MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloterrigena turkmenica DSM 5511 chromosome

Total Repeats: 92875

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_013743	GACCT	2	10	551969	551978	20 %	20 %	20 %	40 %	284163811
13002	NC_013743	CGG	2	6	551989	551994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163811
13003	NC_013743	CCG	2	6	552062	552067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163811
13004	NC_013743	CGA	2	6	552076	552081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163811
13005	NC_013743	GCC	2	6	552101	552106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163811
13006	NC_013743	GAC	2	6	552133	552138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163811
13007	NC_013743	GAC	3	9	552182	552190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163811
13008	NC_013743	CGC	2	6	552202	552207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163811
13009	NC_013743	GAG	2	6	552260	552265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284163811
13010	NC_013743	AGC	2	6	552270	552275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163811
13011	NC_013743	GGC	2	6	552349	552354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163811
13012	NC_013743	GAC	2	6	552425	552430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163811
13013	NC_013743	GCC	2	6	552434	552439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163811
13014	NC_013743	GCC	2	6	552464	552469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163811
13015	NC_013743	GAG	2	6	552479	552484	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284163811
13016	NC_013743	GTCG	2	8	552487	552494	0 %	25 %	50 %	25 %	284163811
13017	NC_013743	GGT	2	6	552529	552534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284163811
13018	NC_013743	CGA	2	6	552544	552549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163811
13019	NC_013743	GAC	2	6	552628	552633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163811
13020	NC_013743	GGA	2	6	552694	552699	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284163811
13021	NC_013743	TCG	2	6	552705	552710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163811
13022	NC_013743	GGC	2	6	552751	552756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163811
13023	NC_013743	CGAG	2	8	552771	552778	25 %	0 %	50 %	25 %	284163811
13024	NC_013743	GAC	2	6	552803	552808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163811
13025	NC_013743	GTC	2	6	552908	552913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163811
13026	NC_013743	CGA	2	6	552934	552939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163811
13027	NC_013743	GC	3	6	552966	552971	0 %	0 %	50 %	50 %	284163811
13028	NC_013743	AAC	2	6	553019	553024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284163811
13029	NC_013743	CGT	2	6	553063	553068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163811
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13031	NC_013743	ACACCG	2	12	553143	553154	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	284163811
13032	NC_013743	GGA	2	6	553213	553218	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284163811
13033	NC_013743	CG	4	8	553228	553235	0 %	0 %	50 %	50 %	284163811
13034	NC_013743	CGA	2	6	553285	553290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163811
13035	NC_013743	GCG	2	6	553341	553346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163811
13036	NC_013743	CGT	2	6	553360	553365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163811
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13038	NC_013743	GAG	2	6	553412	553417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284163811
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13040	NC_013743	CGG	2	6	553459	553464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163811
13041	NC_013743	CGA	2	6	553477	553482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163811
13042	NC_013743	CGG	2	6	553504	553509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163811
13043	NC_013743	CGA	2	6	553519	553524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163811
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13046	NC_013743	GAC	4	12	553697	553708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163811
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13049	NC_013743	CGCGAG	2	12	553775	553786	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	284163811
13050	NC_013743	CGA	2	6	553816	553821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163811
13051	NC_013743	CGA	2	6	553837	553842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163811
13052	NC_013743	GAG	2	6	553922	553927	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284163811
13053	NC_013743	CGA	3	9	553960	553968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163811
13054	NC_013743	GGTC	2	8	554013	554020	0 %	25 %	50 %	25 %	284163811
13055	NC_013743	ACG	2	6	554046	554051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163811
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13058	NC_013743	CGA	2	6	554218	554223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163811
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13060	NC_013743	GTC	2	6	554312	554317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163811
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13066	NC_013743	GAACGC	2	12	554504	554515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163811
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13082	NC_013743	CGA	2	6	555133	555138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163811
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13084	NC_013743	ACG	2	6	555147	555152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163811
13085	NC_013743	GAG	2	6	555179	555184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284163811
13086	NC_013743	CG	3	6	555216	555221	0 %	0 %	50 %	50 %	284163811
13087	NC_013743	GCCA	2	8	555233	555240	25 %	0 %	25 %	50 %	284163811
13088	NC_013743	CTG	2	6	555263	555268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163811
13089	NC_013743	GCC	2	6	555298	555303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163811
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13091	NC_013743	TCG	2	6	555477	555482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163811
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13093	NC_013743	GCC	2	6	555655	555660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163812
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13095	NC_013743	GTC	2	6	555688	555693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163812
13096	NC_013743	CG	3	6	555731	555736	0 %	0 %	50 %	50 %	284163812
13097	NC_013743	CG	3	6	555741	555746	0 %	0 %	50 %	50 %	284163812
13098	NC_013743	GCGCG	2	10	555779	555788	0 %	0 %	60 %	40 %	284163812
13099	NC_013743	GAG	2	6	555847	555852	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284163812
13100	NC_013743	CGGTC	2	10	555875	555884	0 %	20 %	40 %	40 %	284163812
13101	NC_013743	CAA	2	6	555927	555932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284163812
13102	NC_013743	CTG	2	6	556027	556032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163812
13103	NC_013743	GCG	2	6	556088	556093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163812
13104	NC_013743	GCG	2	6	556103	556108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163812
13105	NC_013743	CGA	2	6	556119	556124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163812
13106	NC_013743	ACG	2	6	556145	556150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163812
13107	NC_013743	GCT	2	6	556215	556220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163812
13108	NC_013743	CGG	2	6	556223	556228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163812
13109	NC_013743	GGC	2	6	556323	556328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163812
13110	NC_013743	TGA	2	6	556337	556342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284163812
13111	NC_013743	GC	3	6	556373	556378	0 %	0 %	50 %	50 %	284163812
13112	NC_013743	CGC	2	6	556392	556397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163812
13113	NC_013743	GCG	2	6	556418	556423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163812
13114	NC_013743	CTA	2	6	556425	556430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284163812
13115	NC_013743	CGG	2	6	556437	556442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163812
13116	NC_013743	CCT	2	6	556478	556483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284163812
13117	NC_013743	ACG	2	6	556496	556501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163812
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13119	NC_013743	TCG	2	6	556816	556821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163813
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13122	NC_013743	ATC	2	6	556965	556970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284163813
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13124	NC_013743	CGG	2	6	557092	557097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163813
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13154	NC_013743	GAC	2	6	558570	558575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163815
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13227	NC_013743	GTCG	2	8	561556	561563	0 %	25 %	50 %	25 %	284163819
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13232	NC_013743	CTG	2	6	561703	561708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163819
13233	NC_013743	TCGG	2	8	561717	561724	0 %	25 %	50 %	25 %	284163819
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13471	NC_013743	CCG	2	6	571315	571320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163827
13472	NC_013743	CGG	2	6	571339	571344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163827
13473	NC_013743	GATC	2	8	571789	571796	25 %	25 %	25 %	25 %	284163828
13474	NC_013743	GCTC	2	8	571818	571825	0 %	25 %	25 %	50 %	284163828
13475	NC_013743	TCG	3	9	571857	571865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163828
13476	NC_013743	GCC	2	6	571937	571942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163828
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13479	NC_013743	CGA	3	9	571966	571974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163828
13480	NC_013743	GAC	3	9	571982	571990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163828
13481	NC_013743	CGC	2	6	572014	572019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163828
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13483	NC_013743	CGA	2	6	572053	572058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163828
13484	NC_013743	CGAG	2	8	572154	572161	25 %	0 %	50 %	25 %	284163828
13485	NC_013743	TCG	2	6	572262	572267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163829
13486	NC_013743	GC	3	6	572339	572344	0 %	0 %	50 %	50 %	284163829
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13493	NC_013743	GCG	2	6	572592	572597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163829
13494	NC_013743	CG	3	6	572630	572635	0 %	0 %	50 %	50 %	284163829
13495	NC_013743	GCC	2	6	572666	572671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163829
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13497	NC_013743	ACG	2	6	572729	572734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163829
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13499	NC_013743	CCA	2	6	572835	572840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284163829
13500	NC_013743	TCG	2	6	572865	572870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163829

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