MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halothiobacillus neapolitanus c2 chromosome

Total Repeats: 45067

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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32511	NC_013422	CGCTG	2	10	1879757	1879766	0 %	20 %	40 %	40 %	261856337
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32618	NC_013422	CCAGC	2	10	1885777	1885786	20 %	0 %	20 %	60 %	261856341
32619	NC_013422	GC	3	6	1885785	1885790	0 %	0 %	50 %	50 %	261856341
32620	NC_013422	CCG	2	6	1885791	1885796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856341
32621	NC_013422	TGT	2	6	1885803	1885808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261856341
32622	NC_013422	AGAAC	2	10	1885809	1885818	60 %	0 %	20 %	20 %	261856341
32623	NC_013422	GCG	2	6	1885830	1885835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856341
32624	NC_013422	CAG	2	6	1885873	1885878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856341
32625	NC_013422	GC	4	8	1885939	1885946	0 %	0 %	50 %	50 %	261856341
32626	NC_013422	TCT	2	6	1885953	1885958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261856341
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32631	NC_013422	GCCA	2	8	1886081	1886088	25 %	0 %	25 %	50 %	261856341
32632	NC_013422	CATCAG	2	12	1886128	1886139	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	261856341
32633	NC_013422	CGCC	2	8	1886175	1886182	0 %	0 %	25 %	75 %	261856341
32634	NC_013422	CAT	2	6	1886203	1886208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856341
32635	NC_013422	GCG	2	6	1886265	1886270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856341
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32638	NC_013422	TCA	2	6	1886379	1886384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856341
32639	NC_013422	AGC	3	9	1886414	1886422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856341
32640	NC_013422	GAT	2	6	1886448	1886453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856341
32641	NC_013422	GTAC	2	8	1886471	1886478	25 %	25 %	25 %	25 %	261856341
32642	NC_013422	GGA	2	6	1886497	1886502	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261856341
32643	NC_013422	CCG	2	6	1886696	1886701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856342
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32645	NC_013422	GGC	2	6	1886827	1886832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856342
32646	NC_013422	TCA	2	6	1886921	1886926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856342
32647	NC_013422	GC	3	6	1886930	1886935	0 %	0 %	50 %	50 %	261856342
32648	NC_013422	GC	3	6	1887031	1887036	0 %	0 %	50 %	50 %	261856342
32649	NC_013422	CAAG	2	8	1887081	1887088	50 %	0 %	25 %	25 %	261856342
32650	NC_013422	AAT	2	6	1887106	1887111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261856342
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32652	NC_013422	ATC	2	6	1887178	1887183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856342
32653	NC_013422	GC	3	6	1887292	1887297	0 %	0 %	50 %	50 %	261856342
32654	NC_013422	CGA	2	6	1887306	1887311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856342
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32671	NC_013422	CTTC	2	8	1888200	1888207	0 %	50 %	0 %	50 %	261856343
32672	NC_013422	GCA	2	6	1888364	1888369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856343
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32690	NC_013422	CAGGT	2	10	1889176	1889185	20 %	20 %	40 %	20 %	261856343
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32692	NC_013422	GTG	2	6	1889274	1889279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261856343
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32695	NC_013422	CGA	2	6	1889397	1889402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856343
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32699	NC_013422	TGC	2	6	1889513	1889518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856343
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32702	NC_013422	GAC	2	6	1889686	1889691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856343
32703	NC_013422	GCT	2	6	1889738	1889743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856343
32704	NC_013422	TGC	2	6	1889790	1889795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856343
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32708	NC_013422	TCG	2	6	1890017	1890022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856343
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32713	NC_013422	CGCC	2	8	1890303	1890310	0 %	0 %	25 %	75 %	261856343
32714	NC_013422	GTT	2	6	1890316	1890321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261856343
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32717	NC_013422	GAT	2	6	1890412	1890417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856343
32718	NC_013422	CTT	2	6	1890426	1890431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261856343
32719	NC_013422	TGA	2	6	1890444	1890449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856343
32720	NC_013422	A	6	6	1890515	1890520	100 %	0 %	0 %	0 %	261856343
32721	NC_013422	T	6	6	1890604	1890609	0 %	100 %	0 %	0 %	261856343
32722	NC_013422	CGA	2	6	1890660	1890665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856343
32723	NC_013422	GAAT	2	8	1891310	1891317	50 %	25 %	25 %	0 %	261856344
32724	NC_013422	AC	3	6	1891318	1891323	50 %	0 %	0 %	50 %	261856344
32725	NC_013422	CTG	2	6	1891420	1891425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856344
32726	NC_013422	CCA	2	6	1891561	1891566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856344
32727	NC_013422	CGG	2	6	1891595	1891600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856344
32728	NC_013422	ACGAAG	2	12	1891649	1891660	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	261856344
32729	NC_013422	CTG	2	6	1891663	1891668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856344
32730	NC_013422	CAA	2	6	1891674	1891679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261856344
32731	NC_013422	CTG	2	6	1891682	1891687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856344
32732	NC_013422	CGG	2	6	1891701	1891706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856344
32733	NC_013422	AC	3	6	1891746	1891751	50 %	0 %	0 %	50 %	261856344
32734	NC_013422	CCGG	2	8	1891860	1891867	0 %	0 %	50 %	50 %	261856344
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32840	NC_013422	GGC	2	6	1896654	1896659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856348
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32844	NC_013422	CGCC	2	8	1897278	1897285	0 %	0 %	25 %	75 %	261856350
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32847	NC_013422	AG	3	6	1897345	1897350	50 %	0 %	50 %	0 %	261856350
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32849	NC_013422	TGCG	2	8	1897503	1897510	0 %	25 %	50 %	25 %	261856350
32850	NC_013422	GCA	2	6	1897586	1897591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856350
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32965	NC_013422	GCG	2	6	1904206	1904211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856355
32966	NC_013422	TCA	2	6	1904230	1904235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856355
32967	NC_013422	CG	3	6	1904287	1904292	0 %	0 %	50 %	50 %	261856355
32968	NC_013422	GCT	2	6	1904345	1904350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856355
32969	NC_013422	TGAT	2	8	1904364	1904371	25 %	50 %	25 %	0 %	261856355
32970	NC_013422	ATC	2	6	1904552	1904557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856356
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32972	NC_013422	TCT	2	6	1904710	1904715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261856356
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32981	NC_013422	TCA	2	6	1905284	1905289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856356
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32993	NC_013422	GCCA	2	8	1905726	1905733	25 %	0 %	25 %	50 %	261856357
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32996	NC_013422	AG	3	6	1905803	1905808	50 %	0 %	50 %	0 %	261856357
32997	NC_013422	CG	3	6	1905933	1905938	0 %	0 %	50 %	50 %	261856357
32998	NC_013422	TTGG	2	8	1906001	1906008	0 %	50 %	50 %	0 %	261856357
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