MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloterrigena turkmenica DSM 5511 plasmid pHTUR01

Total Repeats: 13849

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013744	CTC	2	6	95	100	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284167036
2	NC_013744	GTG	2	6	101	106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284167036
3	NC_013744	GCGA	2	8	113	120	25 %	0 %	50 %	25 %	284167036
4	NC_013744	TCGA	2	8	227	234	25 %	25 %	25 %	25 %	284167036
5	NC_013744	CCT	2	6	235	240	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284167036
6	NC_013744	TCG	2	6	252	257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167036
7	NC_013744	GTT	2	6	368	373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284167036
8	NC_013744	GCG	2	6	409	414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167036
9	NC_013744	CGGC	2	8	423	430	0 %	0 %	50 %	50 %	284167036
10	NC_013744	GGA	2	6	434	439	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284167036
11	NC_013744	TGA	2	6	445	450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284167036
12	NC_013744	CGA	2	6	484	489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167036
13	NC_013744	TG	3	6	492	497	0 %	50 %	50 %	0 %	284167036
14	NC_013744	CGA	2	6	526	531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167036
15	NC_013744	CTC	2	6	557	562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284167036
16	NC_013744	GTT	2	6	590	595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284167036
17	NC_013744	CCG	2	6	612	617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167036
18	NC_013744	TCG	2	6	621	626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167036
19	NC_013744	CCGG	2	8	697	704	0 %	0 %	50 %	50 %	284167036
20	NC_013744	CCT	2	6	730	735	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284167036
21	NC_013744	CGAG	2	8	745	752	25 %	0 %	50 %	25 %	284167036
22	NC_013744	GAC	3	9	761	769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167036
23	NC_013744	TC	3	6	844	849	0 %	50 %	0 %	50 %	284167036
24	NC_013744	AGT	2	6	866	871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284167036
25	NC_013744	ACA	2	6	884	889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284167036
26	NC_013744	GCG	2	6	1019	1024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167037
27	NC_013744	GAC	2	6	1029	1034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167037
28	NC_013744	GTC	2	6	1044	1049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167037
29	NC_013744	CCG	2	6	1096	1101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167037
30	NC_013744	AACCG	2	10	1132	1141	40 %	0 %	20 %	40 %	284167037
31	NC_013744	GCG	2	6	1190	1195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167037
32	NC_013744	GAT	2	6	1206	1211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284167037
33	NC_013744	CGC	2	6	1229	1234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167037
34	NC_013744	CGC	2	6	1268	1273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167037
35	NC_013744	AC	3	6	1281	1286	50 %	0 %	0 %	50 %	284167037
36	NC_013744	CGG	2	6	1293	1298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167037
37	NC_013744	CGG	2	6	1343	1348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167037
38	NC_013744	ACC	2	6	1448	1453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284167038
39	NC_013744	CCG	2	6	1487	1492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167038
40	NC_013744	CGC	2	6	1548	1553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167038
41	NC_013744	CCCG	2	8	1624	1631	0 %	0 %	25 %	75 %	284167038
42	NC_013744	GTC	2	6	1661	1666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167038
43	NC_013744	CG	3	6	1674	1679	0 %	0 %	50 %	50 %	284167038
44	NC_013744	CGT	2	6	1776	1781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167038
45	NC_013744	CGCT	2	8	1819	1826	0 %	25 %	25 %	50 %	284167038
46	NC_013744	CGG	2	6	1827	1832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167038
47	NC_013744	TCG	2	6	1940	1945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167038
48	NC_013744	CCG	2	6	1956	1961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167038
49	NC_013744	CCGT	2	8	1970	1977	0 %	25 %	25 %	50 %	284167038
50	NC_013744	CGT	2	6	1989	1994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167038
51	NC_013744	GCG	2	6	2019	2024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167038
52	NC_013744	CGT	2	6	2034	2039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167038
53	NC_013744	GTTC	2	8	2070	2077	0 %	50 %	25 %	25 %	284167038
54	NC_013744	GCGTGG	2	12	2084	2095	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	284167038
55	NC_013744	TTC	2	6	2096	2101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284167038
56	NC_013744	TCG	2	6	2213	2218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167038
57	NC_013744	ACGA	2	8	2243	2250	50 %	0 %	25 %	25 %	284167038
58	NC_013744	TCGT	2	8	2258	2265	0 %	50 %	25 %	25 %	284167038
59	NC_013744	GCC	2	6	2278	2283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167038
60	NC_013744	CGC	3	9	2304	2312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167038
61	NC_013744	CGC	2	6	2343	2348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167038
62	NC_013744	CGG	2	6	2394	2399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167038
63	NC_013744	TGG	2	6	2420	2425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284167038
64	NC_013744	ATC	2	6	2500	2505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284167038
65	NC_013744	CCGAA	2	10	2523	2532	40 %	0 %	20 %	40 %	284167038
66	NC_013744	GTCCG	2	10	2541	2550	0 %	20 %	40 %	40 %	284167038
67	NC_013744	AGC	2	6	2812	2817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167039
68	NC_013744	CGT	2	6	2819	2824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167039
69	NC_013744	GTC	2	6	2874	2879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167039
70	NC_013744	GCC	2	6	2892	2897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167039
71	NC_013744	GAA	2	6	2898	2903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284167039
72	NC_013744	CCG	2	6	2922	2927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167039
73	NC_013744	CGAT	2	8	2938	2945	25 %	25 %	25 %	25 %	284167039
74	NC_013744	ACCG	2	8	2972	2979	25 %	0 %	25 %	50 %	284167039
75	NC_013744	CGGAT	2	10	2992	3001	20 %	20 %	40 %	20 %	284167039
76	NC_013744	CAG	2	6	3286	3291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167040
77	NC_013744	ACC	2	6	3363	3368	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284167040
78	NC_013744	CGG	4	12	3432	3443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167040
79	NC_013744	TGAG	2	8	3446	3453	25 %	25 %	50 %	0 %	284167040
80	NC_013744	CAG	2	6	3523	3528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167040
81	NC_013744	TGG	2	6	3530	3535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284167040
82	NC_013744	C	6	6	3536	3541	0 %	0 %	0 %	100 %	284167040
83	NC_013744	CGGC	2	8	3599	3606	0 %	0 %	50 %	50 %	284167040
84	NC_013744	CGA	2	6	3668	3673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167040
85	NC_013744	GAA	2	6	3679	3684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284167040
86	NC_013744	GTCA	2	8	3724	3731	25 %	25 %	25 %	25 %	284167040
87	NC_013744	CGG	2	6	3749	3754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167040
88	NC_013744	GCTC	2	8	3785	3792	0 %	25 %	25 %	50 %	284167040
89	NC_013744	CGA	3	9	3804	3812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167040
90	NC_013744	GGA	2	6	3876	3881	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284167040
91	NC_013744	TCG	2	6	3884	3889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167040
92	NC_013744	GAG	2	6	3895	3900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284167040
93	NC_013744	CG	3	6	3911	3916	0 %	0 %	50 %	50 %	284167040
94	NC_013744	AGG	2	6	3920	3925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284167040
95	NC_013744	CAG	2	6	4030	4035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167040
96	NC_013744	CG	4	8	4118	4125	0 %	0 %	50 %	50 %	284167040
97	NC_013744	CG	3	6	4135	4140	0 %	0 %	50 %	50 %	284167040
98	NC_013744	GA	3	6	4211	4216	50 %	0 %	50 %	0 %	284167040
99	NC_013744	CGT	2	6	4227	4232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167040
100	NC_013744	CGC	2	6	4323	4328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167040
101	NC_013744	CGA	2	6	4335	4340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167040
102	NC_013744	AGA	2	6	4346	4351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284167040
103	NC_013744	CGA	2	6	4849	4854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167041
104	NC_013744	CAGA	2	8	4871	4878	50 %	0 %	25 %	25 %	284167041
105	NC_013744	TTC	2	6	4958	4963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284167041
106	NC_013744	AAG	2	6	4979	4984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284167041
107	NC_013744	GAA	2	6	4993	4998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284167041
108	NC_013744	GTGCG	2	10	5008	5017	0 %	20 %	60 %	20 %	284167041
109	NC_013744	CGC	2	6	5028	5033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167041
110	NC_013744	AGG	2	6	5034	5039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284167041
111	NC_013744	GGTCGA	2	12	5074	5085	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	284167041
112	NC_013744	CGT	2	6	5095	5100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167041
113	NC_013744	TTC	2	6	5120	5125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284167041
114	NC_013744	GCC	2	6	5146	5151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167041
115	NC_013744	TGC	2	6	5196	5201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167041
116	NC_013744	CGA	2	6	5209	5214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167041
117	NC_013744	ACG	2	6	5232	5237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167041
118	NC_013744	GCACG	2	10	5445	5454	20 %	0 %	40 %	40 %	284167042
119	NC_013744	GCC	2	6	5518	5523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167042
120	NC_013744	CGG	2	6	5531	5536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167042
121	NC_013744	GAG	2	6	5548	5553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284167042
122	NC_013744	CAT	2	6	5562	5567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284167042
123	NC_013744	ACG	2	6	5588	5593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167042
124	NC_013744	CCG	2	6	5624	5629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167042
125	NC_013744	CGGG	2	8	5630	5637	0 %	0 %	75 %	25 %	284167042
126	NC_013744	GGC	2	6	5671	5676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167042
127	NC_013744	CCA	2	6	5685	5690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284167042
128	NC_013744	GGC	3	9	5691	5699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167042
129	NC_013744	CGT	2	6	5724	5729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167042
130	NC_013744	TCG	2	6	5735	5740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167042
131	NC_013744	GC	3	6	5768	5773	0 %	0 %	50 %	50 %	284167042
132	NC_013744	ACC	2	6	5801	5806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284167042
133	NC_013744	AGG	2	6	5861	5866	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284167042
134	NC_013744	CCG	2	6	5879	5884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167042
135	NC_013744	GAA	2	6	5907	5912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284167042
136	NC_013744	CGG	2	6	5924	5929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167042
137	NC_013744	ACG	2	6	5933	5938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167042
138	NC_013744	CGA	2	6	5967	5972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167042
139	NC_013744	CGG	2	6	5990	5995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167042
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143	NC_013744	GGC	2	6	6183	6188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167042
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152	NC_013744	CGA	2	6	6389	6394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167042
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160	NC_013744	CGA	2	6	6701	6706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167043
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164	NC_013744	CCG	2	6	6829	6834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167043
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246	NC_013744	GCGACC	2	12	10466	10477	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	284167046
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249	NC_013744	CGG	2	6	10530	10535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167046
250	NC_013744	CGA	2	6	10557	10562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167046
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254	NC_013744	CG	3	6	10819	10824	0 %	0 %	50 %	50 %	284167047
255	NC_013744	CTC	2	6	10873	10878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284167047
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257	NC_013744	CCT	2	6	11004	11009	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284167047
258	NC_013744	CG	3	6	11018	11023	0 %	0 %	50 %	50 %	284167047
259	NC_013744	CGAGAC	2	12	11040	11051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167047
260	NC_013744	GTC	2	6	11074	11079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167047
261	NC_013744	CTCG	2	8	11140	11147	0 %	25 %	25 %	50 %	284167047
262	NC_013744	TGG	2	6	11150	11155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284167047
263	NC_013744	AGC	2	6	11171	11176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167047
264	NC_013744	GAA	2	6	11197	11202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284167047
265	NC_013744	CGA	2	6	11263	11268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167047
266	NC_013744	GTTC	2	8	11272	11279	0 %	50 %	25 %	25 %	284167047
267	NC_013744	ACG	2	6	11285	11290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167047
268	NC_013744	TCG	2	6	11306	11311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167047
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270	NC_013744	TTC	2	6	11344	11349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284167047
271	NC_013744	GCC	2	6	11354	11359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167047
272	NC_013744	CGA	2	6	11361	11366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167047
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275	NC_013744	CGGCGT	2	12	11427	11438	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	284167047
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279	NC_013744	CGT	2	6	11484	11489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167047
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286	NC_013744	CGA	2	6	11897	11902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167048
287	NC_013744	CGT	2	6	11954	11959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167048
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289	NC_013744	GTGA	2	8	11970	11977	25 %	25 %	50 %	0 %	284167048
290	NC_013744	CCG	2	6	11996	12001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167048
291	NC_013744	TGA	2	6	12026	12031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284167048
292	NC_013744	TGA	2	6	12077	12082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284167048
293	NC_013744	CGT	2	6	12107	12112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167048
294	NC_013744	TCGCG	2	10	12171	12180	0 %	20 %	40 %	40 %	284167048
295	NC_013744	TCG	2	6	12220	12225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167048
296	NC_013744	CTC	2	6	12252	12257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284167048
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299	NC_013744	GATC	2	8	12398	12405	25 %	25 %	25 %	25 %	284167048
300	NC_013744	CGA	2	6	12410	12415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167048
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302	NC_013744	TCG	2	6	12445	12450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167048
303	NC_013744	CGT	2	6	12458	12463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167048
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332	NC_013744	CGA	2	6	13678	13683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167049
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384	NC_013744	TCG	2	6	15944	15949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167051
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498	NC_013744	CTCG	2	8	20201	20208	0 %	25 %	25 %	50 %	284167055
499	NC_013744	TTC	2	6	20219	20224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284167055
500	NC_013744	GAC	2	6	20269	20274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167055

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