MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haliangium ochraceum DSM 14365 chromosome

Total Repeats: 237741

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16002	NC_013440	CGGC	2	8	610898	610905	0 %	0 %	50 %	50 %	262193770
16003	NC_013440	GGCCGC	2	12	610935	610946	0 %	0 %	50 %	50 %	262193770
16004	NC_013440	CGG	2	6	610962	610967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193770
16005	NC_013440	CGG	2	6	610971	610976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193770
16006	NC_013440	CGTGTA	2	12	610986	610997	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	262193770
16007	NC_013440	CTCGG	2	10	610999	611008	0 %	20 %	40 %	40 %	262193770
16008	NC_013440	CAC	2	6	611022	611027	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	262193770
16009	NC_013440	GGC	2	6	611059	611064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193770
16010	NC_013440	GGC	2	6	611082	611087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193770
16011	NC_013440	GAC	3	9	611098	611106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193770
16012	NC_013440	GC	3	6	611129	611134	0 %	0 %	50 %	50 %	262193770
16013	NC_013440	GTGTTC	2	12	611155	611166	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	262193770
16014	NC_013440	CGG	2	6	611169	611174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193770
16015	NC_013440	GC	3	6	611282	611287	0 %	0 %	50 %	50 %	262193770
16016	NC_013440	CGA	4	12	611292	611303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193770
16017	NC_013440	GC	3	6	611304	611309	0 %	0 %	50 %	50 %	262193770
16018	NC_013440	GC	3	6	611324	611329	0 %	0 %	50 %	50 %	262193770
16019	NC_013440	CGG	5	15	611331	611345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193770
16020	NC_013440	CGG	2	6	611349	611354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193770
16021	NC_013440	CGG	2	6	611370	611375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193770
16022	NC_013440	GCG	2	6	611414	611419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193770
16023	NC_013440	GCG	2	6	611423	611428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193770
16024	NC_013440	CGA	2	6	611475	611480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193770
16025	NC_013440	GC	3	6	611534	611539	0 %	0 %	50 %	50 %	262193770
16026	NC_013440	AAC	2	6	611578	611583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	262193770
16027	NC_013440	TGG	2	6	611588	611593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	262193770
16028	NC_013440	GCC	2	6	611603	611608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193770
16029	NC_013440	CGC	2	6	611637	611642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193770
16030	NC_013440	TCGGC	2	10	611702	611711	0 %	20 %	40 %	40 %	262193770
16031	NC_013440	TCGA	2	8	611719	611726	25 %	25 %	25 %	25 %	262193770
16032	NC_013440	ACGGCG	2	12	611735	611746	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	262193770
16033	NC_013440	CG	4	8	611745	611752	0 %	0 %	50 %	50 %	262193770
16034	NC_013440	TGG	2	6	611756	611761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	262193770
16035	NC_013440	ACG	2	6	611786	611791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193770
16036	NC_013440	TCG	2	6	611842	611847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193770
16037	NC_013440	ACG	2	6	611870	611875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193770
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16039	NC_013440	CGC	2	6	611928	611933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193770
16040	NC_013440	CGACGG	2	12	611955	611966	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	262193770
16041	NC_013440	CTG	2	6	611977	611982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193770
16042	NC_013440	CGGC	2	8	611987	611994	0 %	0 %	50 %	50 %	262193770
16043	NC_013440	GCT	2	6	612015	612020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193770
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16046	NC_013440	TCG	2	6	612104	612109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193770
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16050	NC_013440	CGGC	2	8	612212	612219	0 %	0 %	50 %	50 %	262193770
16051	NC_013440	GCT	2	6	612240	612245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193770
16052	NC_013440	CGATCC	2	12	612249	612260	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	262193770
16053	NC_013440	AGCCC	2	10	612263	612272	20 %	0 %	20 %	60 %	262193770
16054	NC_013440	ACG	2	6	612420	612425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193771
16055	NC_013440	AGC	2	6	612426	612431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193771
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16058	NC_013440	CTGTC	2	10	612536	612545	0 %	40 %	20 %	40 %	262193771
16059	NC_013440	GGC	2	6	612548	612553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193771
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16062	NC_013440	ACG	2	6	612607	612612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193772
16063	NC_013440	CTG	2	6	612615	612620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193772
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16067	NC_013440	GC	3	6	612713	612718	0 %	0 %	50 %	50 %	262193772
16068	NC_013440	CG	5	10	612726	612735	0 %	0 %	50 %	50 %	262193772
16069	NC_013440	GGT	2	6	612743	612748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	262193772
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16071	NC_013440	GCG	2	6	612766	612771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193772
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16099	NC_013440	GC	3	6	614200	614205	0 %	0 %	50 %	50 %	262193774
16100	NC_013440	GCG	2	6	614236	614241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193774
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16103	NC_013440	AGC	3	9	614362	614370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193774
16104	NC_013440	GGCG	2	8	614408	614415	0 %	0 %	75 %	25 %	262193774
16105	NC_013440	TCG	2	6	614437	614442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193774
16106	NC_013440	GCA	2	6	614486	614491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193774
16107	NC_013440	GCCA	2	8	614497	614504	25 %	0 %	25 %	50 %	262193774
16108	NC_013440	GC	4	8	614535	614542	0 %	0 %	50 %	50 %	262193774
16109	NC_013440	GCC	2	6	614584	614589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193774
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16119	NC_013440	GTG	2	6	614971	614976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	262193774
16120	NC_013440	TCG	2	6	614977	614982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193774
16121	NC_013440	GTA	2	6	614985	614990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262193774
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16228	NC_013440	TCACGA	2	12	619069	619080	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	262193777
16229	NC_013440	GC	3	6	619118	619123	0 %	0 %	50 %	50 %	262193777
16230	NC_013440	GAT	2	6	619142	619147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262193777
16231	NC_013440	CGG	3	9	619230	619238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193777
16232	NC_013440	CAG	2	6	619247	619252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193777
16233	NC_013440	TGC	2	6	619300	619305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193777
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16237	NC_013440	G	6	6	619471	619476	0 %	0 %	100 %	0 %	262193777
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16240	NC_013440	CGC	2	6	619857	619862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193778
16241	NC_013440	CGA	2	6	619869	619874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193778
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16359	NC_013440	GTCGAC	2	12	625113	625124	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	262193782
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16478	NC_013440	GA	3	6	629783	629788	50 %	0 %	50 %	0 %	262193784
16479	NC_013440	CG	3	6	629790	629795	0 %	0 %	50 %	50 %	262193784
16480	NC_013440	GCG	2	6	629837	629842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193784
16481	NC_013440	AAC	2	6	629852	629857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	262193784
16482	NC_013440	CG	5	10	629861	629870	0 %	0 %	50 %	50 %	262193784
16483	NC_013440	CTC	2	6	629890	629895	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	262193784
16484	NC_013440	CGG	2	6	629902	629907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193784
16485	NC_013440	GCGG	2	8	630023	630030	0 %	0 %	75 %	25 %	262193784
16486	NC_013440	GCG	2	6	630048	630053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193784
16487	NC_013440	GC	3	6	630067	630072	0 %	0 %	50 %	50 %	262193784
16488	NC_013440	GCG	2	6	630108	630113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193784
16489	NC_013440	CGCC	2	8	630133	630140	0 %	0 %	25 %	75 %	262193784
16490	NC_013440	CGA	2	6	630180	630185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193784
16491	NC_013440	AGGCCG	2	12	630213	630224	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	262193784
16492	NC_013440	GCC	2	6	630250	630255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193784
16493	NC_013440	CAG	2	6	630268	630273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193784
16494	NC_013440	CG	4	8	630274	630281	0 %	0 %	50 %	50 %	262193784
16495	NC_013440	GC	3	6	630346	630351	0 %	0 %	50 %	50 %	262193784
16496	NC_013440	GTGCAG	2	12	630376	630387	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	262193784
16497	NC_013440	GC	3	6	630392	630397	0 %	0 %	50 %	50 %	262193784
16498	NC_013440	TGGC	2	8	630398	630405	0 %	25 %	50 %	25 %	262193784
16499	NC_013440	CG	3	6	630535	630540	0 %	0 %	50 %	50 %	262193784
16500	NC_013440	CG	5	10	630562	630571	0 %	0 %	50 %	50 %	262193784

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