MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halothiobacillus neapolitanus c2 chromosome

Total Repeats: 45067

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_013422	CGA	2	6	166784	166789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261854792
3002	NC_013422	AC	3	6	166979	166984	50 %	0 %	0 %	50 %	261854792
3003	NC_013422	GC	3	6	166987	166992	0 %	0 %	50 %	50 %	261854792
3004	NC_013422	CG	3	6	167010	167015	0 %	0 %	50 %	50 %	261854792
3005	NC_013422	GCC	2	6	167049	167054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261854792
3006	NC_013422	CGC	2	6	167355	167360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261854793
3007	NC_013422	CAG	3	9	167414	167422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261854793
3008	NC_013422	TTG	2	6	167525	167530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261854793
3009	NC_013422	GT	3	6	167556	167561	0 %	50 %	50 %	0 %	261854793
3010	NC_013422	CAG	2	6	167618	167623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261854793
3011	NC_013422	TTC	2	6	167651	167656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261854793
3012	NC_013422	GC	3	6	167661	167666	0 %	0 %	50 %	50 %	261854793
3013	NC_013422	GCG	2	6	169876	169881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261854794
3014	NC_013422	TTA	2	6	169892	169897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261854794
3015	NC_013422	TGG	2	6	169944	169949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261854794
3016	NC_013422	CTG	2	6	169976	169981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854794
3017	NC_013422	GAT	2	6	170069	170074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261854794
3018	NC_013422	CG	4	8	170229	170236	0 %	0 %	50 %	50 %	261854794
3019	NC_013422	GGT	2	6	170303	170308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261854794
3020	NC_013422	CTCG	2	8	170327	170334	0 %	25 %	25 %	50 %	261854794
3021	NC_013422	CTTG	2	8	170338	170345	0 %	50 %	25 %	25 %	261854794
3022	NC_013422	CTG	2	6	170360	170365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854794
3023	NC_013422	ACCA	2	8	170378	170385	50 %	0 %	0 %	50 %	261854794
3024	NC_013422	CTGG	2	8	170407	170414	0 %	25 %	50 %	25 %	261854794
3025	NC_013422	TGG	3	9	170445	170453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261854794
3026	NC_013422	GC	3	6	170560	170565	0 %	0 %	50 %	50 %	261854794
3027	NC_013422	GC	3	6	170699	170704	0 %	0 %	50 %	50 %	261854794
3028	NC_013422	GC	3	6	170854	170859	0 %	0 %	50 %	50 %	261854794
3029	NC_013422	TTG	2	6	170876	170881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261854794
3030	NC_013422	ACC	2	6	170903	170908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261854794
3031	NC_013422	AAG	2	6	171072	171077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261854794
3032	NC_013422	CGG	2	6	171091	171096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261854794
3033	NC_013422	TGGCCT	2	12	171165	171176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854794
3034	NC_013422	GGCA	2	8	171186	171193	25 %	0 %	50 %	25 %	261854794
3035	NC_013422	ACCA	2	8	171221	171228	50 %	0 %	0 %	50 %	261854794
3036	NC_013422	GCG	2	6	171257	171262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261854794
3037	NC_013422	TGG	3	9	171288	171296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261854794
3038	NC_013422	CGA	2	6	171385	171390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261854794
3039	NC_013422	CCG	2	6	171394	171399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261854794
3040	NC_013422	TGA	2	6	171409	171414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261854794
3041	NC_013422	GAC	2	6	171451	171456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261854794
3042	NC_013422	CCA	2	6	171489	171494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261854794
3043	NC_013422	A	6	6	171494	171499	100 %	0 %	0 %	0 %	261854794
3044	NC_013422	GGT	2	6	171565	171570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261854794
3045	NC_013422	CAT	2	6	171809	171814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261854795
3046	NC_013422	GCA	2	6	171998	172003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261854795
3047	NC_013422	GCCC	2	8	172022	172029	0 %	0 %	25 %	75 %	261854795
3048	NC_013422	CGC	2	6	172066	172071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261854795
3049	NC_013422	AGC	2	6	172108	172113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261854795
3050	NC_013422	TG	3	6	172180	172185	0 %	50 %	50 %	0 %	261854795
3051	NC_013422	A	7	7	172211	172217	100 %	0 %	0 %	0 %	261854795
3052	NC_013422	TTG	2	6	172230	172235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261854795
3053	NC_013422	GCG	2	6	172254	172259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261854795
3054	NC_013422	GACC	2	8	172417	172424	25 %	0 %	25 %	50 %	261854796
3055	NC_013422	TTTCT	2	10	172443	172452	0 %	80 %	0 %	20 %	261854796
3056	NC_013422	CTG	2	6	172478	172483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854796
3057	NC_013422	CGG	2	6	172489	172494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261854796
3058	NC_013422	CGC	2	6	172646	172651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261854796
3059	NC_013422	GGCA	2	8	172669	172676	25 %	0 %	50 %	25 %	261854796
3060	NC_013422	TTG	2	6	172700	172705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261854796
3061	NC_013422	GCT	2	6	172783	172788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854796
3062	NC_013422	GGC	2	6	172825	172830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261854796
3063	NC_013422	AAC	2	6	172854	172859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261854796
3064	NC_013422	GCT	2	6	172885	172890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854796
3065	NC_013422	TGT	2	6	172959	172964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261854796
3066	NC_013422	CGT	2	6	172970	172975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854796
3067	NC_013422	CAG	2	6	173067	173072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261854797
3068	NC_013422	TAC	2	6	173215	173220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261854797
3069	NC_013422	ACG	2	6	173252	173257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261854797
3070	NC_013422	CGA	2	6	173331	173336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261854797
3071	NC_013422	CGC	2	6	173375	173380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261854797
3072	NC_013422	A	6	6	173428	173433	100 %	0 %	0 %	0 %	261854797
3073	NC_013422	GACC	3	12	173436	173447	25 %	0 %	25 %	50 %	261854797
3074	NC_013422	CGA	2	6	173475	173480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261854797
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3076	NC_013422	CGTG	2	8	173580	173587	0 %	25 %	50 %	25 %	261854797
3077	NC_013422	GC	3	6	173601	173606	0 %	0 %	50 %	50 %	261854797
3078	NC_013422	GCG	2	6	173609	173614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261854797
3079	NC_013422	GTGC	2	8	173629	173636	0 %	25 %	50 %	25 %	261854797
3080	NC_013422	TGG	2	6	173672	173677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261854797
3081	NC_013422	CAG	2	6	173680	173685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261854797
3082	NC_013422	GCG	2	6	173707	173712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261854797
3083	NC_013422	GGC	2	6	173730	173735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261854797
3084	NC_013422	GGC	2	6	173746	173751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261854797
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3087	NC_013422	A	6	6	174001	174006	100 %	0 %	0 %	0 %	261854797
3088	NC_013422	ATGG	2	8	174040	174047	25 %	25 %	50 %	0 %	261854797
3089	NC_013422	CTG	2	6	174064	174069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854797
3090	NC_013422	CGC	2	6	174283	174288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261854798
3091	NC_013422	CTT	2	6	174355	174360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261854798
3092	NC_013422	TGA	2	6	174458	174463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261854798
3093	NC_013422	TCA	2	6	174474	174479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261854798
3094	NC_013422	G	6	6	174516	174521	0 %	0 %	100 %	0 %	261854798
3095	NC_013422	GC	3	6	174567	174572	0 %	0 %	50 %	50 %	261854798
3096	NC_013422	TTG	2	6	174599	174604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261854798
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3098	NC_013422	ACCA	2	8	174666	174673	50 %	0 %	0 %	50 %	261854798
3099	NC_013422	CAG	2	6	174691	174696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261854798
3100	NC_013422	TTC	2	6	174845	174850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261854798
3101	NC_013422	TCA	2	6	174890	174895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261854798
3102	NC_013422	GATG	2	8	174925	174932	25 %	25 %	50 %	0 %	261854798
3103	NC_013422	CTC	2	6	174973	174978	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261854799
3104	NC_013422	GCG	2	6	174996	175001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261854799
3105	NC_013422	CTC	2	6	175002	175007	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261854799
3106	NC_013422	TTTCG	2	10	175020	175029	0 %	60 %	20 %	20 %	261854799
3107	NC_013422	GGC	2	6	175052	175057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261854799
3108	NC_013422	GTG	2	6	175102	175107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261854799
3109	NC_013422	TTC	2	6	175128	175133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261854799
3110	NC_013422	TCG	2	6	175246	175251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854799
3111	NC_013422	GTC	2	6	175272	175277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854799
3112	NC_013422	TCG	2	6	175285	175290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854799
3113	NC_013422	ATCC	2	8	175311	175318	25 %	25 %	0 %	50 %	261854799
3114	NC_013422	TTC	2	6	175359	175364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261854799
3115	NC_013422	TCT	2	6	175420	175425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261854799
3116	NC_013422	CAC	2	6	175444	175449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261854799
3117	NC_013422	GAT	2	6	175493	175498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261854799
3118	NC_013422	A	7	7	175532	175538	100 %	0 %	0 %	0 %	261854799
3119	NC_013422	GAT	2	6	175540	175545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261854799
3120	NC_013422	A	6	6	175805	175810	100 %	0 %	0 %	0 %	261854800
3121	NC_013422	CTTG	2	8	175827	175834	0 %	50 %	25 %	25 %	261854800
3122	NC_013422	GC	3	6	175921	175926	0 %	0 %	50 %	50 %	261854800
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3244	NC_013422	GCC	2	6	182372	182377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261854807
3245	NC_013422	GCC	2	6	182390	182395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261854807
3246	NC_013422	ATGTCG	2	12	182397	182408	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	261854807
3247	NC_013422	GCC	2	6	182453	182458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261854807
3248	NC_013422	TTG	2	6	182627	182632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261854807
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3250	NC_013422	GAT	2	6	182656	182661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261854807
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3254	NC_013422	TCG	2	6	182932	182937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854808
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3257	NC_013422	CAG	2	6	183141	183146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261854808
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3329	NC_013422	CG	3	6	187333	187338	0 %	0 %	50 %	50 %	261854812
3330	NC_013422	GTG	2	6	187352	187357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261854812
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3354	NC_013422	TTTGC	2	10	188581	188590	0 %	60 %	20 %	20 %	261854813
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3359	NC_013422	CTG	2	6	188768	188773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854814
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3361	NC_013422	CACC	2	8	188812	188819	25 %	0 %	0 %	75 %	261854814
3362	NC_013422	CAT	2	6	188830	188835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261854814
3363	NC_013422	TTG	2	6	188853	188858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261854814
3364	NC_013422	ATC	2	6	188859	188864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261854814
3365	NC_013422	CGC	2	6	188871	188876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261854814
3366	NC_013422	CGC	2	6	188885	188890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261854814
3367	NC_013422	TGGC	2	8	188912	188919	0 %	25 %	50 %	25 %	261854814
3368	NC_013422	GCCC	2	8	188977	188984	0 %	0 %	25 %	75 %	261854814
3369	NC_013422	C	7	7	188982	188988	0 %	0 %	0 %	100 %	261854814
3370	NC_013422	TGT	2	6	189006	189011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261854814
3371	NC_013422	TGG	2	6	189012	189017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261854814
3372	NC_013422	CGATG	2	10	189082	189091	20 %	20 %	40 %	20 %	261854814
3373	NC_013422	TTG	2	6	189101	189106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261854814
3374	NC_013422	GTG	2	6	189149	189154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261854814
3375	NC_013422	GAC	2	6	189184	189189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261854814
3376	NC_013422	GCA	2	6	189285	189290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261854814
3377	NC_013422	TGG	2	6	189330	189335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261854814
3378	NC_013422	CGG	2	6	189358	189363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261854814
3379	NC_013422	TGA	2	6	189366	189371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261854814
3380	NC_013422	GCCC	2	8	189447	189454	0 %	0 %	25 %	75 %	261854814
3381	NC_013422	CGG	2	6	189496	189501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261854814
3382	NC_013422	AGCG	2	8	189514	189521	25 %	0 %	50 %	25 %	261854814
3383	NC_013422	GACC	2	8	189544	189551	25 %	0 %	25 %	50 %	261854814
3384	NC_013422	AGCG	2	8	189559	189566	25 %	0 %	50 %	25 %	261854814
3385	NC_013422	GCG	2	6	189595	189600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261854814
3386	NC_013422	TAT	2	6	189666	189671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261854814
3387	NC_013422	TGT	2	6	189701	189706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261854815
3388	NC_013422	AT	3	6	189719	189724	50 %	50 %	0 %	0 %	261854815
3389	NC_013422	ACG	2	6	189734	189739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261854815
3390	NC_013422	TG	3	6	189744	189749	0 %	50 %	50 %	0 %	261854815
3391	NC_013422	CTG	2	6	189808	189813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854815
3392	NC_013422	CTGGCG	2	12	189834	189845	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	261854815
3393	NC_013422	CG	4	8	189844	189851	0 %	0 %	50 %	50 %	261854815
3394	NC_013422	A	6	6	189854	189859	100 %	0 %	0 %	0 %	261854815
3395	NC_013422	GC	3	6	189903	189908	0 %	0 %	50 %	50 %	261854815
3396	NC_013422	GCT	2	6	189969	189974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854815
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3398	NC_013422	TGG	2	6	190067	190072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261854815
3399	NC_013422	CTG	2	6	190079	190084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854815
3400	NC_013422	CTG	2	6	190135	190140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854815
3401	NC_013422	TGA	2	6	190181	190186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261854815
3402	NC_013422	TGC	3	9	190208	190216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854815
3403	NC_013422	GCG	2	6	190340	190345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261854815
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3410	NC_013422	GCT	2	6	190794	190799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854815
3411	NC_013422	GCT	2	6	190828	190833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854815
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3413	NC_013422	GAT	2	6	190963	190968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261854815
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3424	NC_013422	CAC	2	6	191484	191489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261854815
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3435	NC_013422	CCT	2	6	192022	192027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261854816
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3437	NC_013422	CGTG	2	8	192119	192126	0 %	25 %	50 %	25 %	261854816
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3440	NC_013422	TGC	2	6	192364	192369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854816
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3443	NC_013422	CGC	2	6	192468	192473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261854816
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3445	NC_013422	GAT	2	6	192498	192503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261854816
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3448	NC_013422	GCCC	2	8	192674	192681	0 %	0 %	25 %	75 %	261854816
3449	NC_013422	TGG	3	9	192717	192725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261854816
3450	NC_013422	TTTTGC	2	12	192730	192741	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	261854816
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3452	NC_013422	ATG	2	6	192775	192780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261854816
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3454	NC_013422	CGC	2	6	192938	192943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261854816
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3463	NC_013422	ATTG	2	8	193414	193421	25 %	50 %	25 %	0 %	261854817
3464	NC_013422	CA	3	6	193430	193435	50 %	0 %	0 %	50 %	261854817
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3470	NC_013422	AGC	2	6	193629	193634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261854817
3471	NC_013422	GGT	2	6	193666	193671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261854817
3472	NC_013422	GT	3	6	193670	193675	0 %	50 %	50 %	0 %	261854817
3473	NC_013422	TCGGA	2	10	194206	194215	20 %	20 %	40 %	20 %	261854818
3474	NC_013422	GC	3	6	194252	194257	0 %	0 %	50 %	50 %	261854818
3475	NC_013422	CATGCC	2	12	194258	194269	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	261854818
3476	NC_013422	GAC	2	6	194317	194322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261854818
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3478	NC_013422	GGC	2	6	194633	194638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261854819
3479	NC_013422	T	6	6	194683	194688	0 %	100 %	0 %	0 %	261854819
3480	NC_013422	CAT	2	6	194696	194701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261854819
3481	NC_013422	TGC	2	6	194788	194793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854819
3482	NC_013422	GATC	2	8	194804	194811	25 %	25 %	25 %	25 %	261854819
3483	NC_013422	CG	3	6	194866	194871	0 %	0 %	50 %	50 %	261854819
3484	NC_013422	GCG	3	9	194869	194877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261854819
3485	NC_013422	GGC	2	6	194885	194890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261854819
3486	NC_013422	TGC	2	6	194902	194907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854819
3487	NC_013422	CATG	2	8	194930	194937	25 %	25 %	25 %	25 %	261854819
3488	NC_013422	CGA	2	6	194950	194955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261854819
3489	NC_013422	GGC	2	6	194966	194971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261854819
3490	NC_013422	ACC	2	6	194976	194981	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261854819
3491	NC_013422	GA	3	6	194983	194988	50 %	0 %	50 %	0 %	261854819
3492	NC_013422	GGC	2	6	195035	195040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261854819
3493	NC_013422	CGC	2	6	195074	195079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261854819
3494	NC_013422	GC	3	6	195078	195083	0 %	0 %	50 %	50 %	261854819
3495	NC_013422	AGC	2	6	195106	195111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261854819
3496	NC_013422	CATC	2	8	195125	195132	25 %	25 %	0 %	50 %	261854819
3497	NC_013422	GCT	2	6	195176	195181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854819
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3499	NC_013422	GC	3	6	195216	195221	0 %	0 %	50 %	50 %	261854819
3500	NC_013422	GTCG	2	8	195227	195234	0 %	25 %	50 %	25 %	261854819

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