MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halothiobacillus neapolitanus c2 chromosome

Total Repeats: 45067

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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32002	NC_013422	CGGT	2	8	1852960	1852967	0 %	25 %	50 %	25 %	261856312
32003	NC_013422	CGT	2	6	1853039	1853044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856312
32004	NC_013422	ATG	2	6	1853056	1853061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856312
32005	NC_013422	CAC	2	6	1853069	1853074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856312
32006	NC_013422	AAT	2	6	1853172	1853177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261856312
32007	NC_013422	TCACT	2	10	1853201	1853210	20 %	40 %	0 %	40 %	261856312
32008	NC_013422	GTC	2	6	1853306	1853311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856313
32009	NC_013422	TTG	2	6	1853363	1853368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261856313
32010	NC_013422	CCTGG	2	10	1853591	1853600	0 %	20 %	40 %	40 %	261856314
32011	NC_013422	AGGC	2	8	1853613	1853620	25 %	0 %	50 %	25 %	261856314
32012	NC_013422	TGC	2	6	1853626	1853631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856314
32013	NC_013422	TCA	2	6	1853654	1853659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856314
32014	NC_013422	TGA	2	6	1853713	1853718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856314
32015	NC_013422	TCC	2	6	1853719	1853724	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261856314
32016	NC_013422	ACGCA	2	10	1853757	1853766	40 %	0 %	20 %	40 %	261856314
32017	NC_013422	GAA	2	6	1853769	1853774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261856314
32018	NC_013422	CGA	2	6	1853804	1853809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856314
32019	NC_013422	ATC	2	6	1853910	1853915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856314
32020	NC_013422	GGCA	2	8	1853992	1853999	25 %	0 %	50 %	25 %	261856314
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32022	NC_013422	TGC	2	6	1854067	1854072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856314
32023	NC_013422	TCA	2	6	1854079	1854084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856314
32024	NC_013422	GC	3	6	1854115	1854120	0 %	0 %	50 %	50 %	261856314
32025	NC_013422	GCC	2	6	1854130	1854135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856314
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32028	NC_013422	TCG	2	6	1854196	1854201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856314
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32031	NC_013422	GC	5	10	1854308	1854317	0 %	0 %	50 %	50 %	261856314
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32042	NC_013422	CAGAAT	2	12	1854795	1854806	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	261856315
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32044	NC_013422	GC	3	6	1854952	1854957	0 %	0 %	50 %	50 %	261856315
32045	NC_013422	GGC	2	6	1855002	1855007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856315
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32049	NC_013422	AG	3	6	1855216	1855221	50 %	0 %	50 %	0 %	261856315
32050	NC_013422	GACC	2	8	1855268	1855275	25 %	0 %	25 %	50 %	261856315
32051	NC_013422	CGCC	2	8	1855370	1855377	0 %	0 %	25 %	75 %	261856315
32052	NC_013422	GCA	2	6	1855391	1855396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856315
32053	NC_013422	GTC	2	6	1855501	1855506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856315
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32067	NC_013422	GCCAT	2	10	1856047	1856056	20 %	20 %	20 %	40 %	261856315
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32082	NC_013422	TTCAT	2	10	1856418	1856427	20 %	60 %	0 %	20 %	261856316
32083	NC_013422	TTCAT	2	10	1856430	1856439	20 %	60 %	0 %	20 %	261856316
32084	NC_013422	TTCAT	2	10	1856442	1856451	20 %	60 %	0 %	20 %	261856316
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32100	NC_013422	AGGC	2	8	1856995	1857002	25 %	0 %	50 %	25 %	261856318
32101	NC_013422	ATG	2	6	1857012	1857017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856318
32102	NC_013422	CGT	2	6	1857026	1857031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856318
32103	NC_013422	C	6	6	1857050	1857055	0 %	0 %	0 %	100 %	261856318
32104	NC_013422	GCA	2	6	1857081	1857086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856318
32105	NC_013422	GAT	2	6	1857119	1857124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856318
32106	NC_013422	GAC	2	6	1857217	1857222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856318
32107	NC_013422	GC	3	6	1857308	1857313	0 %	0 %	50 %	50 %	261856318
32108	NC_013422	AAT	2	6	1857458	1857463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261856318
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32114	NC_013422	ACC	2	6	1857796	1857801	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856319
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32116	NC_013422	TCT	2	6	1857914	1857919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261856319
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32220	NC_013422	TTGA	2	8	1864938	1864945	25 %	50 %	25 %	0 %	261856322
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32229	NC_013422	CTG	2	6	1865409	1865414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856322
32230	NC_013422	AATG	2	8	1865415	1865422	50 %	25 %	25 %	0 %	261856322
32231	NC_013422	AC	3	6	1865498	1865503	50 %	0 %	0 %	50 %	261856322
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32233	NC_013422	ACA	2	6	1865627	1865632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261856322
32234	NC_013422	CTT	2	6	1865642	1865647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261856322
32235	NC_013422	ACG	2	6	1865674	1865679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856322
32236	NC_013422	AG	3	6	1865769	1865774	50 %	0 %	50 %	0 %	261856322
32237	NC_013422	TCC	2	6	1866001	1866006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261856323
32238	NC_013422	CGAT	2	8	1866016	1866023	25 %	25 %	25 %	25 %	261856323
32239	NC_013422	GAT	2	6	1866031	1866036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856323
32240	NC_013422	CG	3	6	1866185	1866190	0 %	0 %	50 %	50 %	261856323
32241	NC_013422	CA	3	6	1866233	1866238	50 %	0 %	0 %	50 %	261856323
32242	NC_013422	GC	3	6	1866246	1866251	0 %	0 %	50 %	50 %	261856323
32243	NC_013422	GC	3	6	1866266	1866271	0 %	0 %	50 %	50 %	261856323
32244	NC_013422	ATG	3	9	1866334	1866342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856323
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32246	NC_013422	TTC	2	6	1866414	1866419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261856323
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32250	NC_013422	CG	3	6	1866659	1866664	0 %	0 %	50 %	50 %	261856323
32251	NC_013422	GCA	2	6	1866797	1866802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856323
32252	NC_013422	CAG	2	6	1866845	1866850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856323
32253	NC_013422	TCGA	2	8	1866895	1866902	25 %	25 %	25 %	25 %	261856323
32254	NC_013422	GTC	2	6	1867033	1867038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856323
32255	NC_013422	GGCG	2	8	1867040	1867047	0 %	0 %	75 %	25 %	261856323
32256	NC_013422	GCA	2	6	1867103	1867108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856323
32257	NC_013422	ATC	2	6	1867117	1867122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856323
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32261	NC_013422	CGA	2	6	1867274	1867279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856323
32262	NC_013422	CG	3	6	1867283	1867288	0 %	0 %	50 %	50 %	261856323
32263	NC_013422	TGA	2	6	1867367	1867372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856323
32264	NC_013422	TTC	2	6	1867377	1867382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261856323
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32272	NC_013422	TCA	2	6	1867761	1867766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856324
32273	NC_013422	TGG	2	6	1867791	1867796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261856324
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32340	NC_013422	GGC	2	6	1870862	1870867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856328
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32345	NC_013422	CCG	2	6	1870930	1870935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856328
32346	NC_013422	GC	4	8	1870951	1870958	0 %	0 %	50 %	50 %	261856328
32347	NC_013422	CGA	2	6	1870965	1870970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856328
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32460	NC_013422	TGCCG	2	10	1877217	1877226	0 %	20 %	40 %	40 %	261856336
32461	NC_013422	T	8	8	1877228	1877235	0 %	100 %	0 %	0 %	261856336
32462	NC_013422	AGCC	2	8	1877247	1877254	25 %	0 %	25 %	50 %	261856336
32463	NC_013422	TTC	2	6	1877258	1877263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261856336
32464	NC_013422	GC	4	8	1877275	1877282	0 %	0 %	50 %	50 %	261856336
32465	NC_013422	CGA	2	6	1877356	1877361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856336
32466	NC_013422	CCG	2	6	1877407	1877412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856336
32467	NC_013422	CCA	2	6	1877419	1877424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856336
32468	NC_013422	CG	3	6	1877481	1877486	0 %	0 %	50 %	50 %	261856336
32469	NC_013422	GCC	2	6	1877535	1877540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856336
32470	NC_013422	GTGA	2	8	1877553	1877560	25 %	25 %	50 %	0 %	261856336
32471	NC_013422	ACGC	2	8	1877588	1877595	25 %	0 %	25 %	50 %	261856336
32472	NC_013422	GC	3	6	1877597	1877602	0 %	0 %	50 %	50 %	261856336
32473	NC_013422	TGG	2	6	1877629	1877634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261856336
32474	NC_013422	CGTCA	2	10	1877642	1877651	20 %	20 %	20 %	40 %	261856336
32475	NC_013422	CAG	2	6	1877669	1877674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856336
32476	NC_013422	CCG	2	6	1877691	1877696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856336
32477	NC_013422	GC	3	6	1877729	1877734	0 %	0 %	50 %	50 %	261856336
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32479	NC_013422	CCA	2	6	1877762	1877767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856336
32480	NC_013422	AGATC	2	10	1877829	1877838	40 %	20 %	20 %	20 %	261856337
32481	NC_013422	CCG	2	6	1877840	1877845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856337
32482	NC_013422	GTG	2	6	1877861	1877866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261856337
32483	NC_013422	TGA	2	6	1877904	1877909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856337
32484	NC_013422	CACC	2	8	1877931	1877938	25 %	0 %	0 %	75 %	261856337
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32486	NC_013422	TCA	2	6	1878102	1878107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856337
32487	NC_013422	CAG	2	6	1878154	1878159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856337
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32490	NC_013422	GTG	2	6	1878251	1878256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261856337
32491	NC_013422	CGCAGG	2	12	1878416	1878427	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	261856337
32492	NC_013422	GCGA	2	8	1878467	1878474	25 %	0 %	50 %	25 %	261856337
32493	NC_013422	T	6	6	1878538	1878543	0 %	100 %	0 %	0 %	261856337
32494	NC_013422	ACC	2	6	1878578	1878583	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856337
32495	NC_013422	GC	3	6	1878604	1878609	0 %	0 %	50 %	50 %	261856337
32496	NC_013422	CCG	2	6	1878635	1878640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856337
32497	NC_013422	CCG	2	6	1878813	1878818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856337
32498	NC_013422	GCT	2	6	1878822	1878827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856337
32499	NC_013422	GTATT	2	10	1878837	1878846	20 %	60 %	20 %	0 %	261856337
32500	NC_013422	CCA	2	6	1878861	1878866	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856337

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