MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halothiobacillus neapolitanus c2 chromosome

Total Repeats: 45067

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
34001	NC_013422	CGCAC	2	10	1961607	1961616	20 %	0 %	20 %	60 %	261856411
34002	NC_013422	TCA	2	6	1961797	1961802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856411
34003	NC_013422	ATCGC	2	10	1961806	1961815	20 %	20 %	20 %	40 %	261856411
34004	NC_013422	CGAC	2	8	1961828	1961835	25 %	0 %	25 %	50 %	261856411
34005	NC_013422	CGTAC	2	10	1961988	1961997	20 %	20 %	20 %	40 %	261856411
34006	NC_013422	CGAA	2	8	1962080	1962087	50 %	0 %	25 %	25 %	261856411
34007	NC_013422	GCA	2	6	1962101	1962106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856411
34008	NC_013422	TCG	2	6	1962128	1962133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856411
34009	NC_013422	GGC	2	6	1962163	1962168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856412
34010	NC_013422	TCA	2	6	1962176	1962181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856412
34011	NC_013422	T	7	7	1962298	1962304	0 %	100 %	0 %	0 %	261856412
34012	NC_013422	T	7	7	1962339	1962345	0 %	100 %	0 %	0 %	261856412
34013	NC_013422	TCAAT	2	10	1962353	1962362	40 %	40 %	0 %	20 %	261856412
34014	NC_013422	CGA	2	6	1962375	1962380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856412
34015	NC_013422	TCAT	2	8	1962598	1962605	25 %	50 %	0 %	25 %	261856413
34016	NC_013422	CTT	2	6	1962628	1962633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261856413
34017	NC_013422	ACCA	2	8	1962645	1962652	50 %	0 %	0 %	50 %	261856413
34018	NC_013422	TGC	2	6	1962653	1962658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856413
34019	NC_013422	GC	3	6	1962666	1962671	0 %	0 %	50 %	50 %	261856413
34020	NC_013422	CGG	2	6	1962701	1962706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856413
34021	NC_013422	CGG	2	6	1962712	1962717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856413
34022	NC_013422	AAT	2	6	1962725	1962730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261856413
34023	NC_013422	TCA	2	6	1962750	1962755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856413
34024	NC_013422	T	6	6	1962787	1962792	0 %	100 %	0 %	0 %	261856413
34025	NC_013422	CCG	2	6	1962795	1962800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856413
34026	NC_013422	CAG	2	6	1962839	1962844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856413
34027	NC_013422	GC	3	6	1962860	1962865	0 %	0 %	50 %	50 %	261856413
34028	NC_013422	CGG	2	6	1962885	1962890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856413
34029	NC_013422	T	6	6	1962926	1962931	0 %	100 %	0 %	0 %	261856413
34030	NC_013422	GC	3	6	1962932	1962937	0 %	0 %	50 %	50 %	261856413
34031	NC_013422	ACCG	2	8	1962979	1962986	25 %	0 %	25 %	50 %	261856413
34032	NC_013422	TCAGC	2	10	1963051	1963060	20 %	20 %	20 %	40 %	261856413
34033	NC_013422	CCA	2	6	1963087	1963092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856413
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34035	NC_013422	ATC	2	6	1963221	1963226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856413
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34038	NC_013422	A	6	6	1963400	1963405	100 %	0 %	0 %	0 %	261856414
34039	NC_013422	ACC	2	6	1963425	1963430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856414
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34041	NC_013422	TTGG	2	8	1963685	1963692	0 %	50 %	50 %	0 %	261856415
34042	NC_013422	CGTT	2	8	1963707	1963714	0 %	50 %	25 %	25 %	261856415
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34049	NC_013422	CGC	3	9	1963987	1963995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856415
34050	NC_013422	GCA	2	6	1964023	1964028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856415
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34053	NC_013422	ATTG	2	8	1964215	1964222	25 %	50 %	25 %	0 %	261856416
34054	NC_013422	GGT	2	6	1964226	1964231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261856416
34055	NC_013422	CAT	2	6	1964265	1964270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856416
34056	NC_013422	AAACG	2	10	1964278	1964287	60 %	0 %	20 %	20 %	261856416
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34059	NC_013422	CGT	2	6	1964456	1964461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856416
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34061	NC_013422	TGC	2	6	1964506	1964511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856416
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34064	NC_013422	GAT	2	6	1964634	1964639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856416
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34066	NC_013422	ATGCA	2	10	1964691	1964700	40 %	20 %	20 %	20 %	261856416
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34088	NC_013422	GCG	2	6	1965682	1965687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856417
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34102	NC_013422	CAG	2	6	1966177	1966182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856417
34103	NC_013422	TTG	2	6	1966192	1966197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261856417
34104	NC_013422	GAA	2	6	1966231	1966236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261856417
34105	NC_013422	CAT	2	6	1966285	1966290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856417
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34107	NC_013422	A	6	6	1966356	1966361	100 %	0 %	0 %	0 %	261856418
34108	NC_013422	AAG	2	6	1966401	1966406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261856418
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34110	NC_013422	T	6	6	1966458	1966463	0 %	100 %	0 %	0 %	261856418
34111	NC_013422	GCCA	2	8	1966504	1966511	25 %	0 %	25 %	50 %	261856418
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34115	NC_013422	TC	3	6	1966730	1966735	0 %	50 %	0 %	50 %	261856418
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34117	NC_013422	CAT	2	6	1966792	1966797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856418
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34224	NC_013422	TGA	2	6	1972324	1972329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856423
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34229	NC_013422	A	6	6	1972646	1972651	100 %	0 %	0 %	0 %	261856423
34230	NC_013422	ATCG	2	8	1972661	1972668	25 %	25 %	25 %	25 %	261856423
34231	NC_013422	CAC	2	6	1972695	1972700	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856423
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34351	NC_013422	AGTG	2	8	1981298	1981305	25 %	25 %	50 %	0 %	261856431
34352	NC_013422	CCG	2	6	1981335	1981340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856431
34353	NC_013422	A	6	6	1981408	1981413	100 %	0 %	0 %	0 %	261856431
34354	NC_013422	AGCCA	2	10	1981503	1981512	40 %	0 %	20 %	40 %	261856431
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34356	NC_013422	GAC	2	6	1981605	1981610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856431
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34358	NC_013422	TCA	2	6	1981654	1981659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856431
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34439	NC_013422	ATC	2	6	1985795	1985800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856435
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34449	NC_013422	A	6	6	1986220	1986225	100 %	0 %	0 %	0 %	261856437
34450	NC_013422	GCG	2	6	1986254	1986259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856437
34451	NC_013422	CG	4	8	1986258	1986265	0 %	0 %	50 %	50 %	261856437
34452	NC_013422	TCAA	2	8	1986274	1986281	50 %	25 %	0 %	25 %	261856437
34453	NC_013422	ACC	2	6	1986331	1986336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856437
34454	NC_013422	AAT	2	6	1986362	1986367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261856437
34455	NC_013422	TGT	2	6	1986387	1986392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261856437
34456	NC_013422	CTG	2	6	1986444	1986449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856437
34457	NC_013422	GT	4	8	1986494	1986501	0 %	50 %	50 %	0 %	261856437
34458	NC_013422	AC	3	6	1986509	1986514	50 %	0 %	0 %	50 %	261856437
34459	NC_013422	CGG	2	6	1986521	1986526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856437
34460	NC_013422	ACCC	2	8	1986551	1986558	25 %	0 %	0 %	75 %	261856437
34461	NC_013422	GGA	2	6	1986571	1986576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261856437
34462	NC_013422	ACG	2	6	1986630	1986635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856437
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34464	NC_013422	GCG	2	6	1986806	1986811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856437
34465	NC_013422	TCCA	2	8	1986909	1986916	25 %	25 %	0 %	50 %	261856437
34466	NC_013422	TGCC	2	8	1986987	1986994	0 %	25 %	25 %	50 %	261856437
34467	NC_013422	GC	3	6	1987000	1987005	0 %	0 %	50 %	50 %	261856437
34468	NC_013422	TGC	2	6	1987021	1987026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856437
34469	NC_013422	GCG	3	9	1987039	1987047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856437
34470	NC_013422	GCGGGC	2	12	1987056	1987067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856437
34471	NC_013422	TGC	2	6	1987192	1987197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856437
34472	NC_013422	TGC	2	6	1987240	1987245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856437
34473	NC_013422	GCCG	2	8	1987259	1987266	0 %	0 %	50 %	50 %	261856437
34474	NC_013422	GGC	2	6	1987289	1987294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856437
34475	NC_013422	GCT	2	6	1987532	1987537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856438
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34477	NC_013422	ATC	2	6	1987677	1987682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856438
34478	NC_013422	TTG	2	6	1987699	1987704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261856438
34479	NC_013422	GTT	2	6	1987762	1987767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261856438
34480	NC_013422	GCG	2	6	1987789	1987794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856438
34481	NC_013422	GCA	2	6	1987796	1987801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856438
34482	NC_013422	GA	3	6	1987933	1987938	50 %	0 %	50 %	0 %	261856438
34483	NC_013422	TCAT	2	8	1987945	1987952	25 %	50 %	0 %	25 %	261856438
34484	NC_013422	TGCC	2	8	1988001	1988008	0 %	25 %	25 %	50 %	261856438
34485	NC_013422	GAACC	2	10	1988015	1988024	40 %	0 %	20 %	40 %	261856438
34486	NC_013422	GTT	2	6	1988081	1988086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261856438
34487	NC_013422	CGG	2	6	1988319	1988324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856438
34488	NC_013422	GGCG	2	8	1988360	1988367	0 %	0 %	75 %	25 %	261856438
34489	NC_013422	GGTT	2	8	1988375	1988382	0 %	50 %	50 %	0 %	261856438
34490	NC_013422	GAC	2	6	1988640	1988645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856438
34491	NC_013422	CCG	2	6	1988702	1988707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856438
34492	NC_013422	CCA	2	6	1988713	1988718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856438
34493	NC_013422	GT	4	8	1988743	1988750	0 %	50 %	50 %	0 %	261856438
34494	NC_013422	CATC	2	8	1988888	1988895	25 %	25 %	0 %	50 %	261856438
34495	NC_013422	GA	3	6	1988899	1988904	50 %	0 %	50 %	0 %	261856438
34496	NC_013422	GTTGT	2	10	1988985	1988994	0 %	60 %	40 %	0 %	261856438
34497	NC_013422	CAC	2	6	1989003	1989008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856438
34498	NC_013422	TGC	2	6	1989071	1989076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856438
34499	NC_013422	GACG	2	8	1989080	1989087	25 %	0 %	50 %	25 %	261856438
34500	NC_013422	CAC	2	6	1989173	1989178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856438

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