MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halothiobacillus neapolitanus c2 chromosome

Total Repeats: 45067

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
41501	NC_013422	GTC	2	6	2379782	2379787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856790
41502	NC_013422	AG	3	6	2379833	2379838	50 %	0 %	50 %	0 %	261856791
41503	NC_013422	CGA	2	6	2379893	2379898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856791
41504	NC_013422	CGT	2	6	2379932	2379937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856791
41505	NC_013422	CG	3	6	2379981	2379986	0 %	0 %	50 %	50 %	261856791
41506	NC_013422	AGC	2	6	2380006	2380011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856791
41507	NC_013422	TTG	2	6	2380048	2380053	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261856791
41508	NC_013422	CG	3	6	2380085	2380090	0 %	0 %	50 %	50 %	261856791
41509	NC_013422	CTC	2	6	2380101	2380106	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261856791
41510	NC_013422	ATC	2	6	2380125	2380130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856791
41511	NC_013422	ACCAG	2	10	2380195	2380204	40 %	0 %	20 %	40 %	261856791
41512	NC_013422	GTT	2	6	2380358	2380363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261856791
41513	NC_013422	AGG	2	6	2380382	2380387	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261856791
41514	NC_013422	CG	3	6	2380409	2380414	0 %	0 %	50 %	50 %	261856791
41515	NC_013422	CCA	2	6	2380423	2380428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856791
41516	NC_013422	TCT	2	6	2380507	2380512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261856791
41517	NC_013422	AG	3	6	2380524	2380529	50 %	0 %	50 %	0 %	261856791
41518	NC_013422	ACC	2	6	2380581	2380586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856791
41519	NC_013422	CAC	2	6	2380595	2380600	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856791
41520	NC_013422	GCC	2	6	2380663	2380668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856791
41521	NC_013422	TAA	2	6	2380834	2380839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261856791
41522	NC_013422	AGC	2	6	2380906	2380911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856791
41523	NC_013422	GTT	2	6	2380938	2380943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261856791
41524	NC_013422	ATCAG	2	10	2381022	2381031	40 %	20 %	20 %	20 %	261856792
41525	NC_013422	TTC	2	6	2381084	2381089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261856792
41526	NC_013422	ACTC	2	8	2381118	2381125	25 %	25 %	0 %	50 %	261856792
41527	NC_013422	GTC	3	9	2381185	2381193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856792
41528	NC_013422	TGGGT	2	10	2381341	2381350	0 %	40 %	60 %	0 %	261856792
41529	NC_013422	GCG	2	6	2381373	2381378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856792
41530	NC_013422	GAT	2	6	2381612	2381617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856793
41531	NC_013422	CT	3	6	2381691	2381696	0 %	50 %	0 %	50 %	261856793
41532	NC_013422	GCAC	2	8	2381719	2381726	25 %	0 %	25 %	50 %	261856793
41533	NC_013422	TCA	2	6	2381758	2381763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856794
41534	NC_013422	GCC	2	6	2381802	2381807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856794
41535	NC_013422	TGA	2	6	2381912	2381917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856794
41536	NC_013422	GGT	2	6	2381921	2381926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261856794
41537	NC_013422	ACGCTG	2	12	2382186	2382197	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	261856794
41538	NC_013422	GGA	2	6	2382203	2382208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261856794
41539	NC_013422	GCC	2	6	2382211	2382216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856794
41540	NC_013422	GCG	2	6	2382233	2382238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856794
41541	NC_013422	CGC	2	6	2382372	2382377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856794
41542	NC_013422	CTT	2	6	2382392	2382397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261856794
41543	NC_013422	CAC	2	6	2382417	2382422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856794
41544	NC_013422	CAT	2	6	2382485	2382490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856794
41545	NC_013422	CTG	2	6	2382504	2382509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856794
41546	NC_013422	TGG	2	6	2382520	2382525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261856794
41547	NC_013422	GCC	2	6	2382696	2382701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856794
41548	NC_013422	GCAA	2	8	2382748	2382755	50 %	0 %	25 %	25 %	261856794
41549	NC_013422	AATGC	2	10	2382773	2382782	40 %	20 %	20 %	20 %	261856794
41550	NC_013422	TTG	2	6	2382805	2382810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261856794
41551	NC_013422	CTA	2	6	2382854	2382859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856794
41552	NC_013422	CAG	2	6	2382864	2382869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856794
41553	NC_013422	GCT	2	6	2382940	2382945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856794
41554	NC_013422	ATG	2	6	2382964	2382969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856794
41555	NC_013422	GCC	2	6	2383038	2383043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856794
41556	NC_013422	A	6	6	2383054	2383059	100 %	0 %	0 %	0 %	261856794
41557	NC_013422	ATG	2	6	2383653	2383658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856795
41558	NC_013422	AAG	2	6	2383663	2383668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261856795
41559	NC_013422	CT	3	6	2383702	2383707	0 %	50 %	0 %	50 %	261856795
41560	NC_013422	GCA	2	6	2383728	2383733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856795
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41562	NC_013422	CTGC	2	8	2383830	2383837	0 %	25 %	25 %	50 %	261856795
41563	NC_013422	CCGA	2	8	2383893	2383900	25 %	0 %	25 %	50 %	261856795
41564	NC_013422	CAT	2	6	2383985	2383990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856795
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41566	NC_013422	CGG	2	6	2384035	2384040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856795
41567	NC_013422	CGT	3	9	2384048	2384056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856795
41568	NC_013422	GCTT	2	8	2384337	2384344	0 %	50 %	25 %	25 %	261856796
41569	NC_013422	GAAT	2	8	2384427	2384434	50 %	25 %	25 %	0 %	261856796
41570	NC_013422	GCCA	2	8	2384447	2384454	25 %	0 %	25 %	50 %	261856796
41571	NC_013422	ACGG	2	8	2384475	2384482	25 %	0 %	50 %	25 %	261856796
41572	NC_013422	GT	3	6	2384502	2384507	0 %	50 %	50 %	0 %	261856796
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41575	NC_013422	CGGGC	2	10	2384548	2384557	0 %	0 %	60 %	40 %	261856796
41576	NC_013422	CATT	2	8	2384561	2384568	25 %	50 %	0 %	25 %	261856796
41577	NC_013422	TGGGCA	2	12	2384621	2384632	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	261856796
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41583	NC_013422	TCG	2	6	2384903	2384908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856796
41584	NC_013422	GC	3	6	2384980	2384985	0 %	0 %	50 %	50 %	261856796
41585	NC_013422	TGCGC	2	10	2385068	2385077	0 %	20 %	40 %	40 %	261856797
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41587	NC_013422	AC	3	6	2385113	2385118	50 %	0 %	0 %	50 %	261856797
41588	NC_013422	GTG	2	6	2385142	2385147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261856797
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41596	NC_013422	GC	3	6	2385620	2385625	0 %	0 %	50 %	50 %	261856797
41597	NC_013422	TTG	2	6	2385639	2385644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261856797
41598	NC_013422	GC	3	6	2385712	2385717	0 %	0 %	50 %	50 %	261856797
41599	NC_013422	GCG	2	6	2385729	2385734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856797
41600	NC_013422	CGG	2	6	2385771	2385776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856797
41601	NC_013422	CGG	2	6	2385800	2385805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856797
41602	NC_013422	TGA	2	6	2385842	2385847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856797
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41604	NC_013422	TCGA	2	8	2385946	2385953	25 %	25 %	25 %	25 %	261856797
41605	NC_013422	AGA	2	6	2385973	2385978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261856797
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41607	NC_013422	GCCGA	2	10	2386081	2386090	20 %	0 %	40 %	40 %	261856797
41608	NC_013422	TCG	2	6	2386105	2386110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856797
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41611	NC_013422	CGG	2	6	2386213	2386218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856797
41612	NC_013422	CATC	2	8	2386238	2386245	25 %	25 %	0 %	50 %	261856797
41613	NC_013422	AGCC	2	8	2386258	2386265	25 %	0 %	25 %	50 %	261856797
41614	NC_013422	CG	4	8	2386272	2386279	0 %	0 %	50 %	50 %	261856797
41615	NC_013422	GCA	2	6	2386280	2386285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856797
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41617	NC_013422	CGAT	2	8	2386321	2386328	25 %	25 %	25 %	25 %	261856797
41618	NC_013422	CGA	2	6	2386384	2386389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856797
41619	NC_013422	GGC	2	6	2386413	2386418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856797
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41622	NC_013422	GATC	2	8	2386535	2386542	25 %	25 %	25 %	25 %	261856797
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41625	NC_013422	GCC	2	6	2386609	2386614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856797
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41734	NC_013422	CGG	2	6	2392923	2392928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856801
41735	NC_013422	TGC	2	6	2392939	2392944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856801
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41745	NC_013422	CAAA	2	8	2393494	2393501	75 %	0 %	0 %	25 %	261856801
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41964	NC_013422	ACGC	2	8	2404219	2404226	25 %	0 %	25 %	50 %	261856811
41965	NC_013422	GGCA	2	8	2404345	2404352	25 %	0 %	50 %	25 %	261856811
41966	NC_013422	TCAAT	2	10	2404411	2404420	40 %	40 %	0 %	20 %	261856811
41967	NC_013422	GCT	2	6	2404474	2404479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856811
41968	NC_013422	GCA	2	6	2404564	2404569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856811
41969	NC_013422	CG	3	6	2404604	2404609	0 %	0 %	50 %	50 %	261856811
41970	NC_013422	TGC	2	6	2404623	2404628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856811
41971	NC_013422	A	6	6	2404741	2404746	100 %	0 %	0 %	0 %	261856811
41972	NC_013422	TCGA	2	8	2404777	2404784	25 %	25 %	25 %	25 %	261856811
41973	NC_013422	GCG	2	6	2404788	2404793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856811
41974	NC_013422	GCG	2	6	2404809	2404814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856811
41975	NC_013422	CGGCCG	2	12	2405127	2405138	0 %	0 %	50 %	50 %	261856812
41976	NC_013422	CGAAT	2	10	2405180	2405189	40 %	20 %	20 %	20 %	261856812
41977	NC_013422	GGC	2	6	2405207	2405212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856812
41978	NC_013422	CGG	2	6	2405220	2405225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856812
41979	NC_013422	CGT	2	6	2405301	2405306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856812
41980	NC_013422	AGC	2	6	2405344	2405349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856812
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41982	NC_013422	CG	3	6	2405409	2405414	0 %	0 %	50 %	50 %	261856812
41983	NC_013422	TGC	2	6	2405427	2405432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856812
41984	NC_013422	GGC	2	6	2405477	2405482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856812
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41988	NC_013422	GCG	2	6	2405825	2405830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856812
41989	NC_013422	GGC	2	6	2405831	2405836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856812
41990	NC_013422	GGC	2	6	2405871	2405876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856812
41991	NC_013422	CTG	2	6	2405903	2405908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856812
41992	NC_013422	GC	3	6	2405958	2405963	0 %	0 %	50 %	50 %	261856812
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41994	NC_013422	TCG	2	6	2406007	2406012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856812
41995	NC_013422	GCAG	2	8	2406047	2406054	25 %	0 %	50 %	25 %	261856812
41996	NC_013422	CGC	2	6	2406136	2406141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856812
41997	NC_013422	CG	3	6	2406149	2406154	0 %	0 %	50 %	50 %	261856812
41998	NC_013422	CAT	2	6	2406207	2406212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856812
41999	NC_013422	CAG	3	9	2406310	2406318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856813
42000	NC_013422	AC	3	6	2406345	2406350	50 %	0 %	0 %	50 %	261856813

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