MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halothiobacillus neapolitanus c2 chromosome

Total Repeats: 45067

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
44001	NC_013422	ACA	2	6	2523248	2523253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261856929
44002	NC_013422	ACG	2	6	2523261	2523266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856929
44003	NC_013422	CCG	2	6	2523274	2523279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856929
44004	NC_013422	TCT	2	6	2523376	2523381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261856929
44005	NC_013422	CAG	2	6	2523402	2523407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856929
44006	NC_013422	TGG	2	6	2523530	2523535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261856930
44007	NC_013422	CGC	2	6	2523573	2523578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856930
44008	NC_013422	CCGCG	2	10	2523668	2523677	0 %	0 %	40 %	60 %	261856930
44009	NC_013422	GAC	2	6	2523701	2523706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856930
44010	NC_013422	CAT	2	6	2523770	2523775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856930
44011	NC_013422	CAG	2	6	2523870	2523875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856931
44012	NC_013422	GCC	2	6	2523880	2523885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856931
44013	NC_013422	TCGC	2	8	2523905	2523912	0 %	25 %	25 %	50 %	261856931
44014	NC_013422	GTA	2	6	2524162	2524167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856931
44015	NC_013422	TGT	2	6	2524182	2524187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261856931
44016	NC_013422	GTA	2	6	2524267	2524272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856931
44017	NC_013422	GT	3	6	2524314	2524319	0 %	50 %	50 %	0 %	261856931
44018	NC_013422	CCG	2	6	2524328	2524333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856931
44019	NC_013422	CAT	2	6	2524377	2524382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856931
44020	NC_013422	AGCC	2	8	2524416	2524423	25 %	0 %	25 %	50 %	261856931
44021	NC_013422	CAC	2	6	2524501	2524506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856931
44022	NC_013422	CTG	2	6	2524530	2524535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856931
44023	NC_013422	ACA	2	6	2524583	2524588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261856931
44024	NC_013422	GTCA	2	8	2524982	2524989	25 %	25 %	25 %	25 %	261856932
44025	NC_013422	CTG	2	6	2525000	2525005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856932
44026	NC_013422	GAC	2	6	2525034	2525039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856932
44027	NC_013422	CAAG	2	8	2525064	2525071	50 %	0 %	25 %	25 %	261856932
44028	NC_013422	CGC	2	6	2525124	2525129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856932
44029	NC_013422	CAAC	2	8	2525145	2525152	50 %	0 %	0 %	50 %	261856932
44030	NC_013422	GCG	2	6	2525161	2525166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856932
44031	NC_013422	CG	4	8	2525259	2525266	0 %	0 %	50 %	50 %	261856932
44032	NC_013422	CTA	2	6	2525337	2525342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856932
44033	NC_013422	TCT	2	6	2525355	2525360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261856932
44034	NC_013422	TGG	2	6	2525499	2525504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261856932
44035	NC_013422	GAA	2	6	2525505	2525510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261856932
44036	NC_013422	GC	3	6	2525514	2525519	0 %	0 %	50 %	50 %	261856932
44037	NC_013422	ATC	2	6	2525542	2525547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856932
44038	NC_013422	ACG	2	6	2525576	2525581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856932
44039	NC_013422	ACA	2	6	2525661	2525666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261856932
44040	NC_013422	CG	4	8	2525676	2525683	0 %	0 %	50 %	50 %	261856932
44041	NC_013422	GCA	2	6	2525700	2525705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856932
44042	NC_013422	CGTG	2	8	2525738	2525745	0 %	25 %	50 %	25 %	261856932
44043	NC_013422	GCT	2	6	2525778	2525783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856932
44044	NC_013422	GAA	2	6	2525806	2525811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261856932
44045	NC_013422	TCA	2	6	2525817	2525822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856932
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44048	NC_013422	CGGCA	2	10	2525914	2525923	20 %	0 %	40 %	40 %	261856932
44049	NC_013422	GAT	2	6	2525933	2525938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856932
44050	NC_013422	GCA	2	6	2525993	2525998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856932
44051	NC_013422	TGCA	2	8	2526032	2526039	25 %	25 %	25 %	25 %	261856932
44052	NC_013422	CT	3	6	2526142	2526147	0 %	50 %	0 %	50 %	261856933
44053	NC_013422	CAG	2	6	2526197	2526202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856933
44054	NC_013422	CGA	2	6	2526242	2526247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856933
44055	NC_013422	TTC	2	6	2526294	2526299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261856933
44056	NC_013422	CGG	2	6	2526340	2526345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856933
44057	NC_013422	TCC	2	6	2526370	2526375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261856933
44058	NC_013422	ATG	2	6	2526480	2526485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856934
44059	NC_013422	AGTG	2	8	2526536	2526543	25 %	25 %	50 %	0 %	261856934
44060	NC_013422	GCA	2	6	2526580	2526585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856934
44061	NC_013422	GGCCG	2	10	2526590	2526599	0 %	0 %	60 %	40 %	261856934
44062	NC_013422	CCA	2	6	2526617	2526622	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856934
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44064	NC_013422	TCT	2	6	2526693	2526698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261856934
44065	NC_013422	TGA	2	6	2526742	2526747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856934
44066	NC_013422	GCT	2	6	2526847	2526852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856934
44067	NC_013422	ACGC	2	8	2526873	2526880	25 %	0 %	25 %	50 %	261856934
44068	NC_013422	CA	3	6	2526919	2526924	50 %	0 %	0 %	50 %	261856934
44069	NC_013422	ATC	2	6	2526975	2526980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856934
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44076	NC_013422	GC	3	6	2527271	2527276	0 %	0 %	50 %	50 %	261856935
44077	NC_013422	GCC	2	6	2527278	2527283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856935
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44087	NC_013422	CAC	2	6	2527763	2527768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856935
44088	NC_013422	GGTC	2	8	2527780	2527787	0 %	25 %	50 %	25 %	261856935
44089	NC_013422	GCC	2	6	2527793	2527798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856935
44090	NC_013422	CAT	2	6	2527799	2527804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856935
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44093	NC_013422	TGA	2	6	2527896	2527901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856935
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44099	NC_013422	GC	3	6	2528181	2528186	0 %	0 %	50 %	50 %	261856935
44100	NC_013422	TGG	3	9	2528227	2528235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261856935
44101	NC_013422	CCG	2	6	2528256	2528261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856935
44102	NC_013422	GC	4	8	2528277	2528284	0 %	0 %	50 %	50 %	261856935
44103	NC_013422	CCA	2	6	2528323	2528328	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856935
44104	NC_013422	TTC	2	6	2528378	2528383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261856935
44105	NC_013422	A	7	7	2528384	2528390	100 %	0 %	0 %	0 %	261856935
44106	NC_013422	GCG	2	6	2528400	2528405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856935
44107	NC_013422	GCATG	2	10	2528431	2528440	20 %	20 %	40 %	20 %	261856935
44108	NC_013422	CAG	2	6	2528473	2528478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856935
44109	NC_013422	TGCCAG	2	12	2528664	2528675	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	261856935
44110	NC_013422	GGC	2	6	2528702	2528707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856935
44111	NC_013422	GCC	2	6	2528711	2528716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856935
44112	NC_013422	CG	3	6	2528801	2528806	0 %	0 %	50 %	50 %	261856935
44113	NC_013422	CGC	3	9	2528815	2528823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856935
44114	NC_013422	GAT	2	6	2528828	2528833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856935
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44116	NC_013422	CCA	2	6	2528931	2528936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856936
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44230	NC_013422	CTGG	2	8	2534450	2534457	0 %	25 %	50 %	25 %	261856942
44231	NC_013422	TTTTA	2	10	2534459	2534468	20 %	80 %	0 %	0 %	261856942
44232	NC_013422	GC	3	6	2534502	2534507	0 %	0 %	50 %	50 %	261856942
44233	NC_013422	GTG	2	6	2534531	2534536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261856942
44234	NC_013422	GTC	2	6	2534563	2534568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856942
44235	NC_013422	GCTC	2	8	2534589	2534596	0 %	25 %	25 %	50 %	261856942
44236	NC_013422	ATC	2	6	2534606	2534611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856942
44237	NC_013422	TCCT	2	8	2534627	2534634	0 %	50 %	0 %	50 %	261856942
44238	NC_013422	CATC	2	8	2534661	2534668	25 %	25 %	0 %	50 %	261856942
44239	NC_013422	GGT	2	6	2534734	2534739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261856942
44240	NC_013422	TCA	2	6	2534751	2534756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856942
44241	NC_013422	CAT	2	6	2534769	2534774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856942
44242	NC_013422	CAA	2	6	2534826	2534831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261856942
44243	NC_013422	GCG	2	6	2534843	2534848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856942
44244	NC_013422	CTG	2	6	2534849	2534854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856942
44245	NC_013422	AGA	2	6	2534907	2534912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261856942
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44247	NC_013422	CACT	2	8	2535035	2535042	25 %	25 %	0 %	50 %	261856943
44248	NC_013422	TCA	2	6	2535200	2535205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856943
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44251	NC_013422	GGC	2	6	2535250	2535255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856943
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44255	NC_013422	TTG	2	6	2535350	2535355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261856943
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44258	NC_013422	CCGA	2	8	2535496	2535503	25 %	0 %	25 %	50 %	261856943
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44261	NC_013422	GCC	2	6	2535692	2535697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856943
44262	NC_013422	GATC	2	8	2535753	2535760	25 %	25 %	25 %	25 %	261856943
44263	NC_013422	CG	3	6	2535822	2535827	0 %	0 %	50 %	50 %	261856943
44264	NC_013422	CCG	2	6	2535867	2535872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856943
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44303	NC_013422	CATCTG	2	12	2538128	2538139	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	261856945
44304	NC_013422	TCG	2	6	2538157	2538162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856945
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44309	NC_013422	CACGG	2	10	2538317	2538326	20 %	0 %	40 %	40 %	261856945
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44313	NC_013422	CGCC	2	8	2538406	2538413	0 %	0 %	25 %	75 %	261856945
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44317	NC_013422	CCG	2	6	2538535	2538540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856945
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44322	NC_013422	TTC	2	6	2538878	2538883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261856945
44323	NC_013422	CGCGC	2	10	2538971	2538980	0 %	0 %	40 %	60 %	261856945
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44327	NC_013422	GACA	2	8	2539056	2539063	50 %	0 %	25 %	25 %	261856945
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44331	NC_013422	TTCAT	2	10	2539164	2539173	20 %	60 %	0 %	20 %	261856945
44332	NC_013422	TCG	2	6	2539298	2539303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856946
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44335	NC_013422	TCG	2	6	2539508	2539513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856946
44336	NC_013422	GCG	2	6	2539530	2539535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856946
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44340	NC_013422	ATCGC	2	10	2539667	2539676	20 %	20 %	20 %	40 %	261856946
44341	NC_013422	TCG	2	6	2539709	2539714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856946
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44346	NC_013422	CGC	2	6	2540097	2540102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856946
44347	NC_013422	CTT	2	6	2540115	2540120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261856946
44348	NC_013422	CGG	2	6	2540163	2540168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856946
44349	NC_013422	GCC	2	6	2540192	2540197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856946
44350	NC_013422	ATC	2	6	2540222	2540227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856946
44351	NC_013422	GGC	2	6	2540254	2540259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856946
44352	NC_013422	CGG	2	6	2540294	2540299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856946
44353	NC_013422	CTT	2	6	2540343	2540348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261856946
44354	NC_013422	CG	3	6	2540391	2540396	0 %	0 %	50 %	50 %	261856946
44355	NC_013422	TGC	2	6	2540453	2540458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856946
44356	NC_013422	GCG	2	6	2540489	2540494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856946
44357	NC_013422	CGG	4	12	2540535	2540546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856946
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44359	NC_013422	GTC	2	6	2540909	2540914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856947
44360	NC_013422	CCGC	2	8	2540921	2540928	0 %	0 %	25 %	75 %	261856947
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44364	NC_013422	CCCGG	2	10	2541058	2541067	0 %	0 %	40 %	60 %	261856947
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44384	NC_013422	GTGA	2	8	2542092	2542099	25 %	25 %	50 %	0 %	261856948
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44388	NC_013422	CAG	2	6	2542247	2542252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856948
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44393	NC_013422	GCC	2	6	2542515	2542520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856948
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44429	NC_013422	CA	3	6	2545026	2545031	50 %	0 %	0 %	50 %	261856951
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44432	NC_013422	CATC	2	8	2545152	2545159	25 %	25 %	0 %	50 %	261856952
44433	NC_013422	CAGA	2	8	2545195	2545202	50 %	0 %	25 %	25 %	261856952
44434	NC_013422	GAT	2	6	2545261	2545266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856952
44435	NC_013422	CGCA	2	8	2545282	2545289	25 %	0 %	25 %	50 %	261856952
44436	NC_013422	GCT	2	6	2545356	2545361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856952
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44439	NC_013422	CCA	2	6	2545494	2545499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856952
44440	NC_013422	AAT	2	6	2545513	2545518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261856952
44441	NC_013422	CACAG	2	10	2545537	2545546	40 %	0 %	20 %	40 %	261856952
44442	NC_013422	CGC	2	6	2545587	2545592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856952
44443	NC_013422	ACG	2	6	2545631	2545636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856952
44444	NC_013422	TA	3	6	2545648	2545653	50 %	50 %	0 %	0 %	261856952
44445	NC_013422	CAT	2	6	2545702	2545707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856952
44446	NC_013422	GCC	2	6	2545731	2545736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856952
44447	NC_013422	TCA	2	6	2545754	2545759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856952
44448	NC_013422	CAG	2	6	2545765	2545770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856952
44449	NC_013422	GAT	2	6	2545825	2545830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856952
44450	NC_013422	CAC	2	6	2545833	2545838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856952
44451	NC_013422	TCT	2	6	2545899	2545904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261856952
44452	NC_013422	GCT	2	6	2545977	2545982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856952
44453	NC_013422	CCGGCA	2	12	2545998	2546009	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	261856952
44454	NC_013422	GCAT	2	8	2546021	2546028	25 %	25 %	25 %	25 %	261856952
44455	NC_013422	GCC	2	6	2546038	2546043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856952
44456	NC_013422	TGA	3	9	2546091	2546099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856952
44457	NC_013422	AAT	2	6	2546130	2546135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261856952
44458	NC_013422	GTC	2	6	2546258	2546263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856952
44459	NC_013422	A	6	6	2546267	2546272	100 %	0 %	0 %	0 %	261856952
44460	NC_013422	TGT	2	6	2546274	2546279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261856952
44461	NC_013422	GCA	2	6	2546286	2546291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856952
44462	NC_013422	GCG	2	6	2546306	2546311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856952
44463	NC_013422	AC	3	6	2546348	2546353	50 %	0 %	0 %	50 %	261856952
44464	NC_013422	TGA	2	6	2546617	2546622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856953
44465	NC_013422	CT	3	6	2546741	2546746	0 %	50 %	0 %	50 %	261856953
44466	NC_013422	CAC	2	6	2546977	2546982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856953
44467	NC_013422	CAG	2	6	2547020	2547025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856953
44468	NC_013422	GGC	2	6	2547032	2547037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856953
44469	NC_013422	CTG	2	6	2547068	2547073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856953
44470	NC_013422	CCGGTA	2	12	2547120	2547131	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	261856953
44471	NC_013422	TGT	2	6	2547208	2547213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261856953
44472	NC_013422	GAA	3	9	2547245	2547253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261856953
44473	NC_013422	GTC	2	6	2547278	2547283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856953
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44475	NC_013422	ATTC	2	8	2547394	2547401	25 %	50 %	0 %	25 %	261856953
44476	NC_013422	GAC	2	6	2547424	2547429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856953
44477	NC_013422	CG	3	6	2547437	2547442	0 %	0 %	50 %	50 %	261856953
44478	NC_013422	CGG	2	6	2547458	2547463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856953
44479	NC_013422	GGTT	2	8	2547471	2547478	0 %	50 %	50 %	0 %	261856953
44480	NC_013422	GCA	2	6	2547571	2547576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856953
44481	NC_013422	GCCG	2	8	2547735	2547742	0 %	0 %	50 %	50 %	261856953
44482	NC_013422	GC	3	6	2547801	2547806	0 %	0 %	50 %	50 %	261856953
44483	NC_013422	CG	3	6	2547841	2547846	0 %	0 %	50 %	50 %	261856953
44484	NC_013422	GCCA	2	8	2547900	2547907	25 %	0 %	25 %	50 %	261856953
44485	NC_013422	GC	3	6	2547997	2548002	0 %	0 %	50 %	50 %	261856954
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44489	NC_013422	GGT	2	6	2548316	2548321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261856954
44490	NC_013422	CAA	2	6	2548407	2548412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261856954
44491	NC_013422	CGG	2	6	2548430	2548435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856954
44492	NC_013422	GGAT	2	8	2548485	2548492	25 %	25 %	50 %	0 %	261856954
44493	NC_013422	ATGGG	2	10	2548512	2548521	20 %	20 %	60 %	0 %	261856954
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44495	NC_013422	CCG	2	6	2548643	2548648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856954
44496	NC_013422	CCA	2	6	2549048	2549053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856955
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44499	NC_013422	CTG	2	6	2549183	2549188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856955
44500	NC_013422	GAA	2	6	2549210	2549215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261856955

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