MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halothiobacillus neapolitanus c2 chromosome

Total Repeats: 45067

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
33001	NC_013422	CT	3	6	1906134	1906139	0 %	50 %	0 %	50 %	261856357
33002	NC_013422	GCA	2	6	1906141	1906146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856357
33003	NC_013422	TTG	2	6	1906245	1906250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261856357
33004	NC_013422	CGG	2	6	1906262	1906267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856357
33005	NC_013422	GAC	2	6	1906271	1906276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856357
33006	NC_013422	CGG	2	6	1906301	1906306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856357
33007	NC_013422	CGA	2	6	1906333	1906338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856357
33008	NC_013422	TGC	2	6	1906547	1906552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856358
33009	NC_013422	GC	3	6	1906593	1906598	0 %	0 %	50 %	50 %	261856358
33010	NC_013422	CGG	2	6	1906647	1906652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856358
33011	NC_013422	GATC	2	8	1906671	1906678	25 %	25 %	25 %	25 %	261856358
33012	NC_013422	TGAT	2	8	1906746	1906753	25 %	50 %	25 %	0 %	261856358
33013	NC_013422	GC	3	6	1906755	1906760	0 %	0 %	50 %	50 %	261856358
33014	NC_013422	GAC	2	6	1906807	1906812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856358
33015	NC_013422	GCA	2	6	1906875	1906880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856358
33016	NC_013422	TGG	2	6	1906926	1906931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261856358
33017	NC_013422	CCA	2	6	1906968	1906973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856358
33018	NC_013422	GTG	2	6	1907099	1907104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261856358
33019	NC_013422	GTT	2	6	1907119	1907124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261856358
33020	NC_013422	CTG	2	6	1907146	1907151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856358
33021	NC_013422	GTC	2	6	1907189	1907194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856358
33022	NC_013422	AAT	2	6	1907220	1907225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261856359
33023	NC_013422	GCC	2	6	1907232	1907237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856359
33024	NC_013422	ATC	2	6	1907262	1907267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856359
33025	NC_013422	GGC	2	6	1907287	1907292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856359
33026	NC_013422	ATC	2	6	1907301	1907306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856359
33027	NC_013422	TGC	2	6	1907335	1907340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856359
33028	NC_013422	CGC	2	6	1907350	1907355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856359
33029	NC_013422	CGAT	2	8	1907469	1907476	25 %	25 %	25 %	25 %	261856359
33030	NC_013422	CGC	2	6	1907497	1907502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856359
33031	NC_013422	GAT	2	6	1907510	1907515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856359
33032	NC_013422	CTTG	2	8	1907546	1907553	0 %	50 %	25 %	25 %	261856359
33033	NC_013422	CGG	2	6	1907555	1907560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856359
33034	NC_013422	CGC	2	6	1907641	1907646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856359
33035	NC_013422	TCA	2	6	1907734	1907739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856359
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33038	NC_013422	TGTC	2	8	1908395	1908402	0 %	50 %	25 %	25 %	261856360
33039	NC_013422	GCC	2	6	1908495	1908500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856360
33040	NC_013422	GC	3	6	1908545	1908550	0 %	0 %	50 %	50 %	261856360
33041	NC_013422	ATT	2	6	1908576	1908581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261856360
33042	NC_013422	CCA	2	6	1908626	1908631	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856360
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33045	NC_013422	GGC	2	6	1908828	1908833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856360
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33047	NC_013422	TAA	2	6	1908976	1908981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261856360
33048	NC_013422	TGC	2	6	1909021	1909026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856360
33049	NC_013422	CGT	2	6	1909068	1909073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856360
33050	NC_013422	GGCA	2	8	1909107	1909114	25 %	0 %	50 %	25 %	261856360
33051	NC_013422	GTG	2	6	1909138	1909143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261856360
33052	NC_013422	AAG	2	6	1909348	1909353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261856360
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33054	NC_013422	CTG	2	6	1909416	1909421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856360
33055	NC_013422	GCCCT	2	10	1909443	1909452	0 %	20 %	20 %	60 %	261856360
33056	NC_013422	TTGGCG	2	12	1909534	1909545	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	261856360
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33058	NC_013422	GCT	2	6	1909742	1909747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856361
33059	NC_013422	TGA	2	6	1909765	1909770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856361
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33061	NC_013422	TCCCA	2	10	1909873	1909882	20 %	20 %	0 %	60 %	261856361
33062	NC_013422	GTCG	2	8	1909890	1909897	0 %	25 %	50 %	25 %	261856361
33063	NC_013422	CGATAC	2	12	1909958	1909969	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	261856361
33064	NC_013422	TCG	2	6	1910020	1910025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856361
33065	NC_013422	GCA	2	6	1910034	1910039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856361
33066	NC_013422	GCC	2	6	1910079	1910084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856361
33067	NC_013422	CTGC	2	8	1910101	1910108	0 %	25 %	25 %	50 %	261856361
33068	NC_013422	CGT	2	6	1910150	1910155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856361
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33073	NC_013422	GTTG	2	8	1910381	1910388	0 %	50 %	50 %	0 %	261856361
33074	NC_013422	CAT	2	6	1910468	1910473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856362
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33077	NC_013422	CACC	2	8	1910641	1910648	25 %	0 %	0 %	75 %	261856362
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33081	NC_013422	GCGCCA	2	12	1911047	1911058	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	261856363
33082	NC_013422	CCG	2	6	1911068	1911073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856363
33083	NC_013422	TCA	2	6	1911230	1911235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856363
33084	NC_013422	ACAT	2	8	1911384	1911391	50 %	25 %	0 %	25 %	261856364
33085	NC_013422	TC	3	6	1911468	1911473	0 %	50 %	0 %	50 %	261856364
33086	NC_013422	GGT	2	6	1911515	1911520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261856364
33087	NC_013422	GTGC	2	8	1911524	1911531	0 %	25 %	50 %	25 %	261856364
33088	NC_013422	TTC	2	6	1911573	1911578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261856364
33089	NC_013422	CAA	2	6	1911583	1911588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261856364
33090	NC_013422	GGTC	2	8	1911625	1911632	0 %	25 %	50 %	25 %	261856364
33091	NC_013422	TGA	2	6	1911675	1911680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856364
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33098	NC_013422	CAT	2	6	1911994	1911999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856364
33099	NC_013422	CG	3	6	1912007	1912012	0 %	0 %	50 %	50 %	261856364
33100	NC_013422	TCG	2	6	1912017	1912022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856364
33101	NC_013422	GC	3	6	1912035	1912040	0 %	0 %	50 %	50 %	261856364
33102	NC_013422	CTG	2	6	1912196	1912201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856364
33103	NC_013422	CTA	2	6	1912210	1912215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856364
33104	NC_013422	ACC	2	6	1912238	1912243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856364
33105	NC_013422	GCT	2	6	1912246	1912251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856364
33106	NC_013422	TGG	2	6	1912284	1912289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261856364
33107	NC_013422	CGA	2	6	1912291	1912296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856364
33108	NC_013422	CAC	2	6	1912360	1912365	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856364
33109	NC_013422	ACG	2	6	1912383	1912388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856364
33110	NC_013422	CA	3	6	1912477	1912482	50 %	0 %	0 %	50 %	261856364
33111	NC_013422	ATC	2	6	1912508	1912513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856364
33112	NC_013422	ATC	2	6	1912571	1912576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856364
33113	NC_013422	CG	3	6	1912595	1912600	0 %	0 %	50 %	50 %	261856364
33114	NC_013422	GAAC	2	8	1912627	1912634	50 %	0 %	25 %	25 %	261856364
33115	NC_013422	GC	4	8	1912654	1912661	0 %	0 %	50 %	50 %	261856365
33116	NC_013422	GCG	2	6	1912694	1912699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856365
33117	NC_013422	ACC	2	6	1912834	1912839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856365
33118	NC_013422	GA	3	6	1912872	1912877	50 %	0 %	50 %	0 %	261856365
33119	NC_013422	AAC	2	6	1912878	1912883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261856365
33120	NC_013422	GGC	2	6	1912915	1912920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856365
33121	NC_013422	GGC	2	6	1912948	1912953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856365
33122	NC_013422	TGC	2	6	1912982	1912987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856365
33123	NC_013422	GC	3	6	1913064	1913069	0 %	0 %	50 %	50 %	261856365
33124	NC_013422	TGA	2	6	1913117	1913122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856365
33125	NC_013422	TGG	2	6	1913180	1913185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261856365
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33130	NC_013422	CG	3	6	1913348	1913353	0 %	0 %	50 %	50 %	261856365
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33143	NC_013422	TGC	2	6	1914091	1914096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856366
33144	NC_013422	TTC	2	6	1914097	1914102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261856366
33145	NC_013422	TTC	2	6	1914124	1914129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261856366
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33150	NC_013422	CCTG	2	8	1914420	1914427	0 %	25 %	25 %	50 %	261856367
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33173	NC_013422	CAT	2	6	1916177	1916182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856369
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33178	NC_013422	TGA	2	6	1916395	1916400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856370
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33204	NC_013422	CG	3	6	1917536	1917541	0 %	0 %	50 %	50 %	261856371
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33215	NC_013422	CGG	2	6	1918037	1918042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856371
33216	NC_013422	TGG	2	6	1918092	1918097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261856371
33217	NC_013422	TTG	2	6	1918119	1918124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261856372
33218	NC_013422	GTT	2	6	1918139	1918144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261856372
33219	NC_013422	TCGCG	2	10	1918177	1918186	0 %	20 %	40 %	40 %	261856372
33220	NC_013422	GCGGG	2	10	1918250	1918259	0 %	0 %	80 %	20 %	261856372
33221	NC_013422	GCGCT	2	10	1918292	1918301	0 %	20 %	40 %	40 %	261856372
33222	NC_013422	TCG	2	6	1918306	1918311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856372
33223	NC_013422	GCT	2	6	1918330	1918335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856372
33224	NC_013422	TCCCGC	2	12	1918444	1918455	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	261856372
33225	NC_013422	ATA	2	6	1918482	1918487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261856372
33226	NC_013422	CTG	2	6	1918605	1918610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856372
33227	NC_013422	CAA	2	6	1918614	1918619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261856372
33228	NC_013422	CGG	2	6	1918622	1918627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856372
33229	NC_013422	GCG	2	6	1918667	1918672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856372
33230	NC_013422	CGG	2	6	1918679	1918684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856372
33231	NC_013422	CAA	2	6	1918707	1918712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261856372
33232	NC_013422	TGG	2	6	1918718	1918723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261856372
33233	NC_013422	ATGCA	2	10	1918749	1918758	40 %	20 %	20 %	20 %	261856372
33234	NC_013422	CAT	2	6	1918764	1918769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856372
33235	NC_013422	CCGC	2	8	1918810	1918817	0 %	0 %	25 %	75 %	261856372
33236	NC_013422	CCA	2	6	1918823	1918828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856372
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33238	NC_013422	CAAA	2	8	1918968	1918975	75 %	0 %	0 %	25 %	261856372
33239	NC_013422	CG	3	6	1919003	1919008	0 %	0 %	50 %	50 %	261856372
33240	NC_013422	CGC	2	6	1919048	1919053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856372
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33263	NC_013422	AGAT	2	8	1920625	1920632	50 %	25 %	25 %	0 %	261856374
33264	NC_013422	GCA	2	6	1920647	1920652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856374
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33331	NC_013422	GCATCG	2	12	1924296	1924307	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	261856377
33332	NC_013422	GGT	2	6	1924454	1924459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261856377
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33335	NC_013422	CGC	2	6	1924594	1924599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856377
33336	NC_013422	CTTCGG	2	12	1924663	1924674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856377
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33339	NC_013422	GCC	2	6	1924797	1924802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856377
33340	NC_013422	CA	3	6	1924868	1924873	50 %	0 %	0 %	50 %	261856377
33341	NC_013422	CG	3	6	1924913	1924918	0 %	0 %	50 %	50 %	261856377
33342	NC_013422	CCA	2	6	1924993	1924998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856377
33343	NC_013422	CGG	2	6	1925120	1925125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856377
33344	NC_013422	GAT	2	6	1925173	1925178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856377
33345	NC_013422	CGAC	2	8	1925278	1925285	25 %	0 %	25 %	50 %	261856377
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33347	NC_013422	GT	3	6	1925395	1925400	0 %	50 %	50 %	0 %	261856377
33348	NC_013422	AGT	2	6	1925472	1925477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856377
33349	NC_013422	TGC	2	6	1925533	1925538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856378
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33464	NC_013422	GTG	2	6	1930465	1930470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261856382
33465	NC_013422	TG	3	6	1930479	1930484	0 %	50 %	50 %	0 %	261856382
33466	NC_013422	AGT	2	6	1930594	1930599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856382
33467	NC_013422	T	7	7	1930612	1930618	0 %	100 %	0 %	0 %	261856382
33468	NC_013422	TCA	2	6	1930656	1930661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856383
33469	NC_013422	CTG	2	6	1930664	1930669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856383
33470	NC_013422	CAC	2	6	1930862	1930867	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856383
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33472	NC_013422	GAT	2	6	1931063	1931068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856383
33473	NC_013422	ATG	2	6	1931070	1931075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856383
33474	NC_013422	A	6	6	1931126	1931131	100 %	0 %	0 %	0 %	261856383
33475	NC_013422	CGC	2	6	1931149	1931154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856383
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33486	NC_013422	GCT	2	6	1931834	1931839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856384
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33490	NC_013422	CGGT	2	8	1932146	1932153	0 %	25 %	50 %	25 %	261856384
33491	NC_013422	AAG	2	6	1932156	1932161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261856384
33492	NC_013422	TAGT	2	8	1932266	1932273	25 %	50 %	25 %	0 %	261856384
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33494	NC_013422	AAC	2	6	1932310	1932315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261856384
33495	NC_013422	CAT	2	6	1932394	1932399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856384
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33497	NC_013422	TCA	2	6	1932539	1932544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856384
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33499	NC_013422	AACC	2	8	1932597	1932604	50 %	0 %	0 %	50 %	261856384
33500	NC_013422	ATG	2	6	1932678	1932683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856384

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