MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halothiobacillus neapolitanus c2 chromosome

Total Repeats: 45067

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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43502	NC_013422	ATG	2	6	2491586	2491591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856893
43503	NC_013422	GTT	2	6	2491630	2491635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261856893
43504	NC_013422	GCG	2	6	2491636	2491641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856893
43505	NC_013422	ACCGC	2	10	2492144	2492153	20 %	0 %	20 %	60 %	261856894
43506	NC_013422	T	7	7	2492166	2492172	0 %	100 %	0 %	0 %	261856894
43507	NC_013422	GCC	2	6	2492206	2492211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856894
43508	NC_013422	CGGT	2	8	2492219	2492226	0 %	25 %	50 %	25 %	261856894
43509	NC_013422	AGA	2	6	2492285	2492290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261856894
43510	NC_013422	CAAC	2	8	2492335	2492342	50 %	0 %	0 %	50 %	261856894
43511	NC_013422	CA	3	6	2492487	2492492	50 %	0 %	0 %	50 %	261856894
43512	NC_013422	CTTATG	2	12	2492650	2492661	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	261856894
43513	NC_013422	CATT	2	8	2492814	2492821	25 %	50 %	0 %	25 %	261856894
43514	NC_013422	GCG	2	6	2492836	2492841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856894
43515	NC_013422	TA	3	6	2492912	2492917	50 %	50 %	0 %	0 %	261856894
43516	NC_013422	GAT	2	6	2492932	2492937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856894
43517	NC_013422	GGT	2	6	2492988	2492993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261856894
43518	NC_013422	CGGTA	2	10	2493010	2493019	20 %	20 %	40 %	20 %	261856894
43519	NC_013422	TCG	2	6	2493022	2493027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856894
43520	NC_013422	GGTT	2	8	2493032	2493039	0 %	50 %	50 %	0 %	261856894
43521	NC_013422	CTT	2	6	2493053	2493058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261856894
43522	NC_013422	CG	3	6	2493094	2493099	0 %	0 %	50 %	50 %	261856894
43523	NC_013422	CGA	2	6	2493106	2493111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856894
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43529	NC_013422	TATT	2	8	2493505	2493512	25 %	75 %	0 %	0 %	261856895
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43551	NC_013422	ACTA	2	8	2495021	2495028	50 %	25 %	0 %	25 %	261856896
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43602	NC_013422	AT	3	6	2498637	2498642	50 %	50 %	0 %	0 %	261856900
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43618	NC_013422	TTGGCA	2	12	2499423	2499434	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	261856901
43619	NC_013422	AGC	2	6	2499509	2499514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856901
43620	NC_013422	CTGCTT	2	12	2499557	2499568	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	261856901
43621	NC_013422	GCT	2	6	2499601	2499606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856901
43622	NC_013422	TCA	2	6	2499618	2499623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856901
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43724	NC_013422	GC	3	6	2505066	2505071	0 %	0 %	50 %	50 %	261856909
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43730	NC_013422	CCTGC	2	10	2505479	2505488	0 %	20 %	20 %	60 %	261856909
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43733	NC_013422	CGC	2	6	2505593	2505598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856909
43734	NC_013422	CGC	2	6	2505668	2505673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856910
43735	NC_013422	ACAG	2	8	2505687	2505694	50 %	0 %	25 %	25 %	261856910
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43737	NC_013422	TCA	2	6	2505747	2505752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856910
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43764	NC_013422	CGGGT	2	10	2507169	2507178	0 %	20 %	60 %	20 %	261856911
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43843	NC_013422	TC	3	6	2512132	2512137	0 %	50 %	0 %	50 %	261856916
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43847	NC_013422	GTT	2	6	2512328	2512333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261856916
43848	NC_013422	CAT	2	6	2512505	2512510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856916
43849	NC_013422	ATC	2	6	2512581	2512586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856916
43850	NC_013422	GAT	2	6	2512652	2512657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856916
43851	NC_013422	GAC	2	6	2512691	2512696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856916
43852	NC_013422	CG	3	6	2512753	2512758	0 %	0 %	50 %	50 %	261856916
43853	NC_013422	CTGG	2	8	2512769	2512776	0 %	25 %	50 %	25 %	261856916
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43856	NC_013422	GCCC	2	8	2512882	2512889	0 %	0 %	25 %	75 %	261856916
43857	NC_013422	GCC	2	6	2512905	2512910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856916
43858	NC_013422	CGA	2	6	2512933	2512938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856916
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43861	NC_013422	TGC	2	6	2513108	2513113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856916
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43872	NC_013422	GCC	2	6	2513796	2513801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856917
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43952	NC_013422	CAT	2	6	2520494	2520499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856926
43953	NC_013422	GC	3	6	2520519	2520524	0 %	0 %	50 %	50 %	261856926
43954	NC_013422	CGACA	2	10	2520572	2520581	40 %	0 %	20 %	40 %	261856926
43955	NC_013422	ATG	2	6	2520592	2520597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856926
43956	NC_013422	TCAA	2	8	2520601	2520608	50 %	25 %	0 %	25 %	261856926
43957	NC_013422	GACAAC	2	12	2520618	2520629	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	261856926
43958	NC_013422	CAA	2	6	2520662	2520667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261856926
43959	NC_013422	CGG	2	6	2520671	2520676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856926
43960	NC_013422	GCA	2	6	2520687	2520692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856926
43961	NC_013422	GTG	2	6	2520699	2520704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261856926
43962	NC_013422	CAA	2	6	2520716	2520721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261856926
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43964	NC_013422	GTG	2	6	2520813	2520818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261856926
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