MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloterrigena turkmenica DSM 5511 plasmid pHTUR01

Total Repeats: 13849

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_013744	CGA	2	6	565611	565616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167513
11002	NC_013744	GACCAC	2	12	565627	565638	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	284167513
11003	NC_013744	CGG	2	6	565670	565675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167513
11004	NC_013744	ACT	2	6	565693	565698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284167513
11005	NC_013744	CGT	2	6	565728	565733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167513
11006	NC_013744	ACGA	2	8	565765	565772	50 %	0 %	25 %	25 %	284167513
11007	NC_013744	CGA	2	6	565787	565792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167513
11008	NC_013744	ACG	2	6	565811	565816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167513
11009	NC_013744	CGA	2	6	565833	565838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167513
11010	NC_013744	GCG	2	6	565856	565861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167513
11011	NC_013744	TC	3	6	565863	565868	0 %	50 %	0 %	50 %	284167513
11012	NC_013744	GT	3	6	565910	565915	0 %	50 %	50 %	0 %	284167513
11013	NC_013744	ACT	3	9	565919	565927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284167513
11014	NC_013744	TCG	2	6	565967	565972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167513
11015	NC_013744	CGACC	2	10	565975	565984	20 %	0 %	20 %	60 %	284167513
11016	NC_013744	ACC	2	6	566010	566015	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284167513
11017	NC_013744	GC	3	6	566075	566080	0 %	0 %	50 %	50 %	284167513
11018	NC_013744	CGG	2	6	566085	566090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167513
11019	NC_013744	CGA	2	6	566097	566102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167513
11020	NC_013744	CGG	2	6	566112	566117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167513
11021	NC_013744	GAC	3	9	566119	566127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167513
11022	NC_013744	ACG	2	6	566132	566137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167513
11023	NC_013744	GAC	2	6	566475	566480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167514
11024	NC_013744	ACG	2	6	566547	566552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167514
11025	NC_013744	GGC	2	6	566557	566562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167514
11026	NC_013744	TGC	2	6	566630	566635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167514
11027	NC_013744	CAT	2	6	566679	566684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284167514
11028	NC_013744	CG	3	6	566890	566895	0 %	0 %	50 %	50 %	284167514
11029	NC_013744	GAG	2	6	566932	566937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284167514
11030	NC_013744	GAG	2	6	566962	566967	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284167514
11031	NC_013744	CGTCG	2	10	566997	567006	0 %	20 %	40 %	40 %	284167514
11032	NC_013744	TCC	2	6	567047	567052	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284167514
11033	NC_013744	CCGG	2	8	567069	567076	0 %	0 %	50 %	50 %	284167514
11034	NC_013744	TCG	2	6	567089	567094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167514
11035	NC_013744	TCG	2	6	567098	567103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167514
11036	NC_013744	CGAA	2	8	567158	567165	50 %	0 %	25 %	25 %	284167514
11037	NC_013744	TCG	2	6	567227	567232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167514
11038	NC_013744	GAC	2	6	567241	567246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167514
11039	NC_013744	CTCC	2	8	567270	567277	0 %	25 %	0 %	75 %	284167514
11040	NC_013744	GAC	2	6	567304	567309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167514
11041	NC_013744	CGA	2	6	567327	567332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167514
11042	NC_013744	CTG	2	6	567352	567357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167514
11043	NC_013744	TCG	2	6	567365	567370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167514
11044	NC_013744	GAT	2	6	567505	567510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284167515
11045	NC_013744	CGC	2	6	567540	567545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167515
11046	NC_013744	ATG	2	6	567568	567573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284167515
11047	NC_013744	ATG	2	6	567589	567594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284167515
11048	NC_013744	CGG	2	6	567624	567629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167515
11049	NC_013744	CTC	2	6	567664	567669	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284167515
11050	NC_013744	ATT	2	6	567676	567681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284167515
11051	NC_013744	ACGG	2	8	567747	567754	25 %	0 %	50 %	25 %	284167515
11052	NC_013744	GTG	2	6	567791	567796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284167515
11053	NC_013744	GAG	2	6	567808	567813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284167515
11054	NC_013744	GAG	2	6	567817	567822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284167515
11055	NC_013744	CGT	2	6	567823	567828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167515
11056	NC_013744	GTA	2	6	567849	567854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284167515
11057	NC_013744	CGC	2	6	567881	567886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167516
11058	NC_013744	TGC	2	6	568041	568046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167516
11059	NC_013744	CTCGT	2	10	568082	568091	0 %	40 %	20 %	40 %	284167516
11060	NC_013744	AGCG	2	8	568151	568158	25 %	0 %	50 %	25 %	284167516
11061	NC_013744	TGC	2	6	568193	568198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167516
11062	NC_013744	GAG	2	6	568220	568225	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284167516
11063	NC_013744	GTC	2	6	568388	568393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167516
11064	NC_013744	CGAT	2	8	568429	568436	25 %	25 %	25 %	25 %	284167516
11065	NC_013744	AC	3	6	568488	568493	50 %	0 %	0 %	50 %	284167516
11066	NC_013744	GGA	2	6	568498	568503	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284167516
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11068	NC_013744	TCG	2	6	568668	568673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167516
11069	NC_013744	ACTCG	2	10	568675	568684	20 %	20 %	20 %	40 %	284167516
11070	NC_013744	TCG	2	6	568794	568799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167516
11071	NC_013744	CT	3	6	569239	569244	0 %	50 %	0 %	50 %	284167517
11072	NC_013744	ACG	2	6	569309	569314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167517
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11078	NC_013744	GGT	2	6	570085	570090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284167518
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11082	NC_013744	CCCA	2	8	570245	570252	25 %	0 %	0 %	75 %	284167518
11083	NC_013744	GTT	2	6	570365	570370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284167518
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11086	NC_013744	CTA	2	6	570569	570574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284167518
11087	NC_013744	TCG	2	6	570592	570597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167518
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11090	NC_013744	GGTG	2	8	570984	570991	0 %	25 %	75 %	0 %	284167519
11091	NC_013744	GCG	3	9	571003	571011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167519
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11094	NC_013744	CGG	2	6	571083	571088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167519
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11100	NC_013744	CGA	2	6	571559	571564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167520
11101	NC_013744	AGC	2	6	571588	571593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167520
11102	NC_013744	GTG	2	6	571659	571664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284167520
11103	NC_013744	CCG	2	6	571728	571733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167520
11104	NC_013744	CGGCG	2	10	571760	571769	0 %	0 %	60 %	40 %	284167520
11105	NC_013744	CGT	2	6	571804	571809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167520
11106	NC_013744	CGA	2	6	571823	571828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167520
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11109	NC_013744	GCGACC	2	12	571989	572000	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	284167520
11110	NC_013744	CGG	2	6	572094	572099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167520
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11114	NC_013744	ACG	2	6	572230	572235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167520
11115	NC_013744	TTCGT	2	10	572244	572253	0 %	60 %	20 %	20 %	284167520
11116	NC_013744	ACA	2	6	572254	572259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284167520
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11118	NC_013744	CGA	2	6	572294	572299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167520
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11353	NC_013744	TCC	2	6	580863	580868	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284167530
11354	NC_013744	GAG	2	6	580871	580876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284167530
11355	NC_013744	CGG	2	6	580881	580886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167530
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11382	NC_013744	CCG	2	6	582355	582360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167532
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11423	NC_013744	GCG	2	6	584462	584467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167534
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11467	NC_013744	GC	3	6	586465	586470	0 %	0 %	50 %	50 %	284167537
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11470	NC_013744	CTG	2	6	586558	586563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167537
11471	NC_013744	ACGCTC	2	12	586564	586575	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	284167537
11472	NC_013744	CGT	2	6	586605	586610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167537
11473	NC_013744	CGC	2	6	586662	586667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167537
11474	NC_013744	GCG	2	6	586670	586675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167537
11475	NC_013744	CTCG	2	8	586680	586687	0 %	25 %	25 %	50 %	284167537
11476	NC_013744	GTC	2	6	586735	586740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167537
11477	NC_013744	GAT	2	6	586782	586787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284167537
11478	NC_013744	CGG	2	6	586800	586805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167537
11479	NC_013744	ACG	2	6	586820	586825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167537
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11481	NC_013744	CGGG	2	8	587161	587168	0 %	0 %	75 %	25 %	284167538
11482	NC_013744	CTG	2	6	587222	587227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167538
11483	NC_013744	CTT	2	6	587284	587289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284167538
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11490	NC_013744	CGA	2	6	587482	587487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167538
11491	NC_013744	CGA	2	6	587504	587509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167538
11492	NC_013744	TCG	4	12	587532	587543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167538
11493	NC_013744	CCG	2	6	587576	587581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167538
11494	NC_013744	CGA	2	6	587584	587589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167538
11495	NC_013744	CGA	2	6	587602	587607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167538
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11497	NC_013744	GAGT	2	8	587693	587700	25 %	25 %	50 %	0 %	284167538
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11499	NC_013744	CGC	2	6	587880	587885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167539
11500	NC_013744	CGTT	2	8	587896	587903	0 %	50 %	25 %	25 %	284167539

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