MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haliangium ochraceum DSM 14365 chromosome

Total Repeats: 237741

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14002	NC_013440	CGG	2	6	539088	539093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193716
14003	NC_013440	GTC	2	6	539095	539100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193716
14004	NC_013440	CGG	2	6	539130	539135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193716
14005	NC_013440	GGC	2	6	539152	539157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193716
14006	NC_013440	CGG	2	6	539167	539172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193716
14007	NC_013440	CGC	2	6	539178	539183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193716
14008	NC_013440	GCG	2	6	539189	539194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193716
14009	NC_013440	GCG	2	6	539235	539240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193716
14010	NC_013440	CGC	2	6	539268	539273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193716
14011	NC_013440	CGC	2	6	539286	539291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193716
14012	NC_013440	GCG	2	6	539301	539306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193716
14013	NC_013440	CGG	2	6	539323	539328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193716
14014	NC_013440	GAT	2	6	539329	539334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262193716
14015	NC_013440	CGCTG	2	10	539382	539391	0 %	20 %	40 %	40 %	262193716
14016	NC_013440	CCG	2	6	539418	539423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193716
14017	NC_013440	GCG	2	6	539457	539462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193716
14018	NC_013440	GCG	2	6	539478	539483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193716
14019	NC_013440	CTCGAA	2	12	539503	539514	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	262193716
14020	NC_013440	GTC	4	12	539533	539544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193716
14021	NC_013440	GTC	2	6	539641	539646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193716
14022	NC_013440	GAT	2	6	539647	539652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262193716
14023	NC_013440	CGC	2	6	539739	539744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193716
14024	NC_013440	CTG	2	6	539797	539802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193716
14025	NC_013440	CG	4	8	539820	539827	0 %	0 %	50 %	50 %	262193716
14026	NC_013440	GC	3	6	539834	539839	0 %	0 %	50 %	50 %	262193716
14027	NC_013440	TTG	2	6	539879	539884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	262193716
14028	NC_013440	CGCC	2	8	539889	539896	0 %	0 %	25 %	75 %	262193716
14029	NC_013440	GCCA	2	8	539956	539963	25 %	0 %	25 %	50 %	262193716
14030	NC_013440	TC	3	6	540080	540085	0 %	50 %	0 %	50 %	262193717
14031	NC_013440	CG	3	6	540103	540108	0 %	0 %	50 %	50 %	262193717
14032	NC_013440	CGC	2	6	540137	540142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193717
14033	NC_013440	CTT	2	6	540147	540152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	262193717
14034	NC_013440	TGA	2	6	540182	540187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262193717
14035	NC_013440	TGG	2	6	540188	540193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	262193717
14036	NC_013440	TCG	2	6	540220	540225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193717
14037	NC_013440	CGG	2	6	540236	540241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193717
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14040	NC_013440	TGG	2	6	540341	540346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	262193717
14041	NC_013440	CCGTGA	2	12	540347	540358	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	262193717
14042	NC_013440	CG	4	8	540386	540393	0 %	0 %	50 %	50 %	262193717
14043	NC_013440	TCGATC	2	12	540430	540441	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	262193717
14044	NC_013440	CGC	2	6	540449	540454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193717
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14046	NC_013440	CG	3	6	540459	540464	0 %	0 %	50 %	50 %	262193717
14047	NC_013440	AGC	2	6	540493	540498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193717
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14049	NC_013440	GCTC	2	8	540515	540522	0 %	25 %	25 %	50 %	262193717
14050	NC_013440	GCA	2	6	540530	540535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193717
14051	NC_013440	GTG	2	6	540571	540576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	262193717
14052	NC_013440	GTG	2	6	540604	540609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	262193717
14053	NC_013440	GCC	2	6	540636	540641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193717
14054	NC_013440	ATG	2	6	540649	540654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262193717
14055	NC_013440	CGAG	2	8	540656	540663	25 %	0 %	50 %	25 %	262193717
14056	NC_013440	GCG	2	6	540665	540670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193717
14057	NC_013440	AGC	2	6	540679	540684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193717
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14059	NC_013440	CGA	2	6	540740	540745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193717
14060	NC_013440	TCG	2	6	540748	540753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193717
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14062	NC_013440	CTG	2	6	540801	540806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193717
14063	NC_013440	GCC	2	6	540828	540833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193717
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14065	NC_013440	TGCAGG	2	12	540964	540975	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	262193717
14066	NC_013440	GAT	2	6	540996	541001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262193717
14067	NC_013440	GC	4	8	541115	541122	0 %	0 %	50 %	50 %	262193717
14068	NC_013440	CCG	2	6	541171	541176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193717
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14073	NC_013440	CGT	2	6	541397	541402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193717
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14084	NC_013440	GTC	2	6	541999	542004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193718
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14086	NC_013440	CGT	2	6	542055	542060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193718
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14097	NC_013440	GTA	2	6	542512	542517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262193718
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14099	NC_013440	AGC	2	6	542597	542602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193718
14100	NC_013440	AGT	2	6	542607	542612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262193718
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14102	NC_013440	CGA	2	6	542640	542645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193718
14103	NC_013440	TCG	2	6	542736	542741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193718
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14105	NC_013440	GCGCAG	2	12	542790	542801	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	262193718
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14108	NC_013440	CGA	3	9	542844	542852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193718
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14113	NC_013440	CAG	2	6	542995	543000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193718
14114	NC_013440	GC	3	6	543029	543034	0 %	0 %	50 %	50 %	262193718
14115	NC_013440	GCT	2	6	543055	543060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193718
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14118	NC_013440	TCG	2	6	543134	543139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193718
14119	NC_013440	AGG	2	6	543161	543166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	262193719
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14123	NC_013440	GGC	2	6	543318	543323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193719
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14157	NC_013440	GCC	2	6	544454	544459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193720
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14159	NC_013440	CG	3	6	544514	544519	0 %	0 %	50 %	50 %	262193720
14160	NC_013440	CCA	2	6	544528	544533	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	262193720
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14218	NC_013440	ATC	2	6	547333	547338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	262193724
14219	NC_013440	T	6	6	547397	547402	0 %	100 %	0 %	0 %	262193724
14220	NC_013440	CGT	2	6	547472	547477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193724
14221	NC_013440	CGC	2	6	547487	547492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193724
14222	NC_013440	CG	3	6	547496	547501	0 %	0 %	50 %	50 %	262193724
14223	NC_013440	GTGC	2	8	547518	547525	0 %	25 %	50 %	25 %	262193724
14224	NC_013440	GCG	2	6	547565	547570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193724
14225	NC_013440	GC	3	6	547572	547577	0 %	0 %	50 %	50 %	262193724
14226	NC_013440	GCCCG	2	10	547583	547592	0 %	0 %	40 %	60 %	262193724
14227	NC_013440	CTG	2	6	547633	547638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193724
14228	NC_013440	ACGCGC	2	12	547639	547650	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	262193724
14229	NC_013440	GGC	2	6	547651	547656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193724
14230	NC_013440	GAT	2	6	547668	547673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262193724
14231	NC_013440	CGAG	2	8	547685	547692	25 %	0 %	50 %	25 %	262193724
14232	NC_013440	GTT	2	6	547719	547724	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	262193724
14233	NC_013440	CGCC	2	8	547741	547748	0 %	0 %	25 %	75 %	262193724
14234	NC_013440	CGG	2	6	547770	547775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193724
14235	NC_013440	CG	3	6	547811	547816	0 %	0 %	50 %	50 %	262193724
14236	NC_013440	GCC	2	6	547853	547858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193724
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14238	NC_013440	CGC	2	6	547889	547894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193724
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14348	NC_013440	CGG	2	6	551982	551987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193726
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14352	NC_013440	GACGCC	2	12	552034	552045	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	262193726
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14354	NC_013440	GACATG	2	12	552067	552078	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	262193726
14355	NC_013440	CGG	3	9	552129	552137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193726
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14357	NC_013440	GCT	2	6	552258	552263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193726
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14359	NC_013440	AGC	2	6	552346	552351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193726
14360	NC_013440	GC	3	6	552380	552385	0 %	0 %	50 %	50 %	262193726
14361	NC_013440	GAG	2	6	552472	552477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	262193726
14362	NC_013440	GC	3	6	552501	552506	0 %	0 %	50 %	50 %	262193726
14363	NC_013440	GAC	3	9	552523	552531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193726
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14366	NC_013440	GCA	2	6	552645	552650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193727
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14368	NC_013440	GTC	2	6	552700	552705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193727
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14372	NC_013440	GCC	2	6	552803	552808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193727
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14374	NC_013440	CGG	2	6	552831	552836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193727
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14376	NC_013440	TCA	2	6	552890	552895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	262193727
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14394	NC_013440	CCG	2	6	553484	553489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193727
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14425	NC_013440	TCG	2	6	554853	554858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193728
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14464	NC_013440	GC	3	6	556333	556338	0 %	0 %	50 %	50 %	262193729
14465	NC_013440	CGC	2	6	556393	556398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193729
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14469	NC_013440	CG	3	6	556594	556599	0 %	0 %	50 %	50 %	262193729
14470	NC_013440	CTG	2	6	556622	556627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193729
14471	NC_013440	GAA	2	6	556691	556696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	262193729
14472	NC_013440	GCG	2	6	556707	556712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193729
14473	NC_013440	CAG	3	9	556748	556756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193729
14474	NC_013440	CGA	2	6	556829	556834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193729
14475	NC_013440	GC	5	10	556844	556853	0 %	0 %	50 %	50 %	262193729
14476	NC_013440	GCA	2	6	556954	556959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193729
14477	NC_013440	GATGCC	2	12	556970	556981	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	262193729
14478	NC_013440	CGG	2	6	556990	556995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193729
14479	NC_013440	CAG	2	6	556997	557002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193729
14480	NC_013440	CAC	2	6	557003	557008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	262193729
14481	NC_013440	CGG	2	6	557020	557025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193729
14482	NC_013440	GGT	2	6	557066	557071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	262193729
14483	NC_013440	GGC	2	6	557072	557077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193729
14484	NC_013440	GAT	2	6	557093	557098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262193729
14485	NC_013440	GCA	2	6	557128	557133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193729
14486	NC_013440	CGGT	2	8	557174	557181	0 %	25 %	50 %	25 %	262193729
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14488	NC_013440	ACCAG	2	10	557188	557197	40 %	0 %	20 %	40 %	262193729
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14490	NC_013440	CAA	2	6	557525	557530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	262193730
14491	NC_013440	GCG	3	9	557545	557553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193730
14492	NC_013440	AGC	2	6	557572	557577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193730
14493	NC_013440	CG	3	6	557578	557583	0 %	0 %	50 %	50 %	262193730
14494	NC_013440	CGA	2	6	557600	557605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193730
14495	NC_013440	GCC	2	6	557608	557613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193730
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14497	NC_013440	TCG	2	6	557725	557730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193730
14498	NC_013440	CGG	2	6	557738	557743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193730
14499	NC_013440	CGA	2	6	557765	557770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193730
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