MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halothiobacillus neapolitanus c2 chromosome

Total Repeats: 45067

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
37001	NC_013422	GC	3	6	2126527	2126532	0 %	0 %	50 %	50 %	261856572
37002	NC_013422	TCC	2	6	2126542	2126547	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261856572
37003	NC_013422	CTGC	2	8	2126555	2126562	0 %	25 %	25 %	50 %	261856572
37004	NC_013422	CAG	2	6	2126616	2126621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856572
37005	NC_013422	ATC	2	6	2126631	2126636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856572
37006	NC_013422	TGC	2	6	2126664	2126669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856572
37007	NC_013422	ACG	2	6	2126694	2126699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856572
37008	NC_013422	GTCG	2	8	2126727	2126734	0 %	25 %	50 %	25 %	261856572
37009	NC_013422	TGA	2	6	2126785	2126790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856572
37010	NC_013422	AGG	2	6	2126839	2126844	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261856572
37011	NC_013422	ACG	2	6	2126888	2126893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856572
37012	NC_013422	TCA	2	6	2127057	2127062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856573
37013	NC_013422	AGC	2	6	2127117	2127122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856573
37014	NC_013422	GAT	2	6	2127143	2127148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856573
37015	NC_013422	CAC	2	6	2127197	2127202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856573
37016	NC_013422	CGG	2	6	2127217	2127222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856573
37017	NC_013422	CCA	2	6	2127223	2127228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856573
37018	NC_013422	ACG	2	6	2127236	2127241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856573
37019	NC_013422	AAC	2	6	2127282	2127287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261856573
37020	NC_013422	GCA	2	6	2127430	2127435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856573
37021	NC_013422	TGT	2	6	2127438	2127443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261856573
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37023	NC_013422	AC	3	6	2127646	2127651	50 %	0 %	0 %	50 %	261856573
37024	NC_013422	AACC	2	8	2127727	2127734	50 %	0 %	0 %	50 %	261856573
37025	NC_013422	CAG	2	6	2127740	2127745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856573
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37027	NC_013422	CAG	2	6	2127905	2127910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856573
37028	NC_013422	CGCT	2	8	2127963	2127970	0 %	25 %	25 %	50 %	261856573
37029	NC_013422	CCT	2	6	2128023	2128028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261856573
37030	NC_013422	GCC	2	6	2128064	2128069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856573
37031	NC_013422	GCC	2	6	2128132	2128137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856573
37032	NC_013422	CAG	2	6	2128154	2128159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856573
37033	NC_013422	ACC	2	6	2128246	2128251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856573
37034	NC_013422	CAA	2	6	2128310	2128315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261856573
37035	NC_013422	GT	3	6	2128385	2128390	0 %	50 %	50 %	0 %	261856573
37036	NC_013422	TCG	2	6	2128410	2128415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856573
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37040	NC_013422	CGAACG	2	12	2128546	2128557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856573
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37042	NC_013422	CACAA	2	10	2128650	2128659	60 %	0 %	0 %	40 %	261856573
37043	NC_013422	GC	3	6	2128666	2128671	0 %	0 %	50 %	50 %	261856573
37044	NC_013422	GGGC	2	8	2128748	2128755	0 %	0 %	75 %	25 %	261856573
37045	NC_013422	ACCC	2	8	2128900	2128907	25 %	0 %	0 %	75 %	261856573
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37050	NC_013422	AAT	2	6	2129078	2129083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261856573
37051	NC_013422	CGCC	2	8	2129170	2129177	0 %	0 %	25 %	75 %	261856573
37052	NC_013422	CAA	2	6	2129180	2129185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261856573
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37058	NC_013422	CGA	2	6	2129501	2129506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856573
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37060	NC_013422	CG	3	6	2129574	2129579	0 %	0 %	50 %	50 %	261856573
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37082	NC_013422	CCGA	2	8	2131023	2131030	25 %	0 %	25 %	50 %	261856574
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37087	NC_013422	CGG	2	6	2131262	2131267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856574
37088	NC_013422	TGCGA	2	10	2131273	2131282	20 %	20 %	40 %	20 %	261856574
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37099	NC_013422	CGC	2	6	2131735	2131740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856575
37100	NC_013422	TGCT	2	8	2131836	2131843	0 %	50 %	25 %	25 %	261856575
37101	NC_013422	CAT	2	6	2131918	2131923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856575
37102	NC_013422	GCATCG	2	12	2131950	2131961	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	261856575
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37108	NC_013422	GGT	2	6	2132197	2132202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261856575
37109	NC_013422	ACC	2	6	2132342	2132347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856575
37110	NC_013422	GCTCG	2	10	2132371	2132380	0 %	20 %	40 %	40 %	261856575
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37112	NC_013422	GCATT	2	10	2132482	2132491	20 %	40 %	20 %	20 %	261856576
37113	NC_013422	CA	3	6	2132504	2132509	50 %	0 %	0 %	50 %	261856576
37114	NC_013422	ATTGC	2	10	2132518	2132527	20 %	40 %	20 %	20 %	261856576
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37116	NC_013422	TGC	3	9	2132635	2132643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856576
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37219	NC_013422	GAT	2	6	2137482	2137487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856580
37220	NC_013422	TGA	2	6	2137523	2137528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856580
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37223	NC_013422	GGT	2	6	2137663	2137668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261856580
37224	NC_013422	CACC	2	8	2137682	2137689	25 %	0 %	0 %	75 %	261856580
37225	NC_013422	GCAA	2	8	2137695	2137702	50 %	0 %	25 %	25 %	261856580
37226	NC_013422	CCATGA	2	12	2137724	2137735	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	261856580
37227	NC_013422	GGC	3	9	2137753	2137761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856580
37228	NC_013422	CCGC	2	8	2137817	2137824	0 %	0 %	25 %	75 %	261856580
37229	NC_013422	TCA	2	6	2137835	2137840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856580
37230	NC_013422	CAAA	2	8	2137884	2137891	75 %	0 %	0 %	25 %	261856580
37231	NC_013422	TCG	2	6	2137930	2137935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856580
37232	NC_013422	TCA	3	9	2137988	2137996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856580
37233	NC_013422	GA	3	6	2138137	2138142	50 %	0 %	50 %	0 %	261856580
37234	NC_013422	GAC	2	6	2138245	2138250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856580
37235	NC_013422	CTG	2	6	2138284	2138289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856580
37236	NC_013422	CGA	3	9	2138340	2138348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856580
37237	NC_013422	ATC	2	6	2138365	2138370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856580
37238	NC_013422	CT	3	6	2138388	2138393	0 %	50 %	0 %	50 %	261856580
37239	NC_013422	TCGT	2	8	2138410	2138417	0 %	50 %	25 %	25 %	261856580
37240	NC_013422	CCGCTG	2	12	2138473	2138484	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	261856580
37241	NC_013422	GT	3	6	2138492	2138497	0 %	50 %	50 %	0 %	261856580
37242	NC_013422	TGC	2	6	2138546	2138551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856580
37243	NC_013422	GCTG	2	8	2138556	2138563	0 %	25 %	50 %	25 %	261856580
37244	NC_013422	GAA	2	6	2138592	2138597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261856580
37245	NC_013422	CG	3	6	2138638	2138643	0 %	0 %	50 %	50 %	261856581
37246	NC_013422	CTG	2	6	2138681	2138686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856581
37247	NC_013422	CAA	2	6	2138724	2138729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261856581
37248	NC_013422	GGC	2	6	2138861	2138866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856581
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37250	NC_013422	CTAT	2	8	2138893	2138900	25 %	50 %	0 %	25 %	261856581
37251	NC_013422	ATC	2	6	2139071	2139076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856581
37252	NC_013422	GGGC	2	8	2139111	2139118	0 %	0 %	75 %	25 %	261856581
37253	NC_013422	CTAT	2	8	2139138	2139145	25 %	50 %	0 %	25 %	261856581
37254	NC_013422	TCA	2	6	2139337	2139342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856581
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37257	NC_013422	CTGCC	2	10	2139379	2139388	0 %	20 %	20 %	60 %	261856582
37258	NC_013422	CCA	2	6	2139425	2139430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856582
37259	NC_013422	TGG	2	6	2139447	2139452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261856582
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37261	NC_013422	GCG	2	6	2139761	2139766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856582
37262	NC_013422	GATG	2	8	2139811	2139818	25 %	25 %	50 %	0 %	261856582
37263	NC_013422	C	6	6	2139823	2139828	0 %	0 %	0 %	100 %	261856582
37264	NC_013422	CGCAC	2	10	2139910	2139919	20 %	0 %	20 %	60 %	261856582
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37267	NC_013422	CCGG	2	8	2140349	2140356	0 %	0 %	50 %	50 %	261856582
37268	NC_013422	GGA	2	6	2140388	2140393	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261856582
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37272	NC_013422	TCGGA	2	10	2140695	2140704	20 %	20 %	40 %	20 %	261856583
37273	NC_013422	TCG	2	6	2140809	2140814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856583
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37280	NC_013422	TCG	2	6	2141079	2141084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856583
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37283	NC_013422	CGCC	2	8	2141202	2141209	0 %	0 %	25 %	75 %	261856583
37284	NC_013422	CGG	2	6	2141274	2141279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856583
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37286	NC_013422	CGCATT	2	12	2141401	2141412	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	261856583
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37288	NC_013422	GCG	2	6	2141480	2141485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856583
37289	NC_013422	GCAA	2	8	2141532	2141539	50 %	0 %	25 %	25 %	261856583
37290	NC_013422	CGGG	2	8	2141631	2141638	0 %	0 %	75 %	25 %	261856583
37291	NC_013422	TGGC	2	8	2141782	2141789	0 %	25 %	50 %	25 %	261856584
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37294	NC_013422	TGC	2	6	2141889	2141894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856584
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37298	NC_013422	CCTT	2	8	2142015	2142022	0 %	50 %	0 %	50 %	261856584
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37303	NC_013422	GGTT	2	8	2142651	2142658	0 %	50 %	50 %	0 %	261856584
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37306	NC_013422	ATGA	2	8	2142848	2142855	50 %	25 %	25 %	0 %	261856584
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37309	NC_013422	ATC	2	6	2142999	2143004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856584
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37312	NC_013422	CATC	2	8	2143363	2143370	25 %	25 %	0 %	50 %	261856585
37313	NC_013422	GATT	2	8	2143435	2143442	25 %	50 %	25 %	0 %	261856585
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37320	NC_013422	TGG	2	6	2143885	2143890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261856585
37321	NC_013422	CGGCG	2	10	2143897	2143906	0 %	0 %	60 %	40 %	261856585
37322	NC_013422	CAAG	2	8	2143954	2143961	50 %	0 %	25 %	25 %	261856585
37323	NC_013422	TGCGC	2	10	2143996	2144005	0 %	20 %	40 %	40 %	261856585
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37333	NC_013422	ATG	2	6	2144355	2144360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856585
37334	NC_013422	TGG	2	6	2144383	2144388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261856585
37335	NC_013422	GAC	2	6	2144407	2144412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856585
37336	NC_013422	GAT	2	6	2144423	2144428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856585
37337	NC_013422	ATG	2	6	2144444	2144449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856585
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37339	NC_013422	GCC	2	6	2144493	2144498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856585
37340	NC_013422	AAT	2	6	2144501	2144506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261856585
37341	NC_013422	TCGA	2	8	2144517	2144524	25 %	25 %	25 %	25 %	261856585
37342	NC_013422	GGC	2	6	2144561	2144566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856585
37343	NC_013422	CAC	2	6	2144666	2144671	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856585
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37345	NC_013422	CTT	2	6	2144812	2144817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261856585
37346	NC_013422	CGA	2	6	2144887	2144892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856585
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37348	NC_013422	ATG	2	6	2144982	2144987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856585
37349	NC_013422	CAG	2	6	2145038	2145043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856585
37350	NC_013422	TGTT	2	8	2145084	2145091	0 %	75 %	25 %	0 %	261856585
37351	NC_013422	TTC	2	6	2145119	2145124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261856585
37352	NC_013422	CGG	2	6	2145134	2145139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856585
37353	NC_013422	TTC	2	6	2145155	2145160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261856585
37354	NC_013422	GC	3	6	2145161	2145166	0 %	0 %	50 %	50 %	261856585
37355	NC_013422	CTT	2	6	2145170	2145175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261856585
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37359	NC_013422	GCGT	2	8	2145250	2145257	0 %	25 %	50 %	25 %	261856585
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37364	NC_013422	TGC	2	6	2145418	2145423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856585
37365	NC_013422	AAC	2	6	2145440	2145445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261856585
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37375	NC_013422	CTG	2	6	2146285	2146290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856586
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37378	NC_013422	AGGA	2	8	2146442	2146449	50 %	0 %	50 %	0 %	261856586
37379	NC_013422	ACCC	2	8	2146455	2146462	25 %	0 %	0 %	75 %	261856586
37380	NC_013422	AGA	2	6	2146491	2146496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261856586
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37385	NC_013422	CGG	2	6	2146752	2146757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856587
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37388	NC_013422	CAA	2	6	2146982	2146987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261856587
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37462	NC_013422	CACC	2	8	2151022	2151029	25 %	0 %	0 %	75 %	261856590
37463	NC_013422	CCA	2	6	2151154	2151159	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856591
37464	NC_013422	ATC	2	6	2151431	2151436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856591
37465	NC_013422	CGA	2	6	2151454	2151459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856591
37466	NC_013422	CCA	2	6	2151513	2151518	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856591
37467	NC_013422	CAG	2	6	2151565	2151570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856591
37468	NC_013422	GGT	2	6	2151581	2151586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261856591
37469	NC_013422	TCCAGC	2	12	2151589	2151600	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	261856591
37470	NC_013422	CAC	2	6	2151635	2151640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856591
37471	NC_013422	CGG	2	6	2151646	2151651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856591
37472	NC_013422	CTTG	2	8	2151691	2151698	0 %	50 %	25 %	25 %	261856592
37473	NC_013422	GCC	2	6	2151717	2151722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856592
37474	NC_013422	CG	4	8	2151802	2151809	0 %	0 %	50 %	50 %	261856592
37475	NC_013422	GAA	2	6	2151818	2151823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261856592
37476	NC_013422	AAC	2	6	2151875	2151880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261856592
37477	NC_013422	GAT	2	6	2152161	2152166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856593
37478	NC_013422	GC	3	6	2152299	2152304	0 %	0 %	50 %	50 %	261856593
37479	NC_013422	CTG	2	6	2152429	2152434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856593
37480	NC_013422	CGC	2	6	2152447	2152452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856593
37481	NC_013422	AACC	2	8	2152468	2152475	50 %	0 %	0 %	50 %	261856593
37482	NC_013422	CGT	2	6	2152494	2152499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856593
37483	NC_013422	CAT	2	6	2152544	2152549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856593
37484	NC_013422	GTG	2	6	2152585	2152590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261856593
37485	NC_013422	GTG	2	6	2152666	2152671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261856593
37486	NC_013422	GAC	2	6	2152675	2152680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856593
37487	NC_013422	GTAC	2	8	2152692	2152699	25 %	25 %	25 %	25 %	261856593
37488	NC_013422	CACC	2	8	2152790	2152797	25 %	0 %	0 %	75 %	261856593
37489	NC_013422	AAT	2	6	2152871	2152876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261856593
37490	NC_013422	CAAAA	2	10	2152881	2152890	80 %	0 %	0 %	20 %	261856593
37491	NC_013422	GC	3	6	2152963	2152968	0 %	0 %	50 %	50 %	261856593
37492	NC_013422	GCCCC	2	10	2153001	2153010	0 %	0 %	20 %	80 %	261856593
37493	NC_013422	GCC	2	6	2153026	2153031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856593
37494	NC_013422	CGGG	2	8	2153116	2153123	0 %	0 %	75 %	25 %	261856593
37495	NC_013422	CAC	2	6	2153178	2153183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856593
37496	NC_013422	TTC	2	6	2153251	2153256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261856593
37497	NC_013422	GT	3	6	2153270	2153275	0 %	50 %	50 %	0 %	261856593
37498	NC_013422	CAC	2	6	2153304	2153309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856593
37499	NC_013422	TCA	2	6	2153356	2153361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856593
37500	NC_013422	CAA	2	6	2153381	2153386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261856593

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