MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haliangium ochraceum DSM 14365 chromosome

Total Repeats: 237741

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_013440	GCG	3	9	307604	307612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193530
8002	NC_013440	TGG	2	6	307648	307653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	262193530
8003	NC_013440	CCG	2	6	307663	307668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193530
8004	NC_013440	CTTGGC	2	12	307682	307693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193530
8005	NC_013440	GC	3	6	307723	307728	0 %	0 %	50 %	50 %	262193530
8006	NC_013440	TGT	2	6	307738	307743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	262193530
8007	NC_013440	TTG	2	6	307809	307814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	262193530
8008	NC_013440	CGC	2	6	307866	307871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193530
8009	NC_013440	CAT	2	6	307904	307909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	262193530
8010	NC_013440	CTC	2	6	308006	308011	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	262193530
8011	NC_013440	GCG	2	6	308016	308021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193530
8012	NC_013440	CTT	2	6	308030	308035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	262193530
8013	NC_013440	GAT	2	6	308069	308074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262193530
8014	NC_013440	AGA	2	6	308188	308193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	262193530
8015	NC_013440	CCG	2	6	308253	308258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193530
8016	NC_013440	CCA	2	6	308282	308287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	262193530
8017	NC_013440	GAG	2	6	308315	308320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	262193530
8018	NC_013440	GTG	2	6	308338	308343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	262193530
8019	NC_013440	GTC	2	6	308365	308370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193531
8020	NC_013440	GGC	2	6	308432	308437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193531
8021	NC_013440	GAG	2	6	308439	308444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	262193531
8022	NC_013440	GGC	2	6	308449	308454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193531
8023	NC_013440	GC	3	6	308459	308464	0 %	0 %	50 %	50 %	262193531
8024	NC_013440	GTC	2	6	308487	308492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193531
8025	NC_013440	AC	3	6	308616	308621	50 %	0 %	0 %	50 %	262193531
8026	NC_013440	CGA	2	6	308627	308632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193531
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8028	NC_013440	GCG	2	6	308654	308659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193531
8029	NC_013440	GGT	2	6	308708	308713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	262193531
8030	NC_013440	CTCGGC	2	12	308856	308867	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	262193531
8031	NC_013440	TCG	2	6	308896	308901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193531
8032	NC_013440	TCG	2	6	308905	308910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193531
8033	NC_013440	TTG	2	6	308980	308985	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	262193531
8034	NC_013440	ACC	2	6	308998	309003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	262193531
8035	NC_013440	AGCG	2	8	309076	309083	25 %	0 %	50 %	25 %	262193531
8036	NC_013440	GAA	2	6	309114	309119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	262193531
8037	NC_013440	TCG	2	6	309157	309162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193531
8038	NC_013440	GC	3	6	309164	309169	0 %	0 %	50 %	50 %	262193531
8039	NC_013440	GAT	2	6	309219	309224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262193531
8040	NC_013440	TCA	2	6	309230	309235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	262193531
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8043	NC_013440	GC	3	6	309317	309322	0 %	0 %	50 %	50 %	262193531
8044	NC_013440	CG	3	6	309344	309349	0 %	0 %	50 %	50 %	262193531
8045	NC_013440	TGG	2	6	309359	309364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	262193531
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8047	NC_013440	GC	3	6	309386	309391	0 %	0 %	50 %	50 %	262193531
8048	NC_013440	CCG	2	6	309392	309397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193531
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8051	NC_013440	TCG	2	6	309496	309501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193531
8052	NC_013440	TCCA	2	8	309502	309509	25 %	25 %	0 %	50 %	262193531
8053	NC_013440	CGG	2	6	309659	309664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193532
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8055	NC_013440	GGC	2	6	309687	309692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193532
8056	NC_013440	CGC	2	6	309734	309739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193532
8057	NC_013440	GC	4	8	309738	309745	0 %	0 %	50 %	50 %	262193532
8058	NC_013440	CGG	2	6	309761	309766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193532
8059	NC_013440	CG	3	6	309786	309791	0 %	0 %	50 %	50 %	262193532
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8081	NC_013440	GCA	2	6	310370	310375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193532
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8087	NC_013440	GCCGC	2	10	310802	310811	0 %	0 %	40 %	60 %	262193532
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8103	NC_013440	CGAG	2	8	311824	311831	25 %	0 %	50 %	25 %	262193534
8104	NC_013440	TC	3	6	311930	311935	0 %	50 %	0 %	50 %	262193535
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8107	NC_013440	ATCT	2	8	312027	312034	25 %	50 %	0 %	25 %	262193535
8108	NC_013440	CGA	2	6	312035	312040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193535
8109	NC_013440	AGC	2	6	312061	312066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193535
8110	NC_013440	CGA	2	6	312254	312259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193535
8111	NC_013440	TGC	2	6	312280	312285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193535
8112	NC_013440	TGG	2	6	312301	312306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	262193535
8113	NC_013440	GCT	2	6	312329	312334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193535
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8116	NC_013440	GC	3	6	312472	312477	0 %	0 %	50 %	50 %	262193535
8117	NC_013440	CGA	2	6	312521	312526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193535
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8119	NC_013440	CGCGGC	2	12	312560	312571	0 %	0 %	50 %	50 %	262193535
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8121	NC_013440	CGC	2	6	312866	312871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193536
8122	NC_013440	GCA	2	6	312932	312937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193536
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8242	NC_013440	GCC	2	6	317040	317045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193540
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8245	NC_013440	CGC	2	6	317129	317134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193540
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8348	NC_013440	GCTG	2	8	321616	321623	0 %	25 %	50 %	25 %	262193544
8349	NC_013440	CGC	2	6	321682	321687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193544
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8351	NC_013440	TAC	2	6	321762	321767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	262193544
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8354	NC_013440	CAA	2	6	321815	321820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	262193544
8355	NC_013440	TCG	2	6	321829	321834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193544
8356	NC_013440	GCT	2	6	321887	321892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193544
8357	NC_013440	GCGA	2	8	321985	321992	25 %	0 %	50 %	25 %	262193544
8358	NC_013440	GCT	2	6	322007	322012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193544
8359	NC_013440	GC	3	6	322014	322019	0 %	0 %	50 %	50 %	262193544
8360	NC_013440	CGG	2	6	322022	322027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193544
8361	NC_013440	GAG	2	6	322029	322034	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	262193544
8362	NC_013440	CGC	2	6	322037	322042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193544
8363	NC_013440	TGC	2	6	322045	322050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193544
8364	NC_013440	TCG	2	6	322102	322107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193544
8365	NC_013440	TCA	2	6	322204	322209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	262193544
8366	NC_013440	GAC	2	6	322218	322223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193544
8367	NC_013440	GC	4	8	322368	322375	0 %	0 %	50 %	50 %	262193545
8368	NC_013440	GGC	2	6	322445	322450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193545
8369	NC_013440	CG	3	6	322454	322459	0 %	0 %	50 %	50 %	262193545
8370	NC_013440	GCG	2	6	322525	322530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193545
8371	NC_013440	GTC	2	6	322544	322549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193545
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8373	NC_013440	CAC	2	6	322619	322624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	262193545
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8375	NC_013440	GC	3	6	322695	322700	0 %	0 %	50 %	50 %	262193545
8376	NC_013440	TCGA	2	8	322752	322759	25 %	25 %	25 %	25 %	262193545
8377	NC_013440	CCG	4	12	322770	322781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193545
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8380	NC_013440	TCG	2	6	322902	322907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193545
8381	NC_013440	GC	4	8	322915	322922	0 %	0 %	50 %	50 %	262193545
8382	NC_013440	CGC	2	6	322932	322937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193545
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8384	NC_013440	GCA	2	6	322990	322995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193545
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8387	NC_013440	CGGC	2	8	323172	323179	0 %	0 %	50 %	50 %	262193545
8388	NC_013440	CG	3	6	323191	323196	0 %	0 %	50 %	50 %	262193545
8389	NC_013440	CG	5	10	323254	323263	0 %	0 %	50 %	50 %	262193545
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8392	NC_013440	TCG	2	6	323349	323354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193545
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8398	NC_013440	CCACG	2	10	323677	323686	20 %	0 %	20 %	60 %	262193546
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8401	NC_013440	CGC	2	6	323834	323839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193546
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8435	NC_013440	GTC	2	6	325016	325021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193547
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8448	NC_013440	CG	5	10	325327	325336	0 %	0 %	50 %	50 %	262193547
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8465	NC_013440	GC	3	6	325873	325878	0 %	0 %	50 %	50 %	262193547
8466	NC_013440	GAGC	2	8	325972	325979	25 %	0 %	50 %	25 %	262193547
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8470	NC_013440	GCGAC	2	10	326263	326272	20 %	0 %	40 %	40 %	262193547
8471	NC_013440	GC	3	6	326273	326278	0 %	0 %	50 %	50 %	262193547
8472	NC_013440	CAT	2	6	326311	326316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	262193547
8473	NC_013440	TCG	2	6	326391	326396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193547
8474	NC_013440	GC	3	6	326419	326424	0 %	0 %	50 %	50 %	262193547
8475	NC_013440	CG	3	6	326427	326432	0 %	0 %	50 %	50 %	262193547
8476	NC_013440	CCCG	2	8	326587	326594	0 %	0 %	25 %	75 %	262193548
8477	NC_013440	CG	3	6	326624	326629	0 %	0 %	50 %	50 %	262193548
8478	NC_013440	GAG	2	6	326672	326677	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	262193548
8479	NC_013440	CGG	2	6	326691	326696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193548
8480	NC_013440	CGA	2	6	326737	326742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193548
8481	NC_013440	GCC	3	9	326779	326787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193548
8482	NC_013440	CGA	2	6	326806	326811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193548
8483	NC_013440	TCG	4	12	326831	326842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193548
8484	NC_013440	CTG	2	6	326844	326849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193548
8485	NC_013440	CG	4	8	326935	326942	0 %	0 %	50 %	50 %	262193548
8486	NC_013440	GCC	2	6	326986	326991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193548
8487	NC_013440	GC	3	6	327028	327033	0 %	0 %	50 %	50 %	262193548
8488	NC_013440	GGA	2	6	327085	327090	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	262193548
8489	NC_013440	TCCTCA	2	12	327123	327134	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	262193548
8490	NC_013440	GCC	2	6	327182	327187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193548
8491	NC_013440	GCGCGA	2	12	327202	327213	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	262193548
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