757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284172562
1095	NC_013745	CGA	2	6	47802	47807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172562
1096	NC_013745	GGTCG	2	10	47826	47835	0 %	20 %	60 %	20 %	284172562
1097	NC_013745	GAC	2	6	47839	47844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172562
1098	NC_013745	GTG	2	6	47862	47867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284172562
1099	NC_013745	GC	3	6	47916	47921	0 %	0 %	50 %	50 %	284172562
1100	NC_013745	CGC	3	9	47919	47927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284172562
1101	NC_013745	ACG	2	6	47954	47959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172562
1102	NC_013745	CGA	2	6	47967	47972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172562
1103	NC_013745	CGAAC	2	10	48023	48032	40 %	0 %	20 %	40 %	284172562
1104	NC_013745	GAC	2	6	48073	48078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172562
1105	NC_013745	CGT	2	6	48126	48131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172562
1106	NC_013745	CTG	2	6	48144	48149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172562
1107	NC_013745	CGA	2	6	48156	48161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172562
1108	NC_013745	TCG	2	6	48188	48193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172562
1109	NC_013745	TC	3	6	48213	48218	0 %	50 %	0 %	50 %	284172562
1110	NC_013745	CGG	2	6	48234	48239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284172562
1111	NC_013745	GGA	2	6	48264	48269	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284172562
1112	NC_013745	CGA	2	6	48296	48301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172562
1113	NC_013745	CGA	2	6	48348	48353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172562
1114	NC_013745	TCG	2	6	48356	48361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172562
1115	NC_013745	GCG	2	6	48370	48375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284172562
1116	NC_013745	GAT	2	6	48390	48395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284172562
1117	NC_013745	GAG	2	6	48424	48429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284172562
1118	NC_013745	GGTG	2	8	48437	48444	0 %	25 %	75 %	0 %	284172562
1119	NC_013745	CGAC	2	8	48461	48468	25 %	0 %	25 %	50 %	284172562
1120	NC_013745	GAC	2	6	48573	48578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172562
1121	NC_013745	GGC	2	6	48615	48620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284172562
1122	NC_013745	CGA	2	6	48633	48638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172562
1123	NC_013745	CGAGC	2	10	48705	48714	20 %	0 %	40 %	40 %	284172562
1124	NC_013745	GACC	2	8	48762	48769	25 %	0 %	25 %	50 %	284172562
1125	NC_013745	GAG	2	6	48817	48822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284172562
1126	NC_013745	CGC	2	6	48834	48839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284172562
1127	NC_013745	GACG	2	8	48910	48917	25 %	0 %	50 %	25 %	284172562
1128	NC_013745	GAC	2	6	48922	48927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172562
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1130	NC_013745	GCGA	2	8	48949	48956	25 %	0 %	50 %	25 %	284172562
1131	NC_013745	GA	3	6	48983	48988	50 %	0 %	50 %	0 %	284172562
1132	NC_013745	CGA	2	6	48995	49000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172562
1133	NC_013745	ATC	2	6	49036	49041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284172562
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1135	NC_013745	TAC	2	6	49150	49155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284172562
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1139	NC_013745	GCCG	2	8	49293	49300	0 %	0 %	50 %	50 %	284172562
1140	NC_013745	TGAC	2	8	49316	49323	25 %	25 %	25 %	25 %	284172562
1141	NC_013745	CGA	2	6	49326	49331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172562
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1143	NC_013745	CGG	2	6	49445	49450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284172562
1144	NC_013745	TACGA	2	10	49459	49468	40 %	20 %	20 %	20 %	284172562
1145	NC_013745	CGG	2	6	49486	49491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284172562
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1151	NC_013745	TCG	2	6	49626	49631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172563
1152	NC_013745	TGGCGA	2	12	49672	49683	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	284172563
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1160	NC_013745	CGG	2	6	50099	50104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284172564
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1162	NC_013745	TCG	3	9	50151	50159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172564
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1182	NC_013745	CGAGA	2	10	50984	50993	40 %	0 %	40 %	20 %	284172564
1183	NC_013745	CTCA	2	8	50999	51006	25 %	25 %	0 %	50 %	284172564
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1221	NC_013745	CGA	2	6	52654	52659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172566
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1233	NC_013745	GATC	2	8	53099	53106	25 %	25 %	25 %	25 %	284172567
1234	NC_013745	TGA	2	6	53156	53161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284172567
1235	NC_013745	CAT	2	6	53175	53180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284172567
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1238	NC_013745	ATC	2	6	53290	53295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284172567
1239	NC_013745	GCA	2	6	53312	53317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172567
1240	NC_013745	CCGA	2	8	53325	53332	25 %	0 %	25 %	50 %	284172567
1241	NC_013745	CCG	2	6	53440	53445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284172567
1242	NC_013745	TGGA	2	8	53572	53579	25 %	25 %	50 %	0 %	284172567
1243	NC_013745	AGC	2	6	53596	53601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172567
1244	NC_013745	GTA	2	6	53610	53615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284172567
1245	NC_013745	ACTG	2	8	53663	53670	25 %	25 %	25 %	25 %	284172567
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1247	NC_013745	GGC	2	6	53760	53765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284172567
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1372	NC_013745	TCG	2	6	59982	59987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172572
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1486	NC_013745	GCGAC	2	10	64305	64314	20 %	0 %	40 %	40 %	284172576
1487	NC_013745	GCC	2	6	64323	64328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284172576
1488	NC_013745	GTC	3	9	64385	64393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172576
1489	NC_013745	CGAC	2	8	64435	64442	25 %	0 %	25 %	50 %	284172576
1490	NC_013745	ACCGTC	2	12	64452	64463	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	284172576
1491	NC_013745	GAC	2	6	64464	64469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172576
1492	NC_013745	CGTCGA	2	12	64519	64530	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	284172576
1493	NC_013745	GGGA	2	8	64551	64558	25 %	0 %	75 %	0 %	284172576
1494	NC_013745	CCG	2	6	64594	64599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284172576
1495	NC_013745	GCTG	2	8	64648	64655	0 %	25 %	50 %	25 %	284172576
1496	NC_013745	AGC	2	6	64680	64685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172576
1497	NC_013745	CGG	2	6	64697	64702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284172576
1498	NC_013745	AACC	2	8	64719	64726	50 %	0 %	0 %	50 %	284172576
1499	NC_013745	GGT	3	9	64732	64740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284172576
1500	NC_013745	AGA	2	6	64768	64773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284172576

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