MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halothiobacillus neapolitanus c2 chromosome

Total Repeats: 45067

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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39005	NC_013422	CT	3	6	2235584	2235589	0 %	50 %	0 %	50 %	261856670
39006	NC_013422	CG	3	6	2235604	2235609	0 %	0 %	50 %	50 %	261856670
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39228	NC_013422	GGC	2	6	2248342	2248347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856682
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39230	NC_013422	TGG	2	6	2248430	2248435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261856682
39231	NC_013422	GCTTG	2	10	2248517	2248526	0 %	40 %	40 %	20 %	261856682
39232	NC_013422	GCC	2	6	2248569	2248574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856682
39233	NC_013422	GC	3	6	2248610	2248615	0 %	0 %	50 %	50 %	261856682
39234	NC_013422	AAC	2	6	2248642	2248647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261856682
39235	NC_013422	CGG	2	6	2248664	2248669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856682
39236	NC_013422	CG	4	8	2248731	2248738	0 %	0 %	50 %	50 %	261856682
39237	NC_013422	CCA	2	6	2248739	2248744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856682
39238	NC_013422	TCA	2	6	2248981	2248986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856682
39239	NC_013422	CCT	2	6	2248991	2248996	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261856682
39240	NC_013422	ATG	2	6	2249041	2249046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856682
39241	NC_013422	GGC	2	6	2249053	2249058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856682
39242	NC_013422	TGC	2	6	2249068	2249073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856682
39243	NC_013422	C	6	6	2249132	2249137	0 %	0 %	0 %	100 %	261856682
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39245	NC_013422	GCT	2	6	2249153	2249158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856682
39246	NC_013422	GCC	2	6	2249164	2249169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856682
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39252	NC_013422	ATACG	2	10	2249317	2249326	40 %	20 %	20 %	20 %	261856683
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39254	NC_013422	AGC	2	6	2249390	2249395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856683
39255	NC_013422	A	7	7	2249447	2249453	100 %	0 %	0 %	0 %	261856683
39256	NC_013422	TCT	2	6	2249502	2249507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261856683
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39261	NC_013422	CGG	2	6	2249647	2249652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856683
39262	NC_013422	TCG	2	6	2249688	2249693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856683
39263	NC_013422	GGC	2	6	2249743	2249748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856683
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39266	NC_013422	ACG	2	6	2249813	2249818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856683
39267	NC_013422	GA	3	6	2249840	2249845	50 %	0 %	50 %	0 %	261856683
39268	NC_013422	GC	3	6	2249868	2249873	0 %	0 %	50 %	50 %	261856683
39269	NC_013422	CGG	2	6	2249926	2249931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856683
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39300	NC_013422	CAA	3	9	2252802	2252810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261856686
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39331	NC_013422	TAG	2	6	2255645	2255650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856688
39332	NC_013422	TGC	2	6	2255658	2255663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856688
39333	NC_013422	GTA	2	6	2255683	2255688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856688
39334	NC_013422	GCT	2	6	2255707	2255712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856688
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39338	NC_013422	CTGG	2	8	2255827	2255834	0 %	25 %	50 %	25 %	261856688
39339	NC_013422	TGGT	2	8	2255849	2255856	0 %	50 %	50 %	0 %	261856688
39340	NC_013422	CGG	2	6	2255874	2255879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856688
39341	NC_013422	AGGTGT	2	12	2255886	2255897	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	261856688
39342	NC_013422	CTGC	2	8	2255948	2255955	0 %	25 %	25 %	50 %	261856688
39343	NC_013422	GCTG	2	8	2256028	2256035	0 %	25 %	50 %	25 %	261856688
39344	NC_013422	TGC	2	6	2256060	2256065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856688
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39347	NC_013422	CGG	2	6	2256135	2256140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856688
39348	NC_013422	CGT	3	9	2256156	2256164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856688
39349	NC_013422	CTG	2	6	2256181	2256186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856688
39350	NC_013422	TGG	2	6	2256390	2256395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261856688
39351	NC_013422	ATG	2	6	2256437	2256442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856688
39352	NC_013422	GGC	2	6	2256462	2256467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856688
39353	NC_013422	GTT	2	6	2256478	2256483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261856688
39354	NC_013422	ATACTG	2	12	2256487	2256498	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	261856688
39355	NC_013422	GGCT	2	8	2256548	2256555	0 %	25 %	50 %	25 %	261856688
39356	NC_013422	CGT	2	6	2256624	2256629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856688
39357	NC_013422	TCGC	2	8	2256728	2256735	0 %	25 %	25 %	50 %	261856688
39358	NC_013422	ATA	2	6	2256766	2256771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261856688
39359	NC_013422	GGT	2	6	2256778	2256783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261856688
39360	NC_013422	CGT	2	6	2256828	2256833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856688
39361	NC_013422	GCG	2	6	2256848	2256853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856688
39362	NC_013422	TCAG	2	8	2257064	2257071	25 %	25 %	25 %	25 %	261856688
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39364	NC_013422	CACG	2	8	2257146	2257153	25 %	0 %	25 %	50 %	261856688
39365	NC_013422	CGTAGG	2	12	2257158	2257169	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	261856688
39366	NC_013422	TCG	2	6	2257170	2257175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856688
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39368	NC_013422	GT	3	6	2257296	2257301	0 %	50 %	50 %	0 %	261856688
39369	NC_013422	TGC	2	6	2257317	2257322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856688
39370	NC_013422	CGT	2	6	2257341	2257346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856688
39371	NC_013422	GTC	2	6	2257421	2257426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856688
39372	NC_013422	GGTC	2	8	2257440	2257447	0 %	25 %	50 %	25 %	261856688
39373	NC_013422	GTAG	2	8	2257480	2257487	25 %	25 %	50 %	0 %	261856688
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39377	NC_013422	GTA	2	6	2257843	2257848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856688
39378	NC_013422	GCA	2	6	2257856	2257861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856688
39379	NC_013422	AGA	2	6	2257932	2257937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261856688
39380	NC_013422	GGT	2	6	2258125	2258130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261856688
39381	NC_013422	TGA	2	6	2258139	2258144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856688
39382	NC_013422	GCC	2	6	2258149	2258154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856688
39383	NC_013422	CTG	2	6	2258213	2258218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856688
39384	NC_013422	CG	3	6	2258236	2258241	0 %	0 %	50 %	50 %	261856688
39385	NC_013422	TCT	2	6	2258307	2258312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261856688
39386	NC_013422	CGA	2	6	2258388	2258393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856688
39387	NC_013422	AAG	2	6	2258402	2258407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261856688
39388	NC_013422	TGT	2	6	2258430	2258435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261856688
39389	NC_013422	TGC	2	6	2258457	2258462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856688
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39393	NC_013422	TTCGC	2	10	2258708	2258717	0 %	40 %	20 %	40 %	261856688
39394	NC_013422	GTC	2	6	2258887	2258892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856688
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39399	NC_013422	TTC	2	6	2259190	2259195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261856688
39400	NC_013422	CAA	2	6	2259331	2259336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261856688
39401	NC_013422	TGC	2	6	2259383	2259388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856688
39402	NC_013422	CTC	2	6	2259403	2259408	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261856688
39403	NC_013422	GCGCC	2	10	2259429	2259438	0 %	0 %	40 %	60 %	261856688
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39405	NC_013422	GCA	2	6	2259465	2259470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856688
39406	NC_013422	TCAA	2	8	2259536	2259543	50 %	25 %	0 %	25 %	261856688
39407	NC_013422	AAGCC	2	10	2259636	2259645	40 %	0 %	20 %	40 %	261856688
39408	NC_013422	GCA	2	6	2259722	2259727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856688
39409	NC_013422	CTG	2	6	2259777	2259782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856688
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39412	NC_013422	CTG	2	6	2259847	2259852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856688
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39415	NC_013422	CTT	2	6	2260065	2260070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261856689
39416	NC_013422	GCA	2	6	2260086	2260091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856689
39417	NC_013422	CAATTG	2	12	2260141	2260152	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	261856689
39418	NC_013422	GTC	2	6	2260204	2260209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856689
39419	NC_013422	CCA	2	6	2260246	2260251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856689
39420	NC_013422	TGA	2	6	2260274	2260279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856689
39421	NC_013422	GGCA	2	8	2260471	2260478	25 %	0 %	50 %	25 %	261856689
39422	NC_013422	CAT	2	6	2260522	2260527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856689
39423	NC_013422	ACC	2	6	2260553	2260558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856689
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39425	NC_013422	CA	3	6	2260718	2260723	50 %	0 %	0 %	50 %	261856689
39426	NC_013422	CGG	2	6	2261127	2261132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856690
39427	NC_013422	TTC	2	6	2261164	2261169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261856690
39428	NC_013422	CGA	2	6	2261196	2261201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856690
39429	NC_013422	GCC	2	6	2261203	2261208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856690
39430	NC_013422	GATGGC	2	12	2261254	2261265	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	261856690
39431	NC_013422	CGC	2	6	2261316	2261321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856690
39432	NC_013422	GAT	2	6	2261344	2261349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856690
39433	NC_013422	GC	3	6	2261370	2261375	0 %	0 %	50 %	50 %	261856690
39434	NC_013422	TGCC	2	8	2261385	2261392	0 %	25 %	25 %	50 %	261856690
39435	NC_013422	GAT	2	6	2261488	2261493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856690
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39437	NC_013422	CAG	2	6	2261599	2261604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856690
39438	NC_013422	CG	3	6	2261643	2261648	0 %	0 %	50 %	50 %	261856690
39439	NC_013422	TGA	2	6	2261729	2261734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856690
39440	NC_013422	CGC	2	6	2261736	2261741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856690
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39442	NC_013422	TCG	2	6	2261939	2261944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856690
39443	NC_013422	GAT	2	6	2262015	2262020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856690
39444	NC_013422	GC	3	6	2262021	2262026	0 %	0 %	50 %	50 %	261856690
39445	NC_013422	CAG	2	6	2262070	2262075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856690
39446	NC_013422	GCTG	2	8	2262078	2262085	0 %	25 %	50 %	25 %	261856690
39447	NC_013422	ACC	2	6	2262098	2262103	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856690
39448	NC_013422	GGGC	2	8	2262160	2262167	0 %	0 %	75 %	25 %	261856690
39449	NC_013422	CCA	2	6	2262219	2262224	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856690
39450	NC_013422	AC	3	6	2262261	2262266	50 %	0 %	0 %	50 %	261856690
39451	NC_013422	ATC	2	6	2262304	2262309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856690
39452	NC_013422	GGT	2	6	2262316	2262321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261856690
39453	NC_013422	GCA	2	6	2262372	2262377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856690
39454	NC_013422	GAT	2	6	2262397	2262402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856690
39455	NC_013422	CGG	2	6	2262546	2262551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856690
39456	NC_013422	CAT	2	6	2262693	2262698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856691
39457	NC_013422	ATCGA	2	10	2262732	2262741	40 %	20 %	20 %	20 %	261856691
39458	NC_013422	GCT	2	6	2262828	2262833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856691
39459	NC_013422	ATC	2	6	2262858	2262863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856691
39460	NC_013422	GCGGG	2	10	2262910	2262919	0 %	0 %	80 %	20 %	261856691
39461	NC_013422	GAAT	2	8	2262965	2262972	50 %	25 %	25 %	0 %	261856691
39462	NC_013422	GCG	2	6	2263011	2263016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856691
39463	NC_013422	TTG	2	6	2263020	2263025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261856691
39464	NC_013422	CCTT	2	8	2263071	2263078	0 %	50 %	0 %	50 %	261856691
39465	NC_013422	TCG	2	6	2263185	2263190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856691
39466	NC_013422	GC	3	6	2263195	2263200	0 %	0 %	50 %	50 %	261856691
39467	NC_013422	TACC	2	8	2263225	2263232	25 %	25 %	0 %	50 %	261856691
39468	NC_013422	CAG	2	6	2263301	2263306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856691
39469	NC_013422	AAC	2	6	2263344	2263349	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261856691
39470	NC_013422	CAA	2	6	2263419	2263424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261856692
39471	NC_013422	TCA	2	6	2263435	2263440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856692
39472	NC_013422	ATC	2	6	2263450	2263455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856692
39473	NC_013422	CGG	2	6	2263526	2263531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856692
39474	NC_013422	CG	3	6	2263534	2263539	0 %	0 %	50 %	50 %	261856692
39475	NC_013422	CCA	2	6	2263565	2263570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856692
39476	NC_013422	ATC	2	6	2263650	2263655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856692
39477	NC_013422	A	7	7	2263674	2263680	100 %	0 %	0 %	0 %	261856692
39478	NC_013422	TCA	2	6	2263736	2263741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856692
39479	NC_013422	GAGT	2	8	2263805	2263812	25 %	25 %	50 %	0 %	261856692
39480	NC_013422	TGG	2	6	2263820	2263825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261856692
39481	NC_013422	TCA	2	6	2263858	2263863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856692
39482	NC_013422	AGC	2	6	2263864	2263869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856692
39483	NC_013422	CCAT	2	8	2263885	2263892	25 %	25 %	0 %	50 %	261856692
39484	NC_013422	GGCTC	2	10	2263905	2263914	0 %	20 %	40 %	40 %	261856692
39485	NC_013422	GAC	2	6	2263973	2263978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856692
39486	NC_013422	CAGC	2	8	2263985	2263992	25 %	0 %	25 %	50 %	261856692
39487	NC_013422	CCA	2	6	2264030	2264035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856692
39488	NC_013422	CGC	2	6	2264239	2264244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856693
39489	NC_013422	GAT	2	6	2264285	2264290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856693
39490	NC_013422	TGCG	2	8	2264293	2264300	0 %	25 %	50 %	25 %	261856693
39491	NC_013422	GAAT	2	8	2264326	2264333	50 %	25 %	25 %	0 %	261856693
39492	NC_013422	CCG	2	6	2264340	2264345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856693
39493	NC_013422	CAG	2	6	2264366	2264371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856693
39494	NC_013422	GAT	2	6	2264546	2264551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856693
39495	NC_013422	CA	3	6	2264620	2264625	50 %	0 %	0 %	50 %	261856693
39496	NC_013422	GCG	2	6	2264730	2264735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856693
39497	NC_013422	ATG	2	6	2264763	2264768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856693
39498	NC_013422	CAGA	2	8	2264929	2264936	50 %	0 %	25 %	25 %	261856694
39499	NC_013422	GCCTCG	2	12	2265072	2265083	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	261856694
39500	NC_013422	AGT	2	6	2265109	2265114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856694

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