MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haliangium ochraceum DSM 14365 chromosome

Total Repeats: 237741

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_013440	CCGC	2	8	441421	441428	0 %	0 %	25 %	75 %	262193631
11502	NC_013440	GCG	2	6	441437	441442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193631
11503	NC_013440	GC	3	6	441448	441453	0 %	0 %	50 %	50 %	262193631
11504	NC_013440	CG	3	6	441479	441484	0 %	0 %	50 %	50 %	262193631
11505	NC_013440	GCGCC	2	10	441532	441541	0 %	0 %	40 %	60 %	262193631
11506	NC_013440	CGC	2	6	441550	441555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193631
11507	NC_013440	CGA	2	6	441583	441588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193631
11508	NC_013440	GGCG	2	8	441650	441657	0 %	0 %	75 %	25 %	262193631
11509	NC_013440	CG	3	6	441656	441661	0 %	0 %	50 %	50 %	262193631
11510	NC_013440	G	6	6	441715	441720	0 %	0 %	100 %	0 %	262193631
11511	NC_013440	CG	3	6	441736	441741	0 %	0 %	50 %	50 %	262193631
11512	NC_013440	GCT	2	6	441799	441804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193631
11513	NC_013440	GTC	2	6	441809	441814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193631
11514	NC_013440	TCG	2	6	441852	441857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193631
11515	NC_013440	GCC	2	6	441896	441901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193631
11516	NC_013440	GTT	2	6	442026	442031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	262193632
11517	NC_013440	AGC	2	6	442033	442038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193632
11518	NC_013440	CGAG	2	8	442058	442065	25 %	0 %	50 %	25 %	262193632
11519	NC_013440	GC	3	6	442100	442105	0 %	0 %	50 %	50 %	262193632
11520	NC_013440	GCG	2	6	442121	442126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193632
11521	NC_013440	GC	3	6	442157	442162	0 %	0 %	50 %	50 %	262193632
11522	NC_013440	CGC	2	6	442208	442213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193632
11523	NC_013440	CGG	3	9	442251	442259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193632
11524	NC_013440	CGG	2	6	442295	442300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193632
11525	NC_013440	TCG	2	6	442306	442311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193632
11526	NC_013440	AAC	2	6	442314	442319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	262193632
11527	NC_013440	GGC	2	6	442346	442351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193632
11528	NC_013440	AGG	2	6	442495	442500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	262193632
11529	NC_013440	ATC	2	6	442507	442512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	262193632
11530	NC_013440	CGT	2	6	442517	442522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193632
11531	NC_013440	TCG	2	6	442549	442554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193632
11532	NC_013440	CGC	2	6	442613	442618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193632
11533	NC_013440	CGCT	2	8	442687	442694	0 %	25 %	25 %	50 %	262193632
11534	NC_013440	CG	3	6	442704	442709	0 %	0 %	50 %	50 %	262193632
11535	NC_013440	TCC	2	6	442726	442731	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	262193632
11536	NC_013440	CGG	2	6	442772	442777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193632
11537	NC_013440	GCG	2	6	442783	442788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193632
11538	NC_013440	CGT	2	6	442841	442846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193632
11539	NC_013440	GGCT	2	8	442920	442927	0 %	25 %	50 %	25 %	262193632
11540	NC_013440	GGCGAT	2	12	443010	443021	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	262193632
11541	NC_013440	GCCA	2	8	443291	443298	25 %	0 %	25 %	50 %	262193633
11542	NC_013440	GC	3	6	443316	443321	0 %	0 %	50 %	50 %	262193633
11543	NC_013440	GAT	2	6	443338	443343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262193633
11544	NC_013440	GTC	2	6	443344	443349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193633
11545	NC_013440	GGCCG	2	10	443365	443374	0 %	0 %	60 %	40 %	262193633
11546	NC_013440	ATG	2	6	443387	443392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262193633
11547	NC_013440	GGCGCA	2	12	443403	443414	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	262193633
11548	NC_013440	CGAT	2	8	443441	443448	25 %	25 %	25 %	25 %	262193633
11549	NC_013440	TGA	2	6	443450	443455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262193633
11550	NC_013440	CG	3	6	443462	443467	0 %	0 %	50 %	50 %	262193633
11551	NC_013440	AGT	2	6	443487	443492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262193633
11552	NC_013440	GGC	2	6	443538	443543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193633
11553	NC_013440	TTG	2	6	443588	443593	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	262193633
11554	NC_013440	GCCGC	2	10	443624	443633	0 %	0 %	40 %	60 %	262193633
11555	NC_013440	GTA	2	6	443641	443646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262193633
11556	NC_013440	GC	4	8	443667	443674	0 %	0 %	50 %	50 %	262193633
11557	NC_013440	GCC	2	6	443707	443712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193633
11558	NC_013440	AGC	2	6	443744	443749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193633
11559	NC_013440	AGG	2	6	443754	443759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	262193633
11560	NC_013440	CGC	2	6	443760	443765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193633
11561	NC_013440	GAA	2	6	443800	443805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	262193633
11562	NC_013440	CGC	2	6	443832	443837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193633
11563	NC_013440	GC	4	8	443840	443847	0 %	0 %	50 %	50 %	262193633
11564	NC_013440	GATG	2	8	443853	443860	25 %	25 %	50 %	0 %	262193633
11565	NC_013440	GCC	3	9	443935	443943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193633
11566	NC_013440	CGC	2	6	443958	443963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193633
11567	NC_013440	TGA	2	6	443976	443981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262193633
11568	NC_013440	GTC	2	6	444046	444051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193633
11569	NC_013440	CG	3	6	444072	444077	0 %	0 %	50 %	50 %	262193633
11570	NC_013440	GCC	2	6	444103	444108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193633
11571	NC_013440	TCG	2	6	444134	444139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193633
11572	NC_013440	GCGCGG	2	12	444189	444200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193633
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11575	NC_013440	CCGG	2	8	444242	444249	0 %	0 %	50 %	50 %	262193633
11576	NC_013440	GCT	2	6	444316	444321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193633
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11578	NC_013440	TCG	2	6	444608	444613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193634
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11580	NC_013440	TCG	2	6	444659	444664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193634
11581	NC_013440	GTC	2	6	444673	444678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193634
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11584	NC_013440	GC	3	6	444839	444844	0 %	0 %	50 %	50 %	262193634
11585	NC_013440	GTC	2	6	444889	444894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193634
11586	NC_013440	CCTCGA	2	12	444948	444959	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	262193634
11587	NC_013440	GGC	2	6	444991	444996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193634
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11590	NC_013440	GCG	2	6	445031	445036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193634
11591	NC_013440	TCG	2	6	445040	445045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193634
11592	NC_013440	TCG	2	6	445064	445069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193634
11593	NC_013440	CGTCGG	3	18	445128	445145	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	262193634
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11596	NC_013440	GGC	3	9	445219	445227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193634
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11598	NC_013440	CGT	2	6	445499	445504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193635
11599	NC_013440	AGC	2	6	445505	445510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193635
11600	NC_013440	CGA	2	6	445526	445531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193635
11601	NC_013440	GGCCG	2	10	445536	445545	0 %	0 %	60 %	40 %	262193635
11602	NC_013440	CAG	2	6	445551	445556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193635
11603	NC_013440	GC	3	6	445563	445568	0 %	0 %	50 %	50 %	262193635
11604	NC_013440	TCG	2	6	445609	445614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193635
11605	NC_013440	GGCCG	2	10	445628	445637	0 %	0 %	60 %	40 %	262193635
11606	NC_013440	CG	3	6	445642	445647	0 %	0 %	50 %	50 %	262193635
11607	NC_013440	CG	5	10	445709	445718	0 %	0 %	50 %	50 %	262193635
11608	NC_013440	GGC	2	6	445719	445724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193635
11609	NC_013440	GC	4	8	445732	445739	0 %	0 %	50 %	50 %	262193635
11610	NC_013440	GCA	2	6	445748	445753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193635
11611	NC_013440	GGCG	2	8	445754	445761	0 %	0 %	75 %	25 %	262193635
11612	NC_013440	GCG	2	6	445781	445786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193635
11613	NC_013440	AGC	2	6	445789	445794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193635
11614	NC_013440	GGCG	2	8	445799	445806	0 %	0 %	75 %	25 %	262193635
11615	NC_013440	GCA	2	6	445820	445825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193635
11616	NC_013440	TCG	2	6	445831	445836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193635
11617	NC_013440	GGCGC	2	10	445875	445884	0 %	0 %	60 %	40 %	262193635
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11619	NC_013440	GCG	2	6	445956	445961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193635
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11621	NC_013440	GGC	2	6	446027	446032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193635
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11623	NC_013440	GCG	2	6	446044	446049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193635
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11740	NC_013440	GGC	2	6	450703	450708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193640
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11980	NC_013440	AGC	2	6	460428	460433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193649
11981	NC_013440	GCT	3	9	460438	460446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193649
11982	NC_013440	CGA	2	6	460450	460455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193649
11983	NC_013440	GC	3	6	460464	460469	0 %	0 %	50 %	50 %	262193649
11984	NC_013440	TCA	2	6	460545	460550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	262193649
11985	NC_013440	TGG	2	6	460608	460613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	262193649
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11987	NC_013440	GC	3	6	460667	460672	0 %	0 %	50 %	50 %	262193650
11988	NC_013440	CG	3	6	460799	460804	0 %	0 %	50 %	50 %	262193650
11989	NC_013440	GC	4	8	460854	460861	0 %	0 %	50 %	50 %	262193650
11990	NC_013440	GC	4	8	460874	460881	0 %	0 %	50 %	50 %	262193650
11991	NC_013440	CG	3	6	460916	460921	0 %	0 %	50 %	50 %	262193650
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11995	NC_013440	CGA	3	9	461058	461066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193650
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11998	NC_013440	GC	3	6	461210	461215	0 %	0 %	50 %	50 %	262193650
11999	NC_013440	CGG	2	6	461229	461234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193650
12000	NC_013440	TGGA	2	8	461248	461255	25 %	25 %	50 %	0 %	262193650

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