MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halothiobacillus neapolitanus c2 chromosome

Total Repeats: 45067

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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42502	NC_013422	GAA	2	6	2434770	2434775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261856844
42503	NC_013422	GC	3	6	2434848	2434853	0 %	0 %	50 %	50 %	261856844
42504	NC_013422	GGC	2	6	2434950	2434955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856844
42505	NC_013422	CCGA	2	8	2434977	2434984	25 %	0 %	25 %	50 %	261856844
42506	NC_013422	TCT	2	6	2434991	2434996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261856844
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42508	NC_013422	GATC	2	8	2435197	2435204	25 %	25 %	25 %	25 %	261856844
42509	NC_013422	CGAT	2	8	2435240	2435247	25 %	25 %	25 %	25 %	261856845
42510	NC_013422	CGC	2	6	2435294	2435299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856845
42511	NC_013422	GGC	2	6	2435305	2435310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856845
42512	NC_013422	CGGG	2	8	2435344	2435351	0 %	0 %	75 %	25 %	261856845
42513	NC_013422	GCT	2	6	2435420	2435425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856845
42514	NC_013422	CCT	2	6	2435530	2435535	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261856845
42515	NC_013422	TTG	2	6	2435565	2435570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261856845
42516	NC_013422	TGG	2	6	2435611	2435616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261856845
42517	NC_013422	GCC	2	6	2435655	2435660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856845
42518	NC_013422	CTG	2	6	2435667	2435672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856845
42519	NC_013422	TTGG	2	8	2435738	2435745	0 %	50 %	50 %	0 %	261856845
42520	NC_013422	CTG	2	6	2435844	2435849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856845
42521	NC_013422	CGGG	2	8	2435852	2435859	0 %	0 %	75 %	25 %	261856845
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42532	NC_013422	CG	3	6	2436565	2436570	0 %	0 %	50 %	50 %	261856845
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42554	NC_013422	GC	3	6	2437921	2437926	0 %	0 %	50 %	50 %	261856847
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42618	NC_013422	TCTT	2	8	2441567	2441574	0 %	75 %	0 %	25 %	261856850
42619	NC_013422	CCG	2	6	2441640	2441645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856850
42620	NC_013422	AGC	2	6	2441671	2441676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856850
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42657	NC_013422	CTG	2	6	2444010	2444015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856852
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42689	NC_013422	GAGC	2	8	2445276	2445283	25 %	0 %	50 %	25 %	261856854
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42711	NC_013422	CGG	2	6	2446129	2446134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856854
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42714	NC_013422	A	6	6	2446269	2446274	100 %	0 %	0 %	0 %	261856855
42715	NC_013422	ACCTGT	2	12	2446279	2446290	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	261856855
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42720	NC_013422	CAA	2	6	2446674	2446679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261856856
42721	NC_013422	ATCC	2	8	2446727	2446734	25 %	25 %	0 %	50 %	261856856
42722	NC_013422	GCC	2	6	2446810	2446815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856856
42723	NC_013422	CAAA	2	8	2446827	2446834	75 %	0 %	0 %	25 %	261856856
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42725	NC_013422	TGC	2	6	2446916	2446921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856856
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42727	NC_013422	GTT	2	6	2447181	2447186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261856857
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42729	NC_013422	CGG	2	6	2447275	2447280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856857
42730	NC_013422	TTG	2	6	2447281	2447286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261856857
42731	NC_013422	ACC	2	6	2447295	2447300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856857
42732	NC_013422	TGC	2	6	2447368	2447373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856857
42733	NC_013422	TGG	2	6	2447428	2447433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261856857
42734	NC_013422	ATTG	2	8	2447459	2447466	25 %	50 %	25 %	0 %	261856857
42735	NC_013422	GCG	2	6	2447473	2447478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856857
42736	NC_013422	GCC	3	9	2447505	2447513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856857
42737	NC_013422	GCG	2	6	2447524	2447529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856857
42738	NC_013422	TTCA	2	8	2447535	2447542	25 %	50 %	0 %	25 %	261856857
42739	NC_013422	CGA	2	6	2447548	2447553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856857
42740	NC_013422	TGG	2	6	2447582	2447587	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261856857
42741	NC_013422	ATC	2	6	2447718	2447723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856857
42742	NC_013422	GC	3	6	2447786	2447791	0 %	0 %	50 %	50 %	261856857
42743	NC_013422	CGA	2	6	2447795	2447800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856857
42744	NC_013422	G	7	7	2447873	2447879	0 %	0 %	100 %	0 %	261856857
42745	NC_013422	CG	3	6	2447883	2447888	0 %	0 %	50 %	50 %	261856857
42746	NC_013422	GCT	2	6	2448024	2448029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856857
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42750	NC_013422	GAA	2	6	2448210	2448215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261856857
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42753	NC_013422	CTG	2	6	2448413	2448418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856858
42754	NC_013422	GAC	2	6	2448419	2448424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856858
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42763	NC_013422	GTGG	2	8	2448637	2448644	0 %	25 %	75 %	0 %	261856858
42764	NC_013422	GACC	2	8	2448724	2448731	25 %	0 %	25 %	50 %	261856858
42765	NC_013422	CTG	2	6	2448788	2448793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856858
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42772	NC_013422	TGC	2	6	2448949	2448954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856858
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42841	NC_013422	GCT	2	6	2452538	2452543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856860
42842	NC_013422	TGCA	2	8	2452593	2452600	25 %	25 %	25 %	25 %	261856860
42843	NC_013422	ATT	2	6	2452632	2452637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261856860
42844	NC_013422	CA	3	6	2452643	2452648	50 %	0 %	0 %	50 %	261856860
42845	NC_013422	ACCGA	2	10	2452651	2452660	40 %	0 %	20 %	40 %	261856860
42846	NC_013422	CGG	2	6	2452812	2452817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856860
42847	NC_013422	GGT	2	6	2452920	2452925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261856860
42848	NC_013422	GAT	2	6	2452928	2452933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856860
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42850	NC_013422	GGC	2	6	2453119	2453124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856860
42851	NC_013422	ACACC	2	10	2453132	2453141	40 %	0 %	0 %	60 %	261856860
42852	NC_013422	TCG	2	6	2453171	2453176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856860
42853	NC_013422	GCGTC	2	10	2453194	2453203	0 %	20 %	40 %	40 %	261856860
42854	NC_013422	CCG	2	6	2453244	2453249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856860
42855	NC_013422	CGT	2	6	2453266	2453271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856860
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42858	NC_013422	GTA	2	6	2453355	2453360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856860
42859	NC_013422	GTA	2	6	2453391	2453396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856860
42860	NC_013422	TCA	2	6	2453423	2453428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856860
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42862	NC_013422	CTGG	2	8	2453499	2453506	0 %	25 %	50 %	25 %	261856860
42863	NC_013422	GATC	2	8	2453513	2453520	25 %	25 %	25 %	25 %	261856860
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42869	NC_013422	TTC	2	6	2453701	2453706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261856860
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42877	NC_013422	CGG	2	6	2454623	2454628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856862
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42881	NC_013422	AGGC	2	8	2454703	2454710	25 %	0 %	50 %	25 %	261856862
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42954	NC_013422	C	7	7	2458424	2458430	0 %	0 %	0 %	100 %	261856862
42955	NC_013422	GCA	2	6	2458435	2458440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856862
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42961	NC_013422	GAAAA	2	10	2460557	2460566	80 %	0 %	20 %	0 %	261856863
42962	NC_013422	CGC	2	6	2460638	2460643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856863
42963	NC_013422	CAT	2	6	2460653	2460658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856863
42964	NC_013422	GA	3	6	2460799	2460804	50 %	0 %	50 %	0 %	261856863
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42966	NC_013422	CTTG	2	8	2460887	2460894	0 %	50 %	25 %	25 %	261856863
42967	NC_013422	CGGT	2	8	2460910	2460917	0 %	25 %	50 %	25 %	261856863
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42992	NC_013422	CGC	2	6	2463299	2463304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856865
42993	NC_013422	AGCA	2	8	2463309	2463316	50 %	0 %	25 %	25 %	261856865
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