MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haliangium ochraceum DSM 14365 chromosome

Total Repeats: 237741

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_013440	CGA	2	6	215618	215623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193471
5502	NC_013440	CGC	2	6	215636	215641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193471
5503	NC_013440	GCC	2	6	215655	215660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193471
5504	NC_013440	GCT	3	9	215676	215684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193471
5505	NC_013440	CGT	2	6	215729	215734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193471
5506	NC_013440	TGG	2	6	215774	215779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	262193471
5507	NC_013440	TGA	2	6	215783	215788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262193471
5508	NC_013440	GCC	3	9	215799	215807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193471
5509	NC_013440	CGG	2	6	215852	215857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193471
5510	NC_013440	CG	5	10	215904	215913	0 %	0 %	50 %	50 %	262193471
5511	NC_013440	TCG	2	6	215923	215928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193471
5512	NC_013440	GC	3	6	215977	215982	0 %	0 %	50 %	50 %	262193471
5513	NC_013440	GCC	2	6	215991	215996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193471
5514	NC_013440	GTC	2	6	216015	216020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193471
5515	NC_013440	TCG	2	6	216037	216042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193471
5516	NC_013440	GCCG	2	8	216060	216067	0 %	0 %	50 %	50 %	262193471
5517	NC_013440	GC	4	8	216085	216092	0 %	0 %	50 %	50 %	262193471
5518	NC_013440	AGC	2	6	216170	216175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193471
5519	NC_013440	TCG	2	6	216232	216237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193471
5520	NC_013440	CGG	2	6	216290	216295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193471
5521	NC_013440	GGC	2	6	216306	216311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193471
5522	NC_013440	GC	3	6	216331	216336	0 %	0 %	50 %	50 %	262193471
5523	NC_013440	CGGCG	2	10	216399	216408	0 %	0 %	60 %	40 %	262193471
5524	NC_013440	GC	3	6	216416	216421	0 %	0 %	50 %	50 %	262193471
5525	NC_013440	GCG	2	6	216453	216458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193471
5526	NC_013440	GCG	2	6	216472	216477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193471
5527	NC_013440	AGC	2	6	216595	216600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193472
5528	NC_013440	GCC	2	6	216632	216637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193472
5529	NC_013440	CCA	2	6	216695	216700	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	262193472
5530	NC_013440	CCGCGG	2	12	216701	216712	0 %	0 %	50 %	50 %	262193472
5531	NC_013440	CG	3	6	216743	216748	0 %	0 %	50 %	50 %	262193472
5532	NC_013440	CG	4	8	216776	216783	0 %	0 %	50 %	50 %	262193472
5533	NC_013440	GAT	2	6	216798	216803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262193472
5534	NC_013440	CCT	2	6	216839	216844	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	262193472
5535	NC_013440	CGCAGC	3	18	216856	216873	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	262193472
5536	NC_013440	CG	3	6	216887	216892	0 %	0 %	50 %	50 %	262193472
5537	NC_013440	CGG	2	6	216937	216942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193472
5538	NC_013440	CG	3	6	216965	216970	0 %	0 %	50 %	50 %	262193472
5539	NC_013440	CGCGC	2	10	216976	216985	0 %	0 %	40 %	60 %	262193472
5540	NC_013440	AGC	2	6	217003	217008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193472
5541	NC_013440	CG	3	6	217024	217029	0 %	0 %	50 %	50 %	262193472
5542	NC_013440	GCCC	2	8	217040	217047	0 %	0 %	25 %	75 %	262193472
5543	NC_013440	GCA	2	6	217055	217060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193472
5544	NC_013440	GTGCCG	2	12	217096	217107	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	262193472
5545	NC_013440	CGC	2	6	217145	217150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193472
5546	NC_013440	CG	3	6	217169	217174	0 %	0 %	50 %	50 %	262193472
5547	NC_013440	GAG	2	6	217200	217205	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	262193472
5548	NC_013440	TCGC	2	8	217211	217218	0 %	25 %	25 %	50 %	262193472
5549	NC_013440	GCG	3	9	217509	217517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193473
5550	NC_013440	CAG	2	6	217518	217523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193473
5551	NC_013440	CG	3	6	217533	217538	0 %	0 %	50 %	50 %	262193473
5552	NC_013440	CGC	2	6	217553	217558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193473
5553	NC_013440	CGGG	2	8	217572	217579	0 %	0 %	75 %	25 %	262193473
5554	NC_013440	GCG	2	6	217654	217659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193473
5555	NC_013440	GCC	2	6	217668	217673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193473
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5557	NC_013440	AGC	2	6	217789	217794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193473
5558	NC_013440	CGT	3	9	217808	217816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193473
5559	NC_013440	GCG	2	6	217858	217863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193473
5560	NC_013440	GGC	2	6	217940	217945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193473
5561	NC_013440	GCGG	2	8	218006	218013	0 %	0 %	75 %	25 %	262193473
5562	NC_013440	CAT	2	6	218082	218087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	262193473
5563	NC_013440	GC	3	6	218094	218099	0 %	0 %	50 %	50 %	262193473
5564	NC_013440	GCCGC	2	10	218116	218125	0 %	0 %	40 %	60 %	262193473
5565	NC_013440	CTT	2	6	218133	218138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	262193473
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5570	NC_013440	CCA	2	6	218327	218332	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	262193473
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5572	NC_013440	GGCCGC	2	12	218382	218393	0 %	0 %	50 %	50 %	262193473
5573	NC_013440	CCA	2	6	218462	218467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	262193473
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5589	NC_013440	GCCA	2	8	219273	219280	25 %	0 %	25 %	50 %	262193474
5590	NC_013440	GCG	2	6	219291	219296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193474
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5595	NC_013440	GC	3	6	219470	219475	0 %	0 %	50 %	50 %	262193474
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5607	NC_013440	GC	3	6	219832	219837	0 %	0 %	50 %	50 %	262193475
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5619	NC_013440	GAG	2	6	219989	219994	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	262193475
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5621	NC_013440	GC	4	8	220023	220030	0 %	0 %	50 %	50 %	262193475
5622	NC_013440	AGC	2	6	220050	220055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193475
5623	NC_013440	GC	3	6	220065	220070	0 %	0 %	50 %	50 %	262193475
5624	NC_013440	GCT	2	6	220075	220080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193475
5625	NC_013440	GCT	2	6	220084	220089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193475
5626	NC_013440	TCC	2	6	220116	220121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	262193475
5627	NC_013440	CGA	2	6	220132	220137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193475
5628	NC_013440	ACG	3	9	220140	220148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193475
5629	NC_013440	TCA	2	6	220197	220202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	262193475
5630	NC_013440	TC	3	6	220210	220215	0 %	50 %	0 %	50 %	262193475
5631	NC_013440	GAG	2	6	220238	220243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	262193475
5632	NC_013440	GAC	2	6	220247	220252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193475
5633	NC_013440	GCC	2	6	220315	220320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193475
5634	NC_013440	TGC	2	6	220332	220337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193475
5635	NC_013440	CAC	2	6	220340	220345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	262193475
5636	NC_013440	CGAGGT	2	12	220417	220428	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	262193475
5637	NC_013440	CGT	2	6	220449	220454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193476
5638	NC_013440	GGC	2	6	220503	220508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193476
5639	NC_013440	AGCG	2	8	220513	220520	25 %	0 %	50 %	25 %	262193476
5640	NC_013440	GC	3	6	220538	220543	0 %	0 %	50 %	50 %	262193476
5641	NC_013440	CGT	2	6	220607	220612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193476
5642	NC_013440	CTG	3	9	220615	220623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193476
5643	NC_013440	GGGC	2	8	220667	220674	0 %	0 %	75 %	25 %	262193476
5644	NC_013440	GC	3	6	220673	220678	0 %	0 %	50 %	50 %	262193476
5645	NC_013440	GC	3	6	220702	220707	0 %	0 %	50 %	50 %	262193476
5646	NC_013440	GCG	2	6	220712	220717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193476
5647	NC_013440	GTG	2	6	220735	220740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	262193476
5648	NC_013440	CGC	2	6	220785	220790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193476
5649	NC_013440	GGCGC	2	10	220802	220811	0 %	0 %	60 %	40 %	262193476
5650	NC_013440	GGCGAG	2	12	220840	220851	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	262193476
5651	NC_013440	CGGG	2	8	220854	220861	0 %	0 %	75 %	25 %	262193476
5652	NC_013440	GC	3	6	220902	220907	0 %	0 %	50 %	50 %	262193476
5653	NC_013440	CGC	2	6	220917	220922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193476
5654	NC_013440	CGC	2	6	220934	220939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193476
5655	NC_013440	AGG	2	6	220949	220954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	262193476
5656	NC_013440	TGC	2	6	220955	220960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193476
5657	NC_013440	CGGCCG	2	12	221003	221014	0 %	0 %	50 %	50 %	262193476
5658	NC_013440	CG	3	6	221013	221018	0 %	0 %	50 %	50 %	262193476
5659	NC_013440	GCT	2	6	221028	221033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193476
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5662	NC_013440	CGG	3	9	221091	221099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193476
5663	NC_013440	GCC	2	6	221107	221112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193476
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5666	NC_013440	CGG	3	9	221172	221180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193476
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5672	NC_013440	CGG	2	6	221322	221327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193476
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5702	NC_013440	GCG	2	6	222152	222157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193476
5703	NC_013440	CGGC	2	8	222167	222174	0 %	0 %	50 %	50 %	262193476
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5733	NC_013440	CGG	2	6	223342	223347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193477
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5736	NC_013440	CG	4	8	223417	223424	0 %	0 %	50 %	50 %	262193477
5737	NC_013440	ACG	2	6	223425	223430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193477
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5740	NC_013440	CGG	2	6	223561	223566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193477
5741	NC_013440	GC	5	10	223588	223597	0 %	0 %	50 %	50 %	262193477
5742	NC_013440	CGC	2	6	223612	223617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193477
5743	NC_013440	CG	3	6	223641	223646	0 %	0 %	50 %	50 %	262193477
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5745	NC_013440	GC	4	8	223722	223729	0 %	0 %	50 %	50 %	262193477
5746	NC_013440	CGG	2	6	223735	223740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193477
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5748	NC_013440	GC	3	6	223747	223752	0 %	0 %	50 %	50 %	262193477
5749	NC_013440	GT	3	6	223814	223819	0 %	50 %	50 %	0 %	262193477
5750	NC_013440	GC	4	8	223845	223852	0 %	0 %	50 %	50 %	262193477
5751	NC_013440	GC	3	6	223862	223867	0 %	0 %	50 %	50 %	262193477
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5762	NC_013440	GCG	2	6	224211	224216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193477
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5850	NC_013440	TGGCG	2	10	227471	227480	0 %	20 %	60 %	20 %	262193478
5851	NC_013440	CAGCAC	2	12	227496	227507	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	262193478
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5857	NC_013440	CCGC	2	8	227776	227783	0 %	0 %	25 %	75 %	262193478
5858	NC_013440	GCTCAC	2	12	227784	227795	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	262193478
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5861	NC_013440	TGC	2	6	227978	227983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193478
5862	NC_013440	GCGG	2	8	227998	228005	0 %	0 %	75 %	25 %	262193478
5863	NC_013440	GGT	2	6	228030	228035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	262193478
5864	NC_013440	GCG	2	6	228064	228069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193478
5865	NC_013440	TTTA	2	8	228099	228106	25 %	75 %	0 %	0 %	262193478
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5868	NC_013440	CGAAGC	2	12	228365	228376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193479
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5973	NC_013440	GC	3	6	232356	232361	0 %	0 %	50 %	50 %	262193481
5974	NC_013440	CG	3	6	232381	232386	0 %	0 %	50 %	50 %	262193481
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5984	NC_013440	GGC	2	6	232554	232559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193481
5985	NC_013440	GCG	2	6	232563	232568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193481
5986	NC_013440	GGC	2	6	232619	232624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193481
5987	NC_013440	CTCGAG	2	12	232649	232660	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	262193481
5988	NC_013440	TCG	2	6	232692	232697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193481
5989	NC_013440	GCC	2	6	232705	232710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193481
5990	NC_013440	GC	3	6	232716	232721	0 %	0 %	50 %	50 %	262193481
5991	NC_013440	GCG	2	6	232747	232752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193481
5992	NC_013440	CGA	2	6	232801	232806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193481
5993	NC_013440	CGC	2	6	232816	232821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193481
5994	NC_013440	CCA	2	6	232846	232851	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	262193481
5995	NC_013440	GCC	2	6	232859	232864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193481
5996	NC_013440	TGCT	2	8	232908	232915	0 %	50 %	25 %	25 %	262193481
5997	NC_013440	GCGCC	2	10	232936	232945	0 %	0 %	40 %	60 %	262193481
5998	NC_013440	CAG	3	9	232961	232969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193481
5999	NC_013440	GC	6	12	232977	232988	0 %	0 %	50 %	50 %	262193481
6000	NC_013440	TGGT	2	8	233025	233032	0 %	50 %	50 %	0 %	262193481

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