MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halothiobacillus neapolitanus c2 chromosome

Total Repeats: 45067

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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35002	NC_013422	GAC	2	6	2016819	2016824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856466
35003	NC_013422	CAAG	2	8	2016863	2016870	50 %	0 %	25 %	25 %	261856466
35004	NC_013422	ATG	2	6	2016926	2016931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856466
35005	NC_013422	T	6	6	2016937	2016942	0 %	100 %	0 %	0 %	261856466
35006	NC_013422	ACC	2	6	2017321	2017326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856467
35007	NC_013422	GTAA	2	8	2017329	2017336	50 %	25 %	25 %	0 %	261856467
35008	NC_013422	A	6	6	2017378	2017383	100 %	0 %	0 %	0 %	261856467
35009	NC_013422	CGTG	2	8	2017577	2017584	0 %	25 %	50 %	25 %	261856467
35010	NC_013422	TCA	2	6	2017594	2017599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856467
35011	NC_013422	AGT	2	6	2017647	2017652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856467
35012	NC_013422	CCCG	2	8	2017665	2017672	0 %	0 %	25 %	75 %	261856467
35013	NC_013422	CCT	2	6	2017691	2017696	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261856467
35014	NC_013422	CAA	2	6	2017965	2017970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261856467
35015	NC_013422	CTT	2	6	2018000	2018005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261856467
35016	NC_013422	TCA	2	6	2018118	2018123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856468
35017	NC_013422	AAT	2	6	2018124	2018129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261856468
35018	NC_013422	GCA	2	6	2018220	2018225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856468
35019	NC_013422	ATC	2	6	2018230	2018235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856468
35020	NC_013422	ATGG	2	8	2018251	2018258	25 %	25 %	50 %	0 %	261856468
35021	NC_013422	GTC	2	6	2018261	2018266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856468
35022	NC_013422	GC	3	6	2018267	2018272	0 %	0 %	50 %	50 %	261856468
35023	NC_013422	CAG	2	6	2018295	2018300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856468
35024	NC_013422	CCAA	2	8	2018301	2018308	50 %	0 %	0 %	50 %	261856468
35025	NC_013422	CTG	2	6	2018338	2018343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856468
35026	NC_013422	CAG	2	6	2018355	2018360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856468
35027	NC_013422	ACCT	2	8	2018410	2018417	25 %	25 %	0 %	50 %	261856468
35028	NC_013422	T	7	7	2018438	2018444	0 %	100 %	0 %	0 %	261856468
35029	NC_013422	A	6	6	2018480	2018485	100 %	0 %	0 %	0 %	261856468
35030	NC_013422	GCG	2	6	2018517	2018522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856468
35031	NC_013422	TTTC	2	8	2018527	2018534	0 %	75 %	0 %	25 %	261856468
35032	NC_013422	AGCCA	2	10	2018574	2018583	40 %	0 %	20 %	40 %	261856468
35033	NC_013422	T	7	7	2018605	2018611	0 %	100 %	0 %	0 %	261856468
35034	NC_013422	GGAT	2	8	2018680	2018687	25 %	25 %	50 %	0 %	261856468
35035	NC_013422	CG	3	6	2018694	2018699	0 %	0 %	50 %	50 %	261856468
35036	NC_013422	GC	3	6	2018771	2018776	0 %	0 %	50 %	50 %	261856468
35037	NC_013422	ATCA	2	8	2018818	2018825	50 %	25 %	0 %	25 %	261856468
35038	NC_013422	CGA	2	6	2019081	2019086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856469
35039	NC_013422	A	7	7	2019106	2019112	100 %	0 %	0 %	0 %	261856469
35040	NC_013422	GCT	2	6	2019118	2019123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856469
35041	NC_013422	TGC	2	6	2019153	2019158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856469
35042	NC_013422	GCC	2	6	2019209	2019214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856469
35043	NC_013422	TCG	2	6	2019225	2019230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856469
35044	NC_013422	T	6	6	2019248	2019253	0 %	100 %	0 %	0 %	261856469
35045	NC_013422	ATTG	2	8	2019313	2019320	25 %	50 %	25 %	0 %	261856469
35046	NC_013422	TTA	2	6	2019357	2019362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261856469
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35050	NC_013422	CCA	2	6	2019438	2019443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856469
35051	NC_013422	ATG	2	6	2019467	2019472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856469
35052	NC_013422	CAC	2	6	2019485	2019490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856469
35053	NC_013422	CGC	2	6	2019500	2019505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856469
35054	NC_013422	GAA	2	6	2019518	2019523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261856469
35055	NC_013422	CGA	2	6	2019596	2019601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856470
35056	NC_013422	CGC	2	6	2019650	2019655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856470
35057	NC_013422	CATC	2	8	2019763	2019770	25 %	25 %	0 %	50 %	261856470
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35059	NC_013422	GCCA	2	8	2019815	2019822	25 %	0 %	25 %	50 %	261856470
35060	NC_013422	CAC	2	6	2019824	2019829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856470
35061	NC_013422	GCCC	2	8	2019855	2019862	0 %	0 %	25 %	75 %	261856470
35062	NC_013422	GCG	2	6	2019906	2019911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856470
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35083	NC_013422	ATCG	2	8	2020784	2020791	25 %	25 %	25 %	25 %	261856471
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35099	NC_013422	GC	3	6	2021979	2021984	0 %	0 %	50 %	50 %	261856471
35100	NC_013422	AGC	2	6	2022006	2022011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856471
35101	NC_013422	TCGAA	2	10	2022285	2022294	40 %	20 %	20 %	20 %	261856472
35102	NC_013422	GACG	2	8	2022499	2022506	25 %	0 %	50 %	25 %	261856472
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35107	NC_013422	CGT	2	6	2022607	2022612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856472
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35117	NC_013422	ACTGG	2	10	2023054	2023063	20 %	20 %	40 %	20 %	261856472
35118	NC_013422	A	6	6	2023067	2023072	100 %	0 %	0 %	0 %	261856472
35119	NC_013422	GAT	2	6	2023094	2023099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856472
35120	NC_013422	CAA	2	6	2023106	2023111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261856472
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35230	NC_013422	CA	3	6	2029265	2029270	50 %	0 %	0 %	50 %	261856479
35231	NC_013422	GCG	2	6	2029288	2029293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856479
35232	NC_013422	TGC	2	6	2029337	2029342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856479
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35234	NC_013422	CGC	2	6	2029393	2029398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856479
35235	NC_013422	GCTG	2	8	2029414	2029421	0 %	25 %	50 %	25 %	261856479
35236	NC_013422	TGC	2	6	2029427	2029432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856479
35237	NC_013422	T	6	6	2029467	2029472	0 %	100 %	0 %	0 %	261856479
35238	NC_013422	ATTC	2	8	2029509	2029516	25 %	50 %	0 %	25 %	261856479
35239	NC_013422	TCA	2	6	2029520	2029525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856479
35240	NC_013422	GCCGC	2	10	2029537	2029546	0 %	0 %	40 %	60 %	261856479
35241	NC_013422	T	6	6	2029692	2029697	0 %	100 %	0 %	0 %	261856479
35242	NC_013422	CG	3	6	2029831	2029836	0 %	0 %	50 %	50 %	261856479
35243	NC_013422	GTTT	2	8	2029850	2029857	0 %	75 %	25 %	0 %	261856479
35244	NC_013422	TGGGTT	2	12	2029892	2029903	0 %	50 %	50 %	0 %	261856479
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35247	NC_013422	GCA	2	6	2030002	2030007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856479
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35249	NC_013422	TTTGC	2	10	2030091	2030100	0 %	60 %	20 %	20 %	261856480
35250	NC_013422	TTC	2	6	2030104	2030109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261856480
35251	NC_013422	TACG	2	8	2030204	2030211	25 %	25 %	25 %	25 %	261856480
35252	NC_013422	CGG	2	6	2030234	2030239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856480
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35254	NC_013422	AC	3	6	2030452	2030457	50 %	0 %	0 %	50 %	261856480
35255	NC_013422	GCA	2	6	2030476	2030481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856480
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35258	NC_013422	ATAA	2	8	2030611	2030618	75 %	25 %	0 %	0 %	261856480
35259	NC_013422	AGC	2	6	2030623	2030628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856481
35260	NC_013422	A	7	7	2031071	2031077	100 %	0 %	0 %	0 %	261856481
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35262	NC_013422	CCG	2	6	2031172	2031177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856481
35263	NC_013422	GGT	2	6	2031208	2031213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261856481
35264	NC_013422	GC	3	6	2031235	2031240	0 %	0 %	50 %	50 %	261856482
35265	NC_013422	GAT	2	6	2031246	2031251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856482
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35268	NC_013422	CGG	2	6	2031573	2031578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856483
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35270	NC_013422	CG	3	6	2031634	2031639	0 %	0 %	50 %	50 %	261856483
35271	NC_013422	ACCAA	2	10	2031689	2031698	60 %	0 %	0 %	40 %	261856483
35272	NC_013422	AAC	2	6	2031788	2031793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261856483
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35340	NC_013422	TTG	2	6	2035065	2035070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261856486
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35344	NC_013422	CCG	2	6	2035221	2035226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856486
35345	NC_013422	GTTTCG	2	12	2035257	2035268	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	261856486
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35348	NC_013422	CAG	2	6	2035312	2035317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856486
35349	NC_013422	GCC	3	9	2035388	2035396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856486
35350	NC_013422	ACGA	2	8	2035397	2035404	50 %	0 %	25 %	25 %	261856486
35351	NC_013422	ATG	2	6	2035446	2035451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856486
35352	NC_013422	CTTG	2	8	2035525	2035532	0 %	50 %	25 %	25 %	261856486
35353	NC_013422	TCG	2	6	2035575	2035580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856486
35354	NC_013422	CGG	3	9	2035603	2035611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856486
35355	NC_013422	GC	3	6	2035661	2035666	0 %	0 %	50 %	50 %	261856486
35356	NC_013422	TTAAGG	2	12	2035716	2035727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856486
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35358	NC_013422	ACC	2	6	2035943	2035948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856487
35359	NC_013422	GCG	2	6	2035964	2035969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856487
35360	NC_013422	CCA	2	6	2035998	2036003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856487
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35362	NC_013422	TTG	2	6	2036177	2036182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261856487
35363	NC_013422	TGA	2	6	2036190	2036195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856487
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35367	NC_013422	TCG	2	6	2036252	2036257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856487
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35369	NC_013422	TGT	2	6	2036286	2036291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261856487
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35371	NC_013422	GAT	2	6	2036359	2036364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856487
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35374	NC_013422	TCGG	2	8	2036435	2036442	0 %	25 %	50 %	25 %	261856488
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35378	NC_013422	CTT	2	6	2036757	2036762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261856488
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35382	NC_013422	TGC	2	6	2036888	2036893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856488
35383	NC_013422	CAC	2	6	2036947	2036952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856488
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35459	NC_013422	GC	3	6	2041902	2041907	0 %	0 %	50 %	50 %	261856494
35460	NC_013422	CAA	2	6	2042127	2042132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261856494
35461	NC_013422	CA	3	6	2042205	2042210	50 %	0 %	0 %	50 %	261856494
35462	NC_013422	CAACA	2	10	2042247	2042256	60 %	0 %	0 %	40 %	261856494
35463	NC_013422	AGCA	2	8	2042278	2042285	50 %	0 %	25 %	25 %	261856494
35464	NC_013422	TCA	2	6	2042359	2042364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856494
35465	NC_013422	CTT	2	6	2042385	2042390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261856494
35466	NC_013422	CCTGC	2	10	2042425	2042434	0 %	20 %	20 %	60 %	261856494
35467	NC_013422	ATC	2	6	2042506	2042511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856495
35468	NC_013422	CCG	2	6	2042530	2042535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856495
35469	NC_013422	TCT	2	6	2042581	2042586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261856495
35470	NC_013422	A	8	8	2042615	2042622	100 %	0 %	0 %	0 %	261856495
35471	NC_013422	A	7	7	2042634	2042640	100 %	0 %	0 %	0 %	261856495
35472	NC_013422	ACA	2	6	2042656	2042661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261856495
35473	NC_013422	GAA	2	6	2042724	2042729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261856495
35474	NC_013422	AAT	2	6	2042739	2042744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261856495
35475	NC_013422	TGC	2	6	2042956	2042961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856495
35476	NC_013422	AGCCA	2	10	2042993	2043002	40 %	0 %	20 %	40 %	261856495
35477	NC_013422	GAACA	2	10	2043036	2043045	60 %	0 %	20 %	20 %	261856495
35478	NC_013422	GAA	2	6	2043102	2043107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261856495
35479	NC_013422	CAAA	2	8	2043149	2043156	75 %	0 %	0 %	25 %	261856495
35480	NC_013422	ATGTTG	2	12	2043186	2043197	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	261856495
35481	NC_013422	GAA	2	6	2043200	2043205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261856495
35482	NC_013422	ATG	2	6	2043224	2043229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856495
35483	NC_013422	AAC	2	6	2043293	2043298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261856496
35484	NC_013422	CGA	2	6	2043392	2043397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856496
35485	NC_013422	CACT	2	8	2043398	2043405	25 %	25 %	0 %	50 %	261856496
35486	NC_013422	TCT	2	6	2043419	2043424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261856496
35487	NC_013422	CG	3	6	2043456	2043461	0 %	0 %	50 %	50 %	261856496
35488	NC_013422	AC	3	6	2043549	2043554	50 %	0 %	0 %	50 %	261856496
35489	NC_013422	GTT	2	6	2043581	2043586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261856496
35490	NC_013422	TGAT	2	8	2043614	2043621	25 %	50 %	25 %	0 %	261856496
35491	NC_013422	GCC	2	6	2043707	2043712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856496
35492	NC_013422	GAT	3	9	2043841	2043849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856496
35493	NC_013422	CCG	2	6	2043909	2043914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856496
35494	NC_013422	TGA	2	6	2043973	2043978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856496
35495	NC_013422	GCG	2	6	2043985	2043990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856496
35496	NC_013422	TCT	2	6	2044034	2044039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261856496
35497	NC_013422	GCG	2	6	2044052	2044057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856496
35498	NC_013422	GTA	2	6	2044114	2044119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856496
35499	NC_013422	AAG	2	6	2044159	2044164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261856496
35500	NC_013422	CG	3	6	2044165	2044170	0 %	0 %	50 %	50 %	261856496

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