MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloterrigena turkmenica DSM 5511 plasmid pHTUR01

Total Repeats: 13849

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013744	CGA	2	6	20323	20328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167055
502	NC_013744	CGA	2	6	20362	20367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167055
503	NC_013744	TCG	2	6	20415	20420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167055
504	NC_013744	GCT	2	6	20482	20487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167055
505	NC_013744	CGTCGG	2	12	20578	20589	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	284167055
506	NC_013744	CGT	2	6	20620	20625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167055
507	NC_013744	TCG	2	6	20643	20648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167055
508	NC_013744	ACC	3	9	20649	20657	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284167055
509	NC_013744	AGG	2	6	20667	20672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284167055
510	NC_013744	CTG	2	6	20798	20803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167055
511	NC_013744	CCG	2	6	20845	20850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167055
512	NC_013744	GCG	3	9	21018	21026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167056
513	NC_013744	CGTC	2	8	21033	21040	0 %	25 %	25 %	50 %	284167056
514	NC_013744	CGC	2	6	21048	21053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167056
515	NC_013744	TCG	2	6	21072	21077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167056
516	NC_013744	ACG	2	6	21177	21182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167056
517	NC_013744	CGG	2	6	21220	21225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167056
518	NC_013744	TCG	2	6	21228	21233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167056
519	NC_013744	GGC	2	6	21271	21276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167056
520	NC_013744	GGTC	2	8	21301	21308	0 %	25 %	50 %	25 %	284167056
521	NC_013744	CGA	2	6	21346	21351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167056
522	NC_013744	CTC	2	6	21388	21393	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284167056
523	NC_013744	CGG	2	6	21396	21401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167056
524	NC_013744	TCG	2	6	21402	21407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167056
525	NC_013744	CCGA	2	8	21432	21439	25 %	0 %	25 %	50 %	284167056
526	NC_013744	ACG	2	6	21474	21479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167056
527	NC_013744	GGAT	2	8	21630	21637	25 %	25 %	50 %	0 %	284167057
528	NC_013744	TGA	2	6	21681	21686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284167057
529	NC_013744	ACT	2	6	21726	21731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284167057
530	NC_013744	GAG	2	6	21764	21769	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284167057
531	NC_013744	GGC	2	6	21791	21796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167057
532	NC_013744	CGG	2	6	21826	21831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167057
533	NC_013744	CTC	2	6	21845	21850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284167057
534	NC_013744	GAA	2	6	21881	21886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284167057
535	NC_013744	CTG	2	6	21889	21894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167057
536	NC_013744	GAC	2	6	21898	21903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167057
537	NC_013744	CGG	2	6	21931	21936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167057
538	NC_013744	CGG	2	6	22000	22005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167057
539	NC_013744	CG	3	6	22054	22059	0 %	0 %	50 %	50 %	284167057
540	NC_013744	GCC	2	6	22070	22075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167057
541	NC_013744	CGA	2	6	22087	22092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167057
542	NC_013744	ACC	2	6	22143	22148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284167057
543	NC_013744	TGA	2	6	22155	22160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284167057
544	NC_013744	GAC	2	6	22165	22170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167057
545	NC_013744	GAG	2	6	22178	22183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284167057
546	NC_013744	TCG	2	6	22218	22223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167057
547	NC_013744	TAC	2	6	22271	22276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284167057
548	NC_013744	CGA	2	6	22303	22308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167057
549	NC_013744	AAG	2	6	22425	22430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284167057
550	NC_013744	GCC	2	6	22565	22570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167057
551	NC_013744	GAC	2	6	22669	22674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167057
552	NC_013744	CGG	2	6	22678	22683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167057
553	NC_013744	GCCA	2	8	22691	22698	25 %	0 %	25 %	50 %	284167057
554	NC_013744	CGC	2	6	22711	22716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167057
555	NC_013744	CTG	2	6	22717	22722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167057
556	NC_013744	CGCC	2	8	22729	22736	0 %	0 %	25 %	75 %	284167057
557	NC_013744	CCGGT	2	10	22746	22755	0 %	20 %	40 %	40 %	284167057
558	NC_013744	GGA	2	6	22759	22764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284167057
559	NC_013744	GAT	2	6	22765	22770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284167057
560	NC_013744	ACGA	2	8	23076	23083	50 %	0 %	25 %	25 %	284167058
561	NC_013744	TCG	2	6	23088	23093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167058
562	NC_013744	CTC	3	9	23177	23185	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284167058
563	NC_013744	GCG	2	6	23271	23276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167058
564	NC_013744	GAG	2	6	23322	23327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284167058
565	NC_013744	GAG	2	6	23355	23360	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284167058
566	NC_013744	CCG	2	6	23470	23475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167058
567	NC_013744	CGC	2	6	23500	23505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167058
568	NC_013744	GTT	2	6	23516	23521	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284167058
569	NC_013744	CTC	2	6	23546	23551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284167058
570	NC_013744	CGG	2	6	23554	23559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167058
571	NC_013744	CGA	2	6	23605	23610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167058
572	NC_013744	CGC	2	6	23620	23625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167058
573	NC_013744	CGT	2	6	23626	23631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167058
574	NC_013744	TCG	2	6	23638	23643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167058
575	NC_013744	CGC	2	6	23656	23661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167058
576	NC_013744	GAC	2	6	23684	23689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167058
577	NC_013744	CCG	2	6	24006	24011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167059
578	NC_013744	TCG	2	6	24016	24021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167059
579	NC_013744	GCG	2	6	24045	24050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167059
580	NC_013744	G	6	6	24072	24077	0 %	0 %	100 %	0 %	284167059
581	NC_013744	TCG	2	6	24097	24102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167059
582	NC_013744	CGT	3	9	24137	24145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167059
583	NC_013744	CGGC	2	8	24157	24164	0 %	0 %	50 %	50 %	284167059
584	NC_013744	CGA	2	6	24236	24241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167059
585	NC_013744	TCG	2	6	24244	24249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167059
586	NC_013744	TCG	2	6	24316	24321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167059
587	NC_013744	TCG	2	6	24331	24336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167059
588	NC_013744	CTC	2	6	24369	24374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284167059
589	NC_013744	GGT	2	6	24392	24397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284167059
590	NC_013744	TCG	2	6	24418	24423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167059
591	NC_013744	CGC	2	6	24446	24451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167059
592	NC_013744	CGC	2	6	24477	24482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167059
593	NC_013744	TCGAGG	2	12	24496	24507	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	284167059
594	NC_013744	CCT	2	6	24518	24523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284167059
595	NC_013744	GGA	2	6	24590	24595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284167059
596	NC_013744	CGT	2	6	24596	24601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167059
597	NC_013744	GAT	2	6	24603	24608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284167059
598	NC_013744	TCG	2	6	24616	24621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167059
599	NC_013744	AGC	2	6	24703	24708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167059
600	NC_013744	CGT	2	6	24713	24718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167059
601	NC_013744	GC	3	6	24785	24790	0 %	0 %	50 %	50 %	284167059
602	NC_013744	TCGCC	2	10	24797	24806	0 %	20 %	20 %	60 %	284167059
603	NC_013744	GAA	2	6	24852	24857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284167059
604	NC_013744	ACA	2	6	24863	24868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284167059
605	NC_013744	TCG	2	6	24880	24885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167059
606	NC_013744	GAA	2	6	24888	24893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284167059
607	NC_013744	TCCCG	2	10	24894	24903	0 %	20 %	20 %	60 %	284167059
608	NC_013744	GC	3	6	24949	24954	0 %	0 %	50 %	50 %	284167059
609	NC_013744	TCG	2	6	25031	25036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167059
610	NC_013744	GCG	2	6	25037	25042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167059
611	NC_013744	CGTT	2	8	25071	25078	0 %	50 %	25 %	25 %	284167059
612	NC_013744	GCT	2	6	25277	25282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167060
613	NC_013744	CG	3	6	25367	25372	0 %	0 %	50 %	50 %	284167060
614	NC_013744	CGA	2	6	25412	25417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167060
615	NC_013744	TCG	3	9	25434	25442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167060
616	NC_013744	CGA	2	6	25468	25473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167060
617	NC_013744	GCC	4	12	25571	25582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167060
618	NC_013744	CGAG	2	8	25594	25601	25 %	0 %	50 %	25 %	284167060
619	NC_013744	CG	3	6	25628	25633	0 %	0 %	50 %	50 %	284167060
620	NC_013744	CCG	2	6	25674	25679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167060
621	NC_013744	ACGA	2	8	25815	25822	50 %	0 %	25 %	25 %	284167060
622	NC_013744	ACG	3	9	25848	25856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167060
623	NC_013744	CTC	2	6	25868	25873	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284167060
624	NC_013744	CGA	2	6	25882	25887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167060
625	NC_013744	TCG	2	6	25899	25904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167060
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746	NC_013744	ACG	2	6	30688	30693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167065
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748	NC_013744	CGC	2	6	30755	30760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167065
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