MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halothiobacillus neapolitanus c2 chromosome

Total Repeats: 45067

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
45001	NC_013422	ACA	2	6	2579158	2579163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261856983
45002	NC_013422	GCG	2	6	2579195	2579200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856983
45003	NC_013422	CGG	2	6	2579242	2579247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856983
45004	NC_013422	GAT	2	6	2579252	2579257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856983
45005	NC_013422	GTA	2	6	2579293	2579298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856983
45006	NC_013422	GTG	2	6	2579307	2579312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261856983
45007	NC_013422	ATC	2	6	2579339	2579344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856983
45008	NC_013422	CAG	2	6	2579360	2579365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856983
45009	NC_013422	CGA	2	6	2579392	2579397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856983
45010	NC_013422	CAG	2	6	2579447	2579452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856983
45011	NC_013422	GAAA	2	8	2579505	2579512	75 %	0 %	25 %	0 %	261856983
45012	NC_013422	TCT	2	6	2579520	2579525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261856983
45013	NC_013422	TGT	2	6	2579574	2579579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261856983
45014	NC_013422	GCG	2	6	2579637	2579642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856983
45015	NC_013422	CG	3	6	2579748	2579753	0 %	0 %	50 %	50 %	261856983
45016	NC_013422	GAA	2	6	2579761	2579766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261856983
45017	NC_013422	CAG	2	6	2579774	2579779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856983
45018	NC_013422	GCC	2	6	2579798	2579803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856983
45019	NC_013422	CCA	2	6	2579818	2579823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856983
45020	NC_013422	GCG	2	6	2579845	2579850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856983
45021	NC_013422	GC	3	6	2579884	2579889	0 %	0 %	50 %	50 %	261856983
45022	NC_013422	CG	3	6	2579919	2579924	0 %	0 %	50 %	50 %	261856983
45023	NC_013422	AAT	2	6	2579993	2579998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261856983
45024	NC_013422	ACC	2	6	2580005	2580010	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856983
45025	NC_013422	GGC	2	6	2580032	2580037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856983
45026	NC_013422	CTG	2	6	2580132	2580137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856984
45027	NC_013422	GAA	2	6	2580189	2580194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261856984
45028	NC_013422	GAA	2	6	2580198	2580203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261856984
45029	NC_013422	CTG	2	6	2580276	2580281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856984
45030	NC_013422	GCA	2	6	2580311	2580316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856984
45031	NC_013422	TCA	2	6	2580485	2580490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856984
45032	NC_013422	TGTC	2	8	2580508	2580515	0 %	50 %	25 %	25 %	261856984
45033	NC_013422	GAA	2	6	2580606	2580611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261856984
45034	NC_013422	AGC	2	6	2580682	2580687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856984
45035	NC_013422	AGA	2	6	2580689	2580694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261856984
45036	NC_013422	GCG	2	6	2580755	2580760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856984
45037	NC_013422	AGT	2	6	2580947	2580952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856984
45038	NC_013422	ATA	2	6	2580958	2580963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261856984
45039	NC_013422	TGGC	2	8	2581144	2581151	0 %	25 %	50 %	25 %	261856984
45040	NC_013422	CAC	2	6	2581208	2581213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856984
45041	NC_013422	ATG	2	6	2581219	2581224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856984
45042	NC_013422	TC	3	6	2581358	2581363	0 %	50 %	0 %	50 %	261856984
45043	NC_013422	GCT	2	6	2581633	2581638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856984
45044	NC_013422	GCC	2	6	2581684	2581689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856984
45045	NC_013422	CAAAA	2	10	2581743	2581752	80 %	0 %	0 %	20 %	261856984
45046	NC_013422	CAA	2	6	2581760	2581765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261856984
45047	NC_013422	GGC	2	6	2581775	2581780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856984
45048	NC_013422	TCAA	2	8	2581800	2581807	50 %	25 %	0 %	25 %	261856985
45049	NC_013422	GC	3	6	2581866	2581871	0 %	0 %	50 %	50 %	261856985
45050	NC_013422	CGG	2	6	2581915	2581920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856985
45051	NC_013422	GAT	2	6	2581956	2581961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856985
45052	NC_013422	GCC	2	6	2582074	2582079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856985
45053	NC_013422	CGG	2	6	2582149	2582154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856985
45054	NC_013422	TGA	2	6	2582166	2582171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856985
45055	NC_013422	CG	3	6	2582215	2582220	0 %	0 %	50 %	50 %	261856986
45056	NC_013422	TCA	2	6	2582243	2582248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856986
45057	NC_013422	ATG	2	6	2582296	2582301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856986
45058	NC_013422	ATG	2	6	2582312	2582317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856986
45059	NC_013422	TGA	2	6	2582329	2582334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856986
45060	NC_013422	CGA	2	6	2582335	2582340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856986
45061	NC_013422	CAG	2	6	2582460	2582465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856986
45062	NC_013422	AAACC	2	10	2582542	2582551	60 %	0 %	0 %	40 %	261856986
45063	NC_013422	CAT	2	6	2582565	2582570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856986
45064	NC_013422	TGA	2	6	2582636	2582641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856987
45065	NC_013422	CCA	2	6	2582650	2582655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856987
45066	NC_013422	GT	3	6	2582682	2582687	0 %	50 %	50 %	0 %	261856987
45067	NC_013422	AAT	2	6	2582700	2582705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261856987

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.