MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haliangium ochraceum DSM 14365 chromosome

Total Repeats: 237741

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17002	NC_013440	AAG	2	6	653071	653076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	262193801
17003	NC_013440	AAG	2	6	653086	653091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	262193801
17004	NC_013440	AAG	2	6	653101	653106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	262193801
17005	NC_013440	AAG	2	6	653131	653136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	262193801
17006	NC_013440	TGG	3	9	653212	653220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	262193801
17007	NC_013440	GAG	2	6	653250	653255	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	262193801
17008	NC_013440	TCA	2	6	653266	653271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	262193801
17009	NC_013440	GCT	2	6	653294	653299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193801
17010	NC_013440	AGC	2	6	653322	653327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193801
17011	NC_013440	GCT	2	6	653354	653359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193801
17012	NC_013440	TCA	2	6	653371	653376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	262193801
17013	NC_013440	GCG	2	6	653541	653546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193802
17014	NC_013440	CGG	2	6	653550	653555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193802
17015	NC_013440	GCG	2	6	653647	653652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193802
17016	NC_013440	AGC	2	6	653664	653669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193802
17017	NC_013440	GCT	2	6	653686	653691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193802
17018	NC_013440	CCG	2	6	653766	653771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193802
17019	NC_013440	GCG	2	6	653778	653783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193802
17020	NC_013440	AGC	2	6	653784	653789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193802
17021	NC_013440	GC	3	6	653788	653793	0 %	0 %	50 %	50 %	262193802
17022	NC_013440	CCG	2	6	653839	653844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193802
17023	NC_013440	GGC	2	6	653846	653851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193802
17024	NC_013440	CAG	2	6	653888	653893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193802
17025	NC_013440	CGGG	2	8	653896	653903	0 %	0 %	75 %	25 %	262193802
17026	NC_013440	AGC	2	6	653916	653921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193802
17027	NC_013440	GCTG	2	8	653950	653957	0 %	25 %	50 %	25 %	262193802
17028	NC_013440	GCG	2	6	653967	653972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193802
17029	NC_013440	TCGGCC	2	12	653991	654002	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	262193802
17030	NC_013440	CGC	2	6	654007	654012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193802
17031	NC_013440	CGA	2	6	654061	654066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193802
17032	NC_013440	CGC	2	6	654092	654097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193802
17033	NC_013440	TGA	2	6	654112	654117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262193802
17034	NC_013440	TCA	2	6	654160	654165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	262193802
17035	NC_013440	GGC	2	6	654175	654180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193802
17036	NC_013440	CGA	2	6	654223	654228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193802
17037	NC_013440	CAG	2	6	654230	654235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193802
17038	NC_013440	CGT	2	6	654292	654297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193802
17039	NC_013440	ATG	2	6	654321	654326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262193802
17040	NC_013440	GAT	2	6	654353	654358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262193802
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17042	NC_013440	GCT	2	6	654398	654403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193802
17043	NC_013440	GC	3	6	654441	654446	0 %	0 %	50 %	50 %	262193802
17044	NC_013440	CCG	2	6	654471	654476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193802
17045	NC_013440	GAT	3	9	654500	654508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262193802
17046	NC_013440	GAT	2	6	654515	654520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262193802
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17049	NC_013440	CGAACA	2	12	654589	654600	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	262193802
17050	NC_013440	ATCAGG	2	12	654606	654617	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	262193802
17051	NC_013440	CTG	2	6	654644	654649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193802
17052	NC_013440	CGAT	2	8	654655	654662	25 %	25 %	25 %	25 %	262193802
17053	NC_013440	CCG	2	6	654666	654671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193802
17054	NC_013440	CAC	2	6	654680	654685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	262193802
17055	NC_013440	TGA	2	6	654706	654711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262193802
17056	NC_013440	GAA	2	6	654716	654721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	262193802
17057	NC_013440	CG	3	6	654733	654738	0 %	0 %	50 %	50 %	262193802
17058	NC_013440	GCG	2	6	654797	654802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193802
17059	NC_013440	CCA	2	6	654820	654825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	262193802
17060	NC_013440	CCGA	2	8	654846	654853	25 %	0 %	25 %	50 %	262193802
17061	NC_013440	TGA	2	6	654907	654912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262193802
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17065	NC_013440	CGA	2	6	655428	655433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193803
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17067	NC_013440	GAC	2	6	655594	655599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193803
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17070	NC_013440	CG	4	8	655666	655673	0 %	0 %	50 %	50 %	262193803
17071	NC_013440	GCA	2	6	655675	655680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193803
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17078	NC_013440	ACGC	2	8	655874	655881	25 %	0 %	25 %	50 %	262193804
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17083	NC_013440	CGC	2	6	656042	656047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193805
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17087	NC_013440	CTG	2	6	656235	656240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193805
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17089	NC_013440	ATG	2	6	656331	656336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262193805
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17097	NC_013440	GC	3	6	656636	656641	0 %	0 %	50 %	50 %	262193805
17098	NC_013440	TCG	2	6	656653	656658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193805
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17101	NC_013440	TCGACG	2	12	656686	656697	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	262193805
17102	NC_013440	CGG	2	6	656817	656822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193806
17103	NC_013440	TCG	2	6	656847	656852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193806
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17238	NC_013440	CGA	2	6	661606	661611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193810
17239	NC_013440	GCA	2	6	661621	661626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193810
17240	NC_013440	GGCG	2	8	661714	661721	0 %	0 %	75 %	25 %	262193810
17241	NC_013440	ATG	2	6	661815	661820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262193810
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17246	NC_013440	GCA	2	6	662078	662083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193811
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17250	NC_013440	CGA	2	6	662216	662221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193811
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17261	NC_013440	CGA	2	6	662762	662767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193811
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17342	NC_013440	CAG	2	6	666466	666471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193815
17343	NC_013440	GAC	2	6	666511	666516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193815
17344	NC_013440	CGA	2	6	666577	666582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193815
17345	NC_013440	AGC	2	6	666605	666610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193815
17346	NC_013440	GGCGC	2	10	666729	666738	0 %	0 %	60 %	40 %	262193815
17347	NC_013440	CCT	2	6	666759	666764	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	262193815
17348	NC_013440	CGA	2	6	666765	666770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193815
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17350	NC_013440	GATGC	2	10	666844	666853	20 %	20 %	40 %	20 %	262193815
17351	NC_013440	GC	3	6	666899	666904	0 %	0 %	50 %	50 %	262193815
17352	NC_013440	TCG	2	6	666929	666934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193815
17353	NC_013440	CGT	2	6	666948	666953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193815
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17355	NC_013440	GGC	2	6	666976	666981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193815
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17474	NC_013440	GCG	2	6	672369	672374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193818
17475	NC_013440	CCG	2	6	672390	672395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193818
17476	NC_013440	CGGC	2	8	672444	672451	0 %	0 %	50 %	50 %	262193818
17477	NC_013440	GCG	3	9	672477	672485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193819
17478	NC_013440	CGA	2	6	672519	672524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193819
17479	NC_013440	CGC	2	6	672546	672551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193819
17480	NC_013440	AGT	2	6	672552	672557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262193819
17481	NC_013440	CCT	2	6	672573	672578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	262193819
17482	NC_013440	GGCGC	2	10	672579	672588	0 %	0 %	60 %	40 %	262193819
17483	NC_013440	GCT	2	6	672606	672611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193819
17484	NC_013440	GCGG	2	8	672616	672623	0 %	0 %	75 %	25 %	262193819
17485	NC_013440	AGC	2	6	672713	672718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193819
17486	NC_013440	CAC	2	6	672760	672765	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	262193819
17487	NC_013440	GCT	2	6	672769	672774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193819
17488	NC_013440	CTC	2	6	672814	672819	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	262193819
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17490	NC_013440	GAT	2	6	673013	673018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262193820
17491	NC_013440	GA	3	6	673021	673026	50 %	0 %	50 %	0 %	262193820
17492	NC_013440	GCC	2	6	673051	673056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193820
17493	NC_013440	GGT	2	6	673065	673070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	262193820
17494	NC_013440	CGT	2	6	673076	673081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193820
17495	NC_013440	TGC	2	6	673129	673134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193820
17496	NC_013440	TCG	2	6	673162	673167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193820
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17500	NC_013440	CGCC	2	8	673301	673308	0 %	0 %	25 %	75 %	262193820

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