MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halothiobacillus neapolitanus c2 chromosome

Total Repeats: 45067

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
40001	NC_013422	CAAC	2	8	2297270	2297277	50 %	0 %	0 %	50 %	261856719
40002	NC_013422	TCA	2	6	2297330	2297335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856719
40003	NC_013422	TGA	2	6	2297438	2297443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856719
40004	NC_013422	TGC	2	6	2297449	2297454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856719
40005	NC_013422	CAG	2	6	2297490	2297495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856719
40006	NC_013422	C	6	6	2297515	2297520	0 %	0 %	0 %	100 %	261856719
40007	NC_013422	TGA	2	6	2297599	2297604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856719
40008	NC_013422	GAC	2	6	2297657	2297662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856719
40009	NC_013422	TCAA	2	8	2297671	2297678	50 %	25 %	0 %	25 %	261856719
40010	NC_013422	GCC	2	6	2297683	2297688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856719
40011	NC_013422	CGGG	2	8	2297808	2297815	0 %	0 %	75 %	25 %	261856719
40012	NC_013422	ATC	2	6	2297842	2297847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856719
40013	NC_013422	TGA	2	6	2297878	2297883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856719
40014	NC_013422	CAA	2	6	2298018	2298023	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261856719
40015	NC_013422	GTC	2	6	2298061	2298066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856719
40016	NC_013422	ACT	2	6	2298191	2298196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856720
40017	NC_013422	A	8	8	2298199	2298206	100 %	0 %	0 %	0 %	261856720
40018	NC_013422	CGAC	2	8	2298291	2298298	25 %	0 %	25 %	50 %	261856720
40019	NC_013422	CGC	2	6	2298351	2298356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856720
40020	NC_013422	ACAA	2	8	2298383	2298390	75 %	0 %	0 %	25 %	261856720
40021	NC_013422	CCA	2	6	2298485	2298490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856720
40022	NC_013422	ACC	2	6	2298521	2298526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856720
40023	NC_013422	CGA	2	6	2298555	2298560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856720
40024	NC_013422	CAA	2	6	2298718	2298723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261856720
40025	NC_013422	CCG	2	6	2298736	2298741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856720
40026	NC_013422	AATCG	2	10	2298844	2298853	40 %	20 %	20 %	20 %	261856720
40027	NC_013422	TGT	2	6	2298997	2299002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261856720
40028	NC_013422	CAA	2	6	2299018	2299023	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261856720
40029	NC_013422	GC	3	6	2299103	2299108	0 %	0 %	50 %	50 %	261856720
40030	NC_013422	CGC	2	6	2299243	2299248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856720
40031	NC_013422	GCA	2	6	2299279	2299284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856720
40032	NC_013422	TCA	2	6	2299299	2299304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856720
40033	NC_013422	ATG	2	6	2299314	2299319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856720
40034	NC_013422	CAA	2	6	2299357	2299362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261856720
40035	NC_013422	GCA	2	6	2299377	2299382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856720
40036	NC_013422	GCA	2	6	2299595	2299600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856720
40037	NC_013422	CGG	2	6	2299629	2299634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856720
40038	NC_013422	CG	4	8	2299668	2299675	0 %	0 %	50 %	50 %	261856721
40039	NC_013422	ATGG	2	8	2299717	2299724	25 %	25 %	50 %	0 %	261856721
40040	NC_013422	GC	3	6	2299762	2299767	0 %	0 %	50 %	50 %	261856721
40041	NC_013422	GA	3	6	2299808	2299813	50 %	0 %	50 %	0 %	261856721
40042	NC_013422	CTG	2	6	2299819	2299824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856721
40043	NC_013422	CGAT	2	8	2299856	2299863	25 %	25 %	25 %	25 %	261856721
40044	NC_013422	CAT	2	6	2300000	2300005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856721
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40047	NC_013422	CCCG	2	8	2300127	2300134	0 %	0 %	25 %	75 %	261856721
40048	NC_013422	AGA	2	6	2300160	2300165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261856721
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40050	NC_013422	GGC	2	6	2300197	2300202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856721
40051	NC_013422	GATG	2	8	2300274	2300281	25 %	25 %	50 %	0 %	261856721
40052	NC_013422	CGA	2	6	2300313	2300318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856721
40053	NC_013422	CTG	2	6	2300371	2300376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856721
40054	NC_013422	CAA	2	6	2300392	2300397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261856721
40055	NC_013422	TTGG	2	8	2300463	2300470	0 %	50 %	50 %	0 %	261856721
40056	NC_013422	TGC	2	6	2300553	2300558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856721
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40058	NC_013422	CTGG	2	8	2300721	2300728	0 %	25 %	50 %	25 %	261856721
40059	NC_013422	TGGG	2	8	2300798	2300805	0 %	25 %	75 %	0 %	261856721
40060	NC_013422	CGA	2	6	2300846	2300851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856722
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40062	NC_013422	CAG	2	6	2301014	2301019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856722
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40066	NC_013422	CCAG	2	8	2301244	2301251	25 %	0 %	25 %	50 %	261856722
40067	NC_013422	GCC	2	6	2301311	2301316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856722
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40071	NC_013422	CAGG	2	8	2301440	2301447	25 %	0 %	50 %	25 %	261856722
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40105	NC_013422	AAG	2	6	2303247	2303252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261856724
40106	NC_013422	CTG	2	6	2303262	2303267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856724
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40114	NC_013422	ATTT	2	8	2303778	2303785	25 %	75 %	0 %	0 %	261856725
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40116	NC_013422	AAT	2	6	2303861	2303866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261856725
40117	NC_013422	GCC	2	6	2303898	2303903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856725
40118	NC_013422	ATC	2	6	2303928	2303933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856725
40119	NC_013422	TGG	2	6	2304010	2304015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261856725
40120	NC_013422	TTGG	2	8	2304117	2304124	0 %	50 %	50 %	0 %	261856725
40121	NC_013422	CGC	2	6	2304146	2304151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856725
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40123	NC_013422	GCC	2	6	2304171	2304176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856725
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40126	NC_013422	CAT	2	6	2304233	2304238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856725
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40132	NC_013422	TGC	2	6	2304559	2304564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856725
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40220	NC_013422	AGC	3	9	2308739	2308747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856728
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40224	NC_013422	CG	3	6	2308970	2308975	0 %	0 %	50 %	50 %	261856728
40225	NC_013422	CTG	2	6	2309044	2309049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856728
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40227	NC_013422	GC	3	6	2309178	2309183	0 %	0 %	50 %	50 %	261856728
40228	NC_013422	CCG	2	6	2309195	2309200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856728
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40230	NC_013422	ATC	2	6	2309286	2309291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856728
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40233	NC_013422	ATC	2	6	2309588	2309593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856729
40234	NC_013422	GGCAC	2	10	2309734	2309743	20 %	0 %	40 %	40 %	261856729
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40333	NC_013422	T	6	6	2315660	2315665	0 %	100 %	0 %	0 %	261856734
40334	NC_013422	GAA	2	6	2315703	2315708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261856734
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40337	NC_013422	AACG	2	8	2315811	2315818	50 %	0 %	25 %	25 %	261856735
40338	NC_013422	GGT	2	6	2315895	2315900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261856735
40339	NC_013422	GAC	2	6	2315947	2315952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856735
40340	NC_013422	CG	3	6	2315955	2315960	0 %	0 %	50 %	50 %	261856735
40341	NC_013422	CCG	2	6	2315967	2315972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856735
40342	NC_013422	AAC	2	6	2315993	2315998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261856735
40343	NC_013422	TTC	2	6	2316133	2316138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261856735
40344	NC_013422	CGC	2	6	2316224	2316229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856735
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40347	NC_013422	A	7	7	2316320	2316326	100 %	0 %	0 %	0 %	261856735
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40465	NC_013422	CA	4	8	2322505	2322512	50 %	0 %	0 %	50 %	261856743
40466	NC_013422	ATT	2	6	2322551	2322556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261856744
40467	NC_013422	GCTG	2	8	2322562	2322569	0 %	25 %	50 %	25 %	261856744
40468	NC_013422	GCT	2	6	2322619	2322624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856744
40469	NC_013422	ATC	2	6	2322668	2322673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856744
40470	NC_013422	ATC	2	6	2322695	2322700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856744
40471	NC_013422	CCG	2	6	2322714	2322719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856744
40472	NC_013422	CGA	2	6	2322746	2322751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856744
40473	NC_013422	ACA	2	6	2322766	2322771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261856744
40474	NC_013422	GCC	2	6	2322773	2322778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856744
40475	NC_013422	GCAC	2	8	2322845	2322852	25 %	0 %	25 %	50 %	261856744
40476	NC_013422	CCG	2	6	2322875	2322880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856744
40477	NC_013422	CTG	2	6	2322944	2322949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856744
40478	NC_013422	CTT	2	6	2322963	2322968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261856744
40479	NC_013422	GCT	2	6	2323048	2323053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856744
40480	NC_013422	GGC	2	6	2323063	2323068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856744
40481	NC_013422	AGC	2	6	2323123	2323128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856744
40482	NC_013422	GCG	2	6	2323165	2323170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856744
40483	NC_013422	CGG	2	6	2323228	2323233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856744
40484	NC_013422	AGG	2	6	2323242	2323247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261856744
40485	NC_013422	GC	3	6	2323250	2323255	0 %	0 %	50 %	50 %	261856744
40486	NC_013422	CCG	2	6	2323266	2323271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856744
40487	NC_013422	GGC	2	6	2323276	2323281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856744
40488	NC_013422	ATG	2	6	2323290	2323295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856744
40489	NC_013422	CTCGC	2	10	2323328	2323337	0 %	20 %	20 %	60 %	261856744
40490	NC_013422	CCG	2	6	2323368	2323373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856744
40491	NC_013422	CAG	2	6	2323406	2323411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856744
40492	NC_013422	CAT	2	6	2323430	2323435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856744
40493	NC_013422	CCGC	2	8	2323448	2323455	0 %	0 %	25 %	75 %	261856744
40494	NC_013422	GGCC	2	8	2323492	2323499	0 %	0 %	50 %	50 %	261856744
40495	NC_013422	GCCA	2	8	2323509	2323516	25 %	0 %	25 %	50 %	261856744
40496	NC_013422	GAC	2	6	2323565	2323570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856744
40497	NC_013422	GGC	2	6	2323639	2323644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856744
40498	NC_013422	ATTTG	2	10	2323847	2323856	20 %	60 %	20 %	0 %	261856745
40499	NC_013422	GCG	2	6	2323951	2323956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856745
40500	NC_013422	ACG	2	6	2324010	2324015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856745

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