MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloterrigena turkmenica DSM 5511 plasmid pHTUR01

Total Repeats: 13849

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_013744	CTC	2	6	520369	520374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284167465
10002	NC_013744	GGC	2	6	520385	520390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167465
10003	NC_013744	CGG	2	6	520406	520411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167465
10004	NC_013744	CGA	2	6	520448	520453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167465
10005	NC_013744	GAC	2	6	520554	520559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167466
10006	NC_013744	GAC	2	6	520573	520578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167466
10007	NC_013744	CCG	2	6	520624	520629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167466
10008	NC_013744	CGA	2	6	520646	520651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167466
10009	NC_013744	CG	3	6	520694	520699	0 %	0 %	50 %	50 %	284167466
10010	NC_013744	G	6	6	520701	520706	0 %	0 %	100 %	0 %	284167466
10011	NC_013744	GTC	2	6	520717	520722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167466
10012	NC_013744	TCGT	2	8	520797	520804	0 %	50 %	25 %	25 %	284167466
10013	NC_013744	CTC	2	6	520830	520835	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284167466
10014	NC_013744	CGC	2	6	520850	520855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167466
10015	NC_013744	CGTA	2	8	520897	520904	25 %	25 %	25 %	25 %	284167466
10016	NC_013744	TGT	2	6	520945	520950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284167466
10017	NC_013744	GAT	2	6	520969	520974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284167466
10018	NC_013744	TCCG	2	8	521012	521019	0 %	25 %	25 %	50 %	284167466
10019	NC_013744	TCG	2	6	521020	521025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167466
10020	NC_013744	CCG	2	6	521027	521032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167466
10021	NC_013744	ATC	2	6	521097	521102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284167466
10022	NC_013744	CGATC	2	10	521135	521144	20 %	20 %	20 %	40 %	284167466
10023	NC_013744	TCG	3	9	521213	521221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167466
10024	NC_013744	GTC	2	6	521226	521231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167466
10025	NC_013744	CGG	2	6	521237	521242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167466
10026	NC_013744	TCG	2	6	521309	521314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167466
10027	NC_013744	TGC	2	6	521395	521400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167466
10028	NC_013744	CGT	2	6	521405	521410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167466
10029	NC_013744	CCA	2	6	522194	522199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284167467
10030	NC_013744	TCC	2	6	522222	522227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284167467
10031	NC_013744	GACG	2	8	522232	522239	25 %	0 %	50 %	25 %	284167467
10032	NC_013744	GACC	2	8	522337	522344	25 %	0 %	25 %	50 %	284167467
10033	NC_013744	CGA	2	6	522373	522378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167467
10034	NC_013744	ACT	2	6	522831	522836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284167468
10035	NC_013744	CGC	2	6	522854	522859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167468
10036	NC_013744	CGTC	2	8	522905	522912	0 %	25 %	25 %	50 %	284167468
10037	NC_013744	ACCG	2	8	522957	522964	25 %	0 %	25 %	50 %	284167468
10038	NC_013744	CGA	2	6	522999	523004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167468
10039	NC_013744	GCGA	2	8	523018	523025	25 %	0 %	50 %	25 %	284167468
10040	NC_013744	GGA	3	9	523026	523034	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284167468
10041	NC_013744	CGA	2	6	523044	523049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167468
10042	NC_013744	CG	4	8	523050	523057	0 %	0 %	50 %	50 %	284167468
10043	NC_013744	GCGA	2	8	523063	523070	25 %	0 %	50 %	25 %	284167468
10044	NC_013744	ACG	2	6	523073	523078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167468
10045	NC_013744	TCG	2	6	523124	523129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167468
10046	NC_013744	GAG	2	6	523138	523143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284167468
10047	NC_013744	GATC	2	8	523149	523156	25 %	25 %	25 %	25 %	284167468
10048	NC_013744	CGT	2	6	523158	523163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167468
10049	NC_013744	GA	3	6	523187	523192	50 %	0 %	50 %	0 %	284167468
10050	NC_013744	GTC	2	6	523225	523230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167468
10051	NC_013744	CGG	2	6	523231	523236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167468
10052	NC_013744	CCGTCA	2	12	523247	523258	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	284167468
10053	NC_013744	GTG	2	6	523380	523385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284167469
10054	NC_013744	CGC	2	6	523405	523410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167469
10055	NC_013744	CGA	2	6	523429	523434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167469
10056	NC_013744	CGA	2	6	523449	523454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167469
10057	NC_013744	TCGACG	2	12	523458	523469	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	284167469
10058	NC_013744	TCG	2	6	523512	523517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167469
10059	NC_013744	GTC	2	6	523546	523551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167469
10060	NC_013744	GTTC	2	8	523561	523568	0 %	50 %	25 %	25 %	284167469
10061	NC_013744	CGGC	2	8	523577	523584	0 %	0 %	50 %	50 %	284167469
10062	NC_013744	CGATA	2	10	523588	523597	40 %	20 %	20 %	20 %	284167469
10063	NC_013744	TTC	2	6	523607	523612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284167469
10064	NC_013744	GTC	2	6	523624	523629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167469
10065	NC_013744	GCG	2	6	523655	523660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167469
10066	NC_013744	GAG	2	6	523670	523675	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284167469
10067	NC_013744	TCG	2	6	523677	523682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167469
10068	NC_013744	TCGGG	2	10	523705	523714	0 %	20 %	60 %	20 %	284167469
10069	NC_013744	TTC	2	6	523715	523720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284167469
10070	NC_013744	GGC	2	6	523721	523726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167469
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10072	NC_013744	GGAA	2	8	523845	523852	50 %	0 %	50 %	0 %	284167469
10073	NC_013744	CGC	2	6	523864	523869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167469
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10084	NC_013744	GCG	2	6	524540	524545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167470
10085	NC_013744	GACG	2	8	524574	524581	25 %	0 %	50 %	25 %	284167470
10086	NC_013744	TCG	2	6	524605	524610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167470
10087	NC_013744	GAG	2	6	524658	524663	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284167470
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10089	NC_013744	CCA	2	6	524708	524713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284167470
10090	NC_013744	AGC	2	6	524764	524769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167470
10091	NC_013744	GA	3	6	524810	524815	50 %	0 %	50 %	0 %	284167470
10092	NC_013744	CGG	2	6	524864	524869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167470
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10100	NC_013744	GTG	2	6	525300	525305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284167471
10101	NC_013744	TGG	2	6	525307	525312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284167471
10102	NC_013744	TCG	2	6	525323	525328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167471
10103	NC_013744	TCG	2	6	525371	525376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167471
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10105	NC_013744	CGG	2	6	525423	525428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167471
10106	NC_013744	GGC	3	9	525452	525460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167471
10107	NC_013744	GTCGAC	2	12	525463	525474	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	284167471
10108	NC_013744	GCG	2	6	525493	525498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167471
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10112	NC_013744	GAG	2	6	525667	525672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284167471
10113	NC_013744	GC	3	6	525719	525724	0 %	0 %	50 %	50 %	284167471
10114	NC_013744	GCG	2	6	525757	525762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167471
10115	NC_013744	CGC	2	6	525770	525775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167471
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10118	NC_013744	ACA	2	6	525878	525883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284167471
10119	NC_013744	CTC	2	6	525946	525951	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284167471
10120	NC_013744	CGG	3	9	525962	525970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167471
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10132	NC_013744	GGCT	2	8	526429	526436	0 %	25 %	50 %	25 %	284167472
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10220	NC_013744	CGATCG	2	12	529705	529716	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	284167475
10221	NC_013744	GGAG	2	8	529768	529775	25 %	0 %	75 %	0 %	284167475
10222	NC_013744	CCG	2	6	529809	529814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167475
10223	NC_013744	GGCGTG	2	12	529826	529837	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	284167475
10224	NC_013744	CGA	2	6	529852	529857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167475
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10227	NC_013744	GA	4	8	529951	529958	50 %	0 %	50 %	0 %	284167475
10228	NC_013744	GGTC	2	8	530002	530009	0 %	25 %	50 %	25 %	284167475
10229	NC_013744	CGTC	2	8	530095	530102	0 %	25 %	25 %	50 %	284167475
10230	NC_013744	GCG	2	6	530124	530129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167475
10231	NC_013744	TC	3	6	530143	530148	0 %	50 %	0 %	50 %	284167475
10232	NC_013744	TCC	2	6	530151	530156	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284167475
10233	NC_013744	TTTC	2	8	530173	530180	0 %	75 %	0 %	25 %	284167475
10234	NC_013744	GCC	2	6	530181	530186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167475
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10236	NC_013744	GTC	2	6	530204	530209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167475
10237	NC_013744	GTC	2	6	530255	530260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167475
10238	NC_013744	CGAGCA	2	12	530275	530286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167475
10239	NC_013744	TCG	3	9	530292	530300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167475
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10241	NC_013744	CCGA	2	8	530569	530576	25 %	0 %	25 %	50 %	284167476
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10245	NC_013744	GCTC	2	8	530669	530676	0 %	25 %	25 %	50 %	284167476
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10343	NC_013744	AATC	2	8	535010	535017	50 %	25 %	0 %	25 %	284167482
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10350	NC_013744	CGT	2	6	535235	535240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167482
10351	NC_013744	CT	3	6	535254	535259	0 %	50 %	0 %	50 %	284167482
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10471	NC_013744	GCC	2	6	539885	539890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167486
10472	NC_013744	CGC	2	6	539933	539938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167486
10473	NC_013744	CGA	2	6	539942	539947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167486
10474	NC_013744	GTC	3	9	540007	540015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167486
10475	NC_013744	TCG	2	6	540031	540036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167486
10476	NC_013744	GGA	2	6	540298	540303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284167487
10477	NC_013744	GAT	2	6	540311	540316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284167487
10478	NC_013744	CGC	2	6	540329	540334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167487
10479	NC_013744	CGAG	2	8	540358	540365	25 %	0 %	50 %	25 %	284167487
10480	NC_013744	CGCT	2	8	540522	540529	0 %	25 %	25 %	50 %	284167487
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10483	NC_013744	GTCC	2	8	541381	541388	0 %	25 %	25 %	50 %	284167488
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10485	NC_013744	GCC	2	6	541470	541475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167488
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10489	NC_013744	CGT	2	6	541606	541611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167488
10490	NC_013744	GGA	2	6	541657	541662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284167488
10491	NC_013744	CCG	2	6	541699	541704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167488
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10494	NC_013744	CCCG	2	8	541852	541859	0 %	0 %	25 %	75 %	284167489
10495	NC_013744	ATCGA	2	10	541896	541905	40 %	20 %	20 %	20 %	284167489
10496	NC_013744	TCG	2	6	541917	541922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167489
10497	NC_013744	ACG	2	6	541951	541956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167489
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10500	NC_013744	TCGA	2	8	542188	542195	25 %	25 %	25 %	25 %	284167489

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