MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halothiobacillus neapolitanus c2 chromosome

Total Repeats: 45067

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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34502	NC_013422	CAT	2	6	1989245	1989250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856438
34503	NC_013422	GCCAC	2	10	1989256	1989265	20 %	0 %	20 %	60 %	261856438
34504	NC_013422	ATGG	2	8	1989393	1989400	25 %	25 %	50 %	0 %	261856438
34505	NC_013422	GAA	2	6	1989452	1989457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261856438
34506	NC_013422	GCCC	2	8	1989581	1989588	0 %	0 %	25 %	75 %	261856438
34507	NC_013422	TCCG	2	8	1989599	1989606	0 %	25 %	25 %	50 %	261856438
34508	NC_013422	CG	4	8	1990003	1990010	0 %	0 %	50 %	50 %	261856439
34509	NC_013422	AC	3	6	1990029	1990034	50 %	0 %	0 %	50 %	261856439
34510	NC_013422	ATG	2	6	1990140	1990145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856439
34511	NC_013422	T	6	6	1990160	1990165	0 %	100 %	0 %	0 %	261856439
34512	NC_013422	CCG	2	6	1990166	1990171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856439
34513	NC_013422	AG	3	6	1990185	1990190	50 %	0 %	50 %	0 %	261856439
34514	NC_013422	GC	3	6	1990224	1990229	0 %	0 %	50 %	50 %	261856440
34515	NC_013422	TCA	2	6	1990240	1990245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856440
34516	NC_013422	GTC	2	6	1990257	1990262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856440
34517	NC_013422	TGC	3	9	1990271	1990279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856440
34518	NC_013422	TCA	2	6	1990309	1990314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856440
34519	NC_013422	AGC	2	6	1990315	1990320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856440
34520	NC_013422	CGT	2	6	1990343	1990348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856440
34521	NC_013422	AAC	2	6	1990362	1990367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261856440
34522	NC_013422	TCG	2	6	1990402	1990407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856440
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34524	NC_013422	GC	3	6	1990432	1990437	0 %	0 %	50 %	50 %	261856440
34525	NC_013422	CTT	2	6	1990440	1990445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261856440
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34529	NC_013422	A	6	6	1990663	1990668	100 %	0 %	0 %	0 %	261856441
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34533	NC_013422	GTTG	2	8	1990746	1990753	0 %	50 %	50 %	0 %	261856441
34534	NC_013422	A	6	6	1990792	1990797	100 %	0 %	0 %	0 %	261856441
34535	NC_013422	ATG	2	6	1990892	1990897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856441
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34541	NC_013422	CGTG	2	8	1991238	1991245	0 %	25 %	50 %	25 %	261856442
34542	NC_013422	GCG	2	6	1991246	1991251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856442
34543	NC_013422	CTG	2	6	1991259	1991264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856442
34544	NC_013422	GGATT	2	10	1991322	1991331	20 %	40 %	40 %	0 %	261856442
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34548	NC_013422	GCA	2	6	1991552	1991557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856442
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34553	NC_013422	CGT	2	6	1991751	1991756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856442
34554	NC_013422	GAG	2	6	1991797	1991802	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261856442
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34557	NC_013422	TGAAC	2	10	1991909	1991918	40 %	20 %	20 %	20 %	261856442
34558	NC_013422	GAC	2	6	1991984	1991989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856443
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34588	NC_013422	AT	3	6	1993540	1993545	50 %	50 %	0 %	0 %	261856444
34589	NC_013422	GCC	2	6	1993549	1993554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856444
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34598	NC_013422	CGCA	2	8	1993958	1993965	25 %	0 %	25 %	50 %	261856444
34599	NC_013422	TGA	2	6	1993973	1993978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856444
34600	NC_013422	TG	3	6	1994015	1994020	0 %	50 %	50 %	0 %	261856444
34601	NC_013422	TGA	2	6	1994203	1994208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856445
34602	NC_013422	CAA	2	6	1994249	1994254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261856445
34603	NC_013422	A	6	6	1994316	1994321	100 %	0 %	0 %	0 %	261856445
34604	NC_013422	CAT	2	6	1994327	1994332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856445
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34608	NC_013422	GC	4	8	1994525	1994532	0 %	0 %	50 %	50 %	261856445
34609	NC_013422	CAC	2	6	1994579	1994584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856445
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34612	NC_013422	CGA	2	6	1994792	1994797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856445
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34614	NC_013422	CG	3	6	1994821	1994826	0 %	0 %	50 %	50 %	261856445
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34732	NC_013422	GCGGG	2	10	2001840	2001849	0 %	0 %	80 %	20 %	261856451
34733	NC_013422	TGC	2	6	2001891	2001896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856451
34734	NC_013422	CAT	2	6	2001911	2001916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856451
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34739	NC_013422	GTCG	2	8	2002112	2002119	0 %	25 %	50 %	25 %	261856452
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34748	NC_013422	CATCA	2	10	2002808	2002817	40 %	20 %	0 %	40 %	261856453
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34833	NC_013422	CAT	3	9	2007559	2007567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856458
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34838	NC_013422	A	6	6	2007864	2007869	100 %	0 %	0 %	0 %	261856459
34839	NC_013422	ATT	2	6	2007876	2007881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261856459
34840	NC_013422	CTTG	2	8	2007917	2007924	0 %	50 %	25 %	25 %	261856459
34841	NC_013422	TCG	2	6	2007943	2007948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856459
34842	NC_013422	GTC	2	6	2007969	2007974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856459
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34844	NC_013422	CAT	2	6	2008148	2008153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856459
34845	NC_013422	TCAA	2	8	2008201	2008208	50 %	25 %	0 %	25 %	261856459
34846	NC_013422	AGC	3	9	2008327	2008335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856460
34847	NC_013422	ATGGCG	2	12	2008370	2008381	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	261856460
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34849	NC_013422	ACG	2	6	2008429	2008434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856460
34850	NC_013422	ACC	3	9	2008516	2008524	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856460
34851	NC_013422	CAT	2	6	2008563	2008568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856460
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34964	NC_013422	ATC	2	6	2014583	2014588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856464
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34967	NC_013422	A	6	6	2014730	2014735	100 %	0 %	0 %	0 %	261856464
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34969	NC_013422	CAGCCT	2	12	2014921	2014932	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	261856465
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