MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haliangium ochraceum DSM 14365 chromosome

Total Repeats: 237741

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_013440	GC	6	12	576004	576015	0 %	0 %	50 %	50 %	262193742
15002	NC_013440	GCG	2	6	576112	576117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193742
15003	NC_013440	TCG	2	6	576157	576162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193742
15004	NC_013440	GCG	2	6	576164	576169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193742
15005	NC_013440	GC	3	6	576198	576203	0 %	0 %	50 %	50 %	262193742
15006	NC_013440	TCG	2	6	576229	576234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193742
15007	NC_013440	CCT	2	6	576245	576250	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	262193742
15008	NC_013440	CTC	2	6	576273	576278	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	262193742
15009	NC_013440	GCG	3	9	576289	576297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193742
15010	NC_013440	GC	3	6	576316	576321	0 %	0 %	50 %	50 %	262193742
15011	NC_013440	GTC	2	6	576333	576338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193742
15012	NC_013440	CGT	2	6	576362	576367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193742
15013	NC_013440	GCG	2	6	576431	576436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193742
15014	NC_013440	CG	3	6	576449	576454	0 %	0 %	50 %	50 %	262193742
15015	NC_013440	GC	3	6	576464	576469	0 %	0 %	50 %	50 %	262193742
15016	NC_013440	GCT	2	6	576509	576514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193742
15017	NC_013440	GCG	2	6	576518	576523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193742
15018	NC_013440	AGA	2	6	576569	576574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	262193742
15019	NC_013440	GC	3	6	576582	576587	0 %	0 %	50 %	50 %	262193742
15020	NC_013440	CCT	2	6	576599	576604	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	262193742
15021	NC_013440	CGAT	2	8	576622	576629	25 %	25 %	25 %	25 %	262193742
15022	NC_013440	GCTC	2	8	576665	576672	0 %	25 %	25 %	50 %	262193742
15023	NC_013440	GC	4	8	576695	576702	0 %	0 %	50 %	50 %	262193742
15024	NC_013440	GC	3	6	576720	576725	0 %	0 %	50 %	50 %	262193742
15025	NC_013440	GGC	2	6	576782	576787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193742
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15027	NC_013440	TGG	2	6	576899	576904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	262193742
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15029	NC_013440	GAG	2	6	576960	576965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	262193742
15030	NC_013440	GC	3	6	577126	577131	0 %	0 %	50 %	50 %	262193743
15031	NC_013440	GCT	2	6	577137	577142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193743
15032	NC_013440	GCGCG	2	10	577146	577155	0 %	0 %	60 %	40 %	262193743
15033	NC_013440	GC	3	6	577185	577190	0 %	0 %	50 %	50 %	262193743
15034	NC_013440	CTG	2	6	577198	577203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193743
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15037	NC_013440	GC	3	6	577294	577299	0 %	0 %	50 %	50 %	262193743
15038	NC_013440	GC	5	10	577341	577350	0 %	0 %	50 %	50 %	262193743
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15041	NC_013440	GC	3	6	577428	577433	0 %	0 %	50 %	50 %	262193743
15042	NC_013440	TGG	2	6	577434	577439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	262193743
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15045	NC_013440	GTAG	2	8	577503	577510	25 %	25 %	50 %	0 %	262193743
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15051	NC_013440	CGGC	2	8	577617	577624	0 %	0 %	50 %	50 %	262193743
15052	NC_013440	GC	3	6	577623	577628	0 %	0 %	50 %	50 %	262193743
15053	NC_013440	CGA	2	6	577680	577685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193743
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15055	NC_013440	TCG	2	6	577715	577720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193743
15056	NC_013440	CG	3	6	577740	577745	0 %	0 %	50 %	50 %	262193743
15057	NC_013440	CAG	2	6	577753	577758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193743
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15059	NC_013440	CAG	2	6	577807	577812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193743
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15061	NC_013440	GC	4	8	577858	577865	0 %	0 %	50 %	50 %	262193743
15062	NC_013440	GCG	3	9	577890	577898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193743
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15071	NC_013440	GC	3	6	578344	578349	0 %	0 %	50 %	50 %	262193743
15072	NC_013440	GCA	2	6	578352	578357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193743
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15076	NC_013440	CGCAGA	2	12	578519	578530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193743
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15080	NC_013440	GCG	2	6	578567	578572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193743
15081	NC_013440	GCA	2	6	578589	578594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193743
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15083	NC_013440	TGA	2	6	578630	578635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262193743
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15088	NC_013440	GGGC	2	8	578877	578884	0 %	0 %	75 %	25 %	262193743
15089	NC_013440	CG	3	6	578903	578908	0 %	0 %	50 %	50 %	262193743
15090	NC_013440	CGA	2	6	578932	578937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193743
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15092	NC_013440	T	6	6	579202	579207	0 %	100 %	0 %	0 %	262193744
15093	NC_013440	GTC	3	9	579213	579221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193744
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15100	NC_013440	CGA	2	6	579406	579411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193744
15101	NC_013440	GC	3	6	579426	579431	0 %	0 %	50 %	50 %	262193744
15102	NC_013440	GCT	2	6	579436	579441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193744
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15104	NC_013440	TCG	2	6	579513	579518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193744
15105	NC_013440	CGG	2	6	579535	579540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193744
15106	NC_013440	GTC	2	6	579557	579562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193744
15107	NC_013440	GC	3	6	579565	579570	0 %	0 %	50 %	50 %	262193744
15108	NC_013440	CG	3	6	579589	579594	0 %	0 %	50 %	50 %	262193744
15109	NC_013440	CGC	2	6	579597	579602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193744
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15111	NC_013440	GC	4	8	579625	579632	0 %	0 %	50 %	50 %	262193744
15112	NC_013440	GC	5	10	579666	579675	0 %	0 %	50 %	50 %	262193744
15113	NC_013440	CGC	2	6	579736	579741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193744
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15117	NC_013440	CCG	2	6	579901	579906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193744
15118	NC_013440	CGA	2	6	579934	579939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193744
15119	NC_013440	GCGTGA	2	12	579985	579996	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	262193744
15120	NC_013440	GCT	2	6	580022	580027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193744
15121	NC_013440	CGGC	2	8	580030	580037	0 %	0 %	50 %	50 %	262193744
15122	NC_013440	GCG	2	6	580041	580046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193744
15123	NC_013440	TCG	2	6	580047	580052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193744
15124	NC_013440	TCGCGA	2	12	580056	580067	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	262193744
15125	NC_013440	GCA	2	6	580088	580093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193744
15126	NC_013440	GGCGAG	2	12	580094	580105	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	262193744
15127	NC_013440	GCG	2	6	580122	580127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193744
15128	NC_013440	GCCG	2	8	580185	580192	0 %	0 %	50 %	50 %	262193745
15129	NC_013440	TCG	2	6	580193	580198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193745
15130	NC_013440	CGT	2	6	580251	580256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193745
15131	NC_013440	CCT	2	6	580383	580388	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	262193745
15132	NC_013440	TGA	2	6	580410	580415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262193745
15133	NC_013440	GCCG	2	8	580439	580446	0 %	0 %	50 %	50 %	262193745
15134	NC_013440	CGCCGG	2	12	580612	580623	0 %	0 %	50 %	50 %	262193745
15135	NC_013440	GCG	2	6	580632	580637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193745
15136	NC_013440	GCGCC	2	10	580661	580670	0 %	0 %	40 %	60 %	262193745
15137	NC_013440	CGG	2	6	580690	580695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193745
15138	NC_013440	CGG	2	6	580707	580712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193745
15139	NC_013440	TCG	3	9	580718	580726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193745
15140	NC_013440	GCA	2	6	580746	580751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193745
15141	NC_013440	CGG	2	6	580799	580804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193745
15142	NC_013440	CCG	2	6	581043	581048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193746
15143	NC_013440	GCG	2	6	581117	581122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193746
15144	NC_013440	GCT	2	6	581148	581153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193746
15145	NC_013440	GC	4	8	581154	581161	0 %	0 %	50 %	50 %	262193746
15146	NC_013440	GCGATC	2	12	581188	581199	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	262193746
15147	NC_013440	GCT	2	6	581208	581213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193746
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15149	NC_013440	GCGCT	2	10	581278	581287	0 %	20 %	40 %	40 %	262193746
15150	NC_013440	GT	3	6	581296	581301	0 %	50 %	50 %	0 %	262193746
15151	NC_013440	GCG	2	6	581306	581311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193746
15152	NC_013440	GTG	2	6	581347	581352	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	262193746
15153	NC_013440	TGC	2	6	581357	581362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193746
15154	NC_013440	GCG	2	6	581372	581377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193746
15155	NC_013440	CG	3	6	581379	581384	0 %	0 %	50 %	50 %	262193746
15156	NC_013440	GCTG	2	8	581423	581430	0 %	25 %	50 %	25 %	262193746
15157	NC_013440	CGC	2	6	581447	581452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193746
15158	NC_013440	CATCGG	2	12	581487	581498	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	262193746
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15160	NC_013440	GCG	2	6	581595	581600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193747
15161	NC_013440	CGA	2	6	581704	581709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193747
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15164	NC_013440	GCC	2	6	581819	581824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193747
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15170	NC_013440	TCGTG	2	10	582003	582012	0 %	40 %	40 %	20 %	262193747
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15172	NC_013440	CGG	2	6	582067	582072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193747
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15185	NC_013440	GC	3	6	583115	583120	0 %	0 %	50 %	50 %	262193749
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15189	NC_013440	CCGAG	2	10	583164	583173	20 %	0 %	40 %	40 %	262193749
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15193	NC_013440	GCGG	2	8	583250	583257	0 %	0 %	75 %	25 %	262193749
15194	NC_013440	CA	3	6	583268	583273	50 %	0 %	0 %	50 %	262193749
15195	NC_013440	GGT	2	6	583360	583365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	262193749
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15200	NC_013440	AGC	2	6	583469	583474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193749
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15203	NC_013440	CGA	2	6	583530	583535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193749
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15214	NC_013440	GTC	2	6	583954	583959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193749
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15217	NC_013440	CGAT	2	8	584022	584029	25 %	25 %	25 %	25 %	262193749
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15224	NC_013440	GCT	2	6	584181	584186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193749
15225	NC_013440	TGA	2	6	584211	584216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262193749
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15227	NC_013440	CGC	2	6	584256	584261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193749
15228	NC_013440	GGA	2	6	584271	584276	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	262193749
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15230	NC_013440	TGG	2	6	584304	584309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	262193749
15231	NC_013440	GC	3	6	584343	584348	0 %	0 %	50 %	50 %	262193749
15232	NC_013440	GGC	2	6	584379	584384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193749
15233	NC_013440	TCG	2	6	584396	584401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193749
15234	NC_013440	GCCG	2	8	584406	584413	0 %	0 %	50 %	50 %	262193749
15235	NC_013440	GTG	2	6	584449	584454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	262193749
15236	NC_013440	CTG	2	6	584503	584508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193749
15237	NC_013440	ATC	2	6	584522	584527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	262193749
15238	NC_013440	GTG	2	6	584534	584539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	262193749
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15240	NC_013440	CGAT	2	8	584582	584589	25 %	25 %	25 %	25 %	262193749
15241	NC_013440	ACC	2	6	584597	584602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	262193749
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15243	NC_013440	GAC	2	6	584675	584680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193750
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15245	NC_013440	TCG	2	6	584695	584700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193750
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15253	NC_013440	GCG	3	9	584857	584865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193750
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15359	NC_013440	AGC	2	6	588515	588520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193751
15360	NC_013440	GCT	2	6	588552	588557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193751
15361	NC_013440	GAT	2	6	588565	588570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262193751
15362	NC_013440	CGC	2	6	588589	588594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193751
15363	NC_013440	CG	3	6	588598	588603	0 %	0 %	50 %	50 %	262193751
15364	NC_013440	GAA	2	6	588616	588621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	262193751
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15367	NC_013440	TCG	2	6	588898	588903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193752
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15373	NC_013440	GAT	2	6	589047	589052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262193752
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15392	NC_013440	GC	3	6	589673	589678	0 %	0 %	50 %	50 %	262193752
15393	NC_013440	GCC	2	6	589701	589706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193752
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15442	NC_013440	CGA	2	6	591318	591323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193754
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15451	NC_013440	CGC	2	6	591609	591614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193754
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15464	NC_013440	CG	4	8	591934	591941	0 %	0 %	50 %	50 %	262193755
15465	NC_013440	GGCCGC	2	12	591956	591967	0 %	0 %	50 %	50 %	262193755
15466	NC_013440	GCA	2	6	591989	591994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193755
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15468	NC_013440	CACG	2	8	592046	592053	25 %	0 %	25 %	50 %	262193755
15469	NC_013440	CG	3	6	592085	592090	0 %	0 %	50 %	50 %	262193755
15470	NC_013440	GCT	2	6	592106	592111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193755
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15472	NC_013440	CGGTCG	2	12	592150	592161	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	262193755
15473	NC_013440	CTG	2	6	592188	592193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193755
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15476	NC_013440	GCT	2	6	592229	592234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193755
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15478	NC_013440	CG	3	6	592333	592338	0 %	0 %	50 %	50 %	262193755
15479	NC_013440	GGC	2	6	592356	592361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193755
15480	NC_013440	GGC	2	6	592379	592384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193755
15481	NC_013440	GCC	2	6	592389	592394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193755
15482	NC_013440	GCG	2	6	592402	592407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193755
15483	NC_013440	CGG	2	6	592460	592465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193755
15484	NC_013440	CGA	2	6	592466	592471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193755
15485	NC_013440	CG	3	6	592499	592504	0 %	0 %	50 %	50 %	262193755
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15487	NC_013440	CTGG	2	8	592523	592530	0 %	25 %	50 %	25 %	262193755
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15491	NC_013440	GGCG	2	8	592596	592603	0 %	0 %	75 %	25 %	262193755
15492	NC_013440	CTG	2	6	592608	592613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193755
15493	NC_013440	CCGG	2	8	592614	592621	0 %	0 %	50 %	50 %	262193755
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