MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloterrigena turkmenica DSM 5511 plasmid pHTUR01

Total Repeats: 13849

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_013744	CT	4	8	257988	257995	0 %	50 %	0 %	50 %	284167246
5502	NC_013744	CTT	2	6	258151	258156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284167246
5503	NC_013744	GCA	2	6	258161	258166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167246
5504	NC_013744	AAT	2	6	258183	258188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284167246
5505	NC_013744	TCGG	2	8	258212	258219	0 %	25 %	50 %	25 %	284167246
5506	NC_013744	GAA	2	6	258276	258281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284167246
5507	NC_013744	ATC	2	6	258287	258292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284167246
5508	NC_013744	TC	3	6	258291	258296	0 %	50 %	0 %	50 %	284167246
5509	NC_013744	GTAG	2	8	258324	258331	25 %	25 %	50 %	0 %	284167246
5510	NC_013744	ATCC	2	8	258398	258405	25 %	25 %	0 %	50 %	284167246
5511	NC_013744	TTG	2	6	258419	258424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284167246
5512	NC_013744	CGT	2	6	258481	258486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167246
5513	NC_013744	AT	3	6	258584	258589	50 %	50 %	0 %	0 %	284167246
5514	NC_013744	ACGA	2	8	258858	258865	50 %	0 %	25 %	25 %	284167247
5515	NC_013744	CAG	2	6	258919	258924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167247
5516	NC_013744	GA	3	6	259093	259098	50 %	0 %	50 %	0 %	284167247
5517	NC_013744	GGC	2	6	259113	259118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167247
5518	NC_013744	TC	3	6	259130	259135	0 %	50 %	0 %	50 %	284167247
5519	NC_013744	TGACG	2	10	259172	259181	20 %	20 %	40 %	20 %	284167247
5520	NC_013744	AGC	2	6	259208	259213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167247
5521	NC_013744	AAG	2	6	259243	259248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284167247
5522	NC_013744	ACTC	2	8	259955	259962	25 %	25 %	0 %	50 %	284167248
5523	NC_013744	CGT	2	6	260015	260020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167248
5524	NC_013744	TCG	2	6	260023	260028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167248
5525	NC_013744	CGG	2	6	260068	260073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167248
5526	NC_013744	GCA	2	6	260324	260329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167249
5527	NC_013744	CCA	2	6	260345	260350	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284167249
5528	NC_013744	TCGT	2	8	260420	260427	0 %	50 %	25 %	25 %	284167249
5529	NC_013744	TCG	2	6	260454	260459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167249
5530	NC_013744	CGA	2	6	260509	260514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167249
5531	NC_013744	TGCC	2	8	260515	260522	0 %	25 %	25 %	50 %	284167249
5532	NC_013744	CCG	2	6	260584	260589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167249
5533	NC_013744	GAG	2	6	260647	260652	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284167250
5534	NC_013744	CCGC	2	8	260720	260727	0 %	0 %	25 %	75 %	284167250
5535	NC_013744	CG	3	6	260741	260746	0 %	0 %	50 %	50 %	284167250
5536	NC_013744	GAA	2	6	260791	260796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284167250
5537	NC_013744	TCG	2	6	260805	260810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167250
5538	NC_013744	GCG	2	6	260876	260881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167250
5539	NC_013744	ACG	2	6	260924	260929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167250
5540	NC_013744	GCG	2	6	261107	261112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167250
5541	NC_013744	CACGC	2	10	261123	261132	20 %	0 %	20 %	60 %	284167250
5542	NC_013744	AGA	2	6	261149	261154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284167250
5543	NC_013744	GAC	2	6	261175	261180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167250
5544	NC_013744	AGG	2	6	261182	261187	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284167250
5545	NC_013744	AAG	2	6	261254	261259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284167250
5546	NC_013744	GCCG	2	8	261268	261275	0 %	0 %	50 %	50 %	284167250
5547	NC_013744	CGA	2	6	261363	261368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167250
5548	NC_013744	TGAC	2	8	261418	261425	25 %	25 %	25 %	25 %	284167250
5549	NC_013744	CGA	2	6	261432	261437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167250
5550	NC_013744	AG	3	6	261463	261468	50 %	0 %	50 %	0 %	284167250
5551	NC_013744	CAC	2	6	261555	261560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284167250
5552	NC_013744	CGA	2	6	261597	261602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167250
5553	NC_013744	GTC	2	6	261661	261666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167250
5554	NC_013744	TG	3	6	261679	261684	0 %	50 %	50 %	0 %	284167250
5555	NC_013744	AC	3	6	261750	261755	50 %	0 %	0 %	50 %	284167250
5556	NC_013744	ACGAGC	2	12	261761	261772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167250
5557	NC_013744	TG	3	6	261821	261826	0 %	50 %	50 %	0 %	284167250
5558	NC_013744	ACC	2	6	261847	261852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284167250
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5560	NC_013744	ACC	2	6	261891	261896	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284167251
5561	NC_013744	GAA	2	6	261899	261904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284167251
5562	NC_013744	AGT	2	6	261976	261981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284167251
5563	NC_013744	CGT	2	6	262052	262057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167251
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5565	NC_013744	GAA	2	6	262076	262081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284167251
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5568	NC_013744	CGCC	2	8	262186	262193	0 %	0 %	25 %	75 %	284167251
5569	NC_013744	GT	3	6	262243	262248	0 %	50 %	50 %	0 %	284167251
5570	NC_013744	CGC	2	6	262250	262255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167251
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5573	NC_013744	CGT	2	6	262324	262329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167251
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5578	NC_013744	CGG	2	6	262534	262539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167251
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5582	NC_013744	TCG	2	6	262780	262785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167251
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5589	NC_013744	CTG	2	6	263116	263121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167251
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5592	NC_013744	CGA	2	6	263494	263499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167252
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5594	NC_013744	CGA	2	6	263514	263519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167252
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5601	NC_013744	GGA	2	6	263869	263874	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284167252
5602	NC_013744	CGCCT	2	10	263896	263905	0 %	20 %	20 %	60 %	284167252
5603	NC_013744	GAC	2	6	263933	263938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167252
5604	NC_013744	TCA	2	6	263940	263945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284167252
5605	NC_013744	GAC	2	6	263965	263970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167252
5606	NC_013744	CCA	2	6	264037	264042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284167252
5607	NC_013744	CGA	3	9	264052	264060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167252
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5610	NC_013744	GAG	2	6	264242	264247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284167252
5611	NC_013744	CGA	2	6	264270	264275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167252
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5613	NC_013744	ATC	2	6	264329	264334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284167252
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5617	NC_013744	C	6	6	264483	264488	0 %	0 %	0 %	100 %	284167252
5618	NC_013744	GAGGTC	2	12	264497	264508	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	284167252
5619	NC_013744	GAC	2	6	264512	264517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167252
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5621	NC_013744	GAC	2	6	264539	264544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167252
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5860	NC_013744	CGCCAG	2	12	281050	281061	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	284167262
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5862	NC_013744	GCA	2	6	281144	281149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167262
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5881	NC_013744	CGG	2	6	282288	282293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167264
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5979	NC_013744	TCA	2	6	291077	291082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284167273
5980	NC_013744	ACC	2	6	291109	291114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284167273
5981	NC_013744	CTC	2	6	291184	291189	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284167273
5982	NC_013744	GAT	2	6	291204	291209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284167273
5983	NC_013744	CGT	3	9	291240	291248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167273
5984	NC_013744	ACCTCG	2	12	291272	291283	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	284167273
5985	NC_013744	CGA	2	6	291345	291350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167273
5986	NC_013744	CGC	3	9	291373	291381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167273
5987	NC_013744	TCG	2	6	291383	291388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167273
5988	NC_013744	TG	3	6	291449	291454	0 %	50 %	50 %	0 %	284167273
5989	NC_013744	CCG	2	6	291652	291657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167274
5990	NC_013744	CGT	2	6	291670	291675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167274
5991	NC_013744	GAA	2	6	291776	291781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284167274
5992	NC_013744	GTA	2	6	291782	291787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284167274
5993	NC_013744	GCT	2	6	291842	291847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167274
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5995	NC_013744	TTC	2	6	291903	291908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284167274
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5999	NC_013744	GTA	2	6	292171	292176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284167274
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