MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halothiobacillus neapolitanus c2 chromosome

Total Repeats: 45067

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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35502	NC_013422	GA	3	6	2044215	2044220	50 %	0 %	50 %	0 %	261856496
35503	NC_013422	AG	3	6	2044294	2044299	50 %	0 %	50 %	0 %	261856496
35504	NC_013422	CTT	2	6	2044351	2044356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261856496
35505	NC_013422	GAC	2	6	2044478	2044483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856496
35506	NC_013422	CGG	2	6	2044502	2044507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856496
35507	NC_013422	TGA	2	6	2044673	2044678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856496
35508	NC_013422	GAAT	2	8	2044683	2044690	50 %	25 %	25 %	0 %	261856496
35509	NC_013422	TTC	2	6	2044777	2044782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261856496
35510	NC_013422	TCG	2	6	2044789	2044794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856496
35511	NC_013422	GTG	2	6	2044799	2044804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261856496
35512	NC_013422	CCCAGC	2	12	2045012	2045023	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	261856496
35513	NC_013422	AAC	2	6	2045079	2045084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261856496
35514	NC_013422	CATT	2	8	2045097	2045104	25 %	50 %	0 %	25 %	261856496
35515	NC_013422	TCAAC	2	10	2045130	2045139	40 %	20 %	0 %	40 %	261856497
35516	NC_013422	AAT	2	6	2045179	2045184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261856497
35517	NC_013422	AGGT	2	8	2045234	2045241	25 %	25 %	50 %	0 %	261856497
35518	NC_013422	ACC	2	6	2045307	2045312	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856497
35519	NC_013422	CGT	2	6	2045404	2045409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856497
35520	NC_013422	ACC	2	6	2045450	2045455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856497
35521	NC_013422	TCA	2	6	2045474	2045479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856497
35522	NC_013422	AAC	2	6	2045498	2045503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261856497
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35524	NC_013422	ACC	2	6	2045519	2045524	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856497
35525	NC_013422	AG	3	6	2045561	2045566	50 %	0 %	50 %	0 %	261856497
35526	NC_013422	GC	3	6	2045612	2045617	0 %	0 %	50 %	50 %	261856497
35527	NC_013422	TTCA	2	8	2045621	2045628	25 %	50 %	0 %	25 %	261856497
35528	NC_013422	CGGG	2	8	2045656	2045663	0 %	0 %	75 %	25 %	261856498
35529	NC_013422	CGGC	2	8	2045671	2045678	0 %	0 %	50 %	50 %	261856498
35530	NC_013422	T	6	6	2045693	2045698	0 %	100 %	0 %	0 %	261856498
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35533	NC_013422	TCTGT	2	10	2045869	2045878	0 %	60 %	20 %	20 %	261856498
35534	NC_013422	CGA	2	6	2045975	2045980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856499
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35539	NC_013422	AGGTC	2	10	2046350	2046359	20 %	20 %	40 %	20 %	261856499
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35550	NC_013422	CAT	2	6	2047373	2047378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856500
35551	NC_013422	ATT	2	6	2047401	2047406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261856500
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35553	NC_013422	GCA	2	6	2047421	2047426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856500
35554	NC_013422	AGCA	2	8	2047473	2047480	50 %	0 %	25 %	25 %	261856500
35555	NC_013422	AAG	2	6	2047496	2047501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261856500
35556	NC_013422	TGT	2	6	2047905	2047910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261856501
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35558	NC_013422	CGG	2	6	2047923	2047928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856501
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35601	NC_013422	T	6	6	2049920	2049925	0 %	100 %	0 %	0 %	261856502
35602	NC_013422	CAGG	2	8	2049944	2049951	25 %	0 %	50 %	25 %	261856502
35603	NC_013422	CGA	2	6	2050012	2050017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856502
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35605	NC_013422	TGC	2	6	2050247	2050252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856502
35606	NC_013422	CGA	2	6	2050275	2050280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856502
35607	NC_013422	ATTC	2	8	2050286	2050293	25 %	50 %	0 %	25 %	261856502
35608	NC_013422	GATC	2	8	2050628	2050635	25 %	25 %	25 %	25 %	261856503
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35616	NC_013422	TGG	2	6	2051111	2051116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261856503
35617	NC_013422	TCA	2	6	2051144	2051149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856503
35618	NC_013422	GGC	2	6	2051167	2051172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856503
35619	NC_013422	GGC	2	6	2051199	2051204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856503
35620	NC_013422	CTTG	2	8	2051313	2051320	0 %	50 %	25 %	25 %	261856503
35621	NC_013422	TG	3	6	2051353	2051358	0 %	50 %	50 %	0 %	261856503
35622	NC_013422	GCA	2	6	2051380	2051385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856503
35623	NC_013422	ATA	2	6	2051435	2051440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261856503
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35630	NC_013422	A	7	7	2051830	2051836	100 %	0 %	0 %	0 %	261856504
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35637	NC_013422	GTGG	2	8	2052134	2052141	0 %	25 %	75 %	0 %	261856504
35638	NC_013422	ACC	2	6	2052202	2052207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856504
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35640	NC_013422	GT	3	6	2052450	2052455	0 %	50 %	50 %	0 %	261856505
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35727	NC_013422	CCAGC	2	10	2056989	2056998	20 %	0 %	20 %	60 %	261856508
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35729	NC_013422	T	6	6	2057239	2057244	0 %	100 %	0 %	0 %	261856509
35730	NC_013422	CTT	2	6	2057248	2057253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261856509
35731	NC_013422	GA	3	6	2057312	2057317	50 %	0 %	50 %	0 %	261856509
35732	NC_013422	ATC	2	6	2057330	2057335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856509
35733	NC_013422	CTT	3	9	2057359	2057367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261856509
35734	NC_013422	ACA	2	6	2057388	2057393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261856509
35735	NC_013422	TCT	2	6	2057395	2057400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261856509
35736	NC_013422	TCG	2	6	2057660	2057665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856510
35737	NC_013422	AAT	2	6	2057735	2057740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261856510
35738	NC_013422	CCA	2	6	2057799	2057804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856510
35739	NC_013422	GGC	2	6	2057875	2057880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856510
35740	NC_013422	AACC	2	8	2057913	2057920	50 %	0 %	0 %	50 %	261856510
35741	NC_013422	GAGGT	2	10	2057999	2058008	20 %	20 %	60 %	0 %	261856510
35742	NC_013422	GAT	2	6	2058016	2058021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856510
35743	NC_013422	GTT	2	6	2058079	2058084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261856510
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35745	NC_013422	CGC	2	6	2058177	2058182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856510
35746	NC_013422	CAC	2	6	2058244	2058249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856510
35747	NC_013422	GCT	2	6	2058267	2058272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856510
35748	NC_013422	CA	3	6	2058550	2058555	50 %	0 %	0 %	50 %	261856511
35749	NC_013422	CCAC	2	8	2058558	2058565	25 %	0 %	0 %	75 %	261856511
35750	NC_013422	CGT	3	9	2058615	2058623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856511
35751	NC_013422	ATC	2	6	2058671	2058676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856511
35752	NC_013422	CG	4	8	2058702	2058709	0 %	0 %	50 %	50 %	261856511
35753	NC_013422	ATC	2	6	2058716	2058721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856511
35754	NC_013422	GCC	2	6	2058776	2058781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856511
35755	NC_013422	ACC	2	6	2058830	2058835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856511
35756	NC_013422	GGCGCC	2	12	2058940	2058951	0 %	0 %	50 %	50 %	261856511
35757	NC_013422	CGG	2	6	2058960	2058965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856511
35758	NC_013422	CTG	2	6	2059026	2059031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856511
35759	NC_013422	ACGCC	2	10	2059108	2059117	20 %	0 %	20 %	60 %	261856511
35760	NC_013422	CCA	2	6	2059188	2059193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856511
35761	NC_013422	C	8	8	2059261	2059268	0 %	0 %	0 %	100 %	261856511
35762	NC_013422	ACT	2	6	2059273	2059278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856511
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35764	NC_013422	TGC	2	6	2059706	2059711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856512
35765	NC_013422	GAT	2	6	2059728	2059733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856512
35766	NC_013422	CAT	2	6	2059746	2059751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856512
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35768	NC_013422	CTT	2	6	2059881	2059886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261856512
35769	NC_013422	GC	3	6	2059938	2059943	0 %	0 %	50 %	50 %	261856512
35770	NC_013422	T	6	6	2059950	2059955	0 %	100 %	0 %	0 %	261856512
35771	NC_013422	TTG	2	6	2059988	2059993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261856512
35772	NC_013422	CTC	2	6	2059998	2060003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261856512
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35802	NC_013422	CGA	2	6	2061327	2061332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856513
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35818	NC_013422	TCG	2	6	2062236	2062241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856513
35819	NC_013422	CGA	2	6	2062242	2062247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856513
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35822	NC_013422	TCG	2	6	2062337	2062342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856513
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35827	NC_013422	GTG	4	12	2062580	2062591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261856513
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35831	NC_013422	CGC	2	6	2062871	2062876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856514
35832	NC_013422	TCT	2	6	2062905	2062910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261856514
35833	NC_013422	AACCGA	2	12	2062913	2062924	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	261856514
35834	NC_013422	CGATT	2	10	2062973	2062982	20 %	40 %	20 %	20 %	261856514
35835	NC_013422	TCGT	2	8	2063230	2063237	0 %	50 %	25 %	25 %	261856514
35836	NC_013422	CGG	2	6	2063275	2063280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856514
35837	NC_013422	GC	3	6	2063286	2063291	0 %	0 %	50 %	50 %	261856514
35838	NC_013422	AGA	2	6	2063303	2063308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261856514
35839	NC_013422	AT	3	6	2063364	2063369	50 %	50 %	0 %	0 %	261856514
35840	NC_013422	CGG	2	6	2063518	2063523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856515
35841	NC_013422	CGT	2	6	2063544	2063549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856515
35842	NC_013422	AGC	2	6	2063686	2063691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856515
35843	NC_013422	CCG	2	6	2063705	2063710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856515
35844	NC_013422	GC	3	6	2063752	2063757	0 %	0 %	50 %	50 %	261856515
35845	NC_013422	TCA	2	6	2063848	2063853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856515
35846	NC_013422	GCG	2	6	2063914	2063919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856515
35847	NC_013422	GGC	2	6	2063940	2063945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856515
35848	NC_013422	GGGC	2	8	2064009	2064016	0 %	0 %	75 %	25 %	261856515
35849	NC_013422	CCG	2	6	2064028	2064033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856515
35850	NC_013422	CGA	2	6	2064156	2064161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856515
35851	NC_013422	CGAC	2	8	2064167	2064174	25 %	0 %	25 %	50 %	261856515
35852	NC_013422	GAA	2	6	2064187	2064192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261856515
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35865	NC_013422	GCGCAA	3	18	2064927	2064944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856516
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35922	NC_013422	GCG	2	6	2069074	2069079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856521
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35936	NC_013422	GTTG	2	8	2069866	2069873	0 %	50 %	50 %	0 %	261856522
35937	NC_013422	ATC	2	6	2069893	2069898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856522
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35948	NC_013422	AATCA	2	10	2070661	2070670	60 %	20 %	0 %	20 %	261856522
35949	NC_013422	T	6	6	2070770	2070775	0 %	100 %	0 %	0 %	261856522
35950	NC_013422	ACA	2	6	2070794	2070799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261856522
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35952	NC_013422	TCC	2	6	2070914	2070919	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261856522
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35955	NC_013422	GATT	2	8	2070999	2071006	25 %	50 %	25 %	0 %	261856522
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35959	NC_013422	TG	3	6	2071420	2071425	0 %	50 %	50 %	0 %	261856522
35960	NC_013422	TTG	2	6	2071518	2071523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261856522
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35962	NC_013422	CCA	2	6	2071595	2071600	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856522
35963	NC_013422	A	7	7	2071606	2071612	100 %	0 %	0 %	0 %	261856522
35964	NC_013422	CCA	2	6	2071613	2071618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856522
35965	NC_013422	CGA	2	6	2071641	2071646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856522
35966	NC_013422	GCG	2	6	2071681	2071686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856522
35967	NC_013422	CGT	2	6	2071722	2071727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856522
35968	NC_013422	GCC	2	6	2071757	2071762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856522
35969	NC_013422	TTG	2	6	2071787	2071792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261856522
35970	NC_013422	ACCC	2	8	2071810	2071817	25 %	0 %	0 %	75 %	261856522
35971	NC_013422	A	6	6	2071827	2071832	100 %	0 %	0 %	0 %	261856522
35972	NC_013422	CAA	2	6	2071834	2071839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261856522
35973	NC_013422	A	6	6	2071838	2071843	100 %	0 %	0 %	0 %	261856522
35974	NC_013422	ACA	2	6	2071856	2071861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261856522
35975	NC_013422	ATT	2	6	2072033	2072038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261856523
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35977	NC_013422	TGC	3	9	2072092	2072100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856523
35978	NC_013422	AT	3	6	2072360	2072365	50 %	50 %	0 %	0 %	261856523
35979	NC_013422	AGTC	2	8	2072384	2072391	25 %	25 %	25 %	25 %	261856523
35980	NC_013422	A	7	7	2072433	2072439	100 %	0 %	0 %	0 %	261856523
35981	NC_013422	TCA	2	6	2072470	2072475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856523
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35984	NC_013422	GCCCA	2	10	2072625	2072634	20 %	0 %	20 %	60 %	261856523
35985	NC_013422	ACC	2	6	2072661	2072666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856523
35986	NC_013422	CAAT	2	8	2072668	2072675	50 %	25 %	0 %	25 %	261856523
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35988	NC_013422	CAT	2	6	2072693	2072698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856523
35989	NC_013422	GGC	2	6	2072721	2072726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856523
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35991	NC_013422	GAA	2	6	2072781	2072786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261856523
35992	NC_013422	TTCA	2	8	2072874	2072881	25 %	50 %	0 %	25 %	261856523
35993	NC_013422	GGC	2	6	2072931	2072936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856523
35994	NC_013422	TTG	2	6	2073013	2073018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261856523
35995	NC_013422	CAG	2	6	2073043	2073048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856523
35996	NC_013422	AATC	2	8	2073124	2073131	50 %	25 %	0 %	25 %	261856524
35997	NC_013422	CGC	2	6	2073152	2073157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856524
35998	NC_013422	GGT	2	6	2073221	2073226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261856524
35999	NC_013422	CAAT	2	8	2073274	2073281	50 %	25 %	0 %	25 %	261856524
36000	NC_013422	TCA	2	6	2073294	2073299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856524

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