MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halothiobacillus neapolitanus c2 chromosome

Total Repeats: 45067

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
43001	NC_013422	TGC	2	6	2463600	2463605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856865
43002	NC_013422	TCA	2	6	2463608	2463613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856865
43003	NC_013422	TTG	2	6	2463637	2463642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261856865
43004	NC_013422	CCA	2	6	2463676	2463681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856865
43005	NC_013422	CAG	2	6	2463687	2463692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856865
43006	NC_013422	GAA	2	6	2463698	2463703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261856865
43007	NC_013422	CCT	2	6	2463718	2463723	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261856865
43008	NC_013422	GCG	2	6	2463724	2463729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856865
43009	NC_013422	CCG	2	6	2463737	2463742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856865
43010	NC_013422	TGC	2	6	2463743	2463748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856865
43011	NC_013422	TCA	2	6	2464031	2464036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856865
43012	NC_013422	CCA	2	6	2464084	2464089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856865
43013	NC_013422	CAT	2	6	2464174	2464179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856866
43014	NC_013422	GTT	2	6	2464181	2464186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261856866
43015	NC_013422	ACTGC	2	10	2464352	2464361	20 %	20 %	20 %	40 %	261856866
43016	NC_013422	GCA	2	6	2464442	2464447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856866
43017	NC_013422	GCT	2	6	2464483	2464488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856866
43018	NC_013422	AGGTA	2	10	2464549	2464558	40 %	20 %	40 %	0 %	261856866
43019	NC_013422	CCG	2	6	2464631	2464636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856866
43020	NC_013422	TCG	2	6	2464708	2464713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856866
43021	NC_013422	GCC	2	6	2464900	2464905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856866
43022	NC_013422	GTG	2	6	2464975	2464980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261856866
43023	NC_013422	TA	3	6	2465010	2465015	50 %	50 %	0 %	0 %	261856866
43024	NC_013422	GCA	2	6	2465081	2465086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856866
43025	NC_013422	TCGA	2	8	2465116	2465123	25 %	25 %	25 %	25 %	261856866
43026	NC_013422	TCG	2	6	2465164	2465169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856866
43027	NC_013422	CGC	2	6	2465183	2465188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856866
43028	NC_013422	CA	3	6	2465190	2465195	50 %	0 %	0 %	50 %	261856866
43029	NC_013422	TCAC	2	8	2465203	2465210	25 %	25 %	0 %	50 %	261856866
43030	NC_013422	T	6	6	2465282	2465287	0 %	100 %	0 %	0 %	261856866
43031	NC_013422	TTG	2	6	2465318	2465323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261856866
43032	NC_013422	TCG	2	6	2465335	2465340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856866
43033	NC_013422	GAA	2	6	2465394	2465399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261856866
43034	NC_013422	T	6	6	2465550	2465555	0 %	100 %	0 %	0 %	261856867
43035	NC_013422	TTG	2	6	2465583	2465588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261856867
43036	NC_013422	A	6	6	2465608	2465613	100 %	0 %	0 %	0 %	261856867
43037	NC_013422	TGC	2	6	2465663	2465668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856867
43038	NC_013422	ATTGTC	2	12	2465671	2465682	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	261856867
43039	NC_013422	ATG	2	6	2465705	2465710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856867
43040	NC_013422	GGT	2	6	2465749	2465754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261856867
43041	NC_013422	CTT	2	6	2465779	2465784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261856867
43042	NC_013422	GGC	2	6	2465812	2465817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856867
43043	NC_013422	TC	3	6	2465852	2465857	0 %	50 %	0 %	50 %	261856867
43044	NC_013422	CTG	2	6	2465899	2465904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856867
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43050	NC_013422	AC	3	6	2466145	2466150	50 %	0 %	0 %	50 %	261856867
43051	NC_013422	GCT	2	6	2466175	2466180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856867
43052	NC_013422	TGG	2	6	2466189	2466194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261856867
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43054	NC_013422	T	6	6	2466270	2466275	0 %	100 %	0 %	0 %	261856867
43055	NC_013422	GCC	2	6	2466316	2466321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856868
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43060	NC_013422	TTG	2	6	2466461	2466466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261856868
43061	NC_013422	GCA	2	6	2466486	2466491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856868
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43065	NC_013422	GGC	2	6	2466739	2466744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856868
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43069	NC_013422	TGCG	2	8	2466963	2466970	0 %	25 %	50 %	25 %	261856868
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43100	NC_013422	CG	3	6	2468588	2468593	0 %	0 %	50 %	50 %	261856871
43101	NC_013422	CGG	2	6	2468604	2468609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856871
43102	NC_013422	T	7	7	2468635	2468641	0 %	100 %	0 %	0 %	261856871
43103	NC_013422	TGG	2	6	2468654	2468659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261856871
43104	NC_013422	CAT	2	6	2468747	2468752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856871
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43107	NC_013422	ATCATG	2	12	2468853	2468864	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	261856871
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43116	NC_013422	CAC	2	6	2469181	2469186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856872
43117	NC_013422	GAG	2	6	2469190	2469195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261856872
43118	NC_013422	GGT	2	6	2469214	2469219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261856872
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43124	NC_013422	TCG	2	6	2469631	2469636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856872
43125	NC_013422	GCC	2	6	2469638	2469643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856872
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43128	NC_013422	TTG	2	6	2469828	2469833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261856872
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43220	NC_013422	TGCG	2	8	2475795	2475802	0 %	25 %	50 %	25 %	261856875
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43232	NC_013422	CAC	2	6	2476672	2476677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856876
43233	NC_013422	AGCA	2	8	2476687	2476694	50 %	0 %	25 %	25 %	261856876
43234	NC_013422	GCA	2	6	2476698	2476703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856876
43235	NC_013422	ATC	2	6	2476723	2476728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856876
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43263	NC_013422	TCG	2	6	2478155	2478160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856877
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43339	NC_013422	CTC	2	6	2482362	2482367	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261856883
43340	NC_013422	CAC	2	6	2482424	2482429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856883
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43342	NC_013422	ACG	2	6	2482585	2482590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856883
43343	NC_013422	GTC	2	6	2482672	2482677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856883
43344	NC_013422	GC	3	6	2482833	2482838	0 %	0 %	50 %	50 %	261856883
43345	NC_013422	TCAGTT	2	12	2482865	2482876	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	261856883
43346	NC_013422	CCG	2	6	2482877	2482882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856883
43347	NC_013422	C	6	6	2482966	2482971	0 %	0 %	0 %	100 %	261856883
43348	NC_013422	T	7	7	2482987	2482993	0 %	100 %	0 %	0 %	261856883
43349	NC_013422	ACG	2	6	2483193	2483198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856883
43350	NC_013422	GTG	2	6	2483204	2483209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261856883
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43352	NC_013422	TCA	2	6	2483338	2483343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856883
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43355	NC_013422	CG	3	6	2483478	2483483	0 %	0 %	50 %	50 %	261856883
43356	NC_013422	CATGC	2	10	2483499	2483508	20 %	20 %	20 %	40 %	261856883
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43450	NC_013422	T	6	6	2488484	2488489	0 %	100 %	0 %	0 %	261856890
43451	NC_013422	TTA	2	6	2488500	2488505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261856890
43452	NC_013422	AT	3	6	2488541	2488546	50 %	50 %	0 %	0 %	261856890
43453	NC_013422	TCA	2	6	2488597	2488602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856890
43454	NC_013422	TCT	2	6	2488638	2488643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261856890
43455	NC_013422	AAT	2	6	2488652	2488657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261856890
43456	NC_013422	GGT	2	6	2488663	2488668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261856890
43457	NC_013422	GCT	2	6	2488702	2488707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856890
43458	NC_013422	AGCA	2	8	2488846	2488853	50 %	0 %	25 %	25 %	261856890
43459	NC_013422	GCA	2	6	2488897	2488902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856890
43460	NC_013422	T	6	6	2488915	2488920	0 %	100 %	0 %	0 %	261856890
43461	NC_013422	GACT	2	8	2488976	2488983	25 %	25 %	25 %	25 %	261856890
43462	NC_013422	A	7	7	2488989	2488995	100 %	0 %	0 %	0 %	261856890
43463	NC_013422	CTT	2	6	2489010	2489015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261856890
43464	NC_013422	TGT	2	6	2489084	2489089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261856891
43465	NC_013422	AG	3	6	2489137	2489142	50 %	0 %	50 %	0 %	261856891
43466	NC_013422	TTA	2	6	2489197	2489202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261856891
43467	NC_013422	ATG	2	6	2489208	2489213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856891
43468	NC_013422	GATC	2	8	2489332	2489339	25 %	25 %	25 %	25 %	261856891
43469	NC_013422	CGC	2	6	2489445	2489450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856891
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43472	NC_013422	TC	3	6	2489733	2489738	0 %	50 %	0 %	50 %	261856892
43473	NC_013422	GCGA	2	8	2489772	2489779	25 %	0 %	50 %	25 %	261856892
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43475	NC_013422	GCT	2	6	2489878	2489883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856892
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43477	NC_013422	CGCC	2	8	2490261	2490268	0 %	0 %	25 %	75 %	261856892
43478	NC_013422	CAC	2	6	2490270	2490275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856892
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43483	NC_013422	ATT	2	6	2490649	2490654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261856892
43484	NC_013422	CG	3	6	2490659	2490664	0 %	0 %	50 %	50 %	261856892
43485	NC_013422	CGA	2	6	2490668	2490673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856892
43486	NC_013422	TTG	2	6	2490844	2490849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261856892
43487	NC_013422	CGA	2	6	2490873	2490878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856892
43488	NC_013422	AT	3	6	2490882	2490887	50 %	50 %	0 %	0 %	261856892
43489	NC_013422	GAT	2	6	2490924	2490929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856892
43490	NC_013422	GC	5	10	2491035	2491044	0 %	0 %	50 %	50 %	261856892
43491	NC_013422	TGT	2	6	2491046	2491051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261856892
43492	NC_013422	GCG	2	6	2491070	2491075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856892
43493	NC_013422	T	7	7	2491098	2491104	0 %	100 %	0 %	0 %	261856892
43494	NC_013422	ACC	2	6	2491145	2491150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856892
43495	NC_013422	T	7	7	2491215	2491221	0 %	100 %	0 %	0 %	261856892
43496	NC_013422	CGAG	2	8	2491429	2491436	25 %	0 %	50 %	25 %	261856893
43497	NC_013422	CAG	2	6	2491443	2491448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856893
43498	NC_013422	CTGAC	2	10	2491483	2491492	20 %	20 %	20 %	40 %	261856893
43499	NC_013422	CTC	2	6	2491495	2491500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261856893
43500	NC_013422	ACC	2	6	2491507	2491512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856893

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