MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloterrigena turkmenica DSM 5511 chromosome

Total Repeats: 92875

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_013743	ACG	2	6	162558	162563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4002	NC_013743	GAG	2	6	162682	162687	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284163445
4003	NC_013743	CGG	2	6	162740	162745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163445
4004	NC_013743	GCGG	2	8	162753	162760	0 %	0 %	75 %	25 %	284163445
4005	NC_013743	CGA	2	6	162768	162773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4006	NC_013743	GAGG	2	8	162805	162812	25 %	0 %	75 %	0 %	284163445
4007	NC_013743	GGTCG	2	10	162838	162847	0 %	20 %	60 %	20 %	284163445
4008	NC_013743	CGA	3	9	162849	162857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4009	NC_013743	TCG	2	6	162872	162877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4010	NC_013743	ACCG	2	8	162895	162902	25 %	0 %	25 %	50 %	284163445
4011	NC_013743	CGA	2	6	162945	162950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4012	NC_013743	CCT	2	6	162951	162956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284163445
4013	NC_013743	CGA	2	6	162966	162971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4014	NC_013743	TTC	2	6	163081	163086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284163445
4015	NC_013743	CG	3	6	163099	163104	0 %	0 %	50 %	50 %	284163445
4016	NC_013743	TCG	2	6	163202	163207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4017	NC_013743	CGA	2	6	163208	163213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4018	NC_013743	CGT	2	6	163239	163244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4019	NC_013743	GAC	2	6	163302	163307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4020	NC_013743	GGC	2	6	163345	163350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163445
4021	NC_013743	GAG	2	6	163369	163374	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284163445
4022	NC_013743	CGA	2	6	163395	163400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4023	NC_013743	GAC	2	6	163431	163436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4024	NC_013743	GCCG	2	8	163443	163450	0 %	0 %	50 %	50 %	284163445
4025	NC_013743	CGA	2	6	163473	163478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4026	NC_013743	CCGG	2	8	163479	163486	0 %	0 %	50 %	50 %	284163445
4027	NC_013743	GAC	2	6	163558	163563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4028	NC_013743	GAG	2	6	163567	163572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284163445
4029	NC_013743	CGA	2	6	163614	163619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4030	NC_013743	TCG	2	6	163622	163627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4031	NC_013743	CGAA	2	8	163683	163690	50 %	0 %	25 %	25 %	284163445
4032	NC_013743	CGA	2	6	163782	163787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4033	NC_013743	GGA	2	6	163860	163865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284163445
4034	NC_013743	GGC	2	6	163881	163886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163445
4035	NC_013743	GCG	2	6	163907	163912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163445
4036	NC_013743	CGA	2	6	163947	163952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4037	NC_013743	GGAC	2	8	163998	164005	25 %	0 %	50 %	25 %	284163445
4038	NC_013743	GTC	2	6	164008	164013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4039	NC_013743	ACCG	2	8	164041	164048	25 %	0 %	25 %	50 %	284163445
4040	NC_013743	CGA	2	6	164121	164126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4041	NC_013743	ACG	2	6	164150	164155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4042	NC_013743	GAC	2	6	164200	164205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4043	NC_013743	GCC	2	6	164220	164225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163445
4044	NC_013743	GCT	2	6	164262	164267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4045	NC_013743	GGA	2	6	164271	164276	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284163445
4046	NC_013743	GAC	2	6	164365	164370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4047	NC_013743	CGG	2	6	164387	164392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163445
4048	NC_013743	GTC	2	6	164395	164400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4049	NC_013743	ACG	2	6	164519	164524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4050	NC_013743	GGGA	2	8	164639	164646	25 %	0 %	75 %	0 %	284163445
4051	NC_013743	CCG	2	6	164681	164686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163445
4052	NC_013743	CGG	2	6	164756	164761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163445
4053	NC_013743	GTC	2	6	164764	164769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4054	NC_013743	GAC	2	6	164814	164819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4055	NC_013743	CGG	2	6	164856	164861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163445
4056	NC_013743	GAC	2	6	164877	164882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4057	NC_013743	GCTGAC	2	12	164895	164906	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4058	NC_013743	TCGG	2	8	164927	164934	0 %	25 %	50 %	25 %	284163445
4059	NC_013743	ACC	2	6	164981	164986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284163445
4060	NC_013743	CGA	2	6	164988	164993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4061	NC_013743	CGA	3	9	165075	165083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4062	NC_013743	GAC	2	6	165121	165126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4063	NC_013743	GTC	2	6	165133	165138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4064	NC_013743	ACCG	2	8	165166	165173	25 %	0 %	25 %	50 %	284163445
4065	NC_013743	ACGCGA	2	12	165180	165191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4066	NC_013743	ACG	2	6	165202	165207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4067	NC_013743	CGG	2	6	165243	165248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163445
4068	NC_013743	CGTCGA	2	12	165275	165286	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4069	NC_013743	CGA	2	6	165294	165299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4070	NC_013743	CGA	2	6	165372	165377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4071	NC_013743	GGC	2	6	165405	165410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163445
4072	NC_013743	GAGACG	2	12	165415	165426	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	284163445
4073	NC_013743	ACT	2	6	165609	165614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284163445
4074	NC_013743	GTC	2	6	165649	165654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163445
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4076	NC_013743	TCG	2	6	165742	165747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4077	NC_013743	CGG	2	6	165771	165776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163445
4078	NC_013743	CCGT	2	8	165781	165788	0 %	25 %	25 %	50 %	284163445
4079	NC_013743	CGGT	2	8	165791	165798	0 %	25 %	50 %	25 %	284163445
4080	NC_013743	GAC	2	6	165819	165824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4081	NC_013743	CGT	2	6	165846	165851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4082	NC_013743	CGA	2	6	165852	165857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4083	NC_013743	CGAT	2	8	165870	165877	25 %	25 %	25 %	25 %	284163445
4084	NC_013743	CGC	2	6	165878	165883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163445
4085	NC_013743	CGG	2	6	165888	165893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163445
4086	NC_013743	CGG	2	6	165903	165908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163445
4087	NC_013743	CTG	2	6	165946	165951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4088	NC_013743	CGA	2	6	165962	165967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4089	NC_013743	CGA	3	9	165969	165977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4090	NC_013743	CCG	2	6	165981	165986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163445
4091	NC_013743	TCG	2	6	166001	166006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4092	NC_013743	ACC	2	6	166009	166014	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284163445
4093	NC_013743	GGC	2	6	166074	166079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163445
4094	NC_013743	CGG	2	6	166087	166092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163445
4095	NC_013743	CAGATC	2	12	166102	166113	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	284163445
4096	NC_013743	CGA	2	6	166164	166169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4097	NC_013743	TCG	2	6	166196	166201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4098	NC_013743	GC	3	6	166264	166269	0 %	0 %	50 %	50 %	284163445
4099	NC_013743	CGA	2	6	166281	166286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4100	NC_013743	GCC	2	6	166351	166356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163445
4101	NC_013743	GTC	2	6	166375	166380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4102	NC_013743	CGT	2	6	166386	166391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4103	NC_013743	CGAA	2	8	166417	166424	50 %	0 %	25 %	25 %	284163445
4104	NC_013743	GAG	2	6	166474	166479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284163445
4105	NC_013743	CGA	2	6	166509	166514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4106	NC_013743	TCG	2	6	166625	166630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4107	NC_013743	CGA	2	6	166653	166658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4108	NC_013743	TCT	2	6	166742	166747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284163445
4109	NC_013743	CGA	2	6	166791	166796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4110	NC_013743	CG	3	6	166815	166820	0 %	0 %	50 %	50 %	284163445
4111	NC_013743	CTGT	2	8	166845	166852	0 %	50 %	25 %	25 %	284163445
4112	NC_013743	CGG	2	6	166902	166907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163445
4113	NC_013743	CGA	2	6	166929	166934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4114	NC_013743	GAC	2	6	166968	166973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4115	NC_013743	TCG	2	6	166988	166993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4116	NC_013743	GACC	2	8	167100	167107	25 %	0 %	25 %	50 %	284163445
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4118	NC_013743	GAG	2	6	167176	167181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284163445
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4238	NC_013743	TCG	2	6	171398	171403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163450
4239	NC_013743	CGT	2	6	171453	171458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163450
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4241	NC_013743	AGC	2	6	171497	171502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163450
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4344	NC_013743	CG	4	8	175319	175326	0 %	0 %	50 %	50 %	284163454
4345	NC_013743	CG	3	6	175349	175354	0 %	0 %	50 %	50 %	284163454
4346	NC_013743	CGC	2	6	175360	175365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163454
4347	NC_013743	GCC	2	6	175393	175398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163454
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4350	NC_013743	CTA	2	6	175735	175740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284163455
4351	NC_013743	ACG	2	6	175746	175751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163455
4352	NC_013743	GTC	2	6	175775	175780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163455
4353	NC_013743	GGGCT	2	10	175790	175799	0 %	20 %	60 %	20 %	284163455
4354	NC_013743	GAC	2	6	175841	175846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163455
4355	NC_013743	CAC	2	6	175902	175907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284163455
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4357	NC_013743	GCT	2	6	175942	175947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163455
4358	NC_013743	CTGG	2	8	175955	175962	0 %	25 %	50 %	25 %	284163455
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4477	NC_013743	GCC	2	6	181280	181285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163462
4478	NC_013743	GTC	2	6	181289	181294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163462
4479	NC_013743	GTC	2	6	181299	181304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163462
4480	NC_013743	CGG	2	6	181336	181341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163462
4481	NC_013743	CTC	2	6	181358	181363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284163462
4482	NC_013743	GTC	2	6	181364	181369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163462
4483	NC_013743	CGG	2	6	181381	181386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163462
4484	NC_013743	CGG	2	6	181399	181404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163462
4485	NC_013743	CCG	2	6	181405	181410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163462
4486	NC_013743	GCCG	2	8	181412	181419	0 %	0 %	50 %	50 %	284163462
4487	NC_013743	TCGC	2	8	181422	181429	0 %	25 %	25 %	50 %	284163462
4488	NC_013743	CCGT	2	8	181446	181453	0 %	25 %	25 %	50 %	284163462
4489	NC_013743	TCG	2	6	181455	181460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163462
4490	NC_013743	CTG	2	6	181466	181471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163462
4491	NC_013743	GTC	2	6	181523	181528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163462
4492	NC_013743	TCT	2	6	181560	181565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284163462
4493	NC_013743	TCC	2	6	181566	181571	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284163462
4494	NC_013743	TCG	2	6	181647	181652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163462
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4499	NC_013743	TGAT	2	8	181881	181888	25 %	50 %	25 %	0 %	284163462
4500	NC_013743	TGA	2	6	181909	181914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284163462

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